Участие повторяющегося элемента генома GGAAA в дифференцировке пола у курицы

Тандемные повторяющиеся элементы, образующие протяженные полипуриновые/полипиримидиновые непрерывные последовательности обнаружены в геномах различных видов животных. Особенности их структуры способствуют изгибанию спирали ДНК и переходу к неканоническим формам вторичной структуры ДНК. В современной научной литературе можно встретить множество примеров участия таких элементов в регуляции экспрессии генов и образовании альтернативных транскриптов в клетках разных типов (Matos-Rodrigues et al., 2023). Ранее нами описан повторяющийся элемент (GGAAA)n курицы (Gallus gallus domesticus), который преимущественно локализован на половой хромосоме W и составляет около 1% генома самок (Komissarov et al., 2018). В данной работе мы выявили особенности локализации этого тандемного повтора в геноме курицы в составе аутосом и половой хромосомы Z. Был выявлен ряд генов, содержащих тандемно повторенные элементы (GGAAA)n в составе некодирующих транскрибируемых регуляторных районов, которые могут влиять на интенсивность экспрессии и образование альтернативных транскриптов. Функциональная характеристика генов, несущих блоки (GGAAA)n, позволила выдвинуть предположение об участии этих тандемных повторов в регулировании дифференциальной активности генов, важной для развития признаков полового диморфизма у курицы.