Электронная микроскопия электрофоретических фракций природных гуминовых кислот – ключ к разгадке их структурной организации
- Авторы: Трубецкая О.Е.1, Селиванова О.М.2, Рогачевский В.В.3, Трубецкой О.А.4
-
Учреждения:
- Филиал ФГБУН “Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН
- ФГБУН “Институт белка” РАН
- ФГБУН “Институт биофизики клетки” РАН
- ФГБУН “Институт фундаментальных проблем биологии” РАН
- Выпуск: Том 50, № 3 (2024)
- Страницы: 324-334
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/0132-3423/article/view/261485
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0132342324030118
- EDN: https://elibrary.ru/NYSDGM
- ID: 261485
Цитировать
Аннотация
Просвечивающая электронная микроскопия (ПЭМ) с негативным контрастированием препаратов раствором уранилацетата была использована для изучения морфологических различий между почвенными гуминовыми кислотами (ГК) и их фракциями A, B и C + D, полученными сочетанием препаративной эксклюзивной хроматографии низкого давления и аналитического электрофореза в полиакриламидном геле. Электрофоретическая подвижность фракций изменялась в порядке C + D > B > A. Анализ распределения различных морфологических элементов между фракциями показал, что крупные структуры типа везикулоподобных образований длиной 70–150 нм и шириной 30–80 нм с четкими краями были обнаружены исключительно во фракции A и занимали ~55% площади ПЭМ-изображений. С другой стороны, длинные фибриллы длиной 60–100 нм, шириной 4–6 нм и толщиной 2–3 нм, а также их пучки длиной >150 нм и диаметром 30–70 нм были идентифицированы только во фракции C + D и занимали ~59% площади ПЭМ-изображений. Более мелкие морфологические элементы, такие как точечные частицы диаметром 2–3 нм, кольцевые частицы диаметром 4–6 нм, червеподобные короткие частицы длиной 20–30 нм и сфероиды диаметром 10–30 нм, наблюдали во всех образцах, но в различном количестве. Значительные морфологические различия между фракциями могут быть объяснены их составом, установленным ранее с помощью комплекса физико-химических методов. Отношение Cаром(165–108 м.д.)/Cалиф(10–0 м.д.), или индекс ароматичности, рассчитанный на основании 13С-ЯМР, является одним из вероятных показателей формирования различных морфологических структур. Полученные результаты дают визуальное представление о морфологических особенностях почвенных ГК и фракций, доказывая их супрамолекулярную организацию.
Полный текст
Об авторах
О. Е. Трубецкая
Филиал ФГБУН “Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН
Автор, ответственный за переписку.
Email: olegi03@yahoo.com
Россия, 142290 Пущино, просп. Науки, 6
О. М. Селиванова
ФГБУН “Институт белка” РАН
Email: olegi03@yahoo.com
Россия, 142290 Пущино, просп. Науки, 4
В. В. Рогачевский
ФГБУН “Институт биофизики клетки” РАН
Email: olegi03@yahoo.com
Россия, 142290 Пущино, просп. Науки, 3
О. А. Трубецкой
ФГБУН “Институт фундаментальных проблем биологии” РАН
Email: olegi03@yahoo.com
Россия, 142290 Пущино, просп. Науки, 2
Список литературы
- Кононова М.М. // Органическое вещество почв. М.: Изд-во АН СССР, 1963. 314 с.
- Wershaw R.L. Evaluation of Conceptual Models of Natural Organic Matter (Humus) From a Consideration of the Chemical and Biochemical Processes of Humification, U.S. Geological Survey, Reston, VA. 2004. Scientific Investigations Report No. 2004-5121.
- Kleber M., Johnson M.G. // Adv. Agron. 2010. V. 106. Р. 77–142. https://doi.org/10.1016/S0065-2113(10)06003-7
- Stevenson F.J. // Humus chemistry – Genesis, Composition, Reactions (2nd ed.). New York, John Wiley. 1994. 496 p.
- Schmidt M.W.I., Torn M.S., Abiven S., Dittmar T., Guggenberger G., Janssens I.A., Kleber M., KӧgelKnabner I., Lehmann J., Manning D.A.C., Nannipieri P., Rasse D.P., Weiner S., Trumbore S.E. // Nature. 2011. V. 478. Р. 49–56. https://doi.org/10.1038/nature10386
- Zepp R.G., Schlotzhauer P.F., Sink R.M. // Environ. Sci. Technol. 1985. V. 19. P. 74–81.
- Христева Л.А., Пшеничный А.Е., Пивоваров Л.Р. // Гуминовые удобрения. Теория и практика их применения. Изд-во Харьковского ун-та, 1957. С. 109– 126.
- Canellas L.P., Piccolo A., Dobbss L.B., Spaccini R., Olivares F.L., Zandonadi D.B., Façanha A.R. // Chemosphere. 2010. V. 78. P. 457–466. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2009.10.018
- Martinez-Balmon D., Spassini R., Aguiar N.O., Novotny E.H., Olivares F.L., Canellas L.P. // J. Agric. Food Chem. 2014. V. 62. P. 11412–11419. https://doi.org/10.1021/jf504629c
- Boyle E.S., Guerriero N., Thiallet A., Vecchio, R.D., Blough N.V. // Environ. Sci. Technol. 2009. V. 43. P. 2262–2268. https://doi.org/10.1021/es803264g
- Alberts J.J., Takacs M. // Org. Geochem. 2004. V. 35. P. 243–256. https://doi.org/10.1016/j.orggeochem.2003.11.007
- Lehmann J., Kleber M. // Nature. 2015. V. 528. Р. 60–68. https://doi.org/10.1038/nature16069
- Kleber M., Lehmann J. // J. Environ. Qual. 2019. V. 48. P. 207–216. https://doi.org/10.2134/jeq2019.01.0036
- Haworth R.D. // Soil Sci. 1971. V. 111. Р. 71–79. https://doi.org/10.1097/00010694-197101000-00009
- Schulten H.R., Schnitzer M. // Soil Science. 1997. V. 162. P. 115–130.
- MacCarthy P. // Soil Sci. 2001. V. 166. Р. 738–751. https://doi.org/10.1097/00010694-200111000-00003
- Kleinhempel D. // Archives of Agronomy and Soil Science. 1970. V. 14. P. 3–14.
- Farmer V.C., Pisaniello D.L. // Nature. 1985. V. 313. P. 474–475. https://doi.org/10.1038/313474a0
- Shnitzer M., Neyroud A. // Fuel. 1975. V. 54. P. 17–19.
- Saiz-Jimenez C. // Environ. Sci. Technol. 1994. V. 28. P. 197–200.
- Schnitzer M. // Soil Sci. 1991. V. 151. P. 41–58.
- Стид Д.В., Этвуд Д.Л. // Супрамолекулярная химия (в 2 т.). М.: Академкнига, 2007.
- Wershaw R.L. // J. Contam. Hydrol. 1986. V. 1. P. 29–45. https://doi.org/10.1016/0169-7722(86)90005-7
- Piccolo A. // Soil Sci. 2001. V. 166. P. 810–832.
- Kingery W.L., Simpson A.J., Hayes M.H.B., Hayes M.A., Locke M.A., Hicks R.P. // Soil Sci. 2000. V. 165. P. 483–494.
- Simpson A.J., Kingery W.L., Hayes M.H., Spraul M., Humpfer E., Dvortsak P., Kerssebaum R., Hofmann M. // Naturwissenschaften. 2002. V. 89. P. 84–88.
- Piccolo A., Conte P., Trivellone E., Van Lagen B. // Environ. Sci. Tech. 2002. V. 36 Р. 76–84. https://doi.org/10.1021/es010981v
- Trubetskoj O.A., Trubetskaya O.E., Afanas’eva G.V., Reznikova O.I., Saiz-Jimenez C. // J. Chromatogr. A. 1997. V. 767. P. 285–292. https://doi.org/10.1016/S0021-9673(97)00019-8
- Trubetskaya O.E., Trubetskoj O.A., Afanas’eva G.V., Reznikova O.I., Markova L.F., Muranova T.A. // Environ. Int. 1998. V. 24. P. 573–581. https://doi.org/10.1016/S0160-4120(98)00036-1
- Saiz-Jimenez C., Hermosin B., Trubetskaya O., Reznikova O., Afanas’eva G., Trubetskoj O. // Geoderma. 2006. V. 131. P. 22–32. https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2005.03.001
- Richard C., Trubetskaya O.E., Trubetskoj O.A., Reznikova O.I., Afanas’eva G.V., Aguer J.-P., Guyot G. // Environ. Sci. Technol. 2004. V. 38. P. 2052–2057. https://doi.org/10.1021/es030049f
- Trubetskoj O.A., Hatcher P.G., Trubetskaya O.E. // Chem. Ecol. 2010. V. 26. P. 315–325. https://doi.org/10.1080/02757541003785825
- Trubetskoj O.A., Richard C., Guyot G., Voyard G., Trubetskaya O.E. // J. Chromatogr. A. 2012. V. 1243. P. 62–68. https://doi.org/10.1016/j.chroma.2012.04.043
- Трубецкой О.А., Трубецкая О.Е. // Почвоведение. 2017. № 9. С. 1057–1064. https://doi.org/10.7868/S0032180X17090088
- Orlov D.S., Ammosova Ya.M., Glebova G.I. // Geoderma. 1975. V. 13. P. 211–229. https://doi.org/10.1016/0016-7061(75)90019-1
- Stevenson I.L., Schnitzer M. // Soil Sci. 1982. V. 133. P. 179–185. https://doi.org/10.1097/00010694-198203000-00007
- Stevenson I.L., Schnitzer M. // Soil Sci. 1984. V. 138. P. 123–126.
- Kerner M., Hohenberg H., Ertl S., Reckermannk M., Spitzy A. // Nature. 2003. V. 422. P. 150–154. https://doi.org/10.1038/nature01469
- Dong V., Wan L., Cai J., Fang Q., Chi V, Chen G. // Sci. Rep. 2015. V. 5. P. 10037. https://doi.org/10.1038/srep10037
- Vasiliev V.D., Selivanova O.M., Baranov V.I., Spirin A.S. // FEBS Lett. 1983. V. 155. P. 167–172. https://doi.org/10.1016/0014-5793(83)80232-4
- Peschek J., Braun N., Franzmann T.M., Georgalis Y., Haslbeck M., Weinkauf S., Buchner J. // PNAS. 2009. V. 106. Р. 13272–13277. https://doi.org/10.1073/pnas.0902651106
- Selivanova O.M., Surin A.K., Marchenkov V.V., Dzhus U.F., Grigorashvili E.I., Suvorina M.Y., Glyakina A.V., Dovidchenko N.V., Galzitskaya O.V. // J. Alzheimers Dis. 2016. V. 54. P. 821–830. https://doi.org/10.3233/JAD-160405
- Galzitskaya O.V., Selivanova O.M. // J. Alzheimers Dis. 2017. V. 59. P. 785–795. https://doi.org/10.3233/JAD-170230
- Traina S.J., Novak J., Smeck N.E. // J. Environ. Qual. 1990. V. 19. P. 151−153. https://doi.org/10.2134/jeq1990.004724250019000 10023x
- Трубецкая О.Е., Трубецкой О.А. // Почвоведение. 2021. № 7. С. 862–870. https://doi.org/10.31857/S0032180X21060150