Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 59, № 10 (2023)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОБЗОРНЫЕ И ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ СТАТЬИ

Иммуногенетические факторы в патогенезе шизофрении

Плотникова М.Ю., Кунижева С.С., Рождественских Е.В., Андреева Т.В.

Аннотация

Предрасположенность человека к нейропсихическим заболеваниям, таким как шизофрения, болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона и другим нейропатологиям связана как с генетическими факторами, так и с факторами внешней среды. В настоящее время одним из перспективных направлений в области молекулярных нейронаук является исследование роли иммуногенетических механизмов при различных типах патологических процессов в мозге. В данном обзоре освещаются последние результаты исследований в области иммуногенетики шизофрении, а также ряда других нейропсихических патологий, в патогенезе которых подтверждена роль иммунного компонента. В рамках данного обзора рассмотрена роль генов главного комплекса гистосовместимости в патогенезе шизофрении, оценка изменений иммунного репертуара Т-клеточных и B-клеточных рецепторов при нейровоспалении. Также представлены результаты изучения генов иммуноглобулинов, изменение работы которых связано с развитием нейропсихических патологий.

Генетика. 2023;59(10):1103-1111
pages 1103-1111 views

Генетический ресурс пырея Thinopyrum elongatum (Host) D.R. Dewey в селекционном улучшении пшеницы

Коростылева Т.В., Шиян А.Н., Одинцова Т.И.

Аннотация

Thinopyrum elongatum (Host) D.R. Dewey является ценным генетическим ресурсом, используемым в целях улучшения пшеницы методами геномной инженерии и современными генетическими технологиями, как носитель генома Е, базового для рода Thinopyrum. Его представители успешно используются в отдаленной гибридизации и создании интрогрессивных линий для переноса генов хозяйственно ценных признаков в новые сорта пшеницы. В настоящем обзоре представлены основные генетически охарактеризованные признаки Th. elongatum, перенесенные или желательные для переноса в геном пшеницы: устойчивость к фузариозу, септориозу, к ржавчинным болезням, устойчивость к абиотическим факторам − переувлажнению, засолению почв, к низким температурам, а также гены, влияющие на качество хлебопекарной продукции. Рассмотрены последние результаты в области изучения генома Th. elongatum методами геномного и транскриптомного секвенирования.

Генетика. 2023;59(10):1112-1119
pages 1112-1119 views

Генетические факторы рефлекторных эпилепсий

Дудко Н.А., Кунижева С.С., Андреева Т.В., Адрианова И.Ю., Рогаев Е.И.

Аннотация

Рефлекторные эпилепсии относятся к сравнительно редким формам эпилепсий. Обычно рефлекторные эпилептические приступы являются частью комплексного фенотипа, что усложняет возможность выявления генетических факторов, лежащих в их основе. Многочисленные генетические исследования рефлекторных эпилепсий как на животных моделях, так и у человека позволяют предположить сложную гетерогенную природу этих неврологических расстройств. В данном обзоре рассматриваются основные результаты, полученные в последние годы при исследовании молекулярно-генетических факторов рефлекторной эпилепсии, в том числе освещаются новые данные о механизмах генетической регуляции при рефлекторных эпилепсиях, вызываемых такими триггерами как аудио- и видео-стимуляция, потребление пищи, чтение, контакт с водой и гипоксия. Представлены результаты, полученные в исследованиях на животных моделях и пациентах с использованием технологии секвенирования следующего поколения.

Генетика. 2023;59(10):1120-1133
pages 1120-1133 views

ГЕНЕТИКА РАСТЕНИЙ

Молекулярное маркирование в селекции капусты белокочанной (Brassica oleracea L.) на устойчивость к фузариозному увяданию

Дубина Е.В., Макуха Ю.А., Артемьева А.М., Фатеев Д.А., Гаркуша С.В., Горун О.Л., Лесняк С.А.

