Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 65, № 3 (2023)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Статьи

Новое в геномике центромер: уроки первой Т2Т-сборки хромосом человека

Уральский Л.И., Александров И.А., Рябов Ф.Д., Лапидус А.Л., Рогаев Е.И.

Аннотация

Технологии секвенирования с длинными прочтениями, появившиеся недавно, позволили впервые прочесть полную, без пробелов, последовательность генома человека. Результатом явилась первая Т2Т (от теломеры до теломеры) геномная сборка, опубликованная одноименным международным консорциумом ученых в 2022 г. Наиболее значительным вкладом новой сборки явились центромерные области, состоящие из высокоповторяющейся сателлитной ДНК. В этом обзоре мы кратко перечислим основные достижения Т2Т-консорциума, связанные с центромерами, и более подробно рассмотрим неожиданные находки цитогенетического масштаба, которые принес анализ впервые собранных центромер человека, такие как “расщепленные” центромеры хромосом 3 и 4, мега-инверсия в активном массиве центромеры 1-ой хромосомы, гаплотипические эпиаллели в центромере Х-хромосомы и макроповторы, найденные в нескольких центромерах.

Цитология. 2023;65(3):217-231
pages 217-231 views

Убиквитин-протеасомная система в регуляции клеточной плюрипотентности и дифференцировки

Поденкова У.И., Зубарев И.В., Томилин А.Н., Цимоха А.С.

Аннотация

Эмбриональные стволовые клетки (ЭСК) и индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (иПСК) демонстрируют уникальную способность к непрерывному самообновлению и дифференцировке во все типы соматических клеток. Понимание механизмов, контролирующих эти свойства, приблизит к эффективному и безопасному использованию ЭСК и иПСК в клеточной терапии. Недавние совокупные данные подчеркнули важность протеостаза в поддержании функции ЭСК. Настоящий обзор посвящен роли убиквитин-протеасомной системы (УПС) – ключевого участника сети протеостаза – в регуляции плюрипотентности и дифференцировки ЭСК и иПСК.

Цитология. 2023;65(3):232-245
pages 232-245 views

Роль интегрированного ответа опухолевых клеток на стресс, аутофагии и шаперонов в возникновении рецидивов резистентных опухолей

Зубова С.Г., Гнедина О.О.

Аннотация

Химио- и радиотерапия представляют собой для опухолевых клеток колоссальный стрессорный фактор. В ответ на терапию активируется вся эволюционно закрепленная реакция клеток на стресс. Это происходит на всех уровнях организации клетки, а именно на белковом уровне и уровне ДНК. В этот ответ включаются система протеостаза клетки, системы репарации ДНК, гены-онкосупрессоры и многие другие системы клетки. Мы рассмотрим роль в этих процессах основных систем протеостаза, а именно макроаутофагии и шаперонов, которые являются частью интегрированного ответа клетки на стресс. В результате ответа клетки на стресс, опухолевая клетка становится еще менее дифференцированной, активируя необходимые для выживания гены и внутриклеточные системы. Клетки, которые ответили на стресс таким образом, имеют более агрессивный фенотип, который оказывается значительно устойчивее к терапии. Под воздействием стресса клетка эволюционно упрощается, что дает ей дополнительные шансы для выживания. Аутофагия, с одной стороны, способствует снижению дифференцировки опухолевой клетки, ее пластичности, а с другой – поддерживает определенную стабильность, отвечая за целостность генома и освобождая клетку от поврежденных органелл и дефектных белков. И аутофагия, и шапероны способствуют приобретению опухолью множественной лекарственной устойчивости, что еще более затрудняет терапию. Понимание этих процессов с учетом многостадийности канцерогенеза делает возможной разработку новых терапевтических подходов.

Цитология. 2023;65(3):246-258
pages 246-258 views

ХАРАКТЕРИСТИКА КЛЕТОК МИКРОГЛИИ ЛИНИИ SIM-A9 – НОВЫЕ ДАННЫЕ

Шапошникова Д.А., Москалева Е.Ю., Сёмочкина Ю.П., Высоцкая О.В., Комова О.В., Насонова Е.А., Кошлань И.В.

Аннотация

SIM-A9 – линия спонтанно иммортализованных клеток микроглии мыши, полученных из головного мозга новорожденных мышат линии С57BL/6. Цель настоящей работы – характеристика микроглии мыши линии SIM-A9 по соотношению клеток с фенотипом покоящейся и активированной микроглии в культуре, анализ экспрессии маркеров стволовых (прогениторных) клеток CD133 и нестина, рецепторов факторов роста CSF-1R и EGFR, а также анализ кариотипа этой линии. Использованы методы световой микроскопии, иммуноцитохимии в сочетании с проточной цитометрией и ОТ-ПЦР для анализа морфологии, фенотипа и уровня экспрессии генов провоспалительных цитокинов и метод mFISH для анализа кариотипа. Впервые показано, что клетки линии SIM-А9 экспрессируют высокий уровень белка TSPO, маркеров CD68, CD11b и CD45high на поверхностной мембране клеток, что соответствует фенотипу активированной микроглии. Несмотря на это, клетки линии отвечают дополнительной активацией в ответ на стимуляцию ЛПС, которая приводит к повышению экспрессии генов провоспалительных цитокинов IL-1β, TNFα, IL-6 и образованию высокого уровня активных метаболитов кислорода и азота. Показано, что клетки линии SIM-A9 экспрессируют маркеры стволовых и прогениторных клеток CD133+ и нестин, что позволяет рассматривать их как ранние низко дифференцированные прогениторные клетки, несмотря на их фенотип, соответствующий активированной микроглии. Обнаружено также, что клетки линии SIM-A9 экспрессируют рецепторы двух факторов роста CSF-1 и EGF – CSF-1R и EGFR, что свидетельствует о возможности стимуляции пролиферации клеток SIM-A9 по двум альтернативным механизмам под действием соответствующих факторов. У клеток SIM-A9 установлен гипотетраплоидный кариотип с большим числом структурных и количественных аномалий хромосом.

Цитология. 2023;65(3):259-272
pages 259-272 views

Влияние стимуляции и подавления биосинтеза NAD+ на поддержание плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток мыши

Антипова М.В., Куликова В.А., Соловьева Л.В., Кропотов А.В., Светлова М.П., Якимов А.П., Нериновский К.Б., Бахмет Е.И., Никифоров А.А.

Аннотация

Никотинамидадениндинуклеотид (NAD+) играет ключевую роль в клеточном метаболизме и сигналинге. В последние годы появилось множество свидетельств того, что NAD+-зависимые процессы принимают участие в регуляции плюрипотентности и дифференцировки эмбриональных стволовых клеток млекопитающих. Основным способом поддержания уровня NAD+ в клетках млекопитающих является его биосинтез из различных форм витамина В3. В настоящей работе мы выяснили, как стимуляция и подавление биосинтеза NAD+ влияют на поддержание плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток мыши линии Е14 Tg2a (клетки Е14). Статус плюрипотентности клеток Е14 оценивали при помощи иммуноцитохимического анализа и иммуноблоттинга с использованием антител к фактору плюрипотентности Oct4, а также окраски на щелочную фосфатазу. С помощью метода ЯМР-спектроскопии мы установили, что концентрация NAD+ в плюрипотентных клетках Е14, культивируемых в присутствии фактора ЛИФ, составляет около 4 нмоль/мг и остается неизменной после индукции дифференцировки ретиноевой кислотой. Также мы показали, что фармакологическая стимуляция биосинтеза NAD+ никотинамидрибозидом повышает уровень внутриклеточного NAD+ на 20%, и это не влияет на поддержание плюрипотентности клеток Е14. Более того, в условиях критического истощения внутриклеточного пула NAD+ при подавлении его синтеза из никотинамида ингибитором Nampt (FK866) клетки Е14 сохраняли плюрипотентность, в то время как уровень белка Oct4 был понижен.

Цитология. 2023;65(3):273-282
pages 273-282 views

Наночастицы диоксида титана подавляют энтоз в культуре аденокарциномы молочной железы человека MCF-7

Кисурина-Евгеньева О.П., Савицкая М.А., Смешнова Д.С., Онищенко Г.Е.

Аннотация

Наночастицы TiO2 широко применяются в промышленности, фармакологии, медицине. В последнее время предлагается использовать наночастицы TiO2 для адресной доставки химиотерапевтических препаратов, что может привести к увеличению локальной концентрации TiO2 и оказать влияние на протекающие в опухоли процессы, в т.ч. на энтоз (внедрение одной опухолевой клетки в другую). В настоящей работе проведено исследование влияния наночастиц TiO2 (частиц минерала анатаз размером менее 25 нм и частиц, состоящих из смеси анатаза и рутила, размером менее 75 нм в концентрации 1, 10 или 100 мкг/мл в течение 72 ч) на процесс энтоза в культуре клеток аденокарциномы молочной железы человека MCF-7. Культивирование клеток в присутствии разных типов наночастиц TiO2 замедляет пролиферацию и вызывает уменьшение числа энтозов. Элементный анализ с помощью аналитической электронной микроскопии выявил присутствие TiO2 в эндосомном компартменте, в цитозоле и во внеклеточном пространстве. Методом иммунохимического окрашивания показано, что оба типа наночастиц TiO2 в концентрации 10 мкг/мл нарушают образование адгезивных контактов, в т.ч. и на ранних стадиях энтоза. Воздействие частиц анатаза индуцирует транслокацию белка р53 в ядра клеток. В целом, использованные в работе наночастицы TiO2 ингибируют энтоз в клетках культуры MCF-7, нарушая адгезивные контакты и препятствуя процессу внедрения. Однако можно предположить, что нарушение адгезивных контактов способно усиливать подвижность опухолевых клеток и метастазирование.

Цитология. 2023;65(3):283-294
pages 283-294 views

Применение технологии CRISPR/Cas9 в зиготах мышей для получения дупликаций, делеций и инверсий влияет на стабильность кариотипа

Минина Ю.М., Сорока А.Б., Карамышева Т.В., Сердюкова Н.А., Серов О.Л.

Аннотация

В современной молекулярной и клеточной биологии CRISPR/Cas9 технология получила широкое применение для адресной модификации геномов человека и животных. В настоящей работе с помощью методов молекулярной цитогенетики был проведен анализ кариотипа в 18 линиях фибробластов мыши (ФМ), в геноме которых ген Cntn6 был редактирован с помощью CRISPR/Cas9. Модификации гена Cntn6 представляли собой дупликации размером 2374 т.п.о., делеции 1137 т.п.о. и инверсии сходного размера. Кроме того, был проведен цитогенетический анализ для контрольных 5 линий эмбриональных фибробластов мыши (ЭФМ), несущих интактный аллель гена Cntn6. Проведенное исследование показало наличие высокого уровня полиплоидии для гетерозиготных по инверсии гена Cntn6 и гомозиготных и гетерозиготных по дупликации гена Cntn6 линий ФМ (20–46%), а также наличие моносомии (1–9%) и трисомии по хромосоме 6 (1–8%). Важно отметить, что в 4 линиях ЭФМ, несущих делецию и дупликацию гена Cntn6 в компаунде, трисомии обнаружено не было, а доля полиплоидных клеток была минимальна (1.5–5.7%). Таким образом, полученные данные указывают на дестабилизацию кариотипа клеточных линий, претерпевших редактирование генома с помощью CRISPR/Cas9.

Цитология. 2023;65(3):295-302
pages 295-302 views

Визуализация одиночных клеток Escherichia coli в состоянии SOS-ответа при помощи экспансионной микроскопии

Румянцева Н.А., Голофеева Д.М., Вишняков И.Е., Ведяйкин А.Д.

Аннотация

Экспансионная микроскопия (Expansion microscopy, ExM) – метод пробоподготовки, позволяющий добиться улучшенной визуализации структур за счет физического расширения образца. Этот метод используется в сочетании с традиционной световой микроскопией и позволяет без применения сложных технических устройств, характерных для методов сверхразрешающей микроскопии (super-resolution microscopy), добиться визуализации биологических структур с более высоким разрешением. В отличие от методов сверхразрешающей микроскопии, экспансионная микроскопия не позволяет преодолеть дифракционный предел, однако наблюдаемый эффект можно считать эквивалентным увеличению пространственного разрешения. Относительная простота метода и нетребовательность к используемому микроскопу сделали экспансионную микроскопию довольно популярным методом для визуализации различных биологических структур. В настоящей работе описано использование экспансионной микроскопии для визуализации в клетках Escherichia coli, находящихся в состоянии SOS-ответа, ДНК и структур, формируемых белком FtsZ. Результаты работы подтверждают полученные ранее данные о том, что белок FtsZ в клетках, находящихся в состоянии SOS-ответа, распределен неравномерно. Использованный в работе протокол визуализации клеток E. coli, предварительно закрепленных на поверхности стекла, с помощью метода экспансионной микроскопии может быть использован в будущем для изучения внутренних структур других клеток – как бактериальных, так и эукариотических.

Цитология. 2023;65(3):303-310
pages 303-310 views

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах