Том 20, № 1 (2022)

Цель — оценка особенностей геномной архитектуры айрширского скота России в сравнении с другими популяциями Bos taurus молочного направления продуктивности.

Материалы и методы. С использованием биоинформационного анализа 42 628 маркеров SNP, полученных в ходе генотипирования с помощью микроматрицы средней плотности BovineSNP50_v3 BeadChip, были выявлены особенности геномной архитектуры пяти популяций Bos taurus разных пород.

Результаты. Отечественная популяция айрширского скота характеризовалась наименьшими показателя гетерозиготности (H_o = 0,335, H_е = 0,339) и незначительным инбридингом (F_is = 0,010). Выявлена четкая дифференциация скота различного происхождения друг от друга с использованием программы ADMIXTURE (K = 3, СV = 0,5493) и MDS-анализа. При этом животные отечественной селекции сформировали обособленную группу в рамках единого кластера айрширов.

Заключение. Российская популяция айрширского скота отличается уникальной архитектурой генома, при этом сохраняя генетические варианты финского айрширского скота и незначительные следы генофонда голштинской породы.

Актуальность. Поиск генетических факторов, влияющих на формирование продуктивных качеств новых селекционных форм и популяций кур, — важное направление изучения геномов животных. Полученные знания могут быть востребованными в проектах по созданию современных отечественных высокопродуктивных линий птицы.

Цель — провести сравнительный анализ локализации гомозиготных районов на хромосомах кур у представителей четырех пород из Центра коллективного пользования «Генетическая коллекция редких и исчезающих пород кур» для выявления «следов селекции» и поиска генов, ассоциированных с продуктивными признаками.

Материалы и методы. На основе биоинформационного анализа 42 275 маркеров SNP, выявленных с помощью микрочипа Illumina Chicken 60K SNP iSelect BeadChip, получены данные о распределении гомозиготных районов четырех популяций кур ЦКП «Генетическая коллекция редких и исчезающих пород кур» (ВНИИГРЖ, Санкт-Петербург): пушкинская (n = 20), корниш (n = 22), черно-пестрый австралорп (n = 20), русская белая (n = 23).

Результаты и выводы. У кур пушкинской породы наблюдаемая гетерозиготность составила 0,372 ± 0,004, что выше, чем в других популяциях. По показателю инбридинга, основанному на анализе гомозиготных районов, максимальный уровень выявлен у кур породы корниш. Для пушкинской породы отмечено накопление гомозиготных районов на хромосомах 1, 2, 6, 8. Обнаруженные гомозиготные районы являются доказательством интенсивного отбора, а аннотированные в этих локусах гены, позволяют предположить функциональные особенности участков, находящихся под селекционным давлением.

Актуальность. В настоящее время остро встает проблема оценки реальной генетической опасности и влияния загрязнения окружающей среды на здоровье человека. Один из городов, который испытывает воздействие всего комплекса антропогенных мутагенных факторов, — Уфа (Республика Башкортостан).

Цель исследования заключалась в анализе частоты встречаемости мутаций 5382insC в гене BRCA1 и 6174delT в гене BRCA2 у практически здоровых жителей промышленного города.

Материалы и методы. Определение мутаций проводили методом ПЦР с использованием TaqMan зондов на приборе Bio-Rad CFX96 (Bio-Rad, США) в соответствии с протоколом производителя в 379 образцах ДНК практически здоровых жителей среднего возраста (18,32 ± 0,45 года).

Результаты. Суммарная частота мутаций в генах BRCA1 и ВRCA2 достигала 4,22 % (n = 16). Наибольшая частота мутантных аллелей в генах BRCA1 и ВRCA2 — 6,18 % (n = 11) — присутствовала у жителей I района наблюдения, в котором сосредоточены предприятия нефтехимического производства. Мутантный гомозиготный генотип гена BRCA2 был обнаружен в 3,37 % случаев только среди жителей I района наблюдения (n = 6, p = 0,0002). Риск формирования мутаций в гене BRCA2 в 6 раз выше у жителей I района наблюдения (χ² = 7,75; df 1; р = 0,006; OR 6,31; 95 % ДИ 1,44–27,67).

Выводы. Частота встречаемости мутаций генов семейства BRCA варьирует в зависимости от исследуемого региона, степени загрязнения окружающей среды и изучаемой группы.

Актуальность. Инфекционная бурсальная болезнь — одно из наиболее часто встречающихся и экономически значимых вирусных заболеваний птиц. Наиболее действенным способом предупреждения инфекционных заболеваний является вакцинация. Субъединичные вакцины, содержащие иммуногенный белок патогена или его фрагменты, но не содержащие других белков, липополисахаридов, токсинов, не вызывают побочных реакций.

Цель — получение штаммов дрожжей Pichia pastoris, которые синтезируют и секретируют фрагменты капсидного белка VP2 вируса инфекционной бурсальной болезни.

Материалы и методы. Последовательности ДНК, кодирующие фрагменты N и М белка VP2, были клонированы под контролем промотора гена АОХ1 и интегрированы в геном штаммов Х-33 (mut+) и GS115 (his4) дрожжей P. pastoris.

Результаты. Анализ белков, секретируемых полученными штаммами, продемонстрировал возникновение дополнительных белков с молекулярной массой, соответствующей целевым белкам.

Заключение. Таким образом, полученные штаммы дрожжей P. pastoris — продуценты фрагментов N и М белка VP2 могут быть использованы для выделения иммуногенных белков и создания субъединичной вакцины против инфекционной бурсальной болезни птиц.