Инфекция и иммунитет

Стрептококковые инфекции группы А доминируют среди инвазивных стрептококковых инфекций. Основной их возбудитель, Streptococcus pyogenes, достаточно устойчив во внешней среде и имеет большое число факторов патогенности, кодируемых хромосомой или передающихся путем горизонтального переноса посредством бактериофагов. Разные генетические варианты S. pyogenes могут иметь различный набор факторов патогенности, который может меняться в процессе эволюции возбудителя и определяет вирулентность конкретного изолята. При коротком инкубационном периоде заболевание может протекать с развитием инвазивной инфекции и синдрома токсического шока с неблагоприятным исходом в течение 7 дней от начала заболевания. Целью этой статьи является повышение настороженности врачей в отношении стрептококковой инфекции: своевременного распознавания и проведения ранней лабораторной диагностики, от чего напрямую зависят своевременное начало адекватного лечения и исход заболевания. В статье представлены данные анализа заболеваемости стрептококковой инфекцией в России и в мире, обзор методов лабораторной диагностики и генетического типирования возбудителя. Максимальное число случаев стрептококковой септицемии в России было зарегистрировано в 2022 г., что составило 69% всех случаев за время наблюдения с 2014 по 2022 г. Также в статье приводится описание двух клинических случаев молниеносного течения инвазивной стрептококковой инфекции группы A у детей, имевших симптомы ОРВИ в дебюте заболевания. Представлены результаты различных методов лабораторной диагностики, подтверждающих диагноз. Выполнена генетическая характеристика изолятов микроорганизмов методом глубокого секвенирования ДНК. В биологическом материале пациентов (включая аутопсийный в одном случае) идентифицирован S. pyogenes сиквенс-тип ST-28, серотипы emm-1.25 и emm-1.0. Возрастающая значимость инвазивной стрептококковой инфекции для здравоохранения России и других стран может быть связана с возможной сменой доминирующих генетических вариантов S. pyogenes. В связи с этим необходимы изучение циркулирующих генотипов S. pyogenes на постоянной основе в рамках надзора за стрептококковой инфекцией и разработка вакцины для специфической профилактики.

Классическая реассортация в развивающихся куриных эмбрионах является хорошо отработанной методикой для получения штаммов живой гриппозной вакцины. Сформированные естественным путем реассортантные вакцинные штаммы характеризуются высокой репродуктивностью, генетически стабильными признаками температурочувствительности и холодоустойчивости, полностью соответствующими характеристикам донора аттенуации, участвующего в скрещивании с эпидемическим вирусом. Наряду с антигенной актуальностью, естественная реассортация гарантирует аттенуацию вакцинных штаммов, хорошую репродуктивность в клетках верхних дыхательных путей и неспособность к репродукции в нижних отделах респираторного тракта. Однако при классической реассортации скорость и эффективность получения вакцинных реассортантов в существенной степени зависят от уникальных свойств эпидемического вируса, и поэтому не могут быть стабильными. Возможности генно-инженерных технологий привлекают тем, что позволяют получать вакцинные реассортанты быстро и эффективно, снижают вероятность появления спонтанных мутаций, позволяют работать с высокопатогенными вирусами, однако вакцинный штамм лишается преимуществ естественного отбора, при котором происходит селекция наиболее жизнеспособных клонов. В настоящем исследовании представлены результаты сравнительной оценки штаммов живой гриппозной вакцины А(Н3N2), полученных параллельно методами классической реассортации и генно-инженерной сборки по критериям, подтверждающим наследование вакцинными штаммами необходимых свойств, гарантирующих их безвредность и высокую репродуктивность в куриных эмбрионах. Реассортантные штаммы для живой гриппозной вакцины, полученные обоими методами, сохраняли все аттенуирующие мутации, унаследованные от донора аттенуации, были высокорепродуктивными при оптимальной температуре, их температурочувствительность соответствовала этому признаку у донора аттенуации. Однако у штаммов, полученных методом обратной генетики, наблюдалась частичная утрата холодоустойчивости по сравнению с холодоустойчивостью донора аттенуации и реассортантов из классического скрещивания. Снижение холодоустойчивости может негативно повлиять на эффективность вакцины. Важно, что за несколько дополнительных пассажей в куриных эмбрионах при пониженной температуре холодоустойчивость вакцинного реассортантного штамма, собранного генно-инженерным путем, удалось повысить. Из этого следует, что холодоустойчивость вирусов является фенотипическим признаком, степень проявления которого зависит от температурных условий культивирования вируса. При конструировании реассортантов методами обратной генетики отсутствует необходимый селективный фактор — пониженная температура инкубации. Чтобы холодоустойчивый фенотип реализовался в полной мере, необходимо дополнительное культивирование генно-инженерных реассортантов при пониженной температуре. Таким образом, метод обратной генетики с использованием плазмидной технологии дает возможность эффективной подготовки реассортантных штаммов для живой гриппозной вакцины. Важным этапом получения вакцинных штаммов с помощью генно-инженерных приемов должен быть контроль их холодоадаптированного фенотипа и, при необходимости, оптимизация холодоустойчивого фенотипа дополнительными пассажами при пониженной температуре.

Введение. Инвазия Opisthorchis felineus в организме человека вызывает воспалительные и дискинетические нарушения желудочно-кишечного тракта, сопровождающиеся изменениями фенотипических особенностей микробиоты толстой кишки. Цель исследования — изучение влияния фенотипических характеристик изолятов Escherichia coli в отношении бактерий Klebsiella spp., выделенных из содержимого толстой кишки пациентов с диагнозом «Описторхоз», на их антагонистическую активность. Материалы и методы. Изучены фенотипические свойства 54 изолятов E. coli и 8 — бактерий рода Klebsiella, выделенных из содержимого толстой кишки пациентов с диагнозом «Описторхоз». Идентификация изолятов, анализ протеомных профилей выполнен с использованием программного обеспечения Maldi BioTyper 3.0. Проведено 204 исследования антагонистической активности изолятов E. coli с различными свойствами в отношении Klebsiella spp. методом совместного культивирования. Изоляты E. coli и Klebsiella spp. изучены методом полногеномного секвенирования. Результаты. Бактерии E. coli с типичными фенотипическими характеристиками проявляли достоверно более выраженную антагонистическую активность в отношении Klebsiella spp. Установлен статистически достоверно более высокий уровень антагонистической активности в отношении бактерий K. oxytoca, чем при взаимодействии со штаммами K. pneumoniae. Протеомные профили штаммов разделились на кластеры в зависимости от уровня антагонистической активности. Молекулярное серотипирование E. coli по О- и H-антигенам в 60,0% случаев выявило гены энтеротоксигенных, энтероинвазивных и внекишечных патогенов. Определены штаммы, обладающие максимально высокими показателями индекса антагонистической активности, являющиеся носителями генов энтеротоксигенных E. coli сиквенс-серотипов О6:Н1 и О6:Н5. Геном этих штаммов включал наибольшее количество комплексов генов вирулентности: адгезинов, инвазинов, токсинов, бактериоцинов. Мультилокусное сиквенс-типирование и сиквенс-серотипирование штаммов E. coli и K. pneumoniae установило их гетерогенность, изоляты K. oxytoca определены как ST242 и ST176. Для всех штаммов была характерна гомология маркеров антибиотикорезистентности (oqxA, oqxB, fosA) и разнообразие вариантов генов резистентности к бета-лактамным антибиотикам. Заключение. Установлено, что изоляты E. coli, обладающие типичными фенотипическими характеристиками и являющиеся носителями комплексов генов вирулентности, проявляли достоверно более выраженную антагонистическую активность в отношении Klebsiella spp., изолированных из содержимого толстой кишки пациентов с диагнозом «Описторхоз».

Введение. В настоящее время остаются малоизученными особенности продукции цитокинов в культурах мононуклеарных клеток больных иксодовым клещевым боррелиозом в зависимости от клинических данных. Целью исследования являлось изучение особенностей базальной и липополисахарид-индуцированной цитокин-секреторной активности мононуклеарных лейкоцитов периферической крови больных с острым течением эритемной формы иксодового клещевого боррелиоза в зависимости от клинических параметров. Материалы и методы. Группы из 22 и 12 больных с диагнозами легкой или средней степени тяжести изолированной и смешанной с клещевым энцефалитом эритемной формы иксодового клещевого боррелиоза были обследованы дважды — в первую неделю болезни и в динамике через 14 дней после терапии. Контрольная группа включала 17 здоровых доноров. С помощью иммуноферментного анализа в супернатантах культур мононуклеарных лейкоцитов были исследованы базальные и липополисахарид-индуцированные уровни продукции интерлейкинов (IL)-6, IL-10 и фактора некроза опухоли (TNF)-α. Для статистического анализа использовали U-критерии Манна–Уитни, критерий Вилкоксона и ранговую корреляцию Спирмена. Результаты. Группа пациентов со среднетяжелым течением боррелиоза клинически отличалась более выраженными проявлениями лихорадочно-интоксикационного синдрома. В клеточных культурах больных боррелиозом со среднетяжелым течением в начале заболевания уровни базальной секреции TNFα, IL-6 и IL-10 были существенно повышены как по сравнению с пациентами с легким течением, так и со здоровыми донорами. В динамике после антибиотикотерапии уровни спонтанной секреции TNFα и IL-10 имели тенденцию к снижению. В первую неделю болезни добавление липополисахарида в культуры клеток больных со среднетяжелым течением приводило к значительному подавлению продукции TNFα и повышению секреции IL-10, как по сравнению с пациентами с легким течением, так и со здоровыми донорами. Липополисахарид-индуцированная секреция IL-6 в супернатантах культур этих больных была существенно ниже, чем у пациентов с легким течением. В динамике уровень индуцированной продукции TNFα у больных со среднетяжелым течением повышался, превосходя значения в контрольной группе. У больных выявлены прямые корреляционные зависимости между базальной секрецией IL-6 и TNFα в клеточных культурах и максимальной температурой тела или концентрацией С-реактивного белка в сыворотке крови. Уровни концентрации TNFα в пробах с липополисахаридом имели обратные зависимости от высоты лихорадки или от уровней секреции IL-10. Выводы. Показано, что уровни базальной секреции TNFα, IL-6 и IL-10 в клеточных культурах больных острым иксодовым клещевым боррелиозом повышались с увеличением тяжести течения заболевания. Подавление липополисахарид-индуцированной продукции TNFα в культурах клеток больных со среднетяжелым течением возможно связано с эффектами регуляторного цитокина IL-10.

Использование длительной многокомпонентной антибиотикотерапии является самым эффективным способом лечения туберкулеза (ТБ). Однако мало известно о влиянии данной химиотерапии на кишечную микрофлору человека. Целью данного исследования является изучение влияния длительной многокомпонентной антибиотикотерапии на состав и метаболический профиль кишечного микробиома больных ТБ. В исследовании использовались образцы ДНК фекалий, полученные от 23 больных туберкулезом легких. От каждого пациента было получено две пробы биоматериала: до начала лечения и через два месяца после прохождения интенсивной фазы химиотерапии. Сравнительный анализ метагеномных данных секвенирования микробиома кишечника больных ТБ показал, что длительный многокомпонентный режим лечения ТБ не нарушает общего разнообразия микробиома кишечника, однако оказывает влияние на бактериальный состав и метаболический профиль микробиома. На фоне приема противотуберкулезных препаратов (ПТП) первого ряда (изониазид, рифампицин, этамбутол, пиразинамид) наблюдается статистически значимое увеличение представителей филума Actinobacteria. Парное сравнение метагеномных данных пациентов выявило 28 дифференциально представленных таксонов бактерий, из которых три вида Bacteroides cellulosilyticus, Enterocloster aldensis, Clostridium spiroforme преобладали в микробиоме больных ТБ после прохождения химиотерапии, тогда как 25 видов превалировали в группе больных до лечения (Bifidobacterium catenulatum, Enterococcus faecium, Bacteroides salyersiae, Bacteroides xylanisolvens, Bacteroides eggerthii, Lachnospira eligens, Akkermansia muciniphila, Ruminococcus lactaris и др.) (p < 0,05). Метаболический профиль микробиома кишечника характеризовался усилением метаболических процессов, направленных на рост и деление микробных клеток. Железо является главным лимитирующим фактором роста и размножения. Кроме того, важно отметить превалирование гликолиза и ферментации лактата как основных способов получения энергии кишечной микробиотой.

Целью нашего исследования было оценить распространенность скрытой формы хронического гепатита В у доноров крови в Санкт-Петербурге, а также охарактеризовать выявленные изоляты вируса. В работе использованы 2800 образцов плазмы крови, полученные в 2019 г. от доноров крови, проживающих в Санкт-Петербурге. Методом ИФА определяли HBsAg, anti-HBs IgG, anti-HBcore IgG. ДНК ВГВ выявляли методом гнездовой ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени» по трем мишеням, позволяющим определять ДНК вируса при низкой вирусной нагрузке, в том числе при HBsAg-негативном хроническом гепатите В. Серологические маркеры гепатита В выявили у 69,43% обследованных, HBsAg обнаружен у 0,43% лиц, причем все они сдавали кровь впервые. Показано достоверное превышение встречаемости антител анти-HBcore IgG среди первичных доноров (15,1%) по сравнению с повторными/регулярными (7,48%). Встречаемость ДНК вируса в группе составила 3,14%, в том числе 2,71% случаев, представляющих собой HBsAg-негативный ХГВ. На основании филогенетического анализа 88 изолятов определены субгенотипы ВГВ в следующих соотношениях: D1 и D2 — по 40,91%, D3 и A2 — по 9,09%. При определении серологического подтипа обнаруженных изолятов преобладал серотип ayw3 (52,27%) по сравнению с ayw2 (46,59%) и adw2 (10,23%). Мутации лекарственной устойчивости, включая компенсаторные, выявлены у шести обследованных (6,82%). Во всех изолятах генотипа D определены множественные аминокислотные замены в регионах RT, SHB, MHB, LHB, Core, мутации preCore региона выявлены у 21,59% образцов. В MHR области генома ВГВ генотипа D определены 26 позиций, в которых происходили аминокислотные замены, причем у всех изолятов показаны модификации в положениях 113, 114, 131, 134, 159, 161, 168, у 76 — в положении 122, у 68 — в положении 127, у 36 — в положении 118, у 24 — в положении 128. У изолятов ВГВ A2 определены мутации T113S, S143T, Y161F. В preCore регионе девяти изолятов выявлен полиморфизм, включающий стоп-кодон W28*W, в этой же позиции у пяти изолятов показана замена W28S, у еще одного образца определен вариант W28*S. Высокая частота встречаемости HBsAg-негативных случаев ХГВ среди доноров крови, а также преобладание изолятов ВГВ, несущих одновременно мутации, приводящие к диагностической неудаче тестов на HBsAg и профилактической неэффективности иммуноглобулина или вакцин и реактивации вируса, а также мутации, способствующие прогрессированию заболевания, очевидно несет угрозу здравоохранению и нуждается в дальнейшем изучении.

Введение. Диарейные заболевания — глобальная проблема общественного здравоохранения и причина 15% летальных исходов у детей в возрасте до пяти лет, из которых около 80% приходятся на регионы стран Африки и Юго-Восточной Азии. По результатам Глобального многоцентрового исследования (GEMES), проведенного в ряде стран Африки, установлено, что одним из ведущих патогенов высокого риска смерти пациентов в возрасте до пяти лет являются диареегенные E. coli (DEC). В последние десятилетия резистентность микроорганизмов к антибиотикам приобрела глобальный характер. В Гвинейской Республике существует острая необходимость в проведении широкомасштабных исследований по изучению распространения DEC и их резистентности к антибиотикам.

Цель исследования: оценить структуру эшерихиозов и изучить чувствительность к антибиотикам штаммов диареегенных E. coli, выделенных от жителей Гвинейской Республики.

Материалы и методы. Методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с набором реагентов «АмплиСенс^® Эшерихиозы-FL» для выявления генетических детерминант DEC: EPEC, EHEC, ETEC, EIEC, EAgEC (ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Россия) в период 2019–2022 гг. исследовали 724 пробы испражнений пациентов с ОКИ, из них детей в возрасте 1–5 лет — 72 (9,9%); 6–17 лет — 128 (17,7%); 18 лет и старше — 524 (72,4%). Чувствительность к 15 антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом на агаре Мюллера–Хинтон (Россия) с дисками Oxoid (Великобритания), согласно рекомендациям EUCAST (2019–2022 гг.). Результаты. За период 2019–2022 гг. в этиологической структуре ОКИ доля эшрихиозов составляла 51,7%. В возрастной структуре значимо чаще DEC встречались у детей раннего возраста 0–5 лет (96,9%, р < 0,05) по сравнению с группой детей школьного возраста 6–17 лет (53,9%) и взрослыми (45,6%). Во все годы наблюдения преобладали штаммы патогруппы EAgEC, на долю которых приходилось 38,4%. На долю других патогрупп — EPEC, ETEC, EIEC и STEC — приходилось 27,2, 17,5, 11,8 и 5,1% соответственно. Штаммы DEC сохраняли чувствительность к меропенему, амикацину и нитрофурантоину. Активность других антибиотиков варьировалась от 11,3% к ампициллину, 28,3% — триметоприм-сульфаметоксазолу, 34% — тетрациклину, до 73,6% — цефалоспоринам, 84,0% — аминогликозидам и 98,1% — фторхинолонам. Заключение. Для снижения бремени диарейных заболеваний на территории Гвинейской Республики необходимо проведение целенаправленных эпидемиологических и микробиологических исследований по выявлению DEC и мониторинга развития резистентности в популяции возбудителей эшерихиозов.

Введение. В Черногории вакцинация против инфекции COVID-19 началась с использования Гам-КОВИД-Вак, который не был одобрен для экстренного использования до окончания клинических испытаний со стороны Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов и Европейского агентства по лекарственным средствам. Поэтому необходимо подчеркнуть побочные эффекты.

Материалы и методы. Данные для целей настоящего исследования были собраны из национальной формы сообщения о нежелательных явлениях для Гам-КОВИД-Вак, полученной от Учреждения здравоохранения Аптеки Черногории — Монтефарм как носителя разрешения на эти вакцины.

Результаты. За период с 1 марта 2021 г. по 13 февраля 2022 г. после применения 16 756 доз вакцины Gam-COVID было всего зарегистрировано 220 случаев, то есть 716 побочных эффектов. Средний возраст вакцинированных, сообщивших о нежелательных явлениях, составил 40,79±11,35 лет. В общей сложности 79.55% женщин по сравнению с 20,45% мужчин сообщили о побочных эффектах после вакцинации. Наиболее частой побочной реакцией была температурная (79,55%). Другими очень частыми побочными эффектами были: боль в месте инъекции (38,18%), головная боль (33,18%), миалгия (32,27%), недомогание (31,82%), лихорадка (30,45%), артралгия (22,73%), отек и покраснение в месте введения (15,91%). Менее распространенными побочными эффектами были тошнота, боль в конечностях, диарея, головокружение, утомляемость, боль в горле и herpes labialis. Серьезные побочные эффекты — шум в ушах, тромбофлебит, гипотония, боль в груди, учащенное сердцебиение и периферический цианоз — были зафиксированы в 8 случаях. Все они были связаны с наличием сопутствующих заболеваний.

Выводы. После введения вакцины Гам-KОВИД у населения Черногории наблюдались побочные эффекты легкой и средней степени тяжести с редкими серьезными эффектами преходящего характера, которые были связаны с определенными сопутствующими заболеваниями. По результатам данного исследования вакцина Гам-KОВИД подтвердила хороший профиль безопасности и высокую переносимость, о чем свидетельствует статистический анализ с отсутствием госпитализаций и летальных случаев.

Введение. С мая 2022 г. во всем мире было зарегистрировано необычно большое количество новых случаев заражения оспой обезьян — ранее редкой вирусной зоонозной болезнью, в основном зарегистрированной в Центральной и Западной Африке, а в июле 2022 г. Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) объявила глобальную чрезвычайную ситуацию. Целью настоящей работы было проведение систематическое анализа эпидемиологии, патогенеза, передачи, проявлений и исходов оспы обезьян.

Материалы и методы. Был проведен поиск по ключевым словам в онлайн-базах данных PubMed, Embase, Scopus и Web of Science и изучены все статьи на английском языке, опубликованные до декабря 2022 г. В целях оптимизации качества использовался контрольный список «Предпочтительные элементы отчетности для систематических обзоров и метаанализов» (PRISMA). Для минимизации потенциального риска систематических ошибок мы использовали оценку риска по шкале Ньюкасла–Оттавы (NOS).

Результаты. Наиболее распространенными симптомами были сыпь и лихорадка. Инфекция сопровождалась различными осложнениями, среди прочего представленными энцефалитом (преимущественно у детей), септицемией, бактериальным целлюлитом, заглоточными и парафарингеальными абсцессами и др. Были госпитализированы от 3,7 до 100% больных. Уровень смертности колебался от 0 до 23%, преимущественно среди младенцев и детей. Отмечена высокая смертность от оспы обезьян среди беременных женщин. Уровень смертности среди женщин и тех, кто получил вакцину от оспы, был ниже по сравнению с мужчинами и невакцинированными лицами. Зафиксирован широкий диапазон вторичных случаев инфекции, которая более выражена у непривитых пациентов.

Заключение. В настоящем систематическом обзоре проанализированы 35 исследований оспы обезьян, позволивших пролить свет на имеющиеся данные о ее эпидемиологии, патогенезе, проявлениях и исходах. Необходимы дальнейшие исследования для выяснения естественного течения заболевания у различных групп пациентов, а также детализации частоты заражения оспой обезьян.

Каталаза — гемсодержащий фермент, относящийся к факторам защиты, разрушающий перекисные соединения. Наличие каталазной активности является важной способностью микроорганизмов, позволяющей им защищаться от неблагоприятных факторов, а также адаптироваться в условиях макроорганизма. Каталаза наряду с супероксиддисмутазой играют важную роль в устойчивости патогенов к кислородзависимым бактерицидным механизмам фагоцитов. Целью исследования являлось изучение каталазной активности микросимбионтов женского репродуктивного тракта при нормоценозе и кандидозном дисбиозе хронобиологическим методом. Исследование проводили на клинических изолятах, выделенных из микросимбиоценозов женского репродуктивного тракта. Активность каталазы определяли спектрофотометрическим методом по убыли пероксида водорода в течение суток с 3-часовым интервалом в зимнее время года. Динамику изменения каталазной активности оценивали с 3–5-кратным повторением условий эксперимента. У отдельных видов молочнокислых бактерий обнаружена каталаза, не содержащая гемовой группы — псевдокаталаза. Хронобиологический метод позволил выявить активность фермента у всех микросимбионтов. Доминантная и ассоциативная микробиота, выделенная от здоровых женщин, характеризовалась циркадианными (околосуточными) ритмами каталазной активности в ранние утренние часы — 5:00 (р < 0,05). Перекись водорода разлагается спонтанно или с участием неферментативных катализаторов, и микроорганизмы справляются с ней в этих условиях. У микросимбионтов, характерных для дисбиоза женского репродуктивного тракта и обычно обнаруживаемых в большом количестве на фоне снижения Lactobacillus spp., регистрировались ультрадианные ритмы с 12- и 8- часовыми гармониками каталазной активности с акрофазой в утренние и вечерние часы (8:00; 20:00). Минимальные значения продукции фермента у всех культур фиксировались в 12:00 и 17:00 часов. Таким образом, вклад ритма изучаемого показателя при различной степени чистоты влагалища отражает адаптационные возможности патогенов к условиям существования и может лежать в основе при изучении механизмов их регуляции. Мезор и амплитудно-фазовая стабильность являются универсальными ритмометрическими параметрами, оценивающими состояние пациента и не зависящими от видовой принадлежности культуры.