Email this article Microbiological monitoring of causative agents of nosocomial infection in the urological clinic
- Authors: Slesarevskaya M.N.1, Spiridonova A.A.1, Krasnova M.V.1, Reva S.A.1, Gadzhiev N.K.1, Ponomareva Y.A.1, Al-Shukri A.S.1, Kuzmin I.V.1, Petrov S.B.1, Al-Shukri S.K.1
-
Affiliations:
- Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
- Issue: Vol 10, No 4 (2020)
- Pages: 293-300
- Section: Original articles
- URL: https://journals.rcsi.science/uroved/article/view/54607
- DOI: https://doi.org/10.17816/uroved54607
- ID: 54607
Cite item
Open Access
Access granted
Subscription Access
Abstract
The analysis of the results of microbiological examination of urine samples of 1022 patients (559 women and 463 men) who were hospitalized at the urological clinic of the I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University in period from 2018 to 2020 was performed. The age of the patients varied from 18 to 88 years (average 63.1 ± 17.6 years). In 587 (57.5%) patients, gram-negative microflora was detected, in 355 (34.7%) – gram-positive microflora, and in 80 (7.8%) – mixed microflora. Escherichia coli (28.2%), Enterococcus faecalis (20.9%), Klebsiella pneumoniae (14.1%) and bacteria of the Staphylococcaceae family (11.6%) were prevailed in the structure of uropathogens. The share of other microorganisms did not exceed 5%. A high level of microflora resistance to ampicillin, cephalosporins of the 2nd and 3rd generations, fluoroquinolones was noted. The highest level of antibiotic resistance was observed in K. pneumonia. In general the results obtained correspond to the general trends in the dynamics of the etiological structure and the level of antibiotic resistance of nosocomial urinary tract infections. This study confirms the need for local microbiological monitoring to develop optimal regimens for empiric antibiotic therapy and perioperative antibiotic prophylaxis.
Full Text
##article.viewOnOriginalSite##About the authors
Margarita N. Slesarevskaya
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: mns-1971@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-4911-6018
https://www.1spbgmu.ru/ru/universitet/strustura/kafedry/106-glavnaya/3905-slesarevskaya-margarita-nikolaevna
Cand. Sci. (Med.), Senior Research Fellow of the Research Center of Urology, Research Institute of Surgery and Emergency Medicine
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Anna A. Spiridonova
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: annaasbac@mail.ru
Bacteriologist, Head of the Laboratory for Bacteriological and Mycological Research
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Margarita V. Krasnova
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: annaasbac@mail.ru
Сand. Sci. (Med.), Bacteriologist, Laboratory for Bacteriological and Mycological Research, Department of Clinical Microbiology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Sergeii A. Reva
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: sgreva79@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5183-5153
Cand. Sci. (Med.), Head of Oncourological Division No. 6 (Andrology and Oncourology) of the Research Center of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Nariman K. Gadzhiev
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: nariman.gadjiev@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6255-0193
Doc. Sci. (Med.), Head of Urological Division No. 2 (ESWL and Endovideosurgery) of the Research Center of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Yulia A. Ponomareva
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: uaponomareva@mail.ru
Cand. Sci. (Med.), Head of the Urological division No. 1 (General and Urgent Urology) of the Research Center of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Adel S. Al-Shukri
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: ad330@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6543-8589
Doc. Sci. (Med.), professor, head of the urological division No. 1 (General and Urgent Urology) of the Research Center of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Igor V. Kuzmin
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Author for correspondence.
Email: kuzminigor@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7724-7832
https://www.1spbgmu.ru/ru/obrazovanie/kafedry/106-glavnaya/3828-igor-valentinovich-kuzmin
Doc. Sci. (Med.), Professor of the Department of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Sergeii B. Petrov
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: petrov-uro@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3460-3427
Scopus Author ID: 7201794299
https://www.1spbgmu.ru/ru/klinika/kliniki-pspbgmu/308-universitet/structura/universitetskaya-klinika/kliniki/251-klinika-urologii
Doc. Sci. (Med.), Professor, Head of the Research Center of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8Salman Kh. Al-Shukri
Academician I.P. Pavlov First Saint Petersburg State Medical University
Email: alshukri@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4857-0542
SPIN-code: 2041-8837
Scopus Author ID: 6601962854
https://www.1spbgmu.ru/ru/obrazovanie/150-universitet/structura/kafedry/klinicheskie/kafedra-urologii-s-kursom-urologii-s-klinikoj/77-kafedra-urologii
Doc. Sci. (Med.), Professor, Head of the Department of Urology
Russian Federation, 197022, Saint Petersburg, Lva Tolstogo street, 6-8References
- Давыдов М.И., Дмитриева Н.В. Инфекции в онкологии. – М.: Практическая медицина, 2009. – 472 с. [Davydov MI, Dmitrieva NV. Infekcii v onkologii. Moscow: Prakticheskaja medicina, 2009; 472 s. (In Russ.)]
- Cидоренко С.В., Резван С.П., Еремина Л.В. и др. Этиология тяжелых госпитальных инфекций в отделениях реанимации и антибиотикорезистентность среди их возбудителей // Антибиотики и химиотерапия. – 2005. – Т. 50. – № 2–3. – С. 33–41. [Sidorenko SV, Rezvan SP, Eremina LV, et al. Etiologija tjazhelyh gospital’nyh infekcij v otdelenijah reanimacii i antibiotikorezistentnost’ sredi ih vozbuditelej. Antibiotics and Chemotherapy. 2005;50(2-3):33-41. (In Russ.)]
- Тусматов Ш.М., Нусратуллоев И.Н., Рафиев Х.К. Внутрибольничная инфекция у послеоперационных больных с доброкачественной гиперплазией предстательной железы // Вестник Авиценны. – 2015. – № 4. – С. 53–56. [Tusmatov ShM, Nusratulloev IN, Rafiev KhK. Nosocomial infections in postoperative patients with benign prostatic hyperplasia. Vestnik Avitsenny – Avicenna Bulletin. 2015;(4):53-56. (In Russ.)]. https://doi.org/10.25005/2074-0581-2015-17-4-53-56.
- Bouassida K, Jaidane M, Bouallegue O, et al. Nosocomial urinary tract infections caused by extended-spectrum beta-lactamase uropathogens: Prevalence, pathogens, risk factors, and strategies for infection control. Can Urol Assoc J. 2016;10(3-4):E87-E93. https://doi.org/10.5489/cuaj.3223
- Ризоев Х.Х., Рахимов Д.А., Талабзода М.С. Факторы, способствующие распространению внутрибольничной инфекции мочевыводящих путей // Вестник Авиценны. – 2019. – Т. 21. – № 4. – С. 638–642. [Rizoev KhKh, Rakhimov DA, Talabzoda MS. Factors of spreading the nosocomial urinary tract infection. Avicenna Bulletin. 2019;21(4):638-642. (In Russ.)]. https://doi.org/10.25005/2074-0581-2019-21-4-638-642.
- World Health Organization. Antimicrobial resistance. 2020. Available from: https://www.who.int/publications/i/item/global-action-plan-on-antimicrobial-resistance. [cited 2020, Dec 02].
- Программа СКАТ (Стратегия Контроля Антимикробной Терапии) при оказании стационарной медицинской помощи: Российские клинические рекомендации / под ред. С.В. Яковлева, Н.И. Брико, С.В. Сидоренко, Д.Н. Проценко. – М.: Перо, 2018. – 156 с. [Programma SKAT (Strategija Kontrolja Antimikrobnoj Terapii) pri okazanii stacionarnoj medicinskoj pomoshhi: Rossijskie klinicheskie rekomendacii. Ed. by S.V. Jakovlev, N.I. Briko, S.V. Sidorenko, D.N. Procenko. Moscow: Pero; 2018. 156 p. (In Russ.)]
- Урология. Российские клинические рекомендации / под ред. Ю.Г. Аляева, П.В. Глыбочко, Д.Ю. Пушкаря. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2018. – 480 с. [Urology. Russian clinical guidelines. Ed. by Yu.G. Alaev, P.V. Glybochko, D.Yu. Pushkar. Moscow: GEOTAR-Media; 2018. 480 p. (In Russ.)].
- Bonkat G, Bartoletti R, Bruyere F, et al. Urological Infection. Guideline of European Urological Association. Available from: https://uroweb.org/guideline/urological-infections. [cited 2020 Dec 02].
- Перепанова Т.С. Нозокомиальные инфекции мочевых путей. Катетер-ассоциированные инфекции мочевых путей. В кн: Послеоперационные инфекционные осложнения: диагностика, лечение, профилактика. Практическое руководство / под ред. Н.В. Дмитриевой, И.Н. Петуховой. – М.: Издательский дом «Практическая медицина». 2013. – С. 251–269. [Perepanova TS. Nozokomial’nye infektsii mochevykh putei. Kateter-assotsiirovannye infektsii mochevykh putei. In: Posleoperatsionnye infektsionnye oslozhneniya: diagnostika, lechenie, profilaktika. Prakticheskoe rukovodstvo. Ed. by N.V. Dmitrieva, I.V. Petukhova. Moscow: Izdatel’skii dom “Prakticheskaya meditsina”; 2013. P. 251–269 (In Russ.)].
- Учваткин Г.В., Гайворонский Е.А., Слесаревская М.Н. Уросепсис. Патогенез, диагностика и лечение // Урологические ведомости. – 2020. – Т. 10. – № 1. – C. 81–91. [Uchvatkin GV, Gaivoronskiy EA, Slesarevskaya MN. Urosepsis. Pathogenesis, diagnosis and treatment. Urology reports (St. Petersburg). 2020;10(1):81-91. (In Russ.)]. https://doi.org/10.17816/uroved10181-91.
- Перепанова Т.С., Козлов Р.С., Руднов В.А. и др. Антимикробная терапия и профилактика инфекций почек, мочевыводящих путей и мужских половых органов. Федеральные клинические рекомендации / под ред. Ю.Г. Аляева, О.И. Аполихина, Д.Ю. Пушкаря и др. – М., 2020. – 110 с. [Perepanova TS, Kozlov RS, Rudnov VA, et al. Antimicrobial therapy and prevention of infections of the kidneys, urinary tract and male genital organs. Federal clinical guidelines. Ed. by Yu.G. Alyaev, O.I. Apolikhin, D.Yu. Pushkar, et al. Moscow; 2020. 110 p. (In Russ.)].
- Рябчунова Л.В., Кузьменко А.В., Авдеев А.Н. и др. Анализ возбудителей инфекций мочевыводящих путей у больных урологического отделения БУЗ ВО «ВГКБСМП № 10» // Системный анализ и управление в биомедицинских системах. – 2018. – Т. 17. – № 4. – С. 898–902. [Ryabchunova LV, Kuzmenko AV, Avdeev AN, et al. Analysis of pathogens of urinary tract infections in patients of urological Department of BUZ VO VGKBSMP No. 10. System analysis and management in biomedical systems. 2018;17(4):898-902. (In Russ.)].
- Кузьмин И.В., Аль-Шукри С.Х., Слесаревская М.Н. Лечение и профилактика рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей у женщин // Урологические ведомости. – 2019. – Т. 9. – № 2. – С. 5–10. [Kuzmin IV, Al-Shukri SKh, Slesarevskaya MN. Treatment and prophylaxis of the lower urinary tract recurrent infections in women. Urologicheskie vedomosti. 2019;9(2):5-10 (In Russ.)] https://doi.org/10.17816/uroved925-10.
- Борисов В.В. Диагностика и терапия инфекций мочевыводящих путей. О чем следует помнить всегда (клиническая лекция). Часть 1 // Урологические ведомости. – 2017. – Т. 7. – № 3. – C. 52–59. [Borisov VV. Diagnosis and theraphy of urinary infections. What should always remember (clinical lecture). Part 1. Urologicheskie vedomosti. 2017;7(3):52-59. (In Russ.)] https://doi.org/10.17816/uroved7352-59.
- Iacovelli V, Gaziev G, Topazio L, et al. Nosocomial urinary tract infections: A review. Urologia. 2014;81(4):222-227. https://doi.org/10.5301/uro.5000092.
- Коза Н.М. Факторы риска и профилактика внутрибольничных инфекций мочевыводящих путей // Пермский медицинский журнал. – 2015. – Т. 32. – № 1. – С. 135–140. [Koza NM. Risk factors and prevention of nosocomial urinary infections. Perm Medical Journal. 2015;32(1):135-140. (In Russ.)].
- Димитрова Н.И., Гасретова Т.Д., Алутина Э.Л., Харсеева Г.Г. Чувствительность и резистентность к антимикробным препаратам БЛРС-продуцирующих и непродуцирующих БЛРС штаммов Е. coli у больных с инфекцией мочевыводящих путей // Клиническая лабораторная диагностика. – 2019. – Т. 64. – № 2. – С. 104–110. [Dimitrova NI, Gasretova TD, Alutina EL, Kharseeva GG. Sensitivity and resistance to antimicrobial agents ESBL-producing and not producing ESBL strains of E. coli in patients with urinary tract infection. Russian Clinical Laboratory Diagnostics. 2019;64(2):104-110. (In Russ.)]. https://doi.org/10.18821/0869-2084-2019-64-2-104-110
- Яковлев С.В. Суворова М.П., Белобородов В.Б. и др. Распространенность и клиническое значение нозокомиальных инфекций в лечебных учреждениях России: исследование ЭРГИНИ // Антибиотики и химиотерапия. – 2016. – Т. 61. – № 5–6. – С. 32–42. [Yakovlev SV, Suvorova MP, Beloborodov VB, et al. Multicentre Study of the Prevalence and Clinical Value of Hospital-Acquired Infections in Emergency Hospitals of Russia: ERGINI Study. Antibiotics and Chemotherapy. 2016;61(5-6):32-42. (In Russ.)]
- Козлов Р.С., Меньшиков В.В., Михайлова В.С. и др. Руководство по клинической и лабораторной диагностике «Бактериологический анализ мочи». Утверждено Минздравом РФ 25.12.2013. [Kozlov RS, Men’shikov VV, Mihajlova VS, et al. Rukovodstvo po klinicheskoj i laboratornoj diagnostike “Bakteriologicheskij analiz mochi”. Approved by the Ministry of Healthcare of the Russian Federation on December 25, 2013 (In Russ.)]. Доступно по ссылке: http://antimicrob.net/wp-content/uploads/Bakteriologicheskiy-analiz-mochi_metodicheskie-rekomendacii.pdf. Ссылка активна на 02.12.2020.
- Kranz J, Schmidt S, Wagenlehner F, Schneidewind L. Catheter-associated urinary tract infections in adult patients. Ppreventive strategies and treatment options. Dtsch Arztebl Int 2020;117: 83-88. https://doi.org/10.3238/arztebl.2020.0083.
- Maki DG, Tambyah PA. Engineering out the risk for infection with urinary catheters. Emerg Infect Dis. 2001;7(2):342-347. https://doi.org/10.3201/eid0702.010240.
- Кузьменко А.В., Гяургиев Т.А., Хальченко А.Е., Воркель Я.М. Оценка эффективности эмпирической антибиотикотерапии катетер-ассоциированной инфекции в урологическом стационаре // Урологические ведомости. – 2020. – Т. 10. – № 2. – C. 157–162. [Kuzmenko AV, Gyaurgiev TA, Halchenko AE, Vorkel YaM. Estimation of efficiency of empirical antibiotic therapy of catheter-associated infection in a urological hospital. Urology reports (St. Petersburg). 2020;10(2):157-162. (In Russ.) https://doi.org/10.17816/uroved102157-162.
- Кузьменков А.Ю., Трушин И.В., Авраменко А.А. и др. AMRmap: Интернет-платформа мониторинга антибиотикорезистентности // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2017. – Т. 19. – № 2. – С. 84–90. [Kuzmenkov AYu, Trushin IV, Avramenko AA, et al. AMRmap: an online platform for monitoring antibiotic resistance. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy. 2017;19(2):84-90. (In Russ.)]
