МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ БЕЛКИ КЛЕТОЧНОГО ДЕЛЕНИЯ И ПРИЛЕЖАЩИХ ГЕНОВ ЦИАНОБАКТЕРИИ PLEUROCAPSA SP

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

На примере Pleurocapsa sp. CALU 1126 впервые для группы плеврокапсовых цианобактерий реконструированы нуклеотидные последовательности гена белка клеточного деления FtsZ и прилежащих участков генома. Сопоставление данного локуса с соответствующими участками генома других цианобактерий указывает на различия в филогении, прослеживаемой по разным генам

Об авторах

Мария Юрьевна Скопина

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: masha_sk@list.ru
м. н. с., аспирант кафедры микробиологии

Елена Петровна Чижевская

ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии

Email: chizhevskaya@yandex.ru
к. б. н., с. н. с., лаборатория генетики и селекции микроорганизмов

Евгений Евгеньевич Андронов

ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии

Email: eeandr@gmail.com
к. б. н., заведующий лабораторией микробиологического мониторинга и биоремедиации почв

Александр Васильевич Пиневич

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: Pinevich.A@mail.ru
д. б. н., профессор, заведующий кафедрой микробиологии

Список литературы

  1. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж., 1984. Методы генной инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 480 с.
  2. Altschul S. F., Gish W., Miller W. et al., 1990. Basic local alignment search tool // J. Mol. Biol. Vol. 215. P. 403–410.
  3. Anbudurai P. R., Mor T. S., Ohad I. et al., 1994. The ctpA gene encodes the C-terminal processing protease for the D1 protein of the photosystem II reaction center complex // Plant Biol. Vol. 91. P. 8082–8086.
  4. Barabas O., Ronning D. R., Guynet C. et al., 2007. Mechanism of IS200/IS605 family DNA transposases: activation and transposon-directed target site selection // Cell. Vol. 132. P. 208–220.
  5. Billi D., Caiola M. G., Paolozzi L. et al., 1998. A method for DNA extraction from the desert cyanobacterium Chroococcidiopsis and its application to identification of ftsZ gene // Appl. Environ. Microbiol. Vol. 64. P. 4053–4056.
  6. Blank C. E., Sanchez-Baracaldo P. A., 2010. Timing of morphological and ecological innovations in the cyanobacteria — a key to understanding the rise in atmospheric oxygen // Geobiology. Vol. 8. P. 1–23.
  7. Delihas N., 2009. Stem–loop sequences specific to transposable element IS605 are found linked to lipoprotein genes in Borrelia plasmids // PLoS ONE. Vol. 4. P. 1–10.
  8. Errington J., Daniel R. A., Scheffers D.-J., 2003. Cytokinesis in bacteria // Microbiol. Mol. Biol. Rev. Vol. 67. P. 52–65.
  9. Faguy D. M., Doolittle W. F., 1998. The evolution of cell division // Curr. Biol. Vol. 8. P. R338–R341.
  10. Goericke R., Welschmeyer A., 1993. The marine prochlorophyte Prochlorococcus marinus contributes significantly to phytoplankton biomass and primary production in the Sargasso Sea // Deep-Sea Res. Vol. 40. P. 2283–2294.
  11. Grant S. G. N., Jessee J., Bloom F. R., 1990. Differential plasmid rescue from transgenic mouse DNAs into Escherichia coli methylation-restriction mutant // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 87. P. 4645–4649.
  12. Hiroaki I., Nogima H., Okayama H., 1990. High efficiency transformation of Escherichia coli with plasmids // Gene. Vol. 96. P. 23–28.
  13. Inagaki N., Maitra R., Sato K. et al., 2001. Amino acid residues that are critical for in vivo catalytic activity of CtpA, the carboxyl-terminal processing protease for the D1 protein of photosystem II // J. Biol. Chem. Vol. 276. N. 32. P. 30099–30105.
  14. Koksharova O. A. Wolk C. P., 2002. A novel gene that bears a DnaJ motif influences cyanobacterial cell division // J. Bacteriol. Vol. 184. P. 5524–5528.
  15. Lutkenhaus J., 1998. The regulation of bacterial cell division: a time and place for it // Curr. Opin. Microbiol. Vol. 1. P. 210–215.
  16. Lutkenhaus J., Addinal S. G. Bacterial cell division //Biochem. J. 1997. Vol. 66 P. 93–116.
  17. Mahillon J., Chandler M., 1998. Insertion sequences // Microbiol. Mol. Biol. Rev. Vol. 62. P. 725–774.
  18. Maple J., Møller S. G., 2007. Plastid division: evolution, mechanism and complexity // Ann. Bot. Vol. 99. P. 565–579.
  19. Mazouni K., Domain F., Cassier-Chauvat C. et al., 2004. Molecular analysis of the key cytokinetic components of cyanobacteria: FtsZ, ZipN and Min CDE //Mol. Microbiol. Vol. 52. P. 1145–1158.
  20. Miyagishima S., Wolk C. P., Osteryoung K. W., 2005. Identification of cyanobacterial cell division genes by comparative and mutational analyses // Mol. Microbiol. Vol. 56. P. 126–143.
  21. Mizote T., Tsuda M., Smith S. et al., 1999. Cloning and haracterization of the thiD/J gene of Escherichia coli encoding a thiamine-synthesizing bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase // Microbiol. Vol. 145. P. 495–501.
  22. Nanninga N., 2001. Cytokinesis in prokaryotes and eukaryotes: common principles and different solutions//Microbiol. Mol. Biol. Rev. Vol. 65. P. 319–333.
  23. Norrander J., Kempe T., Messing J., 1983. Construction of improved M13 vectors using oligonucleotide-directed mutagenesis // Gene. Vol. 26. P. 101–106.
  24. Osteryoung K. W., Nunnari J., 2003. The division of endosymbiotic organelles // Science. Vol. 302. P. 1698–1704.
  25. Pinevich A. V., Mamkaeva K. A., Titova N. N. et al., 2004. St. Petersburg Culture Collection (CALU): four decades of storage and research with microscopic algae, cyanobacteria and other microorganisms // Nova Hedwigia. Vol. 79. P. 115–126.
  26. Pinevich A. V., Matthijs H. C. P., Averina S. G. et al., 1997. Picocyanophyte (cyanobacterium) from the boreal inland water accumulates phycoerythrin as a major biliprotein // Algol. Studies. Vol. 87. P. 99–108.
  27. Robson S. A., King G. F., 2006. Domain architecture and structure of the bacterial cell division protein DivIB // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 103. P. 6700–6705.
  28. Teplyakov A., Obmolova G., Sarikaya E. et al., 2004. Crystal structure of the YgfZ protein from Escherichia coli suggests a folate-dependent regulatory role in one-carbon metabolism // J. Bacteriol. Vol. 186. P. 7134–7140.
  29. Villanelo F., Ordenes A., Brunet J. et al., 2011. A model for the Escherichia coli FtsB/FtsL/FtsQ cell division complex // BMC Struct. Biol. Vol. 11. P. 1–15.
  30. WangX., Lutkenhaus J., 1996. FtsZ ring: the eubacterial division apparatus conserved in achaebacteria //Mol. Microbiol. Vol. 21. P. 313–319.
  31. Waterbury J. B., Stanier R. Y., 1978. Patterns of growth and development in pleurocapsalean cyanobacteria//Microbiol. Rev. Vol. 42. P. 2–44.

© Скопина М.Ю., Чижевская Е.П., Андронов Е.Е., Пиневич А.В., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах