Адгезивность специфических бактериофагов к клеткам иерсиний, оцененная методом лазерной ловушки

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В последние годы возрастает интерес к использованию бактериофагов в комплексной терапии некоторых инфекционных заболеваний. Объективно это связано с распространением антибиотикорезистентности и малым числом побочных эффектов при местном и парентеральном назначении фагов. Бактерии рода Yersinia не являются исключением из этого правила, однако начальные стадии их взаимодействия с вирионами подробно не изучены. В России в диагностических целях применяются три вида литических иерсиниозных бактериофагов, различающихся по специфичности, вирулентности, морфологическим свойствам. Мы оценили силу взаимодействия в системе «фаг–бактерия» методом лазерной ловушки.

Материалы и методы. В работе использовали живые клетки Yersinia pseudotuberculosis и Yersinia pestis, различные по структуре ЛПС, и препараты трех иерсиниозных бактериофагов — Покровской, L-413C и д’Эрреля (псевдотуберкулезного диагностического). Фаг Покровской хорошо изучен и широко применяется в диагностике, однако механизм его адсорбции на клетках Y. pestis практически не изучен. Высокоспецифичный фаг L-413С лизирует чумные бактерии, но не псевдотуберкулезные, в то время как фаг д’Эрреля вирулентен для бактерий обоих видов. Вирионы наносили на поверхность аминированных стеклянных подложек. Микробные клетки, захваченные лазерной ловушкой, подводили к поверхности, обработанной фагами, до их соприкосновения, после чего их отводили в обратном направлении, добиваясь разрыва связи. Амплитуду сигнала пересчитывали в силу через калибровочные коэффициенты. Первичные данные обрабатывали в программе «R»; статистический анализ проводили с использованием пакетов «Matlab 7.0» и «Statistica 12».

Результаты и обсуждение. Анализ гистограмм распределения силы, необходимой для разрыва связи, выявил присутствие специфического компонента в паре «Y. pseudotuberculosis–фаг д’Эрреля» (Fср. = 7,46±3,52 пН), а также во всех парах с участием чумного микроба. В последнем случае сила связи оказалась сопоставимой с вышеуказанной и составила: для фага д’Эрреля — 8,64±3,83 пН, для фага Покровской — 11,03±4,22 пН, для фага L-413С — 10,42±4,79 пН. Средняя сила отрыва от подложки, обработанной бычьим сывороточным альбумином (БСА) сопоставима для обоих типов клеток. Проведенные эксперименты свидетельствуют о возможности использования метода оптической ловушки для оценки силовых характеристик взаимодействия в системе «бактерия–фаг».

Об авторах

Илья Владимирович Конышев

ФГБУН Институт физиологии Коми научного центра Уральского отделения РАН; ФБОУ ВО Вятский государственный университет

Email: konyshevil@yandex.ru

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории физиологии микроорганизмов, доцент кафедры биотехнологии кафедры биотехнологии Института биологии и биотехнологии

Россия, 167982, Сыктывкар, ул. Первомайская, д. 50; 610000, Киров, ул. Московская, д. 36, каф. биотехнологии, каб. 513а

Любовь Геннадьевна Дудина

ФГБУН Институт физиологии Коми научного центра Уральского отделения РАН; ФБОУ ВО Вятский государственный университет

Email: necdew@mail.ru

кандидат биологических наук, младший научный сотрудник лаборатории физиологии микроорганизмов, доцент кафедры биотехнологии

Россия, 167982, Сыктывкар, ул. Первомайская, д. 50; 610000, Киров, ул. Московская, д. 36, каф. биотехнологии, каб. 513а

Надежда Александровна Морозова

ФБОУ ВО Вятский государственный университет,

Email: nadymor2000@gmail.com

Студент, магистр кафедры биотехнологии

Россия, 610000, Киров, ул. Московская, д. 36, каф. биотехнологии, каб. 513а

Андрей Анатольевич Бывалов

ФГБУН Институт физиологии Коми научного центра Уральского отделения РАН; ФБОУ ВО Вятский государственный университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: byvalov@nextmail.ru

доктор медицинских наук, профессор, старший научный сотрудник Центра превосходства, зав. лабораторией физиологии микроорганизмов Института физиологии Коми

Россия, 167982, Сыктывкар, ул. Первомайская, д. 50; 610000, Киров, ул. Московская, д. 36, каф. биотехнологии, каб. 513а

Список литературы

  1. Лабинская А.С. Микробиология с техникой микробиологических исследований. М.: Медицина,1978. 394 с. [Labinskaya A.S. Microbiology and methods of microbiology. Moscow: Meditsina,1978. 394 p. (In Russ.)]
  2. Филиппов А.А., Эллиотт Дж.М., Бобров А.Г., Кириллина О.А., Мотин В.Л., Чейн П.С., Гарсия Э. Определение нуклеотидной последовательности генома чумного диагностического бактериофага L-413C // Проблемы особо опасных инфекций. 2005, № 2. С. 49–52. (Filippov A.A., Elliott J.M., Bobrov A.G., Kirillina O.A., Motin V.L., Cheyne P.S., Garcia E. Determination of the nucleotide sequence of the genome of the plague diagnostic bacteriophage L-413C. Problemy osobo opasnykh infektsiy = Problems of Particularly Dangerous Infections,2005, no. 2, pp. 49–52. (In Russ.)]
  3. Cabanel N., Bouchier C., Rajerison M., Carniel E. Plasmid-mediated doxycycline resistance in a Yersinia pestis strain isolated from a rat. Int. J. Antimicrob. Agents.,2008, vol. 51, pp. 249–254. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2017.09.015
  4. Capilla S., Ruiz J., Goñi P., Castillo J., Rubio M.C., Jiménez de Anta M.T., Gómez-Lus R., Vila J. Characterization of the molecular mechanisms of quinolone resistance in Yersinia enterocolitica O:3 clinical isolates. J. Antimicrob. Chemother.,2004, vol. 53, pp. 1068–1071. doi: 10.1093/jac/dkh22.5
  5. Cover T.L., Aber R.C. Yersinia enterocolitica. N. Engl. J. Med.,1989, vol. 321, pp. 16–24. doi: 10.1056/NEJM198907063210104
  6. Deacon A.G., Hay A., Duncan J. Septicemia due to Yersinia pseudotuberculosis — a case report. Clin. Microbiol. Infect.,2003, vol. 9, pp. 1118–1119. doi: 10.1046/j.1469-0691.2003.00746.x
  7. Filippov A.A., Sergueev K.V., He, Y., Huang X.-Z., Gnade B.T., Mueller A.J., Fernandez-Prada C.M., Nikolich M.P. Bacteriophage-resistant mutants in Yersinia pestis: identification of phage receptors and attenuation for mice. PLoS One,2011, vol. 6., no. 9: e25486. doi: 10.1371/journal.pone.0025486
  8. Filippov A.A., Sergueev K.V., He Y., Nikolich M.P. Bacteriophages capable of lysing Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis: efficiency of plating tests and identification of receptors in Escherichia coli K-12. Adv. Exp. Med. Biol.,2012, pp. 123–134. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_16
  9. Filippov A.A., Sergueev K.V., He Y., Huang X.Z., Gnade B.T., Mueller A.J., Fernandez-Prada C.M., Nikolich M.P. Bacteriophage therapy of experimental bubonic plague in mice. Adv. Exp. Med. Biol.,2012, vol. 954, pp. 337–348. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_41
  10. Filippov A.A., Sergueev K.V., Nikolich M.P. Can phage effectively treat multidrug-resistant plague? Bacteriophage,2012, vol. 2, pp. 186–189. doi: 10.4161/bact.22407
  11. Galimand M., Carniel E., Courvalin P. Resistance of Yersinia pestis to antimicrobial agents. Antimicrob. Agents Chemother.,2006, vol. 50, pp. 3233–3236. doi: 10.1128/AAC.00306-06
  12. Galindo C.L., Rosenzweig J.A., Kirtley M.L., Chopra A.K. Pathogenesis of Y. enterocolitica and Y. pseudotuberculosis in Human Yersiniosis. J. Pathog.,2011: 182051. doi: 10.4061/2011/182051
  13. Garcia E., Chain P., Elliott J.M., Bobrov A.G., Motin V.L., Kirillina O., Lao V., Calendar R., Filippov A.A. Molecular characterization of L-413C, a P2-related plague diagnostic bacteriophage. Virology,2008, vol. 372, no. 1, pp. 85–96. doi: 10.1016/ j.virol.2007.10.032
  14. Górski A., Międzybrodzki R., Jończyk-Matysiak E., Borysowski J., Letkiewicz S., Weber-Dąbrowska B. The fall and rise of phage therapy in modern medicine. Expert. Opin. Biol. Ther.,2019, vol. 19, pp. 1115–1117. doi: 10.1080/14712598.2019.1651287
  15. Hill A.A., Diehl G.E. The infectious cause of the chronic effect. Cell Host Microbe,2015, vol. 18, pp. 383–385. doi: 10.1016/ j.chom.2015.09.011
  16. Vagima Y., Gur D., Aftalion M., Moses S., Levy Y., Makovitzki A., Holtzman T., Oren Z., Segula Y., Fatelevich E., Tidhar A., Zauberman A., Rotem S., Mamroud E., Steinberger-Levy I. Phage therapy potentiates second-line antibiotic treatment against pneumonic plague. Viruses,2022, vol. 14: 688. doi: 10.3390/v14040688
  17. Zhao X., Skurnik M. Bacteriophages of Yersinia pestis. Adv. Exp. Med. Biol.,2016, vol. 918, pp. 361–375. doi: 10.1007/978-94-024-0890-4_13.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рисунок 1. Гистограммы распределения сил отрыва в системе «бактериофаг–бактериальная клетка» с указанием их средних значений и соотношения исходов взаимодействия для клеток Y. pseudotuberculosis

Скачать (175KB)
3. Рисунок 2. Гистограммы распределения сил отрыва с указанием их средних значений и соотношения исходов взаимодействия для клеток Y. pestis EV

Скачать (180KB)

© Конышев И.В., Дудина Л.Г., Морозова Н.А., Бывалов А.А., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».