Клинический случай посттравматического остеомиелита, вызванного ассоциацией kytococcus schroeteri и enterococcus faecalis

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Остеомиелиты в большинстве случаев являются мономикробными и вызываются различными грамположительными бактериями, однако предшествующая травма может способствовать формированию микробной ассоциации. Наличие двух и более патогенов в инфекционном очаге может сильно усложнять клиническую картину течения заболевания. Kytococcus schroeteri является одним из наиболее редко встречающихся возбудителей в клиническом материале. Число описанных случаев заболеваний, вызванных данным микроорганизмом, в мире насчитывает немногим более двух десятков. Цель исследования — анализ впервые выявленного клинического случая посттравматического остеомиелита, вызванного ассоциацией Kytococcus schroeteri и Enterococcus faecalis. Материалы и методы. Культуры получены бактериологическим методом из раневого отделяемого голени пациента. Идентификацию чистых культур бактерий осуществляли с использованием масс-спектрометра VITEK MS и подтверждали анализом нуклеотидной последовательности 16S рРНК. Установлены морфологические, тинкториальные и биохимические особенности полученных культур, а также определена их чувствительность к антибиотикам. Результаты. Клинический случай связан с установленным диагнозом «Хронический посттравматический остеомиелит левой голени». Из раневого отделяемого изолированы два вида микроорганизмов, которые были идентифицированы как Kytococcus schroeteri и Enterococcus faecalis с использованием метода MALDI-ToF масс-спектометрии. Секвенирование гена 16S рРНК выделенных культур бактерий полностью подтвердило результаты MALDI-ToF масс-спектрометрии. Чувствительность к антибиотикам для Kytococcus schroeteri была определена по критериям для группы стафилококков согласно клиническим рекомендациям «Определение чувствительности к антимикробным препаратам (ред. 2021 г.)». Выводы. Нами впервые описан вариант микст-инфекции, вызванной двумя грамположительными бактериями K. schroeteri и E. faecalis. Подобные ассоциации могут усиливать патогенетические эффекты друг друга, что может способствовать переходу инфекции в хроническую форму с низкой вероятностью положительного результата бактериологического исследования. K. schroeteri является одним из представителей нормальной микрофлоры кожи, однако данный микроорганизм способен вызывать различные заболевания. При бактериологическом исследовании подозрительным признаком, указывающим на возможную принадлежность культуры к виду K. schroeteri, является устойчивость к оксациллину. В связи с невозможностью использования имеющихся биохимических тест-систем, не нацеленных на дифференциацию K. schroeteri от родственных таксонов, надежная идентификация данного вида пока возможна лишь с применением метода MALDI-ToF масс-спектрометрии или секвенирования гена 16S рРНК.

Об авторах

Сергей Дилюсович Борисов

ФГБОУ ВО Оренбургский государственный медицинский университет Минздрава России

Email: sdborisov56@mail.ru

к.м.н., заслуженный врач Российской Федерации, заведующий и врач-бактериолог микробиологической лаборатории научно-исследовательского центра 

Россия, Оренбург

Ильшат Файзелгаянович Каримов

ФГБОУ ВО Оренбургский государственный медицинский университет Минздрава России

Email: ifkarimov@yandex.ru

к.б.н., доцент кафедры микробиологии, вирусологии, иммунологии; биолог микробиологической лаборатории научно-исследовательского центра 

Россия, Оренбург

Андрей Олегович Плотников

ФГБОУ ВО Оренбургский государственный медицинский университет Минздрава России; Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук — обособленное структурное подразделение ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр УрО РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: protoz@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6830-4068
SPIN-код: 9543-0734
Scopus Author ID: 7101750076
ResearcherId: C-2198-2013
https://ikvs.info/institut/staff/plotnikov-andrej-olegovich/

к.м.н., доцент, директор; доцент кафедры профилактической медицины

Россия, Оренбург; Оренбург

Ксения Сергеевна Инчагова

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук — обособленное структурное подразделение ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр УрО РАН

Email: ksenia.inchagova@mail.ru

к.б.н., старший научный сотрудник Центра коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов» 

Россия, Оренбург

Александр Сергеевич Паньков

ФГБОУ ВО Оренбургский государственный медицинский университет Минздрава России

Email: nic@orgma.ru

д.м.н., доцент, зав. кафедрой эпидемиологии и инфекционных болезней ,  директор научно-исследовательского центра 

Россия, Оренбург

Дмитрий Павлович Даньшин

ГАУЗ Оренбургский областной клинический специализированный центр травматологии и ортопедии

Email: sdborisov56@mail.ru

врач-травматолог 

Россия, Оренбург

Список литературы

  1. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории: Методические указания (МУ 4.2.2039-05). М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2006. 126 с. [Technique for collecting and transporting biomaterials to microbiological laboratories: Guidelines (MU 4.2.2039-05). Moscow: Federal Center for Hygiene and Epidemiology of Rospotrebnadzor, 2006. 126 p. (In Russ.)]
  2. Bagelman S., Zvigule-Neidere G. Insight into Kytococcus schroeteri infection management: a case report and review. Infect. Dis. Rep., 2021, vol. 13, no. 1, pp. 230–238. doi: 10.3390/idr13010026
  3. Ballén V., Ratia C., Cepas V., Soto S.M. Enterococcus faecalis inhibits Klebsiella pneumoniae growth in polymicrobial biofilms in a glucose-enriched medium. Biofouling, 2020, vol. 36, no. 7, pp. 846–861. doi: 10.1080/08927014.2020.1824272
  4. Bayraktar B., Dalgic N., Duman N., Petmezci E. First case of bacteremia caused by Kytococcus schroeteri in a child with congenital adrenal hyperplasia. Pediatr. Infect. Dis. J., 2018, vol. 37, no. 12, pp. 304–305. doi: 10.1097/INF.0000000000002014
  5. Becker K., Schumann P., Wüllenweber J., Schulte M., Weil H.-P., Stackebrandt E., Peters G., Von Eiff C. Kytococcus schroeteri sp. nov., a novel Gram-positive actinobacterium isolated from a human clinical source. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2002, vol. 52, pp. 1609–1614. doi: 10.1099/00207713-52-5-1609
  6. Black C.E., Costerton J.W. Current concepts regarding the effect of wound microbial ecology and biofilms on wound healing. Surg. Clin. North. Am., 2010, vol. 90, no. 6, pp. 1147–1160. doi: 10.1016/j.suc.2010.08.009
  7. Carek P.J., Dickerson L.M., Sack J.L. Diagnosis and management of osteomyelitis. Am. Fam. Physician., 2001, vol. 63, no. 12, pp. 2413–2420.
  8. Chan J.F., Wong S.S., Leung S.S., Fan R.Y., Ngan A.H., To K.K., Lau S.K., Yuen K.Y., Woo P.C. First report of chronic implant-related septic arthritis and osteomyelitis due to Kytococcus schroeteri and a review of human K. schroeteri infections. Infection, 2012, vol. 40, no. 5, pp. 567–573. doi: 10.1007/s15010-012-0250-9
  9. García Del Pozo E., Collazos J., Cartón J.A., Camporro D., Asensi V. Bacterial osteomyelitis: microbiological, clinical, therapeutic, and evolutive characteristics of 344 episodes. Rev. Esp. Quimioter., 2018, vol. 31, no. 3, pp. 217–225
  10. Gaston J.R., Andersen M.J., Johnson A.O., Bair K.L., Sullivan C.M., Guterman L.B., White A.N., Brauer A.L., Learman B.S., Flores-Mireles A.L., Armbruster C.E. Enterococcus faecalis polymicrobial interactions facilitate biofilm formation, antibiotic recalcitrance, and persistent colonization of the catheterized urinary tract. Pathogens, 2020, vol. 9, no. 10: 835. doi: 10.3390/pathogens9100835
  11. Kremers H.M., Nwojo M.E., Ransom J.E., Wood-Wentz C.M., Melton L.J. 3rd, Huddleston P.M. 3rd. Trends in the epidemiology of osteomyelitis: a population-based study, 1969 to 2009. J. Bone Joint Surg. Am., 2015, vol. 97, no. 10, pp. 837–845. doi: 10.2106/JBJS.N.01350
  12. Masters E.A., Ricciardi B.F., Bentley K.L.M., Moriarty T.F., Schwarz E.M., Muthukrishnan G. Skeletal infections: microbial pathogenesis, immunity and clinical management. Nat. Rev. Microbiol., 2022, vol. 20, no. 7, pp. 385–400. doi: 10.1038/s41579-022-00686-0
  13. Mundy L.M., Sahm D.F., Gilmore M. Relationships between enterococcal virulence and antimicrobial resistance. Clin. Microbiol. Rev., 2000, vol. 13, no. 4, pp. 513–522. doi: 10.1128/cmr.13.4.513-522.2000
  14. Noguchi K., Nishimura R., Ikawa Y., Mase S., Matsuda Y., Fujiki T., Kuroda R., Araki R., Maeba H., Yachie A. Half of Micrococcus spp. cases identified by conventional methods are revealed as other life-threatening bacteria with different drug susceptibility patterns by 16S ribosomal RNA gene sequencing. J. Infect. Chemother., 2020, vol. 26, no. 3, pp. 318–319. doi: 10.1016/j.jiac.2019.10.019
  15. Percival S.L., Hill K.E., Williams D.W., Hooper S.J., Thomas D.W., Costerton J.W. A review of the scientific evidence for biofilms in wounds. Wound Repair Regen., 2012, vol. 20, no. 5, pp. 647–657. doi: 10.1111/j.1524-475X.2012.00836.x
  16. Renvoise A., Roux V., Casalta J.P., Thuny F., Riberi A. Kytococcus schroeteri, a rare agent of endocarditis. Int. J. Infect. Dis., 2008, vol. 12, no. 2, pp. 223–227. doi: 10.1016/j.ijid.2007.06.011
  17. Shah A.S., Vijayvargiya P., Jung S., Wilson J.W. Postoperative hardware-related infection from Kytococcus schroeteri: its association with prosthetic material and hematological malignancies — a report of a case and review of existing literature. Case Rep. Infect. Dis., 2019: 6936472. doi: 10.1155/2019/6936472
  18. Shah S., Thakkar P., Poojary S., Singhal T. A case of Kytococcus schroeteri prosthetic valve endocarditis in a patient with COVID-19 infection. Indian J. Med. Microbiol., 2023, vol. 42, pp. 89–91. doi: 10.1016/j.ijmmb.2022.09.001
  19. Stackebrandt E., Koch C., Gvozdiak O., Schumann P. Taxonomic dissection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesterenkonia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Dermacoccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. Int. J. Syst. Bacteriol., 1995, vol. 45, no. 4, pp. 682–692. doi: 10.1099/00207713-45-4-682
  20. Tan C.A.Z., Lam L.N., Biukovic G., Soh E.Y., Toh X.W., Lemos J.A., Kline K.A. Enterococcus faecalis antagonizes Pseudomonas aeruginosa growth in mixed-species interactions. J. Bacteriol., 2022, vol. 204, no. 7: e0061521. doi: 10.1128/jb.00615-21
  21. Tien B.Y.Q., Goh H.M.S., Chong K.K.L., Bhaduri-Tagore S., Holec S., Dress R., Ginhoux F., Ingersoll M.A., Williams R.B.H., Kline K.A. Enterococcus faecalis promotes innate immune suppression and polymicrobial catheter-associated urinary tract infection. Infect. Immun., 2017, vol. 85, no. 12: e00378-17. doi: 10.1128/iai.00378-17

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рисунок 1. Микроскопия культур Enterococcus faecalis (слева) и Kytococcus schroeteri (справа). Окраска по Граму, увеличение ×1000

Скачать (65KB)
Метаданные
3. Рисунок 2. Масс-спектры культур Enterococcus faecalis ICIS11 (вверху) и Kytococcus schroeteri ICIS13 (внизу)

Скачать (57KB)
Метаданные
4. Рисунок 3. Филогенетическое древо, построенное с помощью инструмента BLAST (NCBI) по последовательностям гена 16S рРНК методом Fast Minimum Evolution, демонстрирующее кластер Kytococcus schroeteri (в рамке) из 15 последовательностей, включая ген выделенного штамма K. schroeteri ICIS13

Скачать (281KB)
Метаданные

© Борисов С.Д., Каримов И.Ф., Плотников А.О., Инчагова К.С., Паньков А.С., Даньшин Д.П., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».