Аннотация

В настоящей статье приведены результаты исследований по определению информативных ДНК-маркерных систем, обеспечивающих надежный контроль наличия гена устойчивости к фузариозу Foc1 в селекционном материале капусты белокочанной. На начальном этапе работ 14 молекулярных маркеров, взятых из базы данных VegMarks и литературных источников, были апробированы на контрастных по резистентности к фузариозу изогенных линиях капусты белокочанной (устойчивая линия ДТ-46 и восприимчивая линия Кб1П). Установлено, что InDel-маркер M10 и SSR-маркеры Frg13 и Ol10-D01 выявляют полиморфизм между контрастными образцами капусты белокочанной. Также проведен ПЦР-анализ на растениях сегрегирующей F2 популяции гибридной комбинации ДТ-46 × Кб1П с помощью данных маркеров и выполнено фитопатологическое тестирование. В результате проведения статистического анализа расщепления обнаружено, что только SSR-маркер Ol10-D01 является сонаследуемым с признаком устойчивости к фузариозу, поскольку только по этому локусу наблюдается ожидаемая сегрегация растений F2 по генотипу 1 : 2 : 1 согласно закону Менделя. Установлено, что наименьшая частота рекомбинации – между геном устойчивости Foc1 и маркером O110-D01 (1.6%).

Генетика. 2023;59(10):1134-1141
pages 1134-1141 views

ГЕНЕТИКА ЖИВОТНЫХ

Филогения рода Eleginus (Gadidae) по данным анализа изменчивости микросателлитных локусов и фрагмента CO1 мтДНК

Строганов А.Н., Пономарева Е.В., Пономарева М.В., Шубина Е.А., Жукова К.А., Смирнов А.А., Ракицкая Т.А., Ракитина М.В.

Аннотация

Генетическими методами на основе исследования изменчивости митохондриальной (СО1) и ядерной (микросателлиты) ДНК проводили исследования процессов формообразования в роде Eleginus. Выявленный уровень генетической дифференциации характеризует тихоокеанскую навагу (Eleginus gracilis) и северную навагу (Eleginus nawaga) как самостоятельные виды, дивергировавшие в относительно недавний период на границе плиоцена и плейстоцена. В группировке северной наваги отмечена внутривидовая дифференциация популяции Белого моря по отношению к наваге, обитающей в акваториях Карского и Баренцева морей. При этом предполагается, что карско-баренцевоморский регион мог выступать в качестве “ледникового рефугиума”, обеспечившего послеледниковое расселение наваги, в том числе в “оводнившуюся” беломорскую депрессию. Результаты проведенного филогенетического анализа на основе гаплотипов CO1 предполагают возможную реорганизацию в отряде Gadiformes в плане рассмотрения перспектив включения рода Eleginus в отдельное подсемейство.

Генетика. 2023;59(10):1142-1153
pages 1142-1153 views

ДНК-идентификация паразитических копепод Salmincola (Copepoda, Siphonostomatoida, Lernaeopodidae): изменчивость и скорость эволюции митохондриального гена цитохром с-оксидазы I

Шедько С.В., Шедько М.Б., Мирошниченко И.Л., Немкова Г.А.

Аннотация

Штрихкодовый фрагмент гена COI секвенирован у 91 образца пяти видов паразитических копепод Salmincola, снятых с лососевых рыб в основном c Дальнего Востока России (ДВР): S. californiensis (микижа и сима) и S. edwardsii (различные виды гольцов, нерка из оз. Кроноцкое), S. carpionis (различные виды гольцов), S. markewitschi (кунджа), S. stellata (сахалинский таймень). Всего был найден 41 вариант гаплотипов с максимальным уровнем различий 0.183 нуклеотидных замен на позицию. Расстояние между видами варьировало от 0.139 ± 0.014 (в паре S. markewitschiS. carpionis) до 0.179 ± 0.015 (в паре S. stellataS. californiensis). Внутривидовое нуклеотидное разнообразие фрагмента гена COI намного ниже и составило для S. californiensis и S. edwardsii, населяющих жаберную полость и плавники хозяина – 0.013 ± 0.003 и 0.015 ± 0.003, а для S. stellata, S. markewitschi и S. carpionis, локализующихся в ротоглоточной полости хозяев – 0.002 ± 0.001, 0.004 ± 0.001 и 0.005 ± 0.001 соответственно. Сравнение выборок трех видов копепод Salmincola из разных районов ДВР выявило существенную (Fst = 0.28–0.42, P \( \ll \) 0.001) генетическую подразделенность. Три субклады edwardsii-подобных копепод – S. edwardsii с ДВР, S. edwardsii с американской ручьевой палии востока Северной Америки и S. siscowet с озерной палии штата Мичиган (COI-последовательности копепод из последних двух групп взяты из генетических баз данных) – различались между собой в среднем по 9.3–10.9% нуклеотидным позициям, что указывает на необходимость таксономической ревизии S. edwardsii. Согласно проведенному молекулярному датированию дивергенция линий Salmincola началась в миоцене и завершилась в раннем плиоцене. Филогенетическая скорость составила 0.023 (95%-ный интервал: 0.013–0.033) нуклеотидных замен на позицию на млн лет на линию. Скорость нуклеотидных замещений на популяционном уровне оказалась в 3.7 раза выше – 0.085 (0.021–0.170). Высокий уровень изменчивости фрагмента гена COI делает этот маркер удобным инструментом как для разработки систематики и филогении копепод Salmincola и Lernaeopodidae на видовом и родовом уровнях, так и для анализа дифференциации их популяций.

Генетика. 2023;59(10):1154-1164
pages 1154-1164 views

ГЕНЕТИКА ЧЕЛОВЕКА

Исследование ассоциации полиморфных вариантов rs2295080 и rs1883965 гена MTOR с развитием и течением саркоидоза легких

Малышева И.Е., Топчиева Л.В., Тихонович Э.Л.

Аннотация

Цель исследования – изучение ассоциации полиморфных вариантов rs2295080 и rs1883965 гена MTOR с риском развития саркоидоза легких. В исследование включено 253 человека (122 больных с диагнозом морфологически верифицированный саркоидоз с поражением легких (средний возраст – 41.00 ± 12.56 года) и 131 здоровый человек (контрольная группа) (средний возраст – 44.00 ± 14.23 года)). В исследование включены жители Республики Карелия. В исследуемых группах проанализировано распределение аллелей и генотипов полиморфных маркеров rs2295080 и rs1883965 гена MTOR. Генотипирование проводили с помощью ПЦР-ПДРФ анализа. Уровень транскриптов гена MTOR в лейкоцитах периферической крови (ЛПК) больных саркоидозом легких и здоровых людей оценивали с помощью ПЦР в режиме реального времени. Установлено статистически значимое повышение уровня экспрессии мРНК гена MTOR в ЛПК больных саркоидозом легких по сравнению с контрольной группой (р = 0.007). Отмечено снижение количества транскриптов указанного гена у пациентов, получающих терапию по сравнению с пациентами без терапии (p = 0.025). Cтатистически значимых различий в распределении частот аллелей и генотипов по полиморфным маркерам rs2295080 и rs1883965 гена MTOR в группе больных саркоидозом легких и в контрольной группе не установлено (χ2 = 0.196, d.f. = 1, p = 0.658 и χ2 = 0.637, d.f. = 2, p = 0.728) и (χ2 = 0.034, d.f. = 1, p = = 0.855 и χ2 = 0.051, d.f. = 2, p = 0.975) соответственно. Повышенный уровень экспрессии гена MTOR в лейкоцитах периферической крови больных саркоидозом легких может свидетельствовать о вовлечении указанного гена в патогенез данного заболевания. Полиморфные маркеры rs2295080 и rs1883965 гена MTOR не связаны с риском развития саркоидоза легких. Вероятно, повышение уровня экспрессии гена MTOR у больных саркоидозом легких обусловлено развитием воспаления.

Генетика. 2023;59(10):1165-1170
pages 1165-1170 views

Влияние хронического радиационного воздействия на экспрессию микроРНК человека

Янишевская М.А., Блинова Е.А., Аклеев А.В.

Аннотация

Проведена оценка относительной экспрессии зрелых микроРНК в клетках периферической крови у лиц, подвергшихся хроническому радиационному воздействию в малых дозах в отдаленном периоде. В исследование были включены люди, подвергшиеся облучению в 1950-х гг. на р. Тече (Южный Урал, Россия). Кумулятивные дозы облучения красного костного мозга (ККМ) лиц из основной исследуемой группы (33 человека) находились в диапазоне от 77.7 до 2869.8 мГр (среднее значение – 698.5 мГр). Группу сравнения составили 30 человек, с дозой облучения ККМ, не превышающей 70 мГр за весь период жизни. Обратную транскрипцию образцов РНК проводили с использованием специфических шпилькообразных праймеров (“stem-loop”). Изменение относительного содержания микроРНК оценивали методом ПЦР “в реальном времени” на приборе CFX96 (“BioRad”, США). Статистический анализ полученных результатов проводился с использованием U-критерия Манна–Уитни. У облученных людей спустя 60 лет обнаружено статистически значимое зависимое от дозы облучения ККМ увеличение содержания микроРНК hsa-miR-125b, hsa-miR-181а, hsa-miR-16.

Генетика. 2023;59(10):1171-1178
pages 1171-1178 views

Полногеномное ассоциативное исследование: анализ ассоциации параноидной шизофрении с полиморфными локусами, локализованными в хромосомных областях 4p15.2 и 20q13.31

Гареева А.Э.

Аннотация

На протяжении пятнадцати лет полногеномные ассоциативные исследования (GWAS) позволили выявить несколько миллионов полиморфных маркеров риска развития шизофрении, значительно продвинув наше понимание генетической архитектуры шизофрении. Целью настоящего исследования явилось изучение генетических факторов риска развития шизофрении при проведении полногеномного анализ ассоциации у русских, татар и башкир из Республики Башкортостан. Исследованная выборка состояла из 816 больных параноидной шизофренией и 989 здоровых индивидов. Полногеномное генотипирование образцов ДНК было проведено на биочипе PsychChip, включавшим 610 000 однонуклеотидных полиморфных вариантов (ОНП). В результате проведенного исследования впервые установлена ассоциация ОНП rs73254185 (4p15.2) и rs587778384 гена GNAS (20q13.31) с риском развития параноидной шизофрении у индивидов различной этнической принадлежности, русских, татар и башкир, проживающих в Республике Башкортостан, что вероятно может свидетельствовать о вовлеченности, локализованных в данных хромосомных областях генов PI4K2B и GNAS в патогенез шизофрении.

Генетика. 2023;59(10):1179-1190
pages 1179-1190 views

Полиморфные варианты гена MAOA (rs1137070) и интернет-зависимость у подростков

Копылова К.В., Марченко И.В., Шубина М.В., Горбачева Н.Н., Новицкий И.А., Смольникова М.В.

Аннотация

Моноаминоксидаза А (MAOA) катализирует распад норадреналина, дофамина и серотонина – нейромедиаторов, участвующих в патогенезе ряда патологических зависимостей, к которым относят и интернет-зависимость (ИЗ). Ген МАОА активно исследуется в аспекте генетической предрасположенности в развитии агрессивного поведения, участвующего в формировании зависимости от интернета. В исследование были включены 602 подростка Ангаро-Енисейского макрорегиона (русские n = 329, тувинцы n = 158, хакасы n = 158) в возрастном диапазоне от 9 до 18 лет (средний возраст 14.6 лет, SD 1.7). Тип ИЗ оценивали по шкале Чена (Chen Internet Addiction Scale, CIAS), полиморфизм детектировали с помощью ПЦР-РВ. Выявлено, что частота генотипа TT полиморфного варианта rs1137070 гена MAOA, ассоциированного с низкой активностью фермента MAOA и агрессивным поведением на фоне интернет-зависимости, значимо выше у тувинских подростков по сравнению с русскими (31.1 против 21.2%, p = 0.020). Патологическая интернет-зависимость (более 65 баллов по шкале Чена) чаще наблюдается среди хакасов по сравнению с русскими подростками (26.4 против 15.5%, p = = 0.028). Таким образом, наличие аллельного варианта T полиморфного варианта rs1137070 гена MAOA является потенциальным маркером склонности к формированию зависимого и агрессивного поведения, а тувинцы и хакасы более подвержены к развитию патологических зависимостей, чем русские подростки.

Генетика. 2023;59(10):1191-1198
pages 1191-1198 views

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах