Том 9, № 4 (2011)
- Год: 2011
- Статей: 9
- URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/issue/view/335
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen94
Статьи
Влияние соотношения изоформ LIMK1 на поведение ухаживания Drosophila melanogaster: комплексный подход
Аннотация
LIMK1 - ключевой фермент сигнального каскада ремоделирования актина, обеспечивающий в нервной системе перестройку шипиков дендритов, необходимую для синаптической пластичности при обучении. В данной работе приведены результаты комплексного анализа поведения ухаживания при обучении и формировании среднесрочной памяти самцов линий Berlin, Oregon-R и аgnts3, полиморфных по гену limk1 Drosophila, с использованием 2 подходов: метода условнорефлекторного подавления ухаживания и исследования звукопродукции самца при ухаживании в сопоставлении с оценкой содержания LIMK1 в мозге анализируемых линий.
Экологическая генетика. 2011;9(4):3-14
3-14
Молекулярно-генетические методы анализа хищничества среди насекомых в агроценозах
Аннотация
Проблема определения количественных отношений хищников и жертв среди насекомых в агроценозах стала актуальной при разработке методов биорационального контроля. Многие виды насекомых не могут исследоваться традиционными методами из-за особенностей их поведения и жизненной формы, поэтому рекомендуется использовать методы анализа содержимого кишечника хищников. Приводится сравнение двух методов анализа (полимеразная цепная реакция (ПЦР ) и серологический анализ). Описано планирования эксперимента при ПЦР -анализе и рассмотрены дополнительные возможности ПЦР -анализа.
Экологическая генетика. 2011;9(4):15-24
15-24
Роль мобильных генетических элементов в эволюции цианобактерий
Аннотация
Обсуждаются возможные пути эволюции цианобактерий на основе in silico анализа секвенированных геномов 45 видов/штаммов. Дан обзор информации о количестве и функциях различных мобильных генетических элементов (IS, MITEэлементы и интроны группы II). Выявлена позитивная корреляция между размерами геномов цианобактерий и количеством генов транспозаз. Предполагается, что системы транспозиции играют существенную роль в геномных перестройках, участвующих в регуляции генов и процессах адаптации, которые определяют направления микроэволюционных процессов в популяциях цианобактерий.
Экологическая генетика. 2011;9(4):52-62
52-62
Изменчивость последовательности ITS1-ген 5.8S рРНК-ITS2 в ходе дивергенции видов рода Манник (Glyceria R. Br.)
Аннотация
Секвенирование и сравнительный анализ района ITS1-ген 5.8S рРНК -ITS2 ядерного генома 13 видов рода Glyceria, 4 видов рода Melica и 1 вида монотипного рода Pleuropogon показало, что виды рода Glyceria имеют три гаплотипа: 1) Гаплотипы группы А найдены только у видов подрода Glyceria секции Glyceria (G. septentrionalis, G. fluitans, G. declinata, G. occidentalis, G. notata, G. borealis, G. leptostachya) и у вида Pleuropogon sabinii; 2) Гаплотипы группы С характерны для видов подрода Hydropoa секции Hydropoa (G. grandis, G. х amurensis, G. triflora, G. maxima) и G. leptolepis, относимая к sect. Lithuanicae; 3) Гаплотипы группы В - для видов подрода Hydropoa секций Striatae (G. elata, G. striata, G. neogaea, G. canadensis), Scolochloiformes (G. alnasteretum, G. spiculosa) и G. lithuanica из sect. Lithuanicae. Виды с гаплотипами группы В при разных моделях построения филогенетического древа располагаются в основании древа рода и группируются в кладу всегда с низкими бутстрэпиндексами. Судя по нуклеотидным последовательностям ITS и гена 5.8S рРНК , виды секций Hydropoa и Glyceria представляют собой две независимо возникшие монофилетичные ветви в эволюции рода Glyceria, к последней из которых относится и Pleuropogon sabinii.
Экологическая генетика. 2011;9(4):63-69
63-69
Изучение механизмов регуляции гена РНО3 в зависимости от источника азота в среде у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Аннотация
Тонкая регуляция экспрессии генов осуществляется посредством конкуренции транскрипционных факторов за промоторы, что обеспечивает своевременный ответ клетки на изменения условий среды. Ген PHO3 дрожжей S. cerevisiae кодирует конститутивную кислую фосфатазу. В данной работе изучали генетический контроль экспрессии гена PHO3 в зависимости от источника азота. Показано, что уровень экспрессии гена снижается на среде с «бедным» источником азота, мочевиной. Выявлены возможные механизмы регуляции экспрессии гена PHO3 при участии репрессора генов азотного метаболизма Gzf3p и убиквитин-лигазы Rsp5p.
Экологическая генетика. 2011;9(4):70-78
70-78
Исследование ассоциации полиморфизма генов APOE, LPL и NOS3 с риском сосудистой патологии у детей и беременных женщин
Аннотация
Методом ПЦР /ПДРФ анализа у беременных женщин с гестозом, детей с артериальной гипертензией, с метаболическим синдромом и ожирением, а также у беременных без гестоза, у школьников и доноров (группы контроля), исследован полиморфизм генов метаболизма липидов: аполипопротеина Е - APOE (Е2/Е3/Е4), липопротеинлипазы LPL (1595C>G) и эндотелиальной NO-синтазы - NOS3 (-786T>C). Зарегистрировано статистически значимое увеличение частоты генотипа T/C по гену NOS3 у беременных женщин с гестозом и с физиологической беременностью по сравнению с группой доноров (56, 59 и 37 % соответственно, F < 0,03)
Экологическая генетика. 2011;9(4):25-34
25-34
Особенности полиморфизма генов энергетического обмена PGC-1, семейств PPAR и UCP в двух возрастных группах населения Санкт-Петербурга
Аннотация
Методом ПДРФ -анализа изучен полиморфизм генов: PPARA G/C, PPARG Pro12Ala, PPARD +294Т/С, PGC-1 Gly482Ser, UCP2 Ala55Val и UCP3 -55С/T у лиц старше 69 лет (группа 1) и лиц среднего возраста (группа 2). Частоты генотипов T/C по гену PPARD, Ser/Ser по гену PGC-1 и C/C по гену UCP3 выше в группе 1 по сравнению с группой 2. Анализ распределения частот генотипов выявил гендерные различия по генам PPARA, PPARD, PGC-1, UCP2. Обсуждается ассоциация полиморфизма данных генов с долголетием, их значение в профилактике и оптимизации лечения возрастных заболеваний.
Экологическая генетика. 2011;9(4):35-42
35-42
Полиморфные варианты генов репарации ДНК (XRCC1, XRCC3, XPD, XPC) и риск развития миомы матки у работниц нефтехимического комплекса
Аннотация
Миома матки мультифакториальное заболевание, в развитии которого принимают участие как генетические, так и внешнесредовые факторы. В данной работе был проведен анализ полиморфных маркеров генов эксцизионной репарации ДНК (XRCC1, XPD/ERCC2, XPC) и репарации двуцепочечных разрывов ДНК (XRCC3) у работниц крупного нефтехимического комплекса ОАО «Салаватнефтеоргсинтез». Установлено, что гомозиготный по минорному аллелю генотип и минорный аллель полиморфного локуса Gln939Lys (rs2228001) гена XPС ассоциированы с риском развития миомы матки (3,9 (95 % CI 1,08-14,4) для генотипа и 2,3 (95 % CI 1,4-3,7) для аллеля). С помощью программы MDR была определена двухлокусная модель взаимодействия ДНК -локусов, приводящая к развитию миомы матки, вариантом повышенного риска является комбинация гетерозиготных генотипов генов XPC и XRCC1 AC/AG OR = 2,27 (95 % CI 1,04-4,92).
Экологическая генетика. 2011;9(4):43-51
43-51
Выявление генов, кодирующих потенциально амилоидогенные белки, участвующих в регуляции нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Аннотация
Ранее мы показали, что делеция последовательности, кодирующей N-терминальный домен гена SUP35, создает генетический фон, позволяющий выявлять новые гены и эпигенетические детерминанты, контролирующие нонсенссупрессию. В данном исследовании при помощи геномного скрининга мы выявили три гена, кодирующих потенциально амилоидогенные белки, сверхэкспрессия которых влияет на супрессорный фенотип в штамме, продуцирующем химерный белок Aβ-Sup35MC на фоне делеции хромосомной копии гена SUP35, кодирующего фактор терминации трансляции eRF 3. Нами установлено, что гены NAB2, NAB3 и VTS1 участвуют в регуляции нонсенссупрессии у дрожжей S. cerevisiae.
Экологическая генетика. 2011;9(4):79-86
79-86