Поиск новых факторов, влияющих на процесстерминации трансляции у дрожжей Saccharomyces cerevisiae

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Для поиска белков, взаимодействующих с фактором терминации трансляции eRF1, кодируемых у дрожжей Saccharomyces сerevisiae геном SUP45, проводили скрининг библиотеки дрожжевых генов на мультикопийной плазмиде. Этот подход позволил выявить ген EСM23, увеличение экспрессии которого приводило к понижению жизнеспособности нонсенс-мутантов sup45. Сверхэкспрессия этого гена приводила также к антисупрессорному эффекту, не влияя при этом на количество белка eRF1 в клетке. Обсуждаются возможные механизмы влияния гена EСM23 на жизнеспособность нонсенс-мутантов по гену SUP45

Об авторах

Светлана Евгеньевна Москаленко

Санкт-Петербургский филиал Института общей генетики им. Н. И. Вавилова

Email: smoskalenko@mail.ru
к. б. н., с. н. с., доцент кафедры генетики и биотехнологии

Ольга Анатольевна Мурина

СПбГУ

Email: olga_murina@rambler.ru
студент, кафедра генетики и биотехнологии

Ольга Леонидовна Аскинази

СПбГУ

студент, кафедра генетики и биотехнологии

Галина Анатольевна Журавлева

СПбГУ

Email: zhouravleva@rambler.ru
д. б. н., профессор кафедры генетики и биотехнологии

Список литературы

  1. Bertram G., Innes S., Minella O. et al., 2001. Endless possibilities: translation termination and stop codon recognition // Microbiology. Vol. 147. P. 255–269.
  2. Bradley M. E., Bagriantsev S., Vishveshwara N., Liebman S. W., 2003. Guanidine reduces stop codon read-through caused by missense mutations in SUP35 or SUP45 // Yeast. Vol. 20. P. 625–632.
  3. Breining P., Piepersberg W., 1986. Yeast omnipotent supressor SUP1 (SUP45): nucleotide sequence of the wildtype and a mutant gene // Nucleic Acids Res. Vol. 14. P. 5187–5197.
  4. Canizares J. V., Pallotti C., Saínz-Pardo I. et al., 2002. The SRD2 gene is involved in Saccharomyces cerevisiae morphogenesis // Arch. Microbiol. Vol. 177. P. 352–357.
  5. Chabelskaya S., Kiktev D., Inge-Vechtomov S., et al., 2004. Nonsense mutations in the essential gene SUP35 of Saccharomyces cerevisiae are non-lethal //Mol. Genet. Genomics. Vol. 272. P. 297–307.
  6. Donahue T. F., Cigan A. M., Pabich E. K., Valavicius B. C., 1988. Mutations at a Zn (II) finger motif in the yeast eIF-2 beta gene alter ribosomal start-site selection during the scanning process // Cell. Vol. 54. P. 621–632.
  7. Fabian G. R., Hess S. M., Hopper A. K., 1990. Srd1, a Saccharomyces cerevisiae suppressor of the temperature-sensitive pre-rRNA processing defect of rrp1–1 //Genetics. Vol. 124. P. 497–504.
  8. Frolova L., Le Goff X., Rasmussen H. et al., 1994. A highly conserved eukaryotic protein family possessing properties of polypeptide chain release factor // Nature. Vol. 372. P. 701–703.
  9. Frolova L., Le Goff X., Zhouravleva G. et al., 1996. Eukaryotic polypeptide chain release factor eRF3 is an eRF1-and ribosome-dependent guanosine triphosphatase // RNA. Vol. 2. P. 334–341.
  10. Gietz R. D., Schiestl R. H., Willems A. R., Woods R. A., 1995. Studies on the transformation of intact yeast cells by the LiAc/SS-DNA/PEG procedure // Yeast. Vol. 11. P. 355–360.
  11. Guthrie C., Fink G. R., 1991. Guide to yeast genetics and molecular biology. // San Diego: Academic Press.
  12. Himmelfarb H. J., Maicas E., Friesen J D., 1985. Isolation of the SUP45 omnipotent suppressor gene of Saccharomyces cerevisiae and characterization of its gene product // Mol. Cell Biol. Vol. 5. P. 816–822.
  13. Hess S. M., Stanford D. R., Hopper A. K., 1994. SRD1, a S. cerevisiae gene affecting pre-rRNA processing contains a C2/C2 zinc finger motif // Nucleic Acids Res. Vol. 22. P. 1265–1271.
  14. Inge-Vechtomov S., Zhouravleva G., Philippe M., 2003. Eukaryotic release factors (eRFs) history // Biol. Cell. Vol. 95. P. 195–209.
  15. Kaiser C, Michaelis S, Mitchell A., 1994. Methods in yeast genetics. // Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  16. Kikuchi Y., Shimatake H., Kikuchi A., 1988. A yeast gene required for the G1-to-S transition encodes a protein containing an A-kinase target site and GTPase domain // EMBO J. Vol. 7. P. 1175–1182.
  17. Kisselev L., Ehrenberg M., Frolova L., 2003. Termination of translation: interplay of mRNA, rRNAs and release factors?//EMBO J. Vol. 22. P. 175–182.
  18. Kushnirov V. V., Ter Avanesyan M. D., Telckov M. V. et al., 1988. Nucleotide sequence of the SUP2 (SUP35) gene of Saccharomyces cerevisiae // Gene. Vol. 66. P. 45–54.
  19. Laurino J. P., Thompson G. M., Pacheco E., Castilho B. A., 1999. The beta Subunit of Eukaryotic Translation Initiation Factor 2 Binds mRNA through the Lysine Repeats and a Region Comprising the C2-C2 Motif //Mol. and Cell. Biol. Vol. 19. P. 173–181.
  20. Lussier M., White A. M., Sheraton J. et al., 1997. Large scale identification of genes involved in cell surface biosynthesis and architecture in Saccharomyces cerevisiae // Genetics. Vol. 147. P. 435–450.
  21. Maniatis T., Fritsch E. F., Sambrook J., 1982. Molecular cloning a laboratory manual // Cold Spring Harbor, N.Y: Cold Spring Harbor Laboratory.
  22. Moskalenko S. E., Chabelskaya S. V., Inge-Vechtomov S. G. et al., 2003. Viable nonsense mutants for the essential gene SUP45 of Saccharomyces cerevisiae //BMC Mol. Biol. Vol. 4: 2.
  23. Murina O. A., Moskalenko S. E., Zhouravleva G. A., 2010. Overexpression of genes encoding tRNA (Tyr) AND tRNA (Gln) improves viability of nonsense mutants in SUP45 gene in yeast Saccharomyces cerevisiae // Mol.Biol. Vol. 44. P. 301–310.
  24. Rose M. D., Winston F. M., Hieter P., Sherman F., 1990. Methods in yeast genetics a laboratory course manual // Cold Spring Harbor, N.Y: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  25. Sherman F., Fink G. R., Hicks J. B., 1986. Laboratory course manual for methods in yeast genetics. // N.Y., Cold Spring Harbor Laboratory.
  26. Schiestl R. H., Prakash S., 1988. RAD1, an excision repair gene of Saccharomyces cerevisiae, is also involved in recombination // Mol. Cell Biol. Vol. 8. P. 3619–3626.
  27. Stansfield I., Jones K. M., Kushnirov V. V. et al., 1995. The products of the SUP45 (eRF1) and SUP35 genes interact to mediate translation termination in Saccharomyces cerevisiae // EMBO J. Vol. 14. P. 4365–4373.
  28. Stansfield I., Eurwilaichitr L., Akhmaloka, Tuite M. F., 1996. Depletion in the levels of the release factor eRF1 causes a reduction in the efficiency of translation termination in yeast // Mol. Microbiol. Vol. 20. P. 1135–1143.
  29. Valouev I. A., Urakov V. N., Kochneva-Pervukhova N. V., et al., 2004. Translation termination factors function outside of translation: yeast eRF1 interacts with myosin light chain, Mlc1p, to effect cytokinesis //Mol. Microbiol. Vol. 53. P. 687–696.
  30. Von der Haar T, Tuite M. F., 2007. Regulated translational bypass of stop codons in yeast // Trends Microbiol. Vol.15. P. 78–86.
  31. Wilson P. G., Culbertson M. R., 1988. SUF12 suppressor protein of yeast. A fusion protein related to the EF-1 family of elongation factors//J. Mol. Biol. Vol. 199. P. 559–573.
  32. Zhouravleva G., Frolova L., Le Goff X. et al., 1995. Termination of translation in eukaryotes is governed by two interacting polypeptide chain release factors, eRF1 and eRF3 // EMBO J. Vol. 14. P. 4065–4072.

© Москаленко С.Е., Мурина О.А., Аскинази О.Л., Журавлева Г.А., 2013

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах