Селективная синтетическая питательная среда «Ацинетобактер фенилаланин агар» для выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования — клинико-микробиологическая апробация селективной питательной среды «Ацинетобактер фенилаланин агар» для выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii (комплекса АСВ). В 2018 г. клинико-бактериологической лаборатории Военно-медицинской академии были изучены 400 проб клинического материала (отделяемое ран, кровь, моча, бронхо-альвеолярные смывы) параллельно традиционным методом [посев на кровяной агар, выделение и идентификация чистых культур биохимическими тестами и микробиологическим анализатором «Vitek 2» (bioMerieux)] и посевом на чашки с питательной средой «Ацинетобактер фенилаланин агар». Селективность этой среды обусловлена трофической селекцией ацинетобактеров L-фенилаланином в качестве единственного источника азота и углерода и дополнительной селекцией триметопримом. Ацинетобактеры комплекса АСВ идентифицировали через 18–24 ч инкубации при 37°С по наличию характерных колоний на селективной среде. Контрольные тесты на цитохромоксидазу и ОФ-тест с глюкозой пероксидводородным микрообъемным методом (в течение 1 ч) позволяли в экспресс-режиме отличать ацинетобактеры комплекса АСВ от других бактерий и группы ацинетобактеров неокисляющих глюкозу. Далее определяли вид всех выделенных штаммов ацинетобактеров методом матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации с время пролетной масс-спектрометрией (MALDI-TOF MS). Ацинетобактеры были выделены на селективной среде в 26 пробах (18 проб в монокультуре, 8 — в ассоциации с Pseudomonas aeruginosa или Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae при очень мелких колониях ассоциантов); традиционным методом — в 20 пробах (7 — в монокультуре, 13 — в ассоциациях с синегнойной палочкой, клебсиеллами, эшерихиями, цитробактером, провиденциями, стафилококками, энтерококками, C. albicans). Методом MALDI-TOF MS было установлено, что из 26 штаммов ацинетобактеров, выделенных на селективной среде, 25 относятся к комплексу АСВ (A. baumannii — 23, A. pittii — 2). Один штамм (A. baylyi) не относился к видам комплекса АСВ. Следовательно, диагностическая специфичность селективной синтетической питательной среды «Ацинетобактер фенилаланин агар» по выделению и идентификации бактерий комплекса A. calcoaceticus — A. baumannii составляет 96,2%, а ее диагностическая чувствительность превышает на 25% традиционный метод. Применение селективной среды ускоряет исследование — выделение и идентификация ацинетобактеров комплекса АСВ завершается через 18–24 ч после посева клинического материала. Селективность питательной среды потенциально стабильна, так как ее основной трофический фактор селекции не зависит от приобретенной антибиотикоустойчивости бактерий. Как синтетическая питательная среда она пригодна для стандартизованных исследований.

Об авторах

Е. П. Сиволодский

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ;
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: es279@yandex.ru

Доктор медицинских наук, профессор кафедры микробиологии ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ; старший научный сотрудник ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Санкт-Петербург

Россия

Г. В. Горелова

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ

Email: elenagorelova@mail.ru

Врач-бактериолог микробиологической лаборатории Центральной клинико-диагностической лаборатории

Санкт-Петербург

Россия

С. П. Богословская

ФГБВОУ ВО Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ

Email: telola@mail.ru

Врач-бактериолог микробиологической лаборатории Центральной клинико-диагностической лаборатории

Санкт-Петербург

Россия

Е. В. Зуева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Автор, ответственный за переписку.
Email: elenazueva9@gmail.com

Зуева Елена Викторовна, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

Россия

Список литературы

  1. Патент № 2660567 Российская Федерация, МПК C12Q 1/04 (2006.01); C12N 1/20 (2006.01); C12R 1/02 (2006.01). Способ выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii: № 2017130632; заявлено 29.08.2017: опубликовано 06.07.2018 / Сиволодский Е.П. Патентообладатель: Сиволодский Е.П. 8 с.
  2. Сиволодский Е.П. Пероксидводородный микрообъемный метод ОФ-теста: экспрессное определение окисления и ферментации глюкозы грамотрицательными бактериями // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1991. № 1. С. 14–17.
  3. Сиволодский Е.П., Зуева Е.В. Таксономическое и прикладное значение профилей утилизации белковых аминокислот бактерий Acinetobacter baumannii, Acinetobacter pittii, Acinetobacter nosocomialis // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2018. № 4 (64). С. 113–116.
  4. Cosgaya C., Mari-Almirall M., Van Assche A., Fernandez-Orth D., Mosqueda N., Telli M., Huys G., Higgins P., Seifert H., Lievens B., Roca I., Vila J. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2016, vol. 66, pp. 4105–4111. doi: 10.1099/ijsem.0.001318
  5. Gerner-Smidt P., Tjernberg I., Ursing J. Reliablity of phenotypic tests for identification of Acinetobacter species. J. Clin. Microbiol., 1991, vol. 29, no. 2, pp. 277–282.
  6. Jawad A., Hawkey P.M., Heritage J., Shnelling A.M. Description of Leeds Acinetobacter medium, a new selective and differential medium for clinically important Acinetobacter spp. and comparison with Herella agar and Holton’s agar. J. Clin. Microbiol., 1994, vol. 32, no. 10, pp. 2353–2358.
  7. Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., Sedo O., Brisse S., Higgins P.G. Acinetobacter seifertii sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex isolated from human clinical specimens. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2015, vol. 65, pp. 934–942. doi: 10.1099/ijs.0.000043
  8. Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., Van der Reijden T.J., Deschaght P., Passet V., Veneechoutte M., Brisse S., Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formeily Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13 TU). Res. Microbiol., 2011, vol. 162, pp. 393–404.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Сиволодский Е.П., Горелова Г.В., Богословская С.П., Зуева Е.В., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».