Клиническая гетерогенность и молекулярно-генетические причины в когорте пациентов с нарушением формирования пола

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Обоснование. Нарушения формирования пола (НФП) относятся к группе редких врожденных аномалий, которые характеризуются несоответствием генетического, гонадного, фенотипического и психологического пола. Диагностика и планирование оказания помощи требуют комплексного подхода и должны осуществляться мультидисциплинарной группой специалистов.

Цель. Анализ частоты установления генетических причин при различных формах НФП путем применения оригинальной панели таргетного секвенирования с последующим установлением ассоциаций выявленных генетических вариантов с характером клинических проявлений.

Материалы и методы. Проведено молекулярно-генетическое исследование с помощью метода таргетного секвенирования нового поколения (NGS) на приборе MiSeq (платформа Illumina) с участием 28 пациентов с клинически верифицированным диагнозом НФП кариотипа 46, ХY. Для данного исследования разработали панель генов HaloPlex (Agilent), включающую в себя кодирующие области 80 генов-кандидатов, ассоциированных с НФП. Выявленные варианты затем проверили секвенированием по Сэнгеру. Биоинформационный анализ проводился с использованием баз OMIM, проекта «1000 геномов», ESP6500, Genome Aggregation Database projects. Генетические варианты классифицировали в соответствии с рекомендациями Американского колледжа медицинской генетики и геномики.

Результаты. Генетические варианты, оцененные как вероятно патогенные, патогенные и неизвестной значимости, выявили у 39% пациентов с НФП. В ассоциации с клиническим фенотипом нарушения половой дифференцировки их определили в качестве каузативных. В 82% случав выявлено не более одного вероятно патогенного варианта, в 18% – два, что свидетельствовало об олигогенном генезе НФП. К ранее не описанным отнесли 43% среди выявленных генетических вариантов. В ассоциации с клиническим фенотипом варианты в генах NR5A1 и MAP3K1 выявили у 4 пациентов с гонадным дисгенезом (по 2 случая). Мутации в гене AR были представлены полной резистентностью к андрогенам у 3 пациентов. Вариант в гене MAMLD1 имел место у пациента с проксимальной формой гипоспадии, в гене CYP17A1 – при редкой форме врожденной гиперплазии коры надпочечников – дефиците фермента 17α-гидроксилазы. У 2 пациентов обнаружили олигогенный генез НФП. У 1-го представлен мутациями в генах MAP3K1 и MAMLD1 с клиническим фенотипом промежностной гипоспадии, у 2-го – мутациями в AR и SEMA3A, что клинически было продемонстрировано парциальной формой резистентности к андрогенам и явилось основанием для смены пола воспитания на женский. Оба случая вариантов в гене стероидогенного фактора NR5A1 были представлены семейными формами.

Заключение. Включение в спектр обследования при НФП секвенирования нового поколения с использованием таргетных панелей генов улучшает понимание генетических основ нарушений половой дифференцировки, что в ряде случаев также оказывает влияние на коррекцию терапии и присвоение паспортного пола воспитания.

Об авторах

Ирина Леоровна Никитина

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: nikitina0901@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-3713-5350

д-р мед. наук, ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова»

Россия, Санкт-Петербург

Лейла Рамазановна Саракаева

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова» Минздрава России

Email: sarale723@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-2752-861X

мл. науч. сотр., ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова»

Россия, Санкт-Петербург

Анна Александровна Костарева

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова» Минздрава России

Email: nikitina0901@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9349-6257

д-р мед. наук, ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова»

Россия, Санкт-Петербург

Елена Константиновна Кудряшова

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова» Минздрава России

Email: aksi-lena@rambler.ru

канд. мед. наук, науч. сотр., ФГБУ «НМИЦ им. В.А. Алмазова»

