Том 16, № 2 (2018)

Генетические основы эволюции экосистем

Динамика протеома антибиотикорезистентных штаммов Staphylococcus aureus при воздействии субингибирующих концентраций бета-лактамных антибиотиков

Сопова Ю.В., Гостев В.В., Калиногорская О.С., Лыхолай А.Н., Сидоренко С.В.

Аннотация

Устойчивость к цефтаролину — новому антибиотику семейства цефалоспоринов — была обнаружена у клинических изолятов метициллинрезистентных Staphylococcus aureus, выделенных еще до внедрения антибиотика в медицинскую практику. Для выявления механизмов формирования устойчивости к новому антибиотику было проведено сравнение белковых профилей мутантов, устойчивых к цефтаролину, при воздействии субингибирующими концентрациями бета-лактамных антибиотиков и ванкомицина. Обнаружено, что индукция меропенемом приводит к экспрессии стафилококковой бета-лактамазы у мутантных штаммов, устойчивых к цефтаролину. При индукции другими антибиотиками, а также у исходных штаммов экспрессии бета-лактамазы не отмечали.

Экологическая генетика. 2018;16(2):4-10
pages 4-10 views

Молекулярно-генетическая идентификация грибов арбускулярной микоризы

Юрков А.П., Крюков А.А., Горбунова А.О., Кожемяков А.П., Степанова Г.В., Мачс Э.М., Родионов А.В., Шишова М.Ф.

Аннотация

Арбускулярная микориза (АМ) представляет собой широко распространенный симбиоз, который формируется большинством наземных растений с грибами подотдела Glomeromycotina. Одной из основных проблем в изучении АМ-грибов является сложность их идентификации, связанная с высоким внутри- и межвидовым генетическим полиморфизмом, а также с облигатным статусом АМ-грибов по отношению к растению-хозяину. Методология идентификации АМ-грибов постоянно претерпевает серьезные изменения. В обзоре дан анализ оптимальных методов молекулярно-генетической идентификации АМ-грибов. Рассматриваются этапы пробоподготовки, обсуждаются выбор маркерных участков, подбор праймеров и различные методы амплификации, включая применение вложенной ПЦР. Анализируется и обосновывается перспективность методов клонирования и секвенирования нового поколения в применении к идентификации АМ-грибов.

Экологическая генетика. 2018;16(2):11-23
pages 11-23 views

Генетическая токсикология

Polymorphisms of 5’-UTR of rad51 gene in prostate cancer

Al-Zoubi M., Al-Batayneh K., Al Trad B., Alorjani M., Al Bashir S., Al-Zoubi R., Al-Zoubi R., Al-Khatib S., Al Hamad M., Abd Al-Razaq M., Muhaidat R., Matalka I.

Аннотация

Background. Notwithstanding that prostate cancer is largely studied all over the world for many decades, its etiology is not known and there is an intensive work to elucidate the cause and molecular markers for the development of this male cancer. Polymorphisms in DNA repairing genes may affect the DNA repairing capacity that in turn contributes to cancer development. This study aims to explore the polymorphisms of homologous recombination (HR) RAD51 gene (rs1801320 and rs1801321) as a possible risk factor for developing prostate cancer. Sequencing of 5'-UTR of RAD51 gene (rs1801320 and rs1801321) was studied in 80 DNA samples of prostate cancer and 50 DNA samples from a control group. Our results revealed a significant correlation between rs1801320 G>C polymorphism and the presence of prostate cancer in the Jordanian population (p = 0.041, X2 = 6.377). On the other hand, the rs1801321 G>T polymorphism was not associated with the presence of prostate cancer in the study population (p = 0.27, X2 = 2.6). In conclusion, our results shed a light on the possible role of RAD51 gene polymorphisms in the development of prostate cancer; however, a larger representative study is needed to elucidate a possible role of RAD51 gene polymorphisms in development and prognosis of prostate cancer.

Экологическая генетика. 2018;16(2):24-29
pages 24-29 views

Экологическая генетика человека

Долговременные ген-средовые взаимодействия и метаболические болезни коренного населения Северо-Востока Азии

Малярчук Б.А.

