The use of H/D exchange for secondary structure characterization of supermetallized complexes of ubiquitin with cerium(III)


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

The approach of hydrogen/deuterium exchange combined with ultrahigh resolution mass spectrometry was applied for investigation of conformational changes of supermetallized ubiquitin ions with cerium(III) atoms. The dependencies of the hydrogen/deuterium exchange efficiency on the charge state of ubiquitin ion, the number of associated cerium atoms, as well as on the temperature were obtained. The reaction of hydrogen/deuterium exchange was performed directly in the ionization source according to previously described method. It was found that the number of exchanges is hardly altered under the addition of cerium atoms. This result indirectly suggests that the conformation of small protein supermetallized ions does not significantly change during electrospray ionization.

Об авторах

Yu. Kostyukevich

Skolkovo Institute of Science and Technology; Institute for Energy Problems of Chemical Physics; Emanuel Institute of Biochemical Physics

Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, ul. Novaya 100, Skolkovo, Moscow oblast, 143025; Leninskii pr. 38, k. 2, Moscow, 119334; ul. Kosygina 4, Moscow, 119334

P. Yacovlev

Moscow Institute of Physics and Technology

Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, Institutskii per. 9, Dolgoprudny, Moscow oblast, 141700

A. Kononikhin

Institute for Energy Problems of Chemical Physics; Moscow Institute of Physics and Technology; Kulakov Research Center for Obstetrics, Gynecology, and Perinatology

Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, Leninskii pr. 38, k. 2, Moscow, 119334; Institutskii per. 9, Dolgoprudny, Moscow oblast, 141700; ul. Oparina 4, Moscow, 117997

I. Popov

Emanuel Institute of Biochemical Physics; Moscow Institute of Physics and Technology

Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, ul. Kosygina 4, Moscow, 119334; Institutskii per. 9, Dolgoprudny, Moscow oblast, 141700

A. Bugrova

Emanuel Institute of Biochemical Physics; Kulakov Research Center for Obstetrics, Gynecology, and Perinatology

Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, ul. Kosygina 4, Moscow, 119334; ul. Oparina 4, Moscow, 117997

N. Starodubtzeva

Moscow Institute of Physics and Technology; Kulakov Research Center for Obstetrics, Gynecology, and Perinatology

Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, Institutskii per. 9, Dolgoprudny, Moscow oblast, 141700; ul. Oparina 4, Moscow, 117997

E. Nikolaev

Skolkovo Institute of Science and Technology; Institute for Energy Problems of Chemical Physics; Moscow Institute of Physics and Technology

Автор, ответственный за переписку.
Email: ennikolaev@rambler.ru
Россия, ul. Novaya 100, Skolkovo, Moscow oblast, 143025; Leninskii pr. 38, k. 2, Moscow, 119334; Institutskii per. 9, Dolgoprudny, Moscow oblast, 141700

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Ltd., 2016

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».