Drug Resistance of Different Mycobacterium tuberculosis Genotypes in the Omsk Oblast, Russia

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

A total of 397 Mycobacterium tuberculosis strains isolated from newly diagnosed patients with pulmonary tuberculosis in the Omsk region in 2019‒2020 were genotyped. The prevalence of strains of the Beijing genotype (70.8%) was established, in particular of two clusters of the modern sublineage — Central Asian/Russian (46.1%) and B0/W148 (19.1%). Strains of the ancient sublineage of the Beijing genotype were represented by clusters 1071-32 and 14717-15, totaling 4.8%. Compared with other genotypes, B0/W148 cluster and the ancient Beijing sublineage were associated with multidrug resistance (MDR): 93.4% and 94.7%, respectively (P < 0.0001). Among representatives of other genetic families (LAM, Ural, T, Haarlem), drug-sensitive strains predominated (75.0%). The circulation of MDR Beijing strains requires molecular epidemiological surveillance in view of their possible wider spread.

全文:

受限制的访问

作者简介

A. Vyazovaya

St. Petersburg Pasteur Institute

编辑信件的主要联系方式.
Email: elmtree2001@mail.ru
俄罗斯联邦, St. Petersburg, 197101

I. Kostyukova

Clinical Anti-tuberculosis Dispensary

Email: elmtree2001@mail.ru
俄罗斯联邦, Omsk, 644058

A. Gerasimova

St. Petersburg Pasteur Institute

Email: elmtree2001@mail.ru
俄罗斯联邦, St. Petersburg, 197101

D. Terentieva

St. Petersburg Pasteur Institute

Email: elmtree2001@mail.ru
俄罗斯联邦, St. Petersburg, 197101

O. Pasechnik

Omsk State Medical University

Email: elmtree2001@mail.ru
俄罗斯联邦, Omsk, 644099

I. Mokrousov

St. Petersburg Pasteur Institute

Email: elmtree2001@mail.ru
俄罗斯联邦, St. Petersburg, 197101

参考

  1. Kostyukova I., Pasechnik O., Mokrousov I. Epidemiology and drug resistance patterns of Mycobacterium tuberculosis in High-Burden Area in Western Siberia, Russia // Microorganisms. 2023. V. 11. Art. 425. https://doi.org/10.3390/microorganisms11020425
  2. Mokrousov I., Vyazovaya A., Pasechnik O., Gerasimova A., Dymova M., Chernyaeva E., Tatarintseva M., Stasenko V. Early ancient sublineages of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: unexpected clues from phylogenomics of the pathogen and human history // Clin. Microbiol. Infect. 2019. V. 25. Art. 1039.e1–1039.e6. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2018.11.024
  3. Mokrousov I., Vyazovaya A., Shitikov E., Badleeva M., Belopolskaya O., Bespiatykh D., Gerasimova A., Ioannidis P., Jiao W., Khromova P., Masharsky A., Naizabayeva D., Papaventsis D., Pasechnik O., Perdigão J., Rastogi N., Shen A., Sinkov V., Skiba Y., Solovieva N., Tafaj S., Valcheva V., Kostyukova I., Zhdanova S., Zhuravlev V., Ogarkov O. Insight into pathogenomics and phylogeography of hypervirulent and highly-lethal Mycobacterium tuberculosis strain cluster // BMC Infect. Dis. 2023. V. 23. Art. 426.
  4. https://doi.org/10.1186/s12879-023-08413-7
  5. Mokrousov I., Vyazovaya A., Sinkov V., Gerasimova A., Ioannidis P., Jiao W., Khromova P., Papaventsis D., Pasechnik O., Perdigão J., Rastogi N., Shen A., Skiba Y., Solovieva N., Suffys P., Tafaj S., Umpeleva T., Vakhrusheva D., Yarusova I., Zhdanova S., Zhuravlev V., Ogarkov O. Practical approach to detection and surveillance of emerging highly resistant Mycobacterium tuberculosis Beijing 1071-32-cluster // Sci. Rep. 2021. V. 11. Art. 21392. https://doi.org/10.1038/s41598-021-00890-7
  6. Pasechnik O., Vyazovaya A., Vitriv S., Tatarintseva M., Blokh A., Stasenko V., Mokrousov I. Major genotype families and epidemic clones of Mycobacterium tuberculosis in Omsk region, Western Siberia, Russia, marked by a high burden of tuberculosis-HIVcoinfection // Tuberculosis (Edinb). 2018. V. 108. P. 163‒168. https://doi.org/10.1016/j.tube.2017.12.003
  7. Roelens M., Battista Migliori G., Rozanova L., Estill J., Campbell J.R., Cegielski J.P., Tiberi S., Palmero D., Fox G.J., Guglielmetti L., Sotgiu G., Brust J.C.M., Bang D., Lienhardt C., Lange C., Menzies D., Keiser O., Raviglione M. Evidence-based definition for extensively drug-resistant tuberculosis // Am.J. Respir. Crit. Care Med. 2021. V. 204. P. 713‒722.
  8. https://doi.org/10.1164/rccm.202009-3527OC
  9. van Embden J., Cave M., Crawford J., Dale J.W., Eisenach K.D., Gicquel B., Hermans P., Martin C., McAdam R., Shinnick T.M. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology // J. Clin. Microbiol. 1993. V. 31. P. 406‒409.
  10. Vyazovaya A., Gerasimova A., Mudarisova R., Terentieva D., Solovieva N., Zhuravlev V., Mokrousov I. Genetic diversity and primary drug resistance of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains in Northwestern Russia // Microorganisms. 2023. V. 11. Art. 255. https://doi.org/10.3390/microorganisms11020255
  11. Zhdanova S., Mokrousov I., Orlova E., Sinkov V., Ogarkov O. Transborder molecular analysis of drug-resistant tuberculosis in Mongolia and Eastern Siberia, Russia // Transbound. Emerg. Dis. 2022. V. 69. Art. e1800-e1814. https://doi.org/10.1111/tbed.14515

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».