Том 11, № 2 (2013)
- Год: 2013
- Статей: 9
- URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/issue/view/136
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen112
Статьи
Изучение возможного горизонтального переноса генов от агробактерий к некоторым представителям семейства Solanaceae
Аннотация
Азвитие методов генетической инженерии растений ставит в современном обществе вопрос о безопасности трансгенных растений. Трансформация растений часто критикуется, как искусственный процесс, осуществляемый только в лаборатории. В то же время существуют данные о том, что некоторые представители рода Nicotiana и Linaria содержат в их геномах последовательности, гомологичные Т-ДНК из Agrobacterium rhizogenes. В настоящий момент остается открытым вопрос о том, существуют ли другие примеры горизонтального переноса генов от агробактерий к растениям среди представителей сем. Solanaceae, Plantaginaceae и других покрытосеменных растений. В данной работе проведен скрининг представителей четырех родов сем. Solanaceae на наличие последовательностей, гомологичных онкогенам rolB, rolC, ORF13, ORF14. У всех исследованных видов (кроме рода Nicotiana) случаев горизонтального переноса указанных генов не обнаружено. По-видимому, присутствие в геноме нетрансформированных растений последовательностей, гомологичных онкогенам A. rhizogenes характерно только для части видов рода Nicotiana.
Экологическая генетика. 2013;11(2):3-9
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Геном Linaria dalmatica содержит гомологгена rolC Agrobacterium rhizogenes
Аннотация
Горизонтальный перенос генов в ядерный геном растений — редкое явление. На сегодняшний день известны его примеры только у некоторых видов Nicotiana и Linaria. В геноме льнянки Linaria dalmatica (L.) Mill. впервые описана последовательность, на 94% сходная с таковой гена rolC Agrobacterium rhizogenes. Обсуждается значение гена rolC и Т-ДНК в эволюции льнянки, а также их роль в происхождении видов растений.
Экологическая генетика. 2013;11(2):10-15
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Изучение влияния полиморфизма гена LIG4 на уровень хромосомных аберраций в лимфоцитах человека при фоновом и сверхнормативном воздействии радона
Аннотация
Изучено влияние полиморфных вариантов rs1805388 (Thr9Ile) и rs1805389 (Ala3Val) гена LIG4 на уровень хромосомных аберраций в лимфоцитах периферической крови детей, проживающих и обучающихся в условиях фонового и сверхнормативного воздействия радона в ряде населенных пунктов Кемеровской области. Не выявлено статистически значимых различий величин цитогенетических показателей между представителями генотипических групп по маркеру rs1805388. В то же время в группе носителей варианта Val (маркер rs1805389) из второй когорты обнаружено достоверное повышение количества парных фрагментов по сравнению со значением, характерным для гомозигот Ala/Ala.
Экологическая генетика. 2013;11(2):16-21
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Генетическая предрасположенность к гельминтозам
Аннотация
Гельминты сопровождают человечество с ранних периодов его становления, между паразитом и человеком длительное время происходила ко-эволюция, именно гельминтам отводят важную селективную роль в эволюции генов иммунной системы человека. В статье представлены данные о генетическом вкладе в интенсивность и клиническое течение гельминтных инвазий в различных популяциях, в том числе результаты полногеномных исследований, и обсуждается концепция общности генов предрасположенности к гельминтозам и аллергическим болезням.
Экологическая генетика. 2013;11(2):22-33
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Исследование генетической предрасположенности к развитию артериальной гипертензии у детей Северо-Западного региона России
Аннотация
С помощью ПЦР/ПДРФ-анализа в группе детей с эссенциальной артериальной гипертензией и в контрольной группе детей Северо-Западного региона России были изучены частоты отдельных вариантов генов, участвующих в метаболизме арахидоновой кислоты CYP2J2, CYP4A11 и PTGIS. Кроме того, в обеих группах проведен анализ частот аллелей и генотипов по вариантам генов CDH13, MTHFR, CDKN2BAS, а также внегенного маркера rs11191548, которые были отобраны ранее на основе выявления связи с развитием артериальной гипертензии в GWAS исследованиях, проведенных в Европе и США в 2009 году. Ассоциация ни одного из изученных маркеров с развитием артериальной гипертензии у детей не подтвердилась.
Экологическая генетика. 2013;11(2):34-40
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Ассоциация полиморфизма гена рецептора витамина D с антропометрическими показателями в группе этнических коми
Аннотация
Изучалась ассоциация полиморфизмов гена рецептора витамина D (VDR) с концентрацией 25-OHD3 в крови, длиной (ДТ), массой (МТ) и составом тела у коми. Генотип FF ассоциирован с большей МТ (p = 0,002), но меньшей массой костной ткани (МКТ, p = 0,06), по сравнению с Ff. Носители генотипа BB меньше по ДТ, чем имеющиеBb-генотип; индивиды с bb вариантом отстают от генотипа Bb по МКТ (p = 0,025). Различий в содержании 25-OHD3 не выявлено. Результаты соответствуют данным, полученным в популяциях Северо-Западной Европы, но не в группах европеоидов субтропиков и тропиков или представителей других рас.
Экологическая генетика. 2013;11(2):41-49
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Соматические мутации в гене цитохрома b митохондриальной ДНК гиппокампа крыс линии Wistar
Аннотация
Одним из самых интересных результатов в системной биологии является открытие отрицательной корреляция между скоростью эволюции белков и уровнем экспрессии генов. Природа этой корреляции остается предметом оживленных дискуссий. В последнее время широкое распространение получила гипотеза о том, что ошибки трансляции с последующими ошибками укладки белков являются основным универсальным ограничителем скорости эволюции белков, так как приводят к преждевременной гибели клетки – гипотеза Драммонда–Вилке. Анализ соматических мутаций в митохондриях является перспективным подходом для проверки этой гипотезы. Соматические ткани содержат от нескольких десятков до нескольких тысяч митохондрий, причем на каждую митохондрию приходится достаточно высокое число копий митохондриальной ДНК (мтДНК), и, следовательно, повреждающие мутации не могут приводить к полной потере продукта определенного гена. Мы провели анализ соматических мутаций в гене цитохрома b мтДНК из гиппокампа крыс линии Wistar. Выявленное нами отсутствие очищающего отбора в исследованном кодирующем районе мтДНК не подтверждает гипотезу Драммонда–Вилке о сильном очищающем отборе, элиминирующем ошибки, возникающие в процессе синтеза белков. Этот результат в значительной степени ставит под сомнение реалистичность данной гипотезы.
Экологическая генетика. 2013;11(2):50-57
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
Биосинтез гекса- и пентамерных хитоолигосахаридов с помощью n-ацетилглюкозаминилтрансферазы ризобиальных бактерий
Аннотация
Хитоолигосахариды находят широкое практическое применение, что определяет интерес к изучению возможности биосинтеза этих соединений. В данной работе осуществлен синтез гекса-N-ацетилхитогексаозы и пента-N-ацетилхитопентаозы в клетках E. coli с использованием уникального фермента N-ацетилглюкозаминилтрансферазы клубеньковых бактерий Rhizobium sp. GRH2 и M. loti. При культивировании бактерий E. coli, экспрессирующих рекомбинантные ферменты, в присутствии субстрата N-ацетилглюкозамина, уровень синтеза хитоолигосахаридов достигал нескольких миллиграмм на литр жидкой культуры. Анализ полученных соединений с помощью методов ВЭЖХ и масс-спектрометрии подтвердил их соответствие стандартам.
Экологическая генетика. 2013;11(2):58-72
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)
![pages](/img/style/pages.png)
![views](/img/style/views.png)
![](/img/style/loadingSmall.gif)