Аннотация

Представлен обзор особенностей полиморфизма генов липидного и углеводного обмена в популяциях коренного населения Сибири. Описаны наиболее значимые генетические изменения в популяциях коренного населения Северо-Востока Азии (эскимосов, чукчей и коряков), связанные с долговременной адаптацией к экстремальным условиям природной среды и особенностям диеты. Часть генетической вариабельности коренного населения этого региона представлена вариантами полиморфизма, связанными с метаболическими заболеваниями (недостаточность карнитин пальмитоилтрансферазы 1А, панкреатической амилазы, сахаразы-изомальтазы, трегалазы), которые вызваны сменой традиционной белково-липидной диеты на «европейскую» углеводную. В современных условиях крайне важным представляется проведение широкомасштабного генетического тестирования коренного населения Крайнего Севера.

Экологическая генетика. 2018;16(2):30-35
pages 30-35 views

Критические периоды развития эндометриоза

Баранов В.С.

Аннотация

Предлагается гипотеза трех критических периодов (КП) репрограммирования генома стволовых клеток (СК) в развитии частого мультифакторного заболевания — наружного генитального эндометриоза (НГЭ): I — начальные стадии становления и развития женской половой системы (8–10 н. б.), II — трансцизия клеток эндометрия в мезенхимные СК, III — становление и развитие эндометриоидных гетеротопий. Обсуждаются генетические и эпигенетические аргументы в пользу гипотезы КП и ее значение для понимания проблем этиологии и патогенеза НГЭ.

Экологическая генетика. 2018;16(2):36-39
pages 36-39 views

История и персоналии, рецензии, информация

Петергофская коллекция ржи и ее использование в генетических исследованиях

Аннотация

B статье приводятся сведения об истории и методах создания Петергофской генетической коллекции ржи, основанной доцентом кафедры генетики и селекции Ленинградского университета В.С. Фёдоровым. Выделение самосовместимых мутантов, их скрещивание с самонесовместимыми растениями ржи и последующее самоопыление гибридов позволило вскрыть потенциал наследственной изменчивости гетерогенных и гетерозиготных сортов ржи. В ходе создания генетической коллекции изучали наследование качественных и количественных морфологических признаков, генетический контроль автофертильности, генетику мейоза, генетику межвидовой несовместимости. С помощью изозимных и молекулярных маркёров идентифицированы и в большинстве случаев картированы соответствующие гены. Фундаментальные исследования нашли свое отражение в практической селекции. Под руководством В.С. Фёдорова и В.Г. Смирнова был создан первый в России тетраплоидный сорт ржи Ленинградская тетра. В настоящее время на основании изучения генетики автофертильности получен исходный материал, который используется для совершенствования методов селекции популяционных сортов ржи. Обсуждаются возможности использования генетической коллекции ржи для решения ряда фундаментальных проблем генетики растений.

Экологическая генетика. 2018;16(2):40-49
pages 40-49 views

Методология экологической генетики

Клонирование промоторов генов PpKAR2 и PpPDI1 дрожжей Pichia pastoris, оценка их активности и эффективности использования для экспрессии гетерологичных генов

Цыганков М.А., Падкина М.В.

Аннотация

Дрожжи Pichia pastoris успешно используют в биотехнологии, с их помощью синтезированы различные соединения. Промоторы — ключевой фактор продуктивности системы экспрессии, так как они определяют уровень транскрипции гетерологичного гена. Целью нашей работы было изучение промоторных областей генов PpKAR2 и PpPDI1 и оценка возможности их применения для эффективной экспрессии гетерологичных генов. Активность промоторов оценивали с помощью системы на основе структурного гена кислой фосфатазы дрожжей Saccharomyces cerevisiae — PHO5. Чтобы выяснить влияние сверхпродукции собственного и гетерологичного белка на активность изучаемых промоторов, мы использовали штаммы-продуценты белка протеиндисульфидизомеразы P. pastoris и дельтазеина кукурузы. Для оценки эффективности применения изучаемых промоторов для экспрессии гетерологичных генов мы проэкспрессировали под их контролем ген, кодирующий интерферон-альфа16 человека. С помощью биоинформатических методов определены потенциальные сайты связывания транскрипционных факторов. В результате работы мы показали, что изучаемые промоторы оказалась слабее промотора гена AOX1, но повышают свою активность в ответ на продукцию гетерологичных белков и могут быть использованы для экспрессии гетерологичных генов в дрожжах P. pastoris.

Экологическая генетика. 2018;16(2):50-59
pages 50-59 views


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах