Лекарственная устойчивость различных генотипов Mycobacterium tuberculosis в Омской области России

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Проведено генотипирование 397 штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от впервые выявленных больных туберкулезом легких в Омской области в 2019‒2020 гг. Установлено превалирование штаммов генотипа Beijing (70.8%), в частности, двух кластеров современной сублинии — Central Asian/Russian (46.1%) и B0/W148 (19.1%). Штаммы древней сублинии генотипа Beijing были представлены кластерами 1071-32 и 14717-15, суммарно составляя 4.8%. В сравнении с другими генотипами, штаммы B0/W148-кластера и древней сублинии Beijing чаще характеризовались множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ): 93.4 и 94.7%, соответственно, (P < 0.0001). Среди представителей других генетических семейств (LAM, Ural, T, Haarlem) преобладали лекарственно-чувствительные штаммы (75.0%). Циркуляция МЛУ-штаммов Beijing требует молекулярно-эпидемиологического надзора за их возможным более широким распространением.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. А. Вязовая

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Автор, ответственный за переписку.
Email: elmtree2001@mail.ru
Россия, Санкт-Петербург, 197101

И. В. Костюкова

Клинический противотуберкулёзный диспансер

Email: elmtree2001@mail.ru
Россия, Омск, 644058

А. А. Герасимова

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: elmtree2001@mail.ru
Россия, Санкт-Петербург, 197101

Д. Р. Терентьева

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: elmtree2001@mail.ru
Россия, Санкт-Петербург, 197101

О. А. Пасечник

Омский государственный медицинский университет

Email: elmtree2001@mail.ru
Россия, Омск, 644099

И. В. Мокроусов

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: elmtree2001@mail.ru
Россия, Санкт-Петербург, 197101

Список литературы

  1. Kostyukova I., Pasechnik O., Mokrousov I. Epidemiology and drug resistance patterns of Mycobacterium tuberculosis in High-Burden Area in Western Siberia, Russia // Microorganisms. 2023. V. 11. Art. 425. https://doi.org/10.3390/microorganisms11020425
  2. Mokrousov I., Vyazovaya A., Pasechnik O., Gerasimova A., Dymova M., Chernyaeva E., Tatarintseva M., Stasenko V. Early ancient sublineages of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: unexpected clues from phylogenomics of the pathogen and human history // Clin. Microbiol. Infect. 2019. V. 25. Art. 1039.e1–1039.e6. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2018.11.024
  3. Mokrousov I., Vyazovaya A., Shitikov E., Badleeva M., Belopolskaya O., Bespiatykh D., Gerasimova A., Ioannidis P., Jiao W., Khromova P., Masharsky A., Naizabayeva D., Papaventsis D., Pasechnik O., Perdigão J., Rastogi N., Shen A., Sinkov V., Skiba Y., Solovieva N., Tafaj S., Valcheva V., Kostyukova I., Zhdanova S., Zhuravlev V., Ogarkov O. Insight into pathogenomics and phylogeography of hypervirulent and highly-lethal Mycobacterium tuberculosis strain cluster // BMC Infect. Dis. 2023. V. 23. Art. 426.
  4. https://doi.org/10.1186/s12879-023-08413-7
  5. Mokrousov I., Vyazovaya A., Sinkov V., Gerasimova A., Ioannidis P., Jiao W., Khromova P., Papaventsis D., Pasechnik O., Perdigão J., Rastogi N., Shen A., Skiba Y., Solovieva N., Suffys P., Tafaj S., Umpeleva T., Vakhrusheva D., Yarusova I., Zhdanova S., Zhuravlev V., Ogarkov O. Practical approach to detection and surveillance of emerging highly resistant Mycobacterium tuberculosis Beijing 1071-32-cluster // Sci. Rep. 2021. V. 11. Art. 21392. https://doi.org/10.1038/s41598-021-00890-7
  6. Pasechnik O., Vyazovaya A., Vitriv S., Tatarintseva M., Blokh A., Stasenko V., Mokrousov I. Major genotype families and epidemic clones of Mycobacterium tuberculosis in Omsk region, Western Siberia, Russia, marked by a high burden of tuberculosis-HIVcoinfection // Tuberculosis (Edinb). 2018. V. 108. P. 163‒168. https://doi.org/10.1016/j.tube.2017.12.003
  7. Roelens M., Battista Migliori G., Rozanova L., Estill J., Campbell J.R., Cegielski J.P., Tiberi S., Palmero D., Fox G.J., Guglielmetti L., Sotgiu G., Brust J.C.M., Bang D., Lienhardt C., Lange C., Menzies D., Keiser O., Raviglione M. Evidence-based definition for extensively drug-resistant tuberculosis // Am.J. Respir. Crit. Care Med. 2021. V. 204. P. 713‒722.
  8. https://doi.org/10.1164/rccm.202009-3527OC
  9. van Embden J., Cave M., Crawford J., Dale J.W., Eisenach K.D., Gicquel B., Hermans P., Martin C., McAdam R., Shinnick T.M. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology // J. Clin. Microbiol. 1993. V. 31. P. 406‒409.
  10. Vyazovaya A., Gerasimova A., Mudarisova R., Terentieva D., Solovieva N., Zhuravlev V., Mokrousov I. Genetic diversity and primary drug resistance of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype strains in Northwestern Russia // Microorganisms. 2023. V. 11. Art. 255. https://doi.org/10.3390/microorganisms11020255
  11. Zhdanova S., Mokrousov I., Orlova E., Sinkov V., Ogarkov O. Transborder molecular analysis of drug-resistant tuberculosis in Mongolia and Eastern Siberia, Russia // Transbound. Emerg. Dis. 2022. V. 69. Art. e1800-e1814. https://doi.org/10.1111/tbed.14515

© Российская академия наук, 2024

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах