RAPID URINE SCREENING FOR BACTERIURIA IN CHILDREN USING MICROBIOLOGY ANALYZER, COMBINING PHOTOMETRIC AND COHERENT FLUCTUATION NEPHELOMETRIC METHODS

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

One of the most widespread microbiological analyses in clinical practice is urine culture, and up to 80% of urine samples turn out to be negative. In this study we demonstrate applicability of coherent fluctuating nephelometry (CFN) method for rapid urine screening and negative samples identification for the purpose of reducing the workload of microbiological laboratory. 205 urine samples were tested by conventional culture method (CCM) and using CFN-analyzer. The agreement between CCM and CFN was 87.8%. Compared to CCM, CFN demonstrated sensitivity — 94.5%, specificity — 85.3%, negative predictive value — 97.7%, positive predictive value — 70.3%. In this study CFN-analyzer allowed to identify 85.3% of negative urine samples (63.9% of all tested samples) within 4 hours, and 94.5% of positive samples were retained for later CCM. Moreover none of samples with count ≥ 104 CFU/ml was omitted.

 

About the authors

A. S. Gur’ev

Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine of Federal Medical Biological Agency, Moscow, Russian Federation
St. PetersburgPasteur Institute of Epidemiology and Microbiology, St. Petersburg, Russian Federation

Author for correspondence.
Email: coherneph@mail.ru
Master (Physics and Mathematics), Researcher, Laboratory of Nanotechnology in Medicine, Department of Biophysics, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine; Researcher, Medtechnopark LTD, Moscow, Russian Federation Russian Federation

O. Yu. Kuznetsova

St. PetersburgPasteur Institute of Epidemiology and Microbiology, St. Petersburg, Russian Federation

Email: coherneph@mail.ru
Master of Science in Biotechnology, Researcher, Laboratory Of Nanotechnology, Department Of New Technology Russian Federation

M. F. Pyasetskaya

N.F. Filatov Children’s City Clinical Hospital No. 5, St. Petersburg, Russian Federation

Email: coherneph@mail.ru
Bacteriologist, Clinical Diagnostic Laboratory Russian Federation

I. A. Smirnova

N.F. Filatov Children’s City Clinical Hospital No. 5, St. Petersburg, Russian Federation

Email: coherneph@mail.ru
Bacteriologist, Clinical Diagnostic Laboratory Russian Federation

N. A. Belyaeva

N.F. Filatov Children’s City Clinical Hospital No. 5, St. Petersburg, Russian Federation

Email: coherneph@mail.ru
Bacteriologist, Clinical Diagnostic Laboratory Russian Federation

V. N. Verbov

St. PetersburgPasteur Institute of Epidemiology and Microbiology, St. Petersburg, Russian Federation

Email: coherneph@mail.ru
PhD (Chemistry), Head of the Department of New Technology Russian Federation

A. Yu. Volkov

Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine of Federal Medical Biological Agency, Moscow, Russian Federation
Medtechnopark LTD, Moscow, Russian Federation

Email: coherneph@mail.ru
PhD (Physics and Mathematics), Senior Researcher, Laboratory of Nanotechnology in Medicine, Department of Biophysics, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine; Director of Medtechnopark LTD, Moscow, Russian Federation Russian Federation

References

  1. Гурьев А.С., Волков А.Ю., Долгушин И.И., Поспелова А.В., Растопов С.Ф., Савочкина А.Ю., Сергиенко В.И. Когерентная флуктуационная нефелометрия — быстрый метод скрининга мочи на микробную обсемененность // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2015. Т. 159, № 1. С. 120–123. [Gur’ev A.S., Volkov A.Yu., Dolgushin I.I., Pospelova A.V., Rastopov S.F., Savochkina A.Yu., Sergienko V.I. Coherent fluctuation nephelometry: a rapid method for urine screening for bacterial contamination. Byulleten’ eksperimental’noi biologii i meditsiny = Bulletin of Experimental Biology and Medicine, 2015, vol. 159, no. 1, pp. 120–123. (In Russ.)]
  2. Колясникова Н.М., Тиванова Е.В., Тимошина О.Ю., Станкевич Д.С., Матосова С.В. Бактериологический посев мочи за 4 часа с применением метода лазерного светорассеяния: сравнение с традиционным посевом на чашки Петри // Поликлиника. 2015. Т. 1, № 6 (1). С. 85–88. [Kolyasnikova N.M., Tivanova E.V., Timoshina O.Yu., Stankevich D.S., Matosova S.V. Bacteriological urine culture for 4 hours using the method of laser light scattering: a comparison with traditional sowing on petri dishes. Poliklinika = Polyclinic, 2015, vol. 1, no. 6 (1), pp. 85–88. (In Russ.)]
  3. Эрман М.В. Инфекция мочевой системы // Детская медицина Северо-Запада. 2011. Т. 2. № 1. С. 61–67. [Erman M.V. Infection of urinary tract. Detskaya meditsina Severo-Zapada = Children’s Medicine of North-West, 2011, vol. 2, no. 1, pp. 61–67. (In Russ.)]
  4. Ligozzi M., Bernini C., Bonora M.G., De Fatima M., Zuliani J., Fontana R. Evaluation of the VITEK 2 system for identification and antimicrobial susceptibility testing of medically relevant gram-positive cocci. J. Clin. Microbiol., 2002, vol. 40, no. 5, pp. 1681–1686.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2016 Gur’ev A.S., Kuznetsova O.Y., Pyasetskaya M.F., Smirnova I.A., Belyaeva N.A., Verbov V.N., Volkov A.Y.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».