Оценка генетического разнообразия Калмыцкой породы крупного рогатого скота республики Калмыкия на основе полногеномного анализа

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В статье представлены результаты оценки биоразнообразия аборигенных породных ресурсов крупного рогатого скота Республики Калмыкия на основе полногеномного генотипирования. Объект изучения - биоматериал, полученный от поголовья КРС калмыцкой породы, выращиваемого в Калмыкии (n = 20). Дополнительно были взяты генотипы калмыцкой породы, имеющиеся в ОНИС БиоТехЖ (ФГБНУ ФИЦ ВИЖ имени Л.К. Эрнста, г. Москва). Препараты по своим качественным и количественным характеристикам пригодны для проведения полногеномных исследований с применением ДНК-чипов. Концентрация двухцепочечной ДНК в образцах варьировала от 16 до 80 нг/мкл, соотношение OD260/OD280 - от 1,77 до 2,12, эффективность генотипирования (call rate) - от 99,72 до 99,84%. Впервые получены данные об уровне генетического разнообразия в популяциях калмыцкой породы крупного рогатого скота Республики Калмыкия с применением ДНК-чипов высокой плотности, и выполнено сравнение рассчитанных популяционно-генетических показателей с тремя породами турано-монгольского происхождения. Калмыцкая порода характеризовалась наиболее высоким уровнем генетического разнообразия, что может быть следствием использования естественной случки при разведении, а также относительно высокой численности популяции, по сравнению с другими породами. Из-за малочисленности поголовья в якутской породе минимальный уровень генетического разнообразия. Результаты исследования найдут применение при разработке программ разведения и сохранения калмыцкой породы КРС.

Об авторах

Иван Федорович Горлов

ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

Email: niimmp@mail.ru

Марина Ивановна Сложенкина

ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

Юрий Николаевич Федоров

ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт биологической промышленности

Елена Юрьевна Анисимова

ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

Екатерина Владимировна Карпенко

ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

Кермен Евгеньевна Бадмаева

ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

Виктория Саналовна Убушиева

ФГБНУ «Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной продукции»

Список литературы

  1. Генджиева О.Б., Сулимова Г.Е. Изучение генетического разнообразия калмыцкого скота с использованием ISSR-фингерпринтинга // Зоотехния. 2009. № 3. С. 4-5.
  2. Зиновьева Н.А., Доцев А.В., Сермягин А.А. и др. Изучение генетического разнообразия и популяционной структуры российских пород крупного рогатого скота с использованием полногеномного анализа SNP // Сельскохозяйственная биология. 2016. Т. 51. № 6. С. 788-800.
  3. Ковальчук А.М. Генетическое разнообразие казахской белоголовой породы крупного рогатого скота // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2021. № 6 (92). С. 283-289.
  4. Моисейкина Л.Г., Каюмов Ф.Г., Чимидова Н.В. и др. Аллелофонд крупного рогатого скота калмыцкой породы разных зональных типов // Сборник научных трудов SWorld. 2013. Т. 49. № 4. С. 6-12.
  5. Улимбашев М.Б., Гостева Е.Р., Краснова О.А. и др. Состояние мясных породных ресурсов крупного рогатого скота России (обзор) // Генетика и разведение животных. 2023. № 1. С. 52-64.
  6. Федоров В.Х., Приступа В.Н., Бабкин О.А., Торосян Д.С. Совершенствование скота калмыцкой породы : монография / под общей редакцией О.А. Бабкина. Персиановский: Донской ГАУ, 2021. 168 с.
  7. Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Болдырев Б.А., Черунова И.В. Генетическое сходство калмыцкого скота племенных хозяйств республики Калмыкия // Современные проблемы науки и образования. 2013. № 2. С. 486.
  8. Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Убушиева А.В. и др. Изменения генофонда скота калмыцкой породы // Животноводство и кормопроизводство. 2020. Т. 103. № 4. С. 65-73.
  9. Чимидова Н.В., Моисейкина Л.Г., Убушиева А.В. и др. Генетическое сходство калмыцкого скота в племенных хозяйствах республики Калмыкия // Аграрно-пищевые инновации. 2021. № 4 (16). С. 28-35.
  10. Юдин Н.С., Ларкин Д.М. Происхождение, селекция и адаптация российских пород крупного рогатого скота по данным полногеномных исследований // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2019. Т. 23. № 5. С. 559-568.
  11. Abdelmanova A.S., Kharzinova V.R., Volkova V.V. et al. Comparative Study of the Genetic Diversity of Local Steppe Cattle Breeds from Russia, Kazakhstan and Kyrgyzstan by Microsatellite Analysis of Museum and Modern Samples // Diversity. 2021. Vol. 13. № 8. Article 351. https://doi.org/10.3390/d13080351.
  12. Chimidova N.V., Moiseikina L.G., Ubushieva A.V. et al. Genetic structure of population of the Kalmyk breed cattle // E3S WEB OF CONFERENCES. XV International Scientific Conference on Precision Agriculture and Agricultural Machinery Industry “State and Prospects for the Development of Agribusiness - Interagromash 2022”. Rostov-on-Don, 2022.
  13. Sermyagin A.A., Dotsev A.V., Gladyr E.A. et al. Whole-genome SNP analysis elucidates the genetic structure of Russian cattle and its relationship with Eurasian taurine breeds // Genetics Selection Evolution. 2018. Vol. 50. Article 37. https://doi.org/10.1186/s12711-018-0408-8.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».