Биочип с ячейками из щеточных полимеров с реактивными карбоксильными группами для анализа ДНК
- Авторы: Мифтахов Р.А.1, Наседкина Т.В.1, Заседателев А.С.1, Шершов В.Е.1, Кузнецова В.Е.1, Левашова А.И.1, Лапа С.А.1, Василисков В.А.1, Иконникова А.Ю.1, Чудинов А.В.1
-
Учреждения:
- Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
- Выпуск: Том 49, № 6 (2023)
- Страницы: 641-648
- Раздел: ПИСЬМА РЕДАКТОРУ
- URL: https://journals.rcsi.science/0132-3423/article/view/148163
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0132342323050044
- EDN: https://elibrary.ru/ARRVXQ
- ID: 148163
Цитировать
Аннотация
Разработан способ изготовления биочипов методом фотолитографии с гидрогелевыми ячейками из щеточных сополимеров на основе акриловой кислоты и акриламида, закрепленными одним концом на поверхности полимерной подложки. Гидрогелевые ячейки с реактивными карбоксильными группами использовали для ковалентной иммобилизации олигонуклеотидных зондов. Особенности ячеек из щеточных полимеров – высокая емкость ковалентной иммобилизации олигонуклеотидных зондов и быстрая кинетика гибридизации с комплементарными ДНК-мишенями. Эффективность биочипов продемонстрирована в гибридизационном анализе с ДНК-мишенями различной длины, представляющими собой участок последовательности 7-го экзона гена ABO человека.
Ключевые слова
Об авторах
Р. А. Мифтахов
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
Т. В. Наседкина
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
А. С. Заседателев
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
В. Е. Шершов
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
В. Е. Кузнецова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
А. И. Левашова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
С. А. Лапа
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
В. А. Василисков
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
А. Ю. Иконникова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
А. В. Чудинов
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Email: chud@eimb.ru
Россия, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32
Список литературы
- Rubina A.Y., Pan’kov S.V., Dementieva E.I., Pen’kov D.N., Butygin A.V., Vasiliskov V.A., Chudinov A.V., Mikheikin A.L., Mikhailovich V.M., Mirzabekov A.D. // Anal. Biochem. 2004. V. 325. P. 92–106. https://doi.org/10.1016/j.ab.2003.10.010
- Gryadunov D., Dementieva E., Mikhailovich V., Nasedkina T., Rubina A., Savvateeva E., Fesenko E., Chudinov A., Zimenkov D., Kolchinsky A., Zasedatelev A. // Exp. Rev. Mol. Diagn. 2011. V. 11. P. 839–853. https://doi.org/10.1586/ERM.11.73
- Naidu C.K., Suneetha Y. // Trop. J. Pharm. Res. 2012. V. 11. P. 153–164. https://doi.org/10.4314/tjpr.v11i1.20
- Beaudet A.L., Belmont J.W. // Annu. Rev. Med. 2008. V. 59. P. 113–129. https://doi.org/10.1146/annurev.med.59.012907.101800
- Brittain W.J., Brandstetter T., Prucker O., Rühe J. // ACS Appl. Mat. Int. 2019. V. 11. P. 39397–39409. https://doi.org/10.1021/acsami.9b06838
- Золотов А.М., Мифтахов Р.А., Иконникова А.Ю., Лапа С.А., Кузнецова В.Е., Василисков В.А., Шершов В.Е., Заседателев А.С., Наседкина Т.В., Чудинов А.В. // Биоорг. химия. 2022. Т. 48. С. 599–605. [Zolotov A.M., Miftakhov R.A., Ikonnikova A.Y., Lapa S.A., Kuznetsova V.E., Vasiliskov V.A., Shershov V.E., Zasedatelev A.S., Nasedkina T.V., Chudinov A.V. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2022. V. 48. Р. 858–863.] https://doi.org/10.1134/S1068162022040203
- Shchepinov M.S., Case-Green S.C., Southern E.M. // Nucleic Acids Res. 1997. V. 25. P. 1155–1161. https://doi.org/10.1093/nar/25.6.1155
- Halperin A., Buhot A., Zhulina E.B. // Langmuir. 2006. V. 22. P. 11290–11304. https://doi.org/10.1021/la0616606
- Zubtsov D.A., Savvateeva E.N., Rubina A.Yu., Pan’kov S.V., Konovalova E.V., Moiseeva O.V., Chechetkin V.R., Zasedatelev A.S. // Anal. Biochem. 2007. V. 368. P. 205–213. https://doi.org/10.1016/j.ab.2007.04.040
- Rohr T., Ogletree D.F., Svec F., Fréchet L.M.J. // Adv. Funct. Mat. 2003. V. 13. P. 264–270. https://doi.org/10.1002/adfm.200304229
- Ma H., Davis R.H., Bowman C.N. // Macromolecules. 2000. V. 33. P. 331–335. https://doi.org/10.1021/ma990821s
- Barbey R., Lavanant L., Paripovic D., Schüwer N., Sugnaux C., Tugulu S., Klok H.-A. // Chem. Rev. 2009. V. 109. P. 5437–5527. https://doi.org/10.1021/cr900045a
- Miftakhov R.A., Lapa S.A., Shershov V.E., Zasedateleva O.A., Guseinov T.O., Spitsyn M.A., Kuznetsova V.E., Mamaev D.D., Lysov Yu.P., Barsky V.E., Timofeev E.N., Zasedatelev A.S., Chudinov A.V. // Biophysics. 2018. V. 63. P. 512–518. https://doi.org/10.1134/S0006350918040127
- Jena R.K., Yue C.Y. // Biomicrofluidics. 2012. V. 6. P. 012 822. https://doi.org/10.1063/1.3682098
- Barsky V., Perov A., Tokalov S., Chudinov A., Kreindlin E., Sharonov A., Kotova E., Mirzabekov A. // J. Biomol. Screen. 2002. V. 7. P. 247–257. https://doi.org/10.1177/108705710200700308
- Lysov Y., Barsky V., Urasov D., Urasov R., Cherepanov A., Mamaev D., Yegorov Y., Chudinov A., Surzhikov S., Rubina A., Smoldovskaya O., Zasedatelev A. // Biomed. Optics Express. 2017. V. 8. P. 4798–4810. https://doi.org/10.1364/BOE.8.004798