An Induced Pluripotent Stem Cell Line (ICGi023-A) Obtained from a Patient with Parkinson’s Disease Associated Polymorphisms in LRRK2 and PINK1 Genes

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

Parkinson’s disease is a neurodegenerative disorder with a range of causes, only 5% of which can be explained by known genetic variants. We revealed polymorphisms in LRRK2 and PINK1 genes of a person with parkinsonism cases in family anamnesis. PBMCs of the patient were reprogrammed with a non-integrating episomal vectors to generate an induced pluripotent stem cell (iPSC) line. The iPSC line showed typical morphology and normal karyotype, expressed pluripotency markers, and was capable to differentiate into three germ layers. The iPSCs represent a valuable tool for investigating a potential implication of the genetic variants into the Parkinson’s disease pathogenesis.

About the authors

A. A. Malakhova

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Meshalkin National Medical Research Center, Ministry of Health of the Russian Federation; Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Author for correspondence.
Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10; Russia, 630055, Novosibirsk, ul. Rechkunovskaya, 15; Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 8

L. V. Kovalenko

Surgut State University

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 628403, Surgut, prosp. Lenina, 1

J. A. Rzaev

FSBI Federal Neurosurgical Center

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630087, Novosibirsk, ul. Nemirovicha-Danchenko, 132/1

E. A. Khabarova

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; FSBI Federal Neurosurgical Center

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10; Russia, 630087, Novosibirsk, ul. Nemirovicha-Danchenko, 132/1

Y. V. Vyatkin

Novosibirsk State University

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, ul. Pirogova, 2

J. M. Minina

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10

S. P. Medvedev

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Meshalkin National Medical Research Center, Ministry of Health of the Russian Federation; Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10; Russia, 630055, Novosibirsk, ul. Rechkunovskaya, 15; Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 8

E. V. Grigor’eva

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Meshalkin National Medical Research Center, Ministry of Health of the Russian Federation; Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10; Russia, 630055, Novosibirsk, ul. Rechkunovskaya, 15; Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 8

S. V. Pavlova

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Meshalkin National Medical Research Center, Ministry of Health of the Russian Federation; Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10; Russia, 630055, Novosibirsk, ul. Rechkunovskaya, 15; Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 8

S. M. Zakian

Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences; Meshalkin National Medical Research Center, Ministry of Health of the Russian Federation; Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: amal@bionet.nsc.ru
Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 10; Russia, 630055, Novosibirsk, ul. Rechkunovskaya, 15; Russia, 630090, Novosibirsk, prosp. acad. Lavrentieva, 8

References

  1. Bloem B.R., Okun M.S., Klein C. Parkinson’s disease // Lancet. 2021. V. 397. № 10291. P. 2284–2303.
  2. Choppa P.C., Vojdani A., Tagle C. et al. Multiplex PCR for the detection of Mycoplasma fermentans, M. hominis and M. penetrans in cell cultures and blood samples of patients with chronic fatigue syndrome // Mol. Cell Probes. 1998. V. 12. № 5. P. 301–308.
  3. Cowan C.A., Klimanskaya I., McMahon J. et al. Derivation of embryonic stem-cell lines from human blastocysts // N. Engl. J. Med. 2004. V. 350. № 13. P. 1353–1356.
  4. Grigor’eva E.V., Malankhanova T.B., Surumbayeva A. et al. Generation of GABAergic striatal neurons by a novel iPSC differentiation protocol enabling scalability and cryopreservation of progenitor cells // Cytotechnology. 2020. V. 72. № 5. P. 649–663.
  5. Okita K., Yamakawa T., Matsumura Y. et al. An efficient nonviral method to generate integration-free human-induced pluripotent stem cells from cord blood and peripheral blood cells // Stem Cells. 2013. V. 31. № 3. P. 458–466.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2.

Download (1MB)

Copyright (c) 2023 А.А. Малахова, С.В. Павлова, Е.В. Григорьева, С.П. Медведев, Ю.М. Минина, Ю.В. Вяткин, Е.А. Хабарова, Д.А. Рзаев, Л.В. Коваленко, С.М. Закиян

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».