Evaluation of the two in-patient hospitals on potential environmental hazard during the period of new coronavirus infection in the Khabarovsk city (december 2020 — march 2021)

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Microbiological monitoring after infectious diseases in the system of epidemiological surveillance implies simultaneous pathogen identification both among patients and in hospital environment. Our aim is to assess potential hospital environmental hazard for the two in-patient infectious disease hospitals of the Khabarovsk city by using bacteriological and epidemiological analysis during new coronavirus disease pandemic. Materials and methods. Bacteriological assessment of nasopharyngeal microflora in 241 patients suffering from community-acquired pneumonia that were hospitalized in the two prevention and treatment facilities of the Khabarovsk city was performed. Sanitary-bacteriological control of hospital environment (428 hospital environment samples and 91 air samples) was carried out in parallel. Bacteriological assessment was performed with classical methods. Identification of isolated bacteriological pathogens and evaluation of drug-resistant strains were carried out by utilizing bacteriological analyzer Vitek 2 Compact. Results. Nine different pathogens (Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas stutzeri, Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Enterobacter cloacae, Pantoea, Enterococcus faecium, Staphylococcus haemolyticus) were isolated in 20 out of 428 samples — 4.7% [2.7–6.7]. Half of isolated agents — 2.3% [0.9–3.8] — were represented by drug-resistant isolates (10 out of 20 isolates) including 5 carbapenem-resistant isolates (Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae) and 5 isolates with multiple drug resistance (Enterobacter cloacae, Pantoea, Enterococcus faecium, Staphylococcus haemolyticus). Air samples contained pathogenic biological agents found in 6 out of 91 samples — 6.6% [1.5–11.7], and half of them — 3.3% [0.6–7.9] — were identified as drug-resistant variants, including S. aureus и S. haemolyticus. One of the surveyed hospitals was recognized as more hazardous due to microflora isolated from intensive care unit (A. baumannii and P. aeruginosa were resistant to 3rd–4th generation cephalosporins and carbapenems). Conclusion. Revealed circulation of wide range of microorganisms isolated from environment of two in-patient hospitals indicates high risk of healthcare-associated infections formation. Intensive care units can serve as a reservoir of healthcare-associated infections due to high percentage of patients with severe disease cases (“main reservoir” of drug-resistant strains).

About the authors

Olga E. Trotsenko

Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Federal Service for Surveillance on Consumers Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor)

Author for correspondence.
Email: alyonaf@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-3050-4472

PhD, MD (Medicine), Director of Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Rospotrebnadzor

Russian Federation, Khabarovsk

A. P. Bondarenko

Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Federal Service for Surveillance on Consumers Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor)

Email: adm@hniiem.ru
ORCID iD: 0000-0002-9197-8519

PhD (Medicine), Head of the Bacteriological Laboratory

Russian Federation, Khabarovsk

N. Y. Pshenichnaya

Central Research Institute of Epidemiology of the Federal Service for Surveillance on Consumers Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor)

Email: natalia-pshenichnaya@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2570-711X

PhD, MD (Medicine), Professor, Deputy Director for Clinical Analytical Studies

Russian Federation, Moscow

T. A. Zaitseva

Khabarovsk Krai Rospotrebnadzor Regional Office

Email: root@sanepid.khv.ru
ORCID iD: 0000-0002-3531-4996

Head of Khabarovsk Krai Rospotrebnadzor Regional Office, Khabarovsk

Russian Federation, Khabarovsk

Y. A. Garbuz

Center of Hygiene and Epidemiology of Khabarovsk Krai

Email: fbuz@27.khv.ru

Head Doctor, Center of Hygiene and Epidemiology of Khabarovsk Krai

Russian Federation, Khabarovsk

Inna V. Chishagorova

Center of Hygiene and Epidemiology of Khabarovsk Krai

Email: fbuz@27.khv.ru

Head of the Bacteriological Laboratory

Russian Federation, Khabarovsk

V. A. Shmylenko

Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Federal Service for Surveillance on Consumers Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor)

Email: adm@hniiem.ru
ORCID iD: 0000-0002-7170-3032

Researcher, Bacteriological Laboratory

Russian Federation, Khabarovsk

Elena A. Bazykina

Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Federal Service for Surveillance on Consumers Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor)

Email: alyonaf@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5695-6752

Researcher

Russian Federation, Khabarovsk

Olga N. Ogienko

Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Federal Service for Surveillance on Consumers Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor)

Email: adm@hniiem.ru
ORCID iD: 0000-0003-3872-0006

Junior Researcher, Bacteriological Laboratory

Russian Federation, Khabarovsk

References

  1. Акимкин В.Г. Группы внутрибольничных инфекций и системный подход к их профилактике в многопрофильном стационаре // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2003. Т. 5. С. 15–19. [Akimkin V.G. Groups of nosocomial infections and a systemic approach to their prevention at multidisciplinary hospital. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni = Epidemiology and Infectious Diseases, 2003, vol. 5, pp. 15–19. (In Russ.)]
  2. Акимкин В.Г., Тутельян А.В., Брусина Е.Б. Актуальные направления научных исследований в области неспецифической профилактики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2014. Т. 2. С. 40–44. [Akimkin V.G., Tutelian A.V., Brusina E.B. Topical areas of researches in the nonspecific prevention of health care-associated infections. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktualnye voprosi = Epidemiology