Анализ частот мутаций 5382insC в гене BRCA1 и 6174delT в гене BRCA2 у населения Уфы

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Актуальность. В настоящее время остро встает проблема оценки реальной генетической опасности и влияния загрязнения окружающей среды на здоровье человека. Один из городов, который испытывает воздействие всего комплекса антропогенных мутагенных факторов, — Уфа (Республика Башкортостан).

Цель исследования заключалась в анализе частоты встречаемости мутаций 5382insC в гене BRCA1 и 6174delT в гене BRCA2 у практически здоровых жителей промышленного города.

Материалы и методы. Определение мутаций проводили методом ПЦР с использованием TaqMan зондов на приборе Bio-Rad CFX96 (Bio-Rad, США) в соответствии с протоколом производителя в 379 образцах ДНК практически здоровых жителей среднего возраста (18,32 ± 0,45 года).

Результаты. Суммарная частота мутаций в генах BRCA1 и ВRCA2 достигала 4,22 % (n = 16). Наибольшая частота мутантных аллелей в генах BRCA1 и ВRCA2 — 6,18 % (n = 11) — присутствовала у жителей I района наблюдения, в котором сосредоточены предприятия нефтехимического производства. Мутантный гомозиготный генотип гена BRCA2 был обнаружен в 3,37 % случаев только среди жителей I района наблюдения (n = 6, p = 0,0002). Риск формирования мутаций в гене BRCA2 в 6 раз выше у жителей I района наблюдения (χ2 = 7,75; df 1; р = 0,006; OR 6,31; 95 % ДИ 1,44–27,67).

Выводы. Частота встречаемости мутаций генов семейства BRCA варьирует в зависимости от исследуемого региона, степени загрязнения окружающей среды и изучаемой группы.

Об авторах

Ольга Сергеевна Целоусова

Башкирский государственный медицинский университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: Olga.tselousova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9124-9340
SPIN-код: 3912-5213
Scopus Author ID: 35072340800

канд. биол. наук, доцент

Россия, Уфа

Людмила Борисовна Овсянникова

Башкирский государственный медицинский университет

Email: Ovsyannikova-mpd@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5233-1942
SPIN-код: 2048-4767

д-р мед. наук, профессор

Россия, Уфа

Евгений Георгиевич Степанов

Уфимский научно-исследовательский институт медицины труда и экологии человека; Уфимcкий государственный нефтяной технический университет

Email: doctorse@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1917-8998
SPIN-код: 5386-8869

канд. мед. наук, доцент

Россия, Уфа; Уфа

Список литературы

  1. Ингель Ф.И. Перспективы использования микроядерного теста на лимфоцитах крови человека, культивируемых в условиях цитокинетического блока. Часть 2. Факторы среды и индивидуальные особенности в системе нестабильности генома человека. Дополнительные возможности теста. Методика проведения экспериментов и цитогенетического анализа // Экологическая генетика. 2006. Т. 4, № 4. С. 38–54. doi: 10.17816/ecogen4438-54
  2. Mylavarapu S., Das A., Roy M. Role of BRCA Mutations in the Modulation of Response to Platinum Therapy // Front Oncol. 2018. Vol. 8. P. 16. doi: 10.3389/fonc.2018.00016
  3. Tan S.L.W., Chadha S., Liu Y., et al. A class of environmental and endogenous toxins induces BRCA2 haploinsufficiency and genome instability // Cell. 2017. Vol. 169, No. 6. P. 1105–1118.e15. doi: 10.1016/j.cell.2017.05.010
  4. Maxwell K.N., Domchek S.M., Nathanson K.L., Robson M.E. Population frequency of germline BRCA1/2 mutations // J Clin Oncol. 2016. Vol. 34, No. 34. P. 4183–4185. doi: 10.1200/jco.2016.67.0554
  5. Rebbeck T.R., Friebel T.M., Friedman E., et al. Mutational spectrum in a worldwide study of 29,700 families with BRCA1 or BRCA2 mutations // Hum Mutat. 2018. Vol. 39, No. 5. P. 593–620. doi: 10.1002/humu.23406
  6. Connor F., Bertwistle D., Mee P.J., et al. Tumorigenesis and a DNA repair defect in mice with a truncating BRCA2 mutation // Nat Genet. 1997. Vol. 17. P. 423–430. doi: 10.1038/ng1297-423
  7. Zeinomar N., Oskar S., Kehm R.D., et al. Environmental exposures and breast cancer risk in the context of underlying susceptibility: A systematic review of the epidemiological literature // Environ Res. 2020. Vol. 187. ID109346. doi: 10.1016/j.envres.2020.109346
  8. Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Башкортостан. Государственный доклад о состоянии природных ресурсов и окружающей среды Республики Башкортостан в 2020 году. Уфа: Самрау, 2021. 287 с.
  9. Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Башкортостан. Материалы к государственному докладу «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2019 году» по Республике Башкортостан. Уфа: Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Башкортостан, 2020. 262 с.
  10. Бердина Л.М., Хуснутдинова Э.К. Частота хромосомных аберраций у жителей Республики Башкортостан // Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки. 2006. Т. 148, № 3. С. 189–196.
  11. Целоусова О.С., Овсянникова Л.Б. Комплексная гигиеническая оценка эколого-генетического риска здоровью населения промышленного города // ХII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Здоровье человека в XXI веке»; Октябрь 28–29, 2020; Казань. С. 242–245.
  12. Кочетова О.В., Гайнуллина М.К., Викторова Т.В. Полиморфные варианты генов репарации ДНК (XRCC1, XRCC3, XPD, XPC) и риск развития миомы матки у работниц нефтехимического комплекса // Экологическая генетика. 2011. Т. 9, № 4. С. 43–51. doi: 10.17816/ecogen9443-51
  13. Бермишева М.А., Зиннатуллина Г.Ф., Гилязова И.Р., и др. Распространенность мутации c.5161C>T гена BRCA1 у пациентов с онкологическими заболеваниями из Республики Башкортостан // Успехи молекулярной онкологии. 2021. Т. 8, № 4. С. 84–93. doi: 10.17650/2313-805X-2021-8-4-84-93
  14. Гржибовский А.М. Анализ номинальных данных (независимые наблюдения) // Экология человека. 2008. Т. 6. С. 58–68.
  15. Fox N., Hunn A., Mathers N. Sampling and sample size calculation. Yorkshire & the Humber: The NIHR RDS for the East Midlands, 2007. 41 p.
  16. Наркевич А.Н., Виноградов К.А. Методы определения минимально необходимого объема выборки в медицинских исследованиях // Социальные аспекты здоровья населения. 2019. Т. 65, № 6. С. 10. doi: 10.21045/2071-5021-2019-65-6-10
  17. Collins J.M., Isaacs C. Management of breast cancer risk in BRCA1/2 mutation carriers who are unaffected with cancer // Breast J. 2020. Vol. 26, No. 8. P. 1520–1527. doi: 10.1111/tbj.13970
  18. Галинская Т.В., Щепетов Д.М., Лысенков С.Н. Предубеждения о микросателлитных исследованиях и как им противостоять // Генетика. 2019. Т. 55, № 6. С. 617–632. doi: 10.1134/S0016675819060043

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО "Эко-Вектор", 2022


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».