Мониторинг коронавирусной инфекции в киргизской популяции

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования: изучить динамику формирования популяционного иммунитета к SARS-CoV-2 у населения Республики Кыргызстан на фоне COVID-19. Материалы и методы. Работа проведена по методике оценки популяционного иммунитета, разработанной Роспотребнадзором (Россия) и Министерством здравоохранения (Кыргызстан) и Санкт-Петербургским институтом им Пастера. Подбор участников осуществлялся анкетным опросом с использованием облачного (Интернет-сервера) сервиса. Для мониторинга популяционного иммунитета сформирована когорта из 2421 человек, участвовавшая во всех этапах серомониторинга. Добровольцы были рандомизированы по возрастным группам (1–17, 18–29, 30–39, 40–49, 50–59, 60–69, 70+ лет), региональным и профессиональным факторам. Антитела (Abs) к нуклеокапсиду (Nc) и рецептор-связывающему домену (RBD) S-гликопротеина определяли качественным и количественным методами, Исследование проводилось в 3 этапа по единой схеме: I этап — 28.06–03.07.2021 г., II этап — 21–25.02.2022 г. и III этап — 31.10–04.11.2022 г. С 2021 г. в Кырзызстане проводили вакцинацию населения против SARS-CoV-2 преимущественно инактивированными цельновирионными вакцинами. Результаты. Популяционный иммунитет населения к SARS-CoV-CoV-2 преимущественно был обусловлен обоими Abs (Nc+RBD+). К III этапу доля таких лиц достигла 99,2%, доля Nc–RBD– волонтеров до 0,8%. На I этапе доминировали лица среднего возраста, однако возрастные различия нивелировались ко II этапу. Наибольшее влияние на серопревалентность выявлено среди медицинских работников, наименьшее — среди бизнесменов и промышленных рабочих. Значимое влияние на состояние популяционного иммунитета оказала вакцинация населения, охват которой к III этапу достиг 25%. Отмеченные на II и особенно III этапе отказы населения от вакцинации существенно не повлияли на уровень популяционного иммунитета, что, вероятно, могло быть связано с бессимптомными случаями COVID-19, на фоне которой первичная вакцинация оказывала бустерный эффект. Заключение. Динамика популяционного гуморального иммунитета к SARS-CoV-2 включала в себя ряд изменений уровней циркулирующих антител (Nc, RBD), обусловленных как первичной инфекцией, так и вакцинацией. Сформированный популяционный иммунитет населения Кыргызстана позволил снизить заболеваемость практически до спорадического уровня.

Об авторах

А. Ю. Попова

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека

Email: depart@gsen.ru

д.м.н., профессор, руководитель

Россия, Москва

Вячеслав Сергеевич Смирнов

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии 

Россия, Санкт-Петербург

О. T. Касымов

НПО «Профилактическая медицина» Министерства здравоохранения и социального развития

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., профессор, директор 

Киргизия, Бишкек

С. С. Егорова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., зам. директора по инновациям 

Россия, Санкт-Петербург

З. Ш. Нурматов

НПО «Профилактическая медицина» Министерства здравоохранения и социального развития

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., руководитель

Киргизия, Бишкек

И. В. Дрозд

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

к.б.н., зав. центральной клинико-диагностической лабораторией

Россия, Санкт-Петербург

А. M. Миличкина

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

к.м.н., главный врач медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

В. Ю. Смоленский

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека

Email: vssmi@mail.ru

зам. руководителя 

Россия, Москва

Ж. Н. Нуридиновна

НПО «Профилактическая медицина» Министерства здравоохранения и социального развития

Email: vssmi@mail.ru

научный сотрудник 

Киргизия, Бишкек

В. A. Иванов

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

IT-аналитик 

Россия, Санкт-Петербург

Г. З. Саттарова

НПО «Профилактическая медицина» Министерства здравоохранения и социального развития

Автор, ответственный за переписку.
Email: vssmi@mail.ru

научный сотрудник

Киргизия, Бишкек

Э. C. Рэмзи

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

научный аналитик

Россия, Санкт-Петербург

Б. И. Джангазиев

Министерство здравоохранения и социального развития

Email: vssmi@mail.ru

зам. министра здравоохранения по цифровому развитию

Киргизия, Бишкек

Е. В. Зуева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии 

Россия, Санкт-Петербург

У. У. Арабий

Национальный центр иммунопрофилактики Министерства здравоохранения и социального развития

Email: vssmi@mail.ru

специалист по мониторингу и оценке 

Киргизия, Бишкек

В. Г. Дробышевская

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

врач клинической лабораторной диагностики 

Санкт-Петербург

О. Б. Жимбаева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: damaoyuna@rambler.ru

врач Центральной клинико-диагностической лаборатории Медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

А. П. Разумовская

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

врач клинической лабораторной диагностики Центральной клинико-диагностической лаборатории Медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

А. A. Тотолян

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

 д.м.н., профессор, академик РАН, директор 

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Aboura S. The influence of climate factors and government interventions on the Covid-19 pandemic: evidence from 134 countries. Environ. Res., 2022, vol. 208: 112484. doi: 10.1016/j.envres.2021.112484
  2. About Kyrgyz Republic. URL: https://invest.gov.kg/ru/general-information/ (17.04.2023)
  3. ACTIV-3/TICO Study Group; Rogers A.J., Wentworth D., Phillips A., Shaw-Saliba K., Dewar R.L., Aggarwal N.R., Babiker A.G., Chang W., Dharan N.J., Davey V.J., Higgs E.S., Gerry N., Ginde A.A., Hayanga J.W.A., Highbarger H., Highbarger J.L., Jain M.K., Kan V., Kim K., Lallemand P., Leshnower B.G., Lutaakome J.K., Matthews G., Mourad A., Mylonakis E., Natarajan V., Padilla M.L., Pandit L.M., Paredes R., Pett S., Ramachandruni S., Rehman M.T., Sherman B.T., Files D.C., Brown S.M., Matthay M.A., Thompson B.T., Neaton J.D., Lane H.C., Lundgren J.D. The association of baseline plasma SARS-CoV-2 nucleocapsid antigen level and outcomes in patients hospitalized with COVID-19. Ann. Intern. Med., 2022, vol. 175, no. 10, pp. 1401–1410. doi: 10.7326/M22-0924
  4. Agresti A., Coull B.A. Approximate is better than “exact” for interval estimation of binomial proportions. Am. Stat., 1998, vol. 52, pp. 119–126.
  5. Ali H., Alahmad B., Al-Shammari A.A., Alterki A., Hammad M., Cherian P., Alkhairi I., Sindhu S., Thanaraj T.A., Mohammad A., Alghanim G., Deverajan S., Ahmad R., El-Shazly S, Dashti A.A., Shehab M., Al-Sabah S., Alkandari A., Abubaker J., Abu-Farha M., Al-Mulla F. Previous COVID-19 infection and antibody levels after vaccination. Front. Public Health, 2021, vol. 9: 778243. doi: 10.3389/fpubh.2021.778243
  6. Bhattacharya M., Sharma A.R., Dhama K., Agoramoorthy G., Chakraborty C. Hybrid immunity against COVID-19 in different countries with a special emphasis on the Indian scenario during the Omicron period. Int. Immunopharmacol., 2022, vol. 108: 108766. doi: 10.1016/j.intimp.2022.108766
  7. Carrillo J., Izquierdo-Useros N., Ávila-Nieto C., Pradenas E., Clotet B., Blanco J. Humoral immune responses and neutralizing antibodies against SARS-CoV-2; implications in pathogenesis and protective immunity. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2021, vol. 538, pp. 187–191. doi: 10.1016/j.bbrc.2020.10.108
  8. Chuveleva N.N. Kyrgyzstan. Economic and geographical position. Natural conditions and resources. Educational portal “Reference book”. URL: https://spravochnick.ru/geografiya/kirgiziya_ekonomiko-geograficheskoe_polozhenie_prirodnye_usloviya_ i_resursy (17.04.2023)
  9. Coronavirus COVID-19. URL: https://news.mail.ru/story/incident/coronavirus/stat/world (17.04.2023)
  10. Coronavirus in Kyrgyzstan. URL: https://coronavirus-control.ru/coronavirus-kyrgyzstan (17.04.2023)
  11. Crotty S. Hybrid immunity: COVID-19 vaccine responses provide insights into how the immune system perceives threats. Science, 2021, vol. 372, no. 6549, pp. 1392–1393. doi: 10.1126/science.abj2258
  12. Dzushupov K., Don Lucero-Prisno E., Vishnyakov D., Lin X., Ahmadi A. COVID-19 in Kyrgyzstan: navigating a way out. Review J. Glob. Health., 2021, vol. 11: 03020. doi: 10.7189/jogh.11.03020
  13. Fernandes E.R., Taminato M., Apostolico J.S., Gabrielonni M.C., Lunardelli V.A., Maricato J.T., Andersen M.L., Tufik S., Rosa D.S. Robust specific RBD responses and neutralizing antibodies after ChAdOx1 nCoV-19 and CoronaVac vaccination in SARS-CoV-2-seropositive individuals. J. Allergy Clin. Immunol. Glob., 2023, vol. 2, no. 2: 100083. doi: 10.1016/j.jacig.2023.100083
  14. Haque A., Pant A.B. Mitigating Covid-19 in the face of emerging virus variants, breakthrough infections and vaccine hesitancy. J. Autoimmun., 2022, vol. 127: 102792. doi: 10.1016/j.jaut.2021.102792
  15. Johansson M.A., Quandelacy T.M., Kada S., Prasad P.V., Steele M., Brooks J.T., Slayton R.B., Biggerstaff M., Butler J.C. SARS-CoV-2 transmission from people without COVID-19 symptoms. JAMA Netw. Open., 2021, vol. 4, no. 1: e2035057. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2020.35057
  16. Jung J., Kim S.K., Lee Y., Park S., Lim Y.J., Kim E.O., Kim S.H. Rates of COVID-19 infection among healthcare workers in designated COVID-19 wards and general wards. J. Korean Med. Sci., 2022, vol. 37, no. 43: e308. doi: 10.3346/jkms.2022.37.e308
  17. Khandker S.S., Godman B., Jawad M.I., Meghla B.A., Tisha T.A., Khondoker M.U., Haq M.A., Charan J., Talukder A.A., Azmuda N., Sharmin S., Jamiruddin M.R., Haque M., Adnan N. A systematic review on COVID-19 vaccine strategies, their effectiveness, and issues. Vaccines (Basel), 2021, vol. 9, no. 12: 1387. doi: 10.3390/vaccines9121387
  18. Kyrgyzstan Population 2023. URL: https://worldpopulationreview.com/countries/kyrgyzstan-population (17.04.2023)
  19. Li M., Wang H., Tian L., Pang Z., Yang Q., Huang T., Fan J., Song L., Tong Y., Fan H. COVID-19 vaccine development: milestones, lessons and prospects. Signal Transduct. Target. Ther., 2022, vol. 7, no. 1: 146. doi: 10.1038/s41392-022-00996-y
  20. Matz M., Allemani C., van Tongeren M., Nafilyan V., Rhodes S., van Veldhoven K., Pembrey L., Coleman M.P., Pearce N. Excess mortality among essential workers in England and Wales during the COVID-19 pandemic. J. Epidemiol. Community Health., 2022, vol. 76, no. 7, pp. 660–666. doi: 10.1136/jech-2022-218786
  21. Mittal A., Khattri A., Verma V. Structural and antigenic variations in the spike protein of emerging SARS-CoV-2 variants. PLoS Pathol., 2022, vol. 18, no. 2: e1010260. doi: 10.1371/journal.ppat.1010260
  22. Moreira R.A., Guzman H.V., Boopathi S., Baker J.L., Poma A.B. Characterization of structural and energetic differences between conformations of the SARS-CoV-2 spike protein. Materials (Basel), 2020, vol. 13, no. 23: 5362. doi: 10.3390/ma13235362
  23. National Statistical Committee of the Kyrgyz Republic. Population. URL: https://www.stat.kg/ru/statistics/naselenie (17.04.2023)
  24. Nordström P., Ballin M., Nordström A. Risk of SARS-CoV-2 reinfection and COVID-19 hospitalisation in individuals with natural and hybrid immunity: a retrospective, total population cohort study in Sweden. Lancet Infect. Dis., 2022, vol. 22, no. 6, pp. 781–790. doi: 10.1016/S1473-3099(22)00143-8
  25. Paces J., Strizova Z., Smrz D., Cerny J. COVID-19 and the immune system. Physiol. Res., 2020, vol. 69, no. 3, pp. 379–388. doi: 10.33549/physiolres.934492
  26. Popova A.Yu., Kasymov O.T., Smolenski V.Y., Smirnov V.S., Egorova S.A., Nurmatov Z.S., Milichkina A.M., Suranbaeva G.S., Kuchuk T.E., Khamitova I.V., Zueva E.V., Ivanov V.A., Nuridinova Z.N., Derkenbaeva A.A., Drobyshevskaya V.G., Sattarova G.Z., Kaliev M.T., Gubanova A.V., Zhimbaeva O.B., Razumovskaya A.P., Verbov V.N., Likhachev I.V., Krasnov A.V., Totolian A.A. SARS-CoV-2 herd immunity of the Kyrgyz population in 2021. Med. Microbiol. Immunol., 2022, vol. 211, no. 4, pp. 195–210. doi: 10.1007/s00430-022-00744-7
  27. Popova A.Yu., Totolian A.A. Methodology for assessing herd immunity to the SARS-CoV-2 virus in the context of the COVID-19 andemic. Russian Journal of Infection and Immunity, 2021, vol. 11, no. 4, pp. 609–616. doi: 10.15789/2220-7619-MFA-1770
  28. Population of Kyrgyzstan. URL: https://countrymeters.info/ru/Kyrgyzstan (17.04.2023)
  29. Primorac D., Vrdoljak K., Brlek P., Pavelić E., Molnar V., Matišić V., Erceg Ivkošić I., Parčina M. Adaptive Immune Responses and Immunity to SARS-CoV-2. Front. Immunol., 2022, vol. 13: 848582. doi: 10.3389/fimmu.2022.848582
  30. Ravindra K., Malik V.S., Padhi B.K., Goel S., Gupta M. Asymptomatic infection and transmission of COVID-19 among clusters: systematic review and meta-analysis. Public Health., 2022, vol. 203, pp. 100–109. doi: 10.1016/j.puhe.2021.12.003
  31. Sette A., Crotty S. Adaptive immunity to SARS-CoV-2 and COVID-19. Cell, 2021, vol. 184, no. 4, pp. 861–880. doi: 10.1016/j.cell.2021.01.007
  32. Significant Difference Calculator (z-test). RADAR Research Company. 2020. URL: https://radar-research.ru/ software/z-test_calculator (07.10.2021)
  33. Stokel-Walker C. What we know about COVID-19 reinfection so far. BMJ, 2021, vol. 372: 99. doi: 10.1136/bmj.n99
  34. Totolian A.A., Smirnov V.S., Krasnov A.A., Ramsay E.S., Dedkov V.G., Popova A.Y. COVID-19 case numbers as a function of regional testing strategy, vaccination coverage, and vaccine type. Viruses, 2023, vol. 15: 2181. doi: 10.3390/v15112181
  35. Wald A., Wolfowitz J. Confidence limits for continuous distribution functions. Ann. Math. Stat., 1939, vol. 10, no. 2, pp. 105–118.
  36. Wang H., Zhang Y., Huang B., Deng W., Quan Y., Wang W., Xu W., Zhao Y., Li N., Zhang J., Liang H., Bao L., Xu Y., Ding L., Zhou W., Gao H., Liu J., Niu P., Zhao L., Zhen W., Fu H., Yu S., Zhang Z., Xu G., Li C., Lou Z., Xu M., Qin C., Wu G., Gao G.F., Tan W., Yang X. Development of an inactivated vaccine candidate, BBIBP-CorV, with potent protection against SARS-CoV-2. Cell, 2020, vol. 182, no. 3, pp.713–721.e9. doi: 10.1016/j.cell.2020.06.008
  37. Wang J., Kaperak C., Sato T., Sakuraba A. COVID-19 reinfection: a rapid systematic review of case reports and case series. J. Investig. Med., 2021, vol. 69, pp. 1253–1255. doi: 10.1136/jim-2021-001853
  38. Wheeler S.E., Shurin G.V., Yost M., Anderson A., Pinto L., Wells A., Shurin M.R. Differential antibody response to mRNA COVID-19 vaccines in healthy subjects. Microbiol. Spectr., 2021, vol. 9, no. 1: e0034121. doi: 10.1128/Spectrum.00341-21
  39. Yadav R., Chaudhary J.K., Jain N., Chaudhary P.K., Khanra S., Dhamija P., Sharma A., Kumar A., Handu S. Role of structural and non-structural proteins and therapeutic targets of SARS-CoV-2 for COVID-19. Cells, 2021, vol. 10, no. 4: 821. doi: 10.3390/cells10040821
  40. Zhang Y., Zeng G., Pan H., Li C., Hu Y., Chu K., Han W., Chen Z., Tang R., Yin W., Chen X., Hu Y., Liu X., Jiang C., Li J., Yang M., Song Y., Wang X., Gao Q, Zhu F. Safety, tolerability, and immunogenicity of an inactivated SARS-CoV-2 vaccine in healthy adults aged 18–59 years: a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 1/2 clinical trial. Lancet Infect. Dis., 2021, vol. 21, no. 2, pp. 181–192. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30843-4
  41. Zheng J., Deng Y., Zhao Z., Mao B., Lu M., Lin Y, Huang A. Characterization of SARS-CoV-2-specific humoral immunity and its potential applications and therapeutic prospects. Cell. Mol. Immunol. 2022, vol. 19, no. 2, pp. 150–157. doi: 10.1038/s41423-021-00774-w

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Figure 1. Dynamics of COVID-19 incidence and vaccination in the Kyrgyz population

Скачать (186KB)
Метаданные
3. Figure 2. Shares of seropositive (CGAP) and seronegative (NSG) individuals of different ages throughout seromonitoring

Скачать (255KB)
Метаданные
4. Figure 3. Changes in peripheral Nc and RBD Ab levels in volunteers of different ages throughout seromonitoring

Скачать (135KB)
Метаданные
5. Figure 4. Seropositive (CGAP) and seronegative (NSG) volunteers by Kyrgyz region throughout seromonitoring

Скачать (214KB)
Метаданные
6. Figure 5. Humoral immunity dynamics (Nc, RBD Abs) among volunteers by Kyrgyz region

Скачать (124KB)
Метаданные
7. Figure 6. Shares of seronegative (NSG) and seropositive (CGAP) volunteers in different professional groups throughout seromonitoring

Скачать (280KB)
Метаданные
8. Figure 7. Humoral immunity dynamics (Nc, RBD Abs) among volunteers by professional group

Скачать (144KB)
Метаданные
9. Figure 8. Distribution of Nc Ab levels in the volunteer cohort by age group

Скачать (199KB)
Метаданные
10. Figure 9. Distribution of RBD Ab levels in the volunteer cohort by age

Скачать (145KB)
Метаданные
11. Figure 10. Usage structure of vaccines used to immunize the Kyrgyz population against coronavirus throughout seromonitoring

Скачать (108KB)
Метаданные
12. Figure 11. Structure of coronavirus vaccines administered to participants in the volunteer cohort at the stages of seromonitoring

Скачать (103KB)
Метаданные
13. Figure 12. Age distribution of vaccine platform usage

Скачать (164KB)
Метаданные

© Попова А.Ю., Смирнов В.С., Касымов О.T., Егорова С.С., Нурматов З.Ш., Дрозд И.В., Миличкина А.M., Смоленский В.Ю., Нуридиновна Ж.Н., Иванов В.A., Саттарова Г.З., Рэмзи Э.C., Джангазиев Б.И., Зуева Е.В., Арабий У.У., Дробышевская В.Г., Жимбаева О.Б., Разумовская А.П., Тотолян А.A., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах