Том 15, № 4 (2017)
- Год: 2017
- Статей: 7
- URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/issue/view/426
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen154
Генетические основы эволюции экосистем
Изучение биохимической функции рецептор-подобных киназ гороха sym10, sym37 и k1, необходимых для развития бобово-ризобиального симбиоза
Аннотация
В развитии бобово-ризобиального симбиоза основную роль играют Nod-факторы, выделяемые бактериями порядка Rhizobiales. Nod-факторы действуют в низких концентрациях, а их биологическая активность зависит от структуры, что предполагает наличие у растений специфичных рецепторов. Для гороха вероятными кандидатами на роль рецепторов являются LysM-содержащие рецепторные киназы — Sym10, Sym37 и K1, необходимость которых для развития симбиоза была показана при анализе мутантов. Однако способность связываться с Nod-фактором не была изучена, что определяется сложностью их получения в необходимом количестве для анализа. В этой работе исследована возможность синтеза рецепторных белков гороха в бактериях и использования метода поверхностного плазмонного резонанса для анализа связывания с лигандом.
Экологическая генетика человека
Полиморфизм генов карнитин-ацилтрансфераз у коренного населения Cибири
Аннотация
Полиморфизм экзомов служит богатым источником информации о структуре и функционировании белков и метаболических путей. Традиционная диета коренного населения Северо-Востока Азии (эскимосов, чукчей и коряков) обогащена жирными кислотами, что предполагает наличие у северных аборигенов адаптивных перестроек системы метаболизма липидов. Карнитин-ацилтрансферазы являются важнейшей группой ферментов, метаболизирующих жирные кислоты. Для исследования адаптивных изменений генов, кодирующих карнитин-ацилтрансферазы, нами проведен скрининг полиморфизма в экзонах генов CPT1A, CPT1B, CPT1C, CPT2, CRAT и CROT в различных популяциях коренного населения Сибири. В экзонах пяти генов (за исключением CROT) выявлено 16 несинонимичных замен. Из них три замены обнаружены с высокими частотами в популяциях Северо-Восточной Азии (у эскимосов, чукчей и коряков): в локусах rs80356779 гена CPT1A (замена P479L) и rs763273578 гена CPT1C (T740A), а также новый вариант полиморфизма в позиции 131866581 хромосомы 9 гена CRAT (S99F). Анализ экзомов показал, что среди коренного населения Северо-Востока Азии распространены новые несинонимичные замены с высокими индексами патогенности, появившиеся в генах энергетического метаболизма и липидного обмена (гены GK2, ABHD6, NCOA2, OSPL3, LRP10, TTN, PTTG2). Предполагается, что новые варианты несинонимичного полиморфизма возникли в результате адаптации коренного населения к экстремальным условиям природной среды и специфической «арктической» диете аборигенов Крайнего Севера.
Ген-средовые взаимодействия как основа формирования здоровья
Аннотация
В обзоре обсуждается проблема значимости взаимодействия генетических и средовых факторов для реализации генетической программы индивидов и определения их здоровья. Приведены сведения о важности некоторых нутриентов (витаминов, биоэлементов) для формирования здоровья, о значении генетических факторов в поддержании гомеостаза биологически активных веществ, об ассоциированности полиморфных вариантов генов, вовлеченных в метаболизм нутриентов, с патологическими состояниями, а также примеры модификаций эффектов вариантов генов на риск развития заболеваний многофакторной природы различными средовыми факторами (биоэлементами и другими компонентами диеты, неблагоприятными факторами среды, лекарственными препаратами и др.).
Генетическая токсикология
Цитогенетические эффекты сверхнормативного воздействия радона в зависимости от индивидуальной дозы активных рибосомных генов
Аннотация
Обследованы 345 воспитанников школы-интерната г. Таштагола (Кемеровская область, Россия), подвергающихся воздействию сверхнормативных доз радона в жилых и учебных помещениях (468 Бк/м3). Выявлено статистически значимое увеличение уровня аберраций хромосом в данной группе (р = 0,00001) по сравнению с детьми Кемеровской области, проживающими в благополучных по радиационным показателям условиях (n = 233). С помощью Ag-окраски ядрышкообразующих районов хромосом и полуколичественного цитогенетического метода оценки проанализирована доза активных кластеров рибосомных генов (АкРГ) в исследуемых группах. Установлено, что уровень хромосомных нарушений у детей Таштагола был статистически значимо выше у носителей средней дозы АкРГ по сравнению с обладателями низкой дозы (4,27 ± 0,22 против 3,24 ± 0,29 %, р = 0,003). Полученные результаты свидетельствуют о значимом вкладе индивидуальных особенностей рибосомных генов в формирование генотоксических эффектов воздействия высоких доз радона.
Система генетического образования
Современные методы оценки таксономической принадлежности семей пчел
Аннотация
В ходе эволюции аллопатрически формировалось 30 подвидов медоносной пчелы Apis mellifera L., которые распространены по всей территории Африки, Европы и Западной Азии. Темная лесная пчела Apis mellifera mellifera — единственный и наиболее ценный подвид для стран Северной и Западной Европы, приспособленный к продуктивной жизнедеятельности в резко континентальном климате Евразии. В последние 100 лет естественная географическая изоляция подвидов была нарушена в результате деятельности человека. Массовые перемещения семей пчел за пределы границ их ареалов создали угрозу потери чистопородности аборигенных генофондов подвидов в результате гибридизации. Сохранение генофонда подвидов возможно лишь при контроле транспортировок семей пчел с использованием методов идентификации таксономической принадлежности. На данный момент разработаны десятки методов идентификации таксономической принадлежности семей пчел, которые основываются на вариабельности частей тела, аллозимных локусов, митохондриальной ДНК, микросателлитных локусов ядерной ДНК, сайтов однонуклеотидных замен (SNP). Вариабельность микросателлитных локусов и полиморфизм сайтов однонуклеотидных замен показали наибольшую информативность при идентификации таксономической принадлежности семей пчел.
Роль архей в происхождении эукариот
Аннотация
В обзоре с позиций филогеномики рассмотрена ключевая роль определенной эволюционной ветви архей в происхождении клетки эукариот. Геномы недавно открытых некультивируемых протеоархей Lokiarchaea и Asgard-группы содержат большие наборы генов, сходных с эукариотическими. Это позволило предположить, что родственные таким группам древние археи могли участвовать в симбиотическом слиянии с бактериями — предшественниками митохондрий. В рамках эндосимбиотической гипотезы эукариогенеза обсуждены открытые вопросы о свойствах LECA (так называемого последнего эукариотического общего предка).
Системная биология в экологической генетике
Влияние нефтезагрязнения на микробоценоз почв, прилегающих к нефтехранилищу
Аннотация
Целью работы являлось изучение действия углеводородов на бактериальный и грибной ценозы дерново-подзолистой почвы на территории, примыкающей к нефтехранилищу в поселке Малые Колпаны Ленинградской области. Были использованы методы высокопроизводительного секвенирования ампликонных библиотек гена 16SрРНК для анализа таксономического состава и структуры бактериоценоза и метод прямого микроскопирования Демкиной – Мирчинк для определения длины грибного мицелия и численности спор. Показано, что таксономические и структурные изменения в бактериальном сообществе привели к доминированию родов, содержащих многочисленные виды-нефтедеструкторы. Установлено, что на исследованной территории основная роль в разложении нефти принадлежит прокариотам, относящимся к родам Pseudoxanthomonas, Methylobacterium и Nocardioides. Микоценоз проявил к нефтезагрязнению высокую чувствительность и низкую адаптивность.