Искусственный интеллект и машинное обучение в диагностике центральной серозной хориоретинопатии на основании оптической когерентной томографии

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель данного исследования состояла в изучении возможности машинного обучения для выявления изолированной отслойки нейроэпителия сетчатки и изменений пигментного эпителия сетчатки как диагностических критериев центральной серозной хориоретинопатии (ЦСХ).

Материал и методы. В это исследование были включены пациенты с острой ЦСХ, прошедшие стандартное офтальмологическое обследование и выполнившие оптическую когерентную томографию с помощью RTVue-XR Avanti (протокол Angio Retina HD, 6 × 6 мм). Для обучающей разметки был использован en face пласт толщиной 10 мкм в плоскости над пигментным эпителием сетчатки. В соответствии с задачами обучения нейронной сети на кросс-секционных сканах были выделены три категории патологических изменений: класс 1 — субретинальная жидкость, класс 2 — аномалии пигментного эпителия сетчатки и класс 3 — точки просачивания. Количество данных для каждой из категорий составило 4800/1400 тренировочных/тестовых изображений для класса 1, 2000/802 для класса 2 и 1504/408 для класса 3. Для решения задачи сегментации патологий на ОКТ-сканах была использована архитектура, аналогичная Unet.

Результаты. Анализ тестовых сетов показал, что чувствительность, специфичность, точность и F1-мера в детекции субретинальной жидкости составили 0,61; 0,99; 0,99 и 0,76 соответственно; для детекции аномалий пигментного эпителия сетчатки чувствительность, специфичность, точность и F1-мера равнялись 0,14; 0,95; 0,94 и 0,24 соответственно; для детекции точки просачивания чувствительность, специфичность, точность и F1-мера составили 0,06; 1,0; 1,0 и 0,12 соответственно.

Заключение. Таким образом, машинное обучение демонстрирует высокий потенциал в идентификации патологических изменений, характерных для острой формы ЦСХ (отслойки нейроэпителия сетчатки и альтерации пигментного эпителия сетчатки), по данным ОКТ. Топическая индикация точки просачивания представляется возможной на больших обучающих сетах.

Об авторах

Алексей Николаевич Куликов

ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова» Минобороны России

Email: alexey.kulikov@mail.ru
SPIN-код: 6440-7706

д-р мед. наук, доцент, начальник кафедры офтальмологии

Россия, Санкт-Петербург

Екатерина Юрьевна Малахова

Институт физиологии им. И.П. Павлова Российской академии наук

Email: katerina.malahova@gmail.com

младший научный сотрудник

Россия, Санкт-Петербург

Дмитрий Сергеевич Мальцев

ФГБВОУ ВО «Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова» Минобороны России

Автор, ответственный за переписку.
Email: glaz.med@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6598-3982

канд. мед. наук, врач-офтальмолог клиники офтальмологии

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Gargeya R, Leng T. Automated identification of diabetic retinopathy using deep learning. Ophthalmology. 2017;124(7):962-969. https://doi.org/10.1016/j.ophtha.2017.02.008.
  2. Daruich A, Matet A, Dirani A, et al. Central serous chorioretinopathy: Recent findings and new physiopathology hypothesis. Prog Retin Eye Res. 2015;48:82-118. https://doi.org/10.1016/j.preteyeres.2015.05.003.
  3. Maltsev DS, Kulikov AN, Chhablani J. Topography-guided identification of leakage point in central serous chorioretinopathy: a base for fluorescein angiography-free focal laser photocoagulation. Br J Ophthalmol. 2018;102(9):1218-1225. https://doi.org/10.1136/bjophthalmol-2017-311338.
  4. Бойко Э.В., Мальцев Д.С. Фокальная навигационная лазерная коагуляция сетчатки с помощью ОКТ-картирования // Вестник офтальмологии. – 2016. – Т. 132. – № 3. – С. 56–60. [Boyko EV, Mal’tsev DS. En face’ optical coherence tomography guided focal navigated laser photocoagulation. Annals of ophthalmology. 2016;132(3):56-60. (In Russ.)]. https://doi.org/10.17116/oftalma2016132356- 60.
  5. Maltsev DS, Kulikov AN, Chhablani J. Clinical application of fluorescein angiography-free navigated focal laser photocoagulation in central serous chorioretinopathy. Ophthalmic Surg Lasers Imaging Retina. [In Press]
  6. Xiang D, Tian H, Yang X, et al. Automatic segmentation of retinal layer in OCT images with choroidal neovascularization. IEEE Trans Image Process. 2018;27(12):5880-5891. https://doi.org/10.1109/TIP.2018.2860255.
  7. Khalid S, Akram MU, Hassan T, et al. Fully automated robust system to detect retinal edema, central serous chorioretinopathy, and age related macular degeneration from optical coherence tomography images. Biomed Res Int. 2017;2017:7148245. https://doi.org/10.1155/2017/7148245.
  8. Wu M, Fan W, Chen Q, et al. Three-dimensional continuous max flow optimization-based serous retinal detachment segmentation in SD-OCT for central serous chorioretinopathy. Biomed Opt Express. 2017;8(9):4257-4274. https://doi.org/10.1364/BOE.8.004257.
  9. Ronneberger O, Fischer P, Brox T. U-Net: Convolutional networks for biomedical image segmentation. In: Medical image computing and computer-assisted intervention – MICCAI 2015. MICCAI 2015. Lecture notes in computer science. Vol. 9351. Ed. by N. Navab, J. Hornegger, W. Wells, A. Frangi. Cham: Springer; 2015. https://doi.org/10.1007/978-3-319-24574-4_28.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Пример детекции обученной нейронной сетью субретинальной жидкости на индивидуальном В-скане: а — исходный В-скан; b — результат распознавания зоны скопления субретинальной жидкости; c — распределение вероятностной характеристики наличия субретинальной жидкости

Скачать (381KB)
3. Рис. 2. Репрезентативный пример детекции субретинальной жидкости на совокупности В-сканов обученной нейронной сетью: а — анфас-изображение, демонстрирующее распределение субретинальной жидкости; b — результат распознавания и картирования зоны распределения субретинальной жидкости в совокупности В-сканов; c — распределение вероятностной характеристики наличия субретинальной жидкости на индивидуальном В-скане. Положение скана отмечено пунктирной линией

Скачать (386KB)

© Куликов А.Н., Малахова Е.Ю., Мальцев Д.С., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».