МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ БЕЛКИ КЛЕТОЧНОГО ДЕЛЕНИЯ И ПРИЛЕЖАЩИХ ГЕНОВ ЦИАНОБАКТЕРИИ PLEUROCAPSA SP

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

На примере Pleurocapsa sp. CALU 1126 впервые для группы плеврокапсовых цианобактерий реконструированы нуклеотидные последовательности гена белка клеточного деления FtsZ и прилежащих участков генома. Сопоставление данного локуса с соответствующими участками генома других цианобактерий указывает на различия в филогении, прослеживаемой по разным генам

Об авторах

Мария Юрьевна Скопина

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: masha_sk@list.ru
м. н. с., аспирант кафедры микробиологии

Елена Петровна Чижевская

ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии

Email: chizhevskaya@yandex.ru
к. б. н., с. н. с., лаборатория генетики и селекции микроорганизмов

Евгений Евгеньевич Андронов

ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии

Email: eeandr@gmail.com
к. б. н., заведующий лабораторией микробиологического мониторинга и биоремедиации почв

Александр Васильевич Пиневич

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: Pinevich.A@mail.ru
д. б. н., профессор, заведующий кафедрой микробиологии

Список литературы

  1. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж., 1984. Методы генной инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 480 с.
  2. Altschul S. F., Gish W., Miller W. et al., 1990. Basic local alignment search tool // J. Mol. Biol. Vol. 215. P. 403–410.
  3. Anbudurai P. R., Mor T. S., Ohad I. et al., 1994. The ctpA gene encodes the C-terminal processing protease for the D1 protein of the photosystem II reaction center complex // Plant Biol. Vol. 91. P. 8082–8086.
  4. Barabas O., Ronning D. R., Guynet C. et al., 2007. Mechanism of IS200/IS605 family DNA transposases: activation and transposon-directed target site selection // Cell. Vol. 132. P. 208–220.
  5. Billi D., Caiola M. G., Paolozzi L. et al., 1998. A method for DNA extraction from the desert cyanobacterium Chroococcidiopsis and its application to identification of ftsZ gene // Appl. Environ. Microbiol. Vol. 64. P. 4053–4056.
  6. Blank C. E., Sanchez-Baracaldo P. A., 2010. Timing of morphological and ecological innovations in the cyanobacteria — a key to understanding the rise in atmospheric oxygen // Geobiology. Vol. 8. P. 1–23.
  7. Delihas N., 2009. Stem–loop sequences specific to transposable element IS605 are found linked to lipoprotein genes in Borrelia plasmids // PLoS ONE. Vol. 4. P. 1–10.
  8. Errington J., Daniel R. A., Scheffers D.-J., 2003. Cytokinesis in bacteria // Microbiol. Mol. Biol. Rev. Vol. 67. P. 52–65.
  9. Faguy D. M., Doolittle W. F., 1998. The evolution of cell division // Curr. Biol. Vol. 8. P. R338–R341.
  10. Goericke R., Welschmeyer A., 1993. The marine prochlorophyte Prochlorococcus marinus contributes significantly to phytoplankton biomass and primary production in the Sargasso Sea // Deep-Sea Res. Vol. 40. P. 2283–2294.
  11. Grant S. G. N., Jessee J., Bloom F. R., 1990. Differential plasmid rescue from transgenic mouse DNAs into Escherichia coli methylation-restriction mutant // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 87. P. 4645–4649.
  12. Hiroaki I., Nogima H., Okayama H., 1990. High efficiency transformation of Escherichia coli with plasmids // Gene. Vol. 96. P. 23–28.
  13. Inagaki N., Maitra R., Sato K. et al., 2001. Amino acid residues that are critical for in vivo catalytic activity of CtpA, the carboxyl-terminal processing protease for the D1 protein of photosystem II // J. Biol. Chem. Vol. 276. N. 32. P. 30099–30105.
  14. Koksharova O. A. Wolk C. P., 2002. A novel gene that bears a DnaJ motif influences cyanobacterial cell division // J. Bacteriol. Vol. 184. P. 5524–5528.
  15. Lutkenhaus J., 1998. The regulation of bacterial cell division: a time and place for it // Curr. Opin. Microbiol. Vol. 1. P. 210–215.
  16. Lutkenhaus J., Addinal S. G. Bacterial cell division //Biochem. J. 1997. Vol. 66 P. 93–116.
  17. Mahillon J., Chandler M., 1998. Insertion sequences // Microbiol. Mol. Biol. Rev. Vol. 62. P. 725–774.
  18. Maple J., Møller S. G., 2007. Plastid division: evolution, mechanism and complexity // Ann. Bot. Vol. 99. P. 565–579.
  19. Mazouni K., Domain F., Cassier-Chauvat C. et al., 2004. Molecular analysis of the key cytokinetic components of cyanobacteria: FtsZ, ZipN and Min CDE //Mol. Microbiol. Vol. 52. P. 1145–1158.
  20. Miyagishima S., Wolk C. P., Osteryoung K. W., 2005. Identification of cyanobacterial cell division genes by comparative and mutational analyses // Mol. Microbiol. Vol. 56. P. 126–143.
  21. Mizote T., Tsuda M., Smith S. et al., 1999. Cloning and haracterization of the thiD/J gene of Escherichia coli encoding a thiamine-synthesizing bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase // Microbiol. Vol. 145. P. 495–501.
  22. Nanninga N., 2001. Cytokinesis in prokaryotes and eukaryotes: common principles and different solutions//Microbiol. Mol. Biol. Rev. Vol. 65. P. 319–333.
  23. Norrander J., Kempe T., Messing J., 1983. Construction of improved M13 vectors using oligonucleotide-directed mutagenesis // Gene. Vol. 26. P. 101–106.
  24. Osteryoung K. W., Nunnari J., 2003. The division of endosymbiotic organelles // Science. Vol. 302. P. 1698–1704.
  25. Pinevich A. V., Mamkaeva K. A., Titova N. N. et al., 2004. St. Petersburg Culture Collection (CALU): four decades of storage and research with microscopic algae, cyanobacteria and other microorganisms // Nova Hedwigia. Vol. 79. P. 115–126.
  26. Pinevich A. V., Matthijs H. C. P., Averina S. G. et al., 1997. Picocyanophyte (cyanobacterium) from the boreal inland water accumulates phycoerythrin as a major biliprotein // Algol. Studies. Vol. 87. P. 99–108.
  27. Robson S. A., King G. F., 2006. Domain architecture and structure of the bacterial cell division protein DivIB // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 103. P. 6700–6705.
  28. Teplyakov A., Obmolova G., Sarikaya E. et al., 2004. Crystal structure of the YgfZ protein from Escherichia coli suggests a folate-dependent regulatory role in one-carbon metabolism // J. Bacteriol. Vol. 186. P. 7134–7140.
  29. Villanelo F., Ordenes A., Brunet J. et al., 2011. A model for the Escherichia coli FtsB/FtsL/FtsQ cell division complex // BMC Struct. Biol. Vol. 11. P. 1–15.
  30. WangX., Lutkenhaus J., 1996. FtsZ ring: the eubacterial division apparatus conserved in achaebacteria //Mol. Microbiol. Vol. 21. P. 313–319.
  31. Waterbury J. B., Stanier R. Y., 1978. Patterns of growth and development in pleurocapsalean cyanobacteria//Microbiol. Rev. Vol. 42. P. 2–44.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Скопина М.Ю., Чижевская Е.П., Андронов Е.Е., Пиневич А.В., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».