The Distribution of the Germ Plasm Gene germes among Anurans

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The germes gene is a marker of germ plasm and primordial germ cells (PGC) described in the African clawed frog Xenopus laevis. It is known that overexpression of its mutant form negatively affects the formation and migration of PGC. However, until now it was not known how widely this gene is represented in animals of different phylogenetic groups. In this work, we performed bioinformatic analysis of genomic and transcriptome sequences of animals with germ plasm. It turned out that germes homologs are present only in representatives of the genera Xenopus and Hymenochirus of the family Pipidae (order Anura). The obtained results were confirmed by RT-PCR analysis of the expression of germes orthologs in the ovaries of six representatives of different Anura families. Phylogenetic analysis of cloned sequences of germes homologs suggests the appearance of this gene in the ancestors of Pipidae and its secondary loss in the genus Pseudohymenochirus. It is also identified that the amino acid sequences of the functional domains of the Germes protein are rather conservative.

About the authors

V. V. Konduktorova

Lomonosov Moscow State University

Author for correspondence.
Email: virgo584@yandex.ru
Russia, 119992, Moscow

E. G. Fofanova

Koltzov Institute of Developmental Biology

Email: virgo584@yandex.ru
Russia, 119334, Moscow

D. A. Nikishin

Lomonosov Moscow State University; Koltzov Institute of Developmental Biology

Email: virgo584@yandex.ru
Russia, 119992, Moscow; Russia, 119334, Moscow

References

  1. Altschul S. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs // Nucleic Acids Research. 1997. V. 25. P. 3389–3402.
  2. Berekelya L.A., Ponomarev M.B., Luchinskaya N.N. et al. Xenopus germes encodes novel germ plasm-associated transcript // Gene Expression Patterns. 2003. V. 3. P. 521–524.
  3. Berekelya L.A., Mikryukov A.A., Luchinskaya N.N. et al. The protein encoded by the germ plasm RNA Germes associates with dynein light chains and functions in Xenopus germline development // Differentiation. 2007. V. 75. P. 546–558.
  4. Castrillon D.H., Quade B.J., Wang T.Y. et al. The human VASA gene is specifically 1 expressed in the germ cell lineage // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2000. V. 97. P. 9585–9590.
  5. Extavour C.G., Akam M. Mechanisms of germ cell specification across the metazoans: epigenesis and preformation // Development. 2003. V. 30(24). P. 5869–5884.
  6. Frost D.R. Amphibian Species of the World: an Online Reference. Version 6.2 (Date of access) // Electronic Database accessible at https://amphibiansoftheworld.amnh.org/index.php. 2023. American Museum of Natural History, New York, USA.
  7. Hansen C.L., Pelegri F. Primordial germ cell specification in Vertebrate embryos: phylogenetic distribution and conserved molecular features of preformation and induction // Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2021. V. 9. P. 730332.
  8. Houston D.W., King M.L. Germ plasm and molecular determinants of germ cell fate // Current Topics in Developmental Biology. 2000. V. 50. P. 155–181.
  9. Julaton V.T.A., Reijo Pera R.A. NANOS3 function in human germ cell development // Human Molecular Genetics. 2011. V. 20. P. 2238–2250.
  10. King S.M. The dynein microtubule motor // Biochimica et Biophysica Acta. 2000. V. 1496. P. 60–75.
  11. Konduktorova V.V., Luchinskaya N.N., Belyavsky A.V. Expression of the germes germ plasm gene in follicular cells of X. laevis oocytes // Russian J. Dev. Bio. 2022. V. 53. P. 350–362.
  12. Lesch B.J., Page D.C. Genetics of germ cell development // Nature Reviews Genetics. 2012. V. 13. P. 781–794.
  13. Rapali P., Garcia-Mayoral M.F., Martinez-Moreno M. et al. LC8 dynein light chain (DYNLL1) binds to the C-terminal domain of ATM-interacting protein (ATMIN/ASCIZ) and regulates its subcellular localization // Biochemical and Biophysical Research Communications. 2011. V. 414. P. 493–498.
  14. Rengaraj D., Zheng Y.H., Kang K.S. et al. Conserved expression pattern of chicken DAZL in primordial germ cells and germ-line cells // Theriogenology. 2010. V. 74. P. 765–776.
  15. Stephen F.A., Madden T.L., Schäffer A.A. et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs // Nucleic Acids Research. 1997. V. 25. P. 3389–3402.
  16. Terent’ev P.V., Chernov S.A. Key to Amphibians and Reptiles (3rd ed.) // Israel Program for Scientific Translations. 1965.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2.

Download (374KB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2023 В.В. Кондукторова, Е.Г. Фофанова, Д.А. Никишин

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».