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Lee PA, Houk CP, Ahmed SF, Hughes IA. International Consensus Conference on Intersex organized by the Lawson Wilkins Pediatric Endocrine Society and the European Society for Paediatric Endocrinology. Consensus statement on management of intersex disorders. International Consensus Conference on Intersex. Pediatrics. 2006;118(2):488-500. doi: 10.1542/peds.2006-0738
  2. Lee PA, Nordenström A, Houk CP, et al. Global Disorders of Sex Development Update since 2006: Perceptions, Approach and Care. Horm Res Paediatr. 2016;85(3):158-80. doi: 10.1159/000442975
  3. Kyriakou A, Lucas-Herald AK, McGowan R, et al. Disorders of sex development: advances in genetic diagnosis and challenges in management. Advances in Genomics and Genetics. 2015;5:165-7. doi: 10.2147/AGG.S53226
  4. Никитина И.Л. Старт пубертата – известное и новое. Артериальная гипертензия. 2013;19(3):227-36 [Nikitina IL. Start pubertata – izvestnoe i novoe. Arterialnaia gipertenziia. 2013;19(3):227-36 (in Russian)].
  5. Swaab DF, Garcia-Falueras A. Sexual differentiation of the human brain in relation to gender identity and sexual orientation. Funct Neurol. 2009;24(1):17-28.
  6. Diamond M, Sigmundson HK. Sex reassignment at birth. Long-term review and clinical implications. Arch Pediatr Adolesc Med. 1997;151(3):298-304.
  7. Fitzgerald PJ. A neurotransmitter system theory of sexual orientation. J Sex Med. 2008;5:746-8.
  8. Kim SW, Schenck CH, Grant JE, et al. Neurobiology of sexual desire. NeuroQuantology. 2013;11(2):332-59.
  9. Окулов А.Б. Становление педиатрической андрогеникологии как специальности. М.: Литерра, 2016 [Okulov AB. Formation of pediatric androgenicology as a specialty. Moscow: Literra, 2016 (in Russian)].
  10. Hiort O, Cools M, Springer A, et al. Addressing gaps in care of people with conditions affecting sex development and maturation. Nat Rev Endocrinol. 2019;15:615-22. doi: 10.1038/s41574-019-0238-y
  11. Jürgensen M, Rapp M, Döhnert U, et al. Assessing the health-related management of people with differences of sex development. Endocrine. 2021;71:675-80. doi: 10.1007/s12020-021-02627-y
  12. Richards S, Aziz N, Bale S, et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015;17(5):405-24. doi: 10.1038/gim.2015.30
  13. Database of Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP). Available at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/ Accessed: 15.12.2020.
  14. NHLBI Exome Sequencing Project (ESP). Available at: http://evs.gs.washington.edu/EVS/ Accessed: 20.03.2021.
  15. Exome Aggregation Consortium (ExAC). Available at: https://www.bioSTARs.org/p/195085/ Accessed: 20.03.2021.
  16. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM). Available at: http://www.omim.org/ Accessed: 16.03.2021.
  17. Fan Y, Zhang X, Wang L, et al. Diagnostic Application of Targeted Next-Generation Sequencing of 80 Genes Associated with Disorders of Sexual Development. Sci Rep. 2017;7:44536. doi: 10.1038/srep44536
  18. Dong Y, Yi Y, Yao H, et al. Targeted next-generation sequencing identification of mutations in patients with disorders of sex development. BMC Med Genet. 2016;17:23. doi: 10.1186/s12881-016-0286-2
  19. Eggers S, Sadedin S, van den Bergen JA, et al. Disorders of sex development: insights from targeted gene sequencing of a large international patient cohort. Genome Biol. 2016;17:243. doi: 10.1186/s13059-016-1105-y
  20. Buonocore F, Achermann JC. Human sex development: targeted technologies to improve diagnosis. Genome Biol. 2016;17:257. doi: 10.1186/s13059-016-1128-4
  21. Vilain E. Use of Next Generation Sequencing in Clinical Practice: The Example of Disorders/Differences of Sex Development. J Clin Res Pediatr Endocrinol. 2016;8(Suppl. 1):1-17.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Пациент 1. Молекулярно-генетическое исследование гена MAP3K1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (42KB)
3. Рис. 2. Пациент 2. Молекулярно-генетическое исследование гена MAMLD1, гена MAP3K1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (28KB)
4. Рис. 3. Пациент 2. Молекулярно-генетическое исследование гена MAMLD1, гена MAP3K1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (38KB)
5. Рис. 4. Пациент 3. Молекулярно-генетическое исследование гена MAMLD1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (37KB)
6. Рис. 5. Пациент 5. Молекулярно-генетическое исследование гена AR (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (44KB)
7. Рис. 6. Пациент 6. Молекулярно-генетическое исследование гена AR (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (28KB)
8. Рис. 7. Пациент 8. Молекулярно-генетическое исследование гена NR5A1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (29KB)
9. Рис. 8. Пациент 9. Молекулярно-генетическое исследование гена SEMA3A, гена AR (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (23KB)
10. Рис. 9. Пациент 9. Молекулярно-генетическое исследование гена SEMA3A, гена AR (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (28KB)
11. Рис. 10. Пациент 10. Молекулярно-генетическое исследование гена NR5A1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (26KB)
12. Рис. 11. Пациент 11. Молекулярно-генетическое исследование гена MAP3K1 (фрагмент секвенирования гена с выявленным вариантом).

Скачать (40KB)
13. Рис. 12. Ткань дифференцированного яичка, гиперплазия клеток Лейдига и Сертоли, сперматогенез отсутствует. Окраска гематоксилин-эозином, х100.

Скачать (539KB)

© ООО "Консилиум Медикум", 2021

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».