CHROMATIN REMODELING COMPLEX PBAF ACTIVATES AND REPRESSES INFLAMMATORY GENES

A. V. Feoktistov; Феоктистов А. В.; S. G. Georgieva; Георгиева С. Г.; N. V. Soshnikova; Сошникова Н. В.

doi:10.31857/S2686738923600462

Ремоделирующий хроматин комплекс PBAF участвует в активации и репрессии генов воспаления

Авторы: Феоктистов А.В.¹^,2, Георгиева С.Г.¹, Сошникова Н.В.¹^,2
Учреждения:
1. Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
2. Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта
Выпуск: Том 513, № 1 (2023)
Страницы: 590-594
Раздел: Статьи
URL: https://journals.rcsi.science/2686-7389/article/view/244397
DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738923600462
EDN: https://elibrary.ru/GPQOZU
ID: 244397

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Ремоделирующий хроматин комплекс PBAF является одним из важнейших регуляторов состояния хроматина и транскрипции генов у высших эукариот. В данной работе изучена роль PBAF в регуляции NF–κB – зависимой и JAK/STAT – зависимой активации генов воспаления. Показано, что разрушение модуля PBAF, отвечающего за его связывание с хроматином промотора гена, изменяет уровень транскрипции генов обоих путей. Показано, что PBAF может быть как активатором, так и репрессором генов воспаления. Таким образом, PBAF является одним из важных регуляторов экспрессии генов воспаления.

Ключевые слова

SWI/SNF, эукариотические факторы транскрипции, воспаление, NF–kB, Jak/STAT, экспрессия генов

Список литературы

Yuan J. et al., Structure of human chromatin-remodelling PBAF complex bound to a nucleosome, // Nature, 2022. V. 605. P. 166–171.
Centore R.C. et al., Mammalian SWI/SNF Chromatin Remodeling Complexes: Emerging Mechanisms and Therapeutic Strategies, // Trends in Genetics., 2020. V. 36. № 12. P. 936–950.
Ishizaka A. et al., Double plant homeodomain (PHD) finger proteins DPF3a and -3b are required as transcriptional co-activators in SWI/SNF complex-dependent activation of NF-κB RelA/p50 heterodimer, // Journal of Biological Chemistry., 2012. V. 287. № 15. P. 11924–11933.
Ramirez-Carrozzi V.R. et al., A unifying model for the selective regulation of inducible transcription by CpG islands and nucleosome remodeling // Cell., 2009. V. 138. № 1. P. 114–128.
Gioacchino Natoli, NF-κB and chromatin: ten years on the path from basic mechanisms to candidate drugs // Immunological Reviews., 2012. V. 246. № 1. P. 183–192.
Ramirez-Carrozzi V.R. et al., Selective and antagonistic functions of SWI/SNF and Mi-2β nucleosome remodeling complexes during an inflammatory response // Genes & Development., 2006. V. 20. P. 282–296.
Chen M. et al., CDK8/19 Mediator kinases potentiate induction of transcription by NfκB // PNAS., 2017. V. 114. № 38. P. 10208–10213.
Tatarskiy V.V. et al., Stability of the PHF10 subunit of PBAF signature module is regulated by phosphorylation: role of β-TrCP // Scientific Reports., 2017. V. 7. P. 5645.
Brechalov A.V. et al., Mammalian cells contain two functionally distinct PBAF complexes incorporating different isoforms of PHF10 signature subunit // Cell Cycle., 2014. V. 13. № 12. P. 1970–1979.
Soshnikova N.V. et al., PHF10 subunit of PBAF complex mediates transcriptional activation by MYC // Oncogene., 2021. V. 40. № 42. P. 6071–6080.
Vorobyeva N.E. et al., Transcription coactivator SAYP combines chromatin remodeler Brahma and transcription initiation factor TFIID into a single supercomplex // PNAS., 2009. V. 106. № 27. P. 11049–11054.
Min S. et al., Transcriptional regulation and chromatin dynamics at DNA double-strand breaks // Experimental & Molecular Medicine., 2022. V. 54. P. 1705–1712.
Musladin S. et al., The RSC chromatin remodeling complex has a crucial role in the complete remodeler set for yeast PHO5 promoter opening // Nucleic Acids Research., 2014. V. 42. № 7. P. 4270–4282.