ALLО- AND SYMPATRIC SIBLING SPECIES OF SACCHARОMYСES CEREVISIAE: DNA-DNA REASSOCIATION


Cite item

Full Text

Abstract

Precise DNA-DNA reassociation data were obtained for new biological species S. cariocanus, S. kudriavzevii and S. mikatae, for the first time. The three species showed 25-51 % - of DNA-DNA reassociation with one another and with the known species S. cerevisiae, S. bayanus and S. paradoxus.Only in the combination S. paradoxus × S. cariocanus there was 99 % DNA-DNA homology. Despite high DNA-DNA reassociation value, the two yeasts are genetically isolated: their hybrids are sterile forming non-viable meiotic products (ascospores). Having four reciprocal translocations in its karyotype, S. cariocanus represents species in statu nascendi.

About the authors

Yuliya V Mikhailova

Komarov Botanical Institute, Russian Academy of Sciences. Saint Petersburg, Russia

Email: ymikhaylova@binran.ru

Sofia Castello

New University Lisbon, Caparica, Portugal

Email: sas@fct.unl.pt

Elena S Naumova

Research Institute for Genetics and Selection of Industrial Microorganisms, Moscow, RF

Email: lena_naumova@yahoo.com

Gennadiy I Naumov

Research Institute for Genetics and Selection of Industrial Microorganisms, Moscow, RF

Email: gnaumov@yahoo.com

References

  1. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж., 1984. Молекулярное клонирование. Методы генетической инженерии. Москва: Мир, 479 с.
  2. Наумов Г. И., 1999. Дивергентная популяция дрожжей Saccharomyces paradoxus на Гавайях: вид in statu nascendi//Докл. АН. Т. 364. № 2. С. 281-283.
  3. Наумов Г. И., 2009а. Гибридологический анализ нового биологического вида Saccharomyces arboricolus Wang et Bai//Докл. АН. Т. 426. № 3. С. 424-426.
  4. Наумов Г. И., 2009б. Генетическая идентификация дрожжей Saccharomyces kudriavzevii из европейской популяции//Экологическая генетика. Т. 7. № 1. С. 9-11.
  5. Наумов Г. И., Кондратьева В. И., Наумова Т. И. Гудкова Н. К., 1983. Генетические основы классификации дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Изучение выживаемости аскоспор гибридов//Журнал общей биологии. Т. 44. № 5. С. 648-660.
  6. Britten R. J., Pavich M., Smith J., 1970. A new method of DNA purification//Carnegie Inst. Wash. Year Book. Vol. 68. P. 400-402.
  7. Fischer G., James S. A., Roberts I. N. Oliver S. G., Louis E. S., 2000. Chromosomal evolution in Saccharomyces//Nature. Vol. 405. P. 451-454.
  8. Kaneko Y., Banno I., 1991. Reexamination of Saccharomyces bayanus strains by DNA-DNA hybridization and electrophoretic karyotyping//IFO Res. Comm. Vol. 15. P. 30-41.
  9. Kurtzman C. P., Smiley M. J., Johnson C. J., Wickerham L. J., Fuson G. B., 1980. Two closely related heterothalic species, Pichia amylophyla and Pichia missisipiensis: characterisation by hybridization and deoxyribonucleic acid reassociation//Int. J. Syst. Bacteriol. Vol. 30. P. 208-216.
  10. Lemos G. A., Valente P., Pimental D., Hagler A. N., Mendonga-Hagler L. C., 1995. Characterization of Saccharomyces paradoxus and a new species of Saccharomyces from Brazilian ecosystem.//Abstracts of VII Int. Symp. Microb. Ecol. (ISME-7). Santos-São Paulo. Brazil. 27 August -01 September. 1995. P. 215.
  11. Naumov G. I., 1987. Genetic basis for classification and identification of the ascomycetous yeasts//Studies in Mycology. N 30. P. 469-475.
  12. Naumov G. I., James S. A., Naumova E. S., Louis E. J., Roberts I. N., 2000. Three new species in the Saccharomyces sensu stricto complex: Saccharomyces cariocanus, Saccharomyces kudriavzevii and Saccharomyces mikatae//Int. J. Syst. Evol. Microb. Vol. 50. P. 1931 -1942.
  13. Rodrigues de Sousa M., Madeira-Lopes A., SpencerMartins I., 1995. The significance of active fructose transport and maximum temperature for growth in the taxonomy of Saccharomyces sensu stricto//System. Appl. Microbiol. Vol. 18. P. 44-51.
  14. Sampaio J. P., Gongalves P., 2008. Natural populations of Saccharomyces kudriavzevii in Portugal are associated with oak bark and are sympatric with S. cerevisiae and S. paradoxus//Appl. Environ. Microbiol. Vol. 74. N 7. P. 2144-2152.
  15. Seidler R. J., Mandel M., 1971. Quantitative aspects of deoxyribonucleic acid renaturation: base composition, site of chromosome replication, and polynucleotide homologies//J. Bacteriol. Vol. 106. P. 608-614.
  16. Vaughan Martini A., 1989. Saccharomyces paradoxus comb. nov., a newly separated species of the Saccharomyces sensu stricto complex based upon nDNA/nDNA homologies//System. Appl. Microbiol. Vol. 12. P. 179-182.
  17. Vaughan Martini A., Kurtzman C. P., 1985. Deoxyribonucleic acid relatedness among species of the genus Saccharomyces sensu stricto//Int. J. Syst. Bacteriol. Vol. 35. P. 508-511.
  18. Wang S.-A., Bai F.-Y., 2008. Saccharomyces arboricolus sp. nov., a yeast species from tree bark//Int. J. Syst. Evol. Microbiol. Vol. 58. P. 510-514.
  19. Yamada Y., Mikata K., Banno I., 1993. Reidentification of 121 strains of genus Saccharomyces//Bull. JFCC. Vol. 9. P. 95-119.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2009 Mikhailova Y.V., Castello S., Naumova E.S., Naumov G.I.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».