SEARCHING FOR NEW FACTORS WHICH INFLUENCE TRANSLATION TERMINATION IN YEASTSACCHAROMYCES CEREVISIAE

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

In the yeast Saccharomyces cerevisiae translation termination factor eRF1 is encoded by the essential gene SUP45. Here we applied multicopy yeast library to identify a new factor which interacts with the release factor eRF1 in yeast Saccharomyces cerevisiae. We identified EСM23 gene whose overexpression decreased viability of sup45 nonsense mutants. We also showed that ECM23 overexpression had antisuppressor effect but the level of eRF1 protein was the same as that in the wild-type cells. The mechanisms by which ECM23 influence viability of sup45 mutants are discussed

About the authors

Svetlana Yevgenyevna Moskalenko

St. Petersburg Branch Vavilov Institute of General Genetics (RAS)

Email: smoskalenko@mail.ru
Ph. D., Senior Researcher, Assoc. Prof. Dept. of Genetics and Biotechnology

Olga Anatolyevna Murina

St.-Petersurg State University

Email: olga_murina@rambler.ru
student, Dept. of Genetics and Biotechnology

Olga Leonidovna Askinazi

St.-Petersurg State University

student, Dept. of Genetics and Biotechnology

Galina Anatolyevna Zhuravleva

St.-Petersurg State University

Email: zhouravleva@rambler.ru
Ph.D., Professor of the Dept. of Genetics and Biotechnology

References

  1. Bertram G., Innes S., Minella O. et al., 2001. Endless possibilities: translation termination and stop codon recognition // Microbiology. Vol. 147. P. 255–269.
  2. Bradley M. E., Bagriantsev S., Vishveshwara N., Liebman S. W., 2003. Guanidine reduces stop codon read-through caused by missense mutations in SUP35 or SUP45 // Yeast. Vol. 20. P. 625–632.
  3. Breining P., Piepersberg W., 1986. Yeast omnipotent supressor SUP1 (SUP45): nucleotide sequence of the wildtype and a mutant gene // Nucleic Acids Res. Vol. 14. P. 5187–5197.
  4. Canizares J. V., Pallotti C., Saínz-Pardo I. et al., 2002. The SRD2 gene is involved in Saccharomyces cerevisiae morphogenesis // Arch. Microbiol. Vol. 177. P. 352–357.
  5. Chabelskaya S., Kiktev D., Inge-Vechtomov S., et al., 2004. Nonsense mutations in the essential gene SUP35 of Saccharomyces cerevisiae are non-lethal //Mol. Genet. Genomics. Vol. 272. P. 297–307.
  6. Donahue T. F., Cigan A. M., Pabich E. K., Valavicius B. C., 1988. Mutations at a Zn (II) finger motif in the yeast eIF-2 beta gene alter ribosomal start-site selection during the scanning process // Cell. Vol. 54. P. 621–632.
  7. Fabian G. R., Hess S. M., Hopper A. K., 1990. Srd1, a Saccharomyces cerevisiae suppressor of the temperature-sensitive pre-rRNA processing defect of rrp1–1 //Genetics. Vol. 124. P. 497–504.
  8. Frolova L., Le Goff X., Rasmussen H. et al., 1994. A highly conserved eukaryotic protein family possessing properties of polypeptide chain release factor // Nature. Vol. 372. P. 701–703.
  9. Frolova L., Le Goff X., Zhouravleva G. et al., 1996. Eukaryotic polypeptide chain release factor eRF3 is an eRF1-and ribosome-dependent guanosine triphosphatase // RNA. Vol. 2. P. 334–341.
  10. Gietz R. D., Schiestl R. H., Willems A. R., Woods R. A., 1995. Studies on the transformation of intact yeast cells by the LiAc/SS-DNA/PEG procedure // Yeast. Vol. 11. P. 355–360.
  11. Guthrie C., Fink G. R., 1991. Guide to yeast genetics and molecular biology. // San Diego: Academic Press.
  12. Himmelfarb H. J., Maicas E., Friesen J D., 1985. Isolation of the SUP45 omnipotent suppressor gene of Saccharomyces cerevisiae and characterization of its gene product // Mol. Cell Biol. Vol. 5. P. 816–822.
  13. Hess S. M., Stanford D. R., Hopper A. K., 1994. SRD1, a S. cerevisiae gene affecting pre-rRNA processing contains a C2/C2 zinc finger motif // Nucleic Acids Res. Vol. 22. P. 1265–1271.
  14. Inge-Vechtomov S., Zhouravleva G., Philippe M., 2003. Eukaryotic release factors (eRFs) history // Biol. Cell. Vol. 95. P. 195–209.
  15. Kaiser C, Michaelis S, Mitchell A., 1994. Methods in yeast genetics. // Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  16. Kikuchi Y., Shimatake H., Kikuchi A., 1988. A yeast gene required for the G1-to-S transition encodes a protein containing an A-kinase target site and GTPase domain // EMBO J. Vol. 7. P. 1175–1182.
  17. Kisselev L., Ehrenberg M., Frolova L., 2003. Termination of translation: interplay of mRNA, rRNAs and release factors?//EMBO J. Vol. 22. P. 175–182.
  18. Kushnirov V. V., Ter Avanesyan M. D., Telckov M. V. et al., 1988. Nucleotide sequence of the SUP2 (SUP35) gene of Saccharomyces cerevisiae // Gene. Vol. 66. P. 45–54.
  19. Laurino J. P., Thompson G. M., Pacheco E., Castilho B. A., 1999. The beta Subunit of Eukaryotic Translation Initiation Factor 2 Binds mRNA through the Lysine Repeats and a Region Comprising the C2-C2 Motif //Mol. and Cell. Biol. Vol. 19. P. 173–181.
  20. Lussier M., White A. M., Sheraton J. et al., 1997. Large scale identification of genes involved in cell surface biosynthesis and architecture in Saccharomyces cerevisiae // Genetics. Vol. 147. P. 435–450.
  21. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J., 1982. Molecular cloning a laboratory manual // Cold Spring Harbor, N.Y: Cold Spring Harbor Laboratory.
  22. Moskalenko S. E., Chabelskaya S. V., Inge-Vechtomov S. G. et al., 2003. Viable nonsense mutants for the essential gene SUP45 of Saccharomyces cerevisiae //BMC Mol. Biol. Vol. 4: 2.
  23. Murina O. A., Moskalenko S. E., Zhouravleva G. A., 2010. Overexpression of genes encoding tRNA (Tyr) AND tRNA (Gln) improves viability of nonsense mutants in SUP45 gene in yeast Saccharomyces cerevisiae // Mol.Biol. Vol. 44. P. 301–310.
  24. Rose M. D., Winston F. M., Hieter P., Sherman F., 1990. Methods in yeast genetics a laboratory course manual // Cold Spring Harbor, N.Y: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  25. Sherman F., Fink G. R., Hicks J. B., 1986. Laboratory course manual for methods in yeast genetics. // N.Y., Cold Spring Harbor Laboratory.
  26. Schiestl R. H., Prakash S., 1988. RAD1, an excision repair gene of Saccharomyces cerevisiae, is also involved in recombination // Mol. Cell Biol. Vol. 8. P. 3619–3626.
  27. Stansfield I., Jones K. M., Kushnirov V. V. et al., 1995. The products of the SUP45 (eRF1) and SUP35 genes interact to mediate translation termination in Saccharomyces cerevisiae // EMBO J. Vol. 14. P. 4365–4373.
  28. Stansfield I., Eurwilaichitr L., Akhmaloka, Tuite M. F., 1996. Depletion in the levels of the release factor eRF1 causes a reduction in the efficiency of translation termination in yeast // Mol. Microbiol. Vol. 20. P. 1135–1143.
  29. Valouev I. A., Urakov V. N., Kochneva-Pervukhova N. V., et al., 2004. Translation termination factors function outside of translation: yeast eRF1 interacts with myosin light chain, Mlc1p, to effect cytokinesis //Mol. Microbiol. Vol. 53. P. 687–696.
  30. Von der Haar T, Tuite M. F., 2007. Regulated translational bypass of stop codons in yeast // Trends Microbiol. Vol.15. P. 78–86.
  31. Wilson P. G., Culbertson M. R., 1988. SUF12 suppressor protein of yeast. A fusion protein related to the EF-1 family of elongation factors//J. Mol. Biol. Vol. 199. P. 559–573.
  32. Zhouravleva G., Frolova L., Le Goff X. et al., 1995. Termination of translation in eukaryotes is governed by two interacting polypeptide chain release factors, eRF1 and eRF3 // EMBO J. Vol. 14. P. 4065–4072.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2013 Moskalenko S.Y., Murina O.A., Askinazi O.L., Zhuravleva G.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».