EXTRACTION, PURIFICATION, AND SMALL-ANGLE X-RAY SCATTERING ANALYSIS OF THE YSXC GTPASE OF STAPHYLOCOCCUS AUREUS

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

Study of the structures of various biological macromolecules is one of the main directions that are intensively developed using physical methods. Since proteins are an elementary unit of the structural and functional organization of a cell, the strategies for combating pathogenic microorganisms include the analysis of the bacterial protein synthesis apparatus and related systems. The extraction, purification, and small-angle X-ray scattering analysis of the structure of YsxC protein from the Staphylococcus aureus pathogenic bacterium are reported. This protein is involved in the cell growth and division processes, serves an energy-dependent factor, and participates in the assembly of large ribosome subunit. The structural study of this protein opens up a possibility of searching for small molecules capable of inhibiting its function. Since the structural variability of protein factors is higher than that of the conservative ribosome sites, their inhibition makes it possible to selectively affect a pathogenic microorganism.

作者简介

A. Biktimirov

Kazan (Volga Region) Federal University, Kazan, 420008 Russia

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

D. Islamov

Kazan (Volga Region) Federal University, Kazan, 420008 Russia

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

S. Validov

Kazan (Volga Region) Federal University, Kazan, 420008 Russia

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

G. Peter's

National Research Centre “Kurchatov Institute,” Moscow, 123098 Russia

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Москва

A. Khaliullina

Kazan (Volga Region) Federal University, Kazan, 420008 Russia

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

M. Yusupov

Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire, 67400 Illkirch-Graffenstaden, France

Email: k.usachev@kpfu.ru
Франция, Илькирш-Граффенштаден

K. Usachev

Kazan (Volga Region) Federal University, Kazan, 420008 Russia

编辑信件的主要联系方式.
Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

参考

  1. Chambers H.F., Deleo F.R. // Nat Rev Microbiol. 2009. V. 7 № 9. P. 629. https://doi.org/10.1038/nrmicro2200
  2. Stapleton P.D., Taylor P.W. // Sci Prog. 2002. V. 85 № 1. P. 57. https://doi.org/10.3184/003685002783238870
  3. Gan T., Shu G., Fu H. et al. // BMC Vet Res. 2021. V. 17 P. 177. https://doi.org/10.1186/s12917-021-02884-z
  4. Murray Ch.J.L., Shunji I.K., Sharara F. et al. // Lancet. 2022. V. 10325. № 399. P. 629. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)02724-0
  5. Poehlsgaard J., Douthwaite S. // Nat. Rev. Microbiol. 2005. V. 3. P. 870. https://doi.org/10.1038/nrmicro1265
  6. Усачев К.С., Юсупов М.М., Валидов Ш.З. // Биохимия. 2020. Т. 85. № 11. С. 1690. https://doi.org/10.1134/S0006297920110115
  7. Khusainov I., Fatkhullin B., Pellegrino S. // Nature Commun. 2020. V. 11 № 1656. https://doi.org/10.1038/s41467-020-15517-0
  8. Cooper E.L., García-Lara J., Foster S.J. // BMC Microbiol. 2009. V. 9. № 266. https://doi.org/10.1186/1471-2180-9-266
  9. Ramakrishnan C., Dani V.S., Ramasarma T. // Protein Eng. Des. Sel. 2002. V. 15. № 10. P. 783. https://doi.org/10.1093/protein/15.10.783
  10. Ni X., Davis J.H., Jain N. et al. // Nucl. Acids Res. 2016. V. 44. № 17. P. 8442. https://doi.org/10.1093/nar/gkw678
  11. Корчуганов В.Н., Валентинов А.Г., Полозов С.М. и др. // Кристаллография. 2022. Т. 67. № 5. С. 735. https://doi.org/10.31857/S0023476122050058
  12. Konarev P.V., Volkov V.V., Sokolova A.V. et al. // J. Appl. Cryst. 2003. V. 36. P. 1277. https://doi.org/10.1107/S0021889803012779
  13. Svergun D.I. // Biophys J. 1999. V. 76. № 6. P. 2879. https://doi.org/10.1016/S0006-3495(99)77443-6
  14. Gosavi R.A., Mueser T.C., Schall C.A. // Acta Cryst. 2008. V. 64. P. 506. https://doi.org/10.1107/S0907444908004265
  15. Ruzheinikov S.N., Das Sanjan K., Sedelnikova S.E. et al. // J. Mol. Biol. 2004. V. 339 № 2. P. 265. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2004.03.043
  16. Goldenberg D.P., Argyle B. // Biophys. J. 2014. V. 106. № 4. P. 895. https://doi.org/10.1016/j.bpj.2013.12.004
  17. Chacon P., Moran F., Dia z J.F. et al. // Biophys. J. 1998. V. 74. P. 2760. https://doi.org/10.1016/S0006-3495(98)77984-6
  18. Svergun D.I., Barberato C., Koch M.H.J. // J. Appl. Cryst. 1999. V. 28. P. 768. https://doi.org/10.1107/S1600576717007786
  19. Jumper J., Evans R., Pritzel A. et al. // Nature. 2021. V. 596. P. 583. https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2.

下载 (22KB)
索引源数据
3.

下载 (264KB)
索引源数据
4.

下载 (88KB)
索引源数据
5.

下载 (62KB)
索引源数据
6.

下载 (375KB)
索引源数据

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».