Коллективный иммунитет к SARS-CoV-2 населения Республики Армения

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Пандемия COVID-19 стала серьезным глобальным кризисом в области здравоохранения, не имеющим аналогов в мировой истории. Динамика инфекции может иметь специфические особенности в разных странах в силу социальных, экономических, климатических или географических факторов. Цель: изучить особенности коллективного иммунитета против SARS-CoV-2 среди населения Армении. Материалы и методы. Поперечное рандомизированное исследование коллективного иммунитета проводили по программе, разработанной Роспотребнадзором и Санкт-Петербургским институтом Пастера с учетом рекомендаций ВОЗ. Исследование одобрено этическими комитетами Национального центра инфекционных болезней (Армения) и Санкт-Петербургского института Пастера (Россия). Была сформирована когорта добровольцев (N = 6057), рандомизированная по возрасту и региону. Анализ исследования включал: доли и распределение антител (АТ) к нуклеокапсиду (Nc), антигену (Ag) и рецепторсвязывающему домену (RBD) S-1 Ag в когорте; и количественное определение этих антител с помощью ELISA. В ходе опроса в анамнезе прививки указали 4395 человек. Результаты. Общая серопозитивность, сформированная во всей когорте (к 14 апреля 2022 г.), составила 98.6% (95% ДИ: 98.1–98.7). Оно не зависело от возраста, места жительства или рода занятий. При количественном определении антител Nc и RBD доля добровольцев с уровнями антител Nc 1–17 BAU/мл и уровнями антител RBD 22.6–220 BAU/мл была наименьшей и составила 6.9% (95% ДИ: 6.2–7.5). и 20.4% (95% ДИ: 19.4–21.4) соответственно. При повышении концентрации в сыворотке (Nc > 667 BAU/мл, RBD > 450 BAU/мл) доля лиц с соответствующими уровнями составляла 20.2% для Nc (95% ДИ: 19.2–21.3) и 54.2% для RBD (95% ДИ: 52.9–55.5). Охват вакцинацией составил 72.6% (95% ДИ: 71.5–73.7). Наиболее часто использовались Sinopharm/BIBP (32.4%), AZD1222 (22.3%) и Gam-COVID-Vac (21%). Остальные вакцины (CoronaVac, mRNA-1273, BNT162b2, CoviVac) использовали 24.3% привитых. При суммировании вакцин по платформам установлено, что: векторные вакцины применялись в 40.34% (95% ДИ: 33.57–42.39) случаев; цельновирионные вакцины использовались в 26.83% (95% ДИ: 24.76–32.20); и векторные вакцины использовались в 6.33% (95% ДИ: 4.84–8.91). Вывод. Эпидемическая ситуация в Армении к апрелю 2022 г. характеризовалась высоким уровнем коллективного иммунитета, не зависящим от возрастных и региональных факторов. Наибольшее распространение получили векторные и цельновирионные вакцины.

Об авторах

Анна Юрьевна Попова

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., профессор, руководитель

Россия, Москва

Вячеслав Сергеевич Смирнов

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Автор, ответственный за переписку.
Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии

Россия, Санкт-Петербург

Светлана Александровна Егорова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., зам. директора по инновациям

Россия, Санкт-Петербург

Атавазд Вруйрович Ванян

ГНКО Национальный центр по контролю и профилактике заболеваний

Email: vssmi@mail.ru

к.м.н., генеральный директор

Армения, Ереван

Анжелика Марсовна Миличкина

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

к.м.н., главный врач медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

Нунэ Григорьевна Бакунц

ГНКО Национальный центр по контролю и профилактике заболеваний

Email: vssmi@mail.ru

зам. генерального директора

Армения, Ереван

Ирина Викторовна Дрозд

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

к.б.н., зав. центральной клинико-диагностической лабораторией

Россия, Санкт-Петербург

Ромелла Александровнав Абовян

ГНКО Национальный центр по контролю и профилактике заболеваний

Email: vssmi@mail.ru

начальник отдела эпидемиологии инфекционных и неинфекционных заболеваний

Армения, Ереван

Валерий Андреевич Иванов

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

IT-аналитик

Россия, Санкт-Петербург

Гаянэ Гургеновна Мелик-Андреасян

ГНКО Национальный центр по контролю и профилактике заболеваний

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., профессор, зам. директора по научной работе филиала «Референс Лабораторный Центр»

Армения, Ереван

Эдвард Смит Рэмзи

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

научный аналитик

Россия, Санкт-Петербург

Генннадий Оисепович Палозян

ГНКО Национальный центр по контролю и профилактике заболеваний

Email: vssmi@mail.ru

врач-эпидемиолог отдела эпидемиологии инфекционных и неинфекционных заболеваний

Армения, Ереван

Татьяна Владимировна Арбузова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

младший научный сотрудник группы эпидемиологического мониторинга и прогнозирования

Россия, Санкт-Петербург

Ара Шагенович Кешишян

ГНКО Национальный центр по контролю и профилактике заболеваний

Email: vssmi@mail.ru

к.м.н., зав. лаборатории паразитологии филиала «Референс Лабораторный Центр»

Армения, Ереван

Оюна Байяровна Жимбаева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

врач Центральной клинико-диагностической лаборатории Медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

Ольга Александровна Петрова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

врач клинической лабораторной диагностики Центральной клинико-диагностической лаборатории Медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

Александра Валерьевна Губанова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

врач клинической лабораторной диагностики Центральной клинико-диагностической лаборатории Медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

Александра Петровна Разумовская

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

врач клинической лабораторной диагностики Центральной клинико-диагностической лаборатории Медицинского центра

Россия, Санкт-Петербург

Арег Артёмович Тотолян

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: vssmi@mail.ru

д.м.н., профессор, академик РАН, директор

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Agresti A., Coull B.A. Approximate is better than “exact” for interval estimation of binomial proportions. Am. Stat., 1998, vol. 52, pp. 119–126. doi: 10.2307/2685469
  2. Calculation of the required sample size. In: Batrakova L.G. Statistics theory. 2009. URL: https://docplayer. com.28880846-L-g-batrakova-teoriya-statistiki (01.04.2022)
  3. Coronavirus Monitor. URL: https://coronavirus-monitor.info (14.10.2022)
  4. Crotty S. Hybrid immunity. Science. 2021. vol. 372, no. 6549, pp. 1392–1393. doi: 10.1126/science
  5. Fiolet T., Kherabi Y., MacDonald C.J., Ghosn J., Peiffer-Smadja N. Comparing COVID-19 vaccines for their characteristics, efficacy and effectiveness against SARS-CoV-2 and variants of concern: a narrative review. Clin. Microbiol. Infect., 2022, vol. 28, no. 2, pp. 202–221. doi: 10.1016/j.cmi.2021.10.005
  6. GOGOV. 2022. URL: https://gogov.ru/covid-v-stats/armeniya (20.10.2022)
  7. Haas E.J., Angulo F.J., McLaughlin J.M., Anis E., Singer S.R., Khan F., Brooks N., Smaja M., Mircus G., Pan K., Southern J., Swerdlow D.L., Jodar L., Levy Y., Alroy-Preis S. Impact and effectiveness of mRNA BNT162b2 vaccine against SARS-CoV-2 infections and COVID-19 cases, hospitalisations, and deaths following a nationwide vaccination campaign in Israel: an observational study using national surveillance data. Lancet, 2021, vol. 397, no. 10287, pp. 1819–1829. doi: 10.1016/S0140-6736(21)00947-8
  8. Hassine I.H. Covid-19 vaccines and variants of concern: a review. Rev. Med. Virol., 2022, vol. 32, no. 4: e2313. doi: 10.1002/rmv.2313
  9. Hernández C.R., Moreno J.C.S. Inmunidad frente a SARS-CoV-2: caminando hacia la vacunación Revista Española de Quimioterapia. Rev. Esp. Quimioter., 2020. doi: 10.37201/req/086.2020
  10. Indari O., Jakhmola S., Manivannan E., Jha H.C. An update on antiviral therapy against SARS-CoV-2: how far have we come? Front. Pharmacol., 2021, vol. 12: 632677. doi: 10.3389/fphar.2021.632677
  11. Li J., Jia H., Tian M., Wu N., Yang X., Qi. J., Ren W., Li. F., Bian H. SARS-CoV-2 and emerging variants: unmasking structure, function, infection, and immune escape mechanisms. Front. Cell. Infect. Microbiol., 2022, vol. 12: 869832. doi: 10.3389/fcimb.2022.869832
  12. Our world in data. URL: https://ourworldindata.org/explorers/coronavirus-data-explorer (14.09.2022)
  13. Popova A.Y., Kasymov O.T., Smolenski V.Y., Smirnov V.S., Egorova S.A. Nurmatov Z.S., Milichkina A.M., Suranbaeva G.S., Kuchuk T.E., Khamitova I.V., Zueva E.V., Ivanov V.A., Nuridinova Z.N., Derkenbaeva A.A., Drobyshevskaya V.G., Sattarova G.Z., Kaliev M.T., Gubanova A.V., Zhimbaeva O.B., Razumovskaya A.P., Verbov V.N., Likhachev I.V., Krasnov A.V., Totolian A.A. SARS-CoV-2 herd immunity of the Kyrgyz population in 2021. Med. Microbiol. Immunol., 2022, vol. 211, no. 4, pp. 195–210. doi: 10.1007/s00430-022-00744-7
  14. Popova A.Yu., Tarasenko A.A., Smolenskiy V.Yu., Egorova S.A., Smirnov V.S., Dashkevich A.M., Svetogor T.N., Glinskaya I.N., Skuranovich A.L., Milichkina A.M., Dronina A.M., Samoilovich E.O., Khamitova I.V., Semeiko G.V., Amvrosyeva T.V., Shmeleva N.P., Rubanik L.V., Esmanchik O.P., Karaban I.A., Drobyshevskaya V.G., Sadovnikova G.V., Shilovich M.V., Podushkina E.A., Kireichuk V.V., Petrova O.A., Bondarenko S.V., Salazhkova I.F., Tkach L.M., Shepelevich L.P., Avtukhova N.L., Ivanov V.A., Babilo A.S., Navyshnaya M.V., Belyaev N.N., Zueva E.V., Volosar L.A., Verbov V.N., Likhachev I.V., Zagorskaya T.O., Morozova N.F., Korobova Z.R., Gubanova A.V., Totolian Areg A. Herd immunity to SARS-CoV-2 among the population of the Republic of Belarus amid the COVID-19 pandemic. Russian Journal of Infection and Immunity, 2021, vol. 11, no. 5, pp. 887–904. doi: 10.15789/2220-7619-HIT-1798
  15. Popova A.Yu., Totolian A.A. Methodology for assessing herd immunity to the SARS-CoV-2 virus in the context of the COVID-19 pandemic. Russian Journal of Infection and Immunity, 2021, vol. 11, no. 4, pp. 609–616. doi: 10.15789/2220-7619-MFA-1770
  16. Population-based age-stratified seroepidemiological investigation protocol for coronavirus 2019 (COVID-19) infection. URL: https://www.who.int/publications/i/item/WHO-2019-nCoV-Seroepidemiology-2020.2 (20.04.2022)
  17. Public Health and Social Measures in Response to COVID-19. URL: https://phsm.euro.who.int/countries/3 (21.09.2022)
  18. Randolph H.E., Barreiro L.B. Herd immunity: understanding COVID-19. Immunity, 2020, vol. 52, no. 5, pp. 737–741. doi: 10.1016/j.immuni.2020.04.012
  19. Schwab K., Malleret T. COVID-19: the Great Reset. Geneva (Switzerland): World Economic Forum, 2020.
  20. Significant Difference Calculator (z-test). RADAR Research Company. 2020. URL: https://radar-research.ru (18.04.2022)
  21. Şimşek-Yavuz S., Komsuoğlu Çelikyurt F.I. An update of anti-viral treatment of COVID-19. Turk. J. Med. Sci., 2021, vol. 51, no. SI-1, pp. 3372–3390. doi: 10.3906/sag-2106-250
  22. Totolian A.A., Smirnov V.S., Krasnov, A.A, Ramsay E.S., Dedkov V.G., Popova A.Yu. COVID-19 case numbers as a function of regional testing strategy, vaccination coverage, and vaccine type. Preprint. 2022. doi: 10.21203/rs.3.rs-2183670/v1
  23. Wald A., Wolfowitz J. Confidence limits for continuous distribution functions. Ann. Math. Stat., 1939, vol. 10, no. 2, pp. 105–118.
  24. Wang X., Zhao X., Song J., Wu J., Zhu Y., Li M., Cui Y., Chen Y., Yang L., Liu J., Zhu H., Jiang S., Wang P. Homologous or heterologous booster of inactivated vaccine reduces SARS-CoV-2 Omicron variant escape from neutralizing antibodies. Emerg. Microbes Infect., 2022, vol. 11, no. 1, pp. 477–481. doi: 10.1080/22221751.2022.2030200
  25. Wang R., Chen J., Gao K., Wei G.W. Vaccine-escape and fast-growing mutations in the United Kingdom, the United States, Singapore, Spain, India, and other COVID-19-devastated countries. Genomics, 2021, vol. 113, no. 4, pp. 2158–2170. doi: 10.1016/j.ygeno.2021.05.006
  26. Yan W., Zheng Y., Zeng X., He B., Cheng W. Structural biology of SARS-CoV-2: open the door for novel therapies. Signal Transduct. Target Ther., 2022, vol. 7, no. 1: 26. doi: 10.1038/s41392-022-00884-5

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Figure 1. Incidence dynamics in the Armenian population for the entire observation period until April 14 2022

Скачать (76KB)
Метаданные
3. Figure 2. Dynamics of COVID-19 vaccination in Armenia [6]

Скачать (96KB)
Метаданные
4. Figure 3. Algorithm for organization and conduct of the study of SARS-CoV-2 collective immunity in the Republic of Armenia

Скачать (156KB)
Метаданные
5. Figure 4. Volunteer seroprevalence by age group

Скачать (159KB)
Метаданные
6. Figure 5. Volunteer seroprevalence by region of residence

Скачать (187KB)
Метаданные
7. Figure 6. Distribution of the volunteer cohort by occupation with grouping

Скачать (90KB)
Метаданные
8. Figure 7. Volunteer seroprevalence by field of activity

Скачать (172KB)
Метаданные
9. Figure 8. Nc antibody serological intervals plotted by age group

Скачать (167KB)
Метаданные
10. Figure 9. RBD antibody serological intervals plotted by age group

Скачать (116KB)
Метаданные
11. Figure 10. Vaccine usage structure in Armenia by share

Скачать (86KB)
Метаданные
12. Figure 11. Vaccination coverage by professional group

Скачать (100KB)
Метаданные
13. Figure 12. Vaccination coverage by age group

Скачать (82KB)
Метаданные
14. Figure 13. Distribution of the main vaccine types by age

Скачать (95KB)
Метаданные
15. Figure 14. Share of completely vaccinated volunteers by region (as of 16/04/2022)

Скачать (89KB)
Метаданные
16. Figure 15. Regional distribution of vaccine usage (%) by production platform

Скачать (93KB)
Метаданные
17. Figure 16. Structure of seropositivity (RBD, Nc) following completion of immunization with inactivated vaccines

Скачать (22KB)
Метаданные
18. Figure 17. Structure of seropositivity (RBD, Nc) following completion of immunization with vector vaccines

Скачать (24KB)
Метаданные
19. Figure 18. Structure of seropositivity (RBD, Nc) following completion of immunization with mRNA vaccines

Скачать (24KB)
Метаданные
20. Figure 18. Heat map of the regional distribution of SARS-CoV-2 seroprevalence

Скачать (273KB)
Метаданные
21. SUPPLIMENTARY MATERIALS FOR ARTICLE ID 2540
Скачать (216KB)
Метаданные

© Попова А.Ю., Смирнов В.С., Егорова С.А., Ванян А.В., Миличкина А.М., Бакунц Н.Г., Дрозд И.В., Абовян Р.А., Иванов В.А., Мелик-Андреасян Г.Г., Рэмзи Э.С., Палозян Г.О., Арбузова Т.В., Кешишян А.Ш., Жимбаева О.Б., Петрова О.А., Губанова А.В., Разумовская А.П., Тотолян А.А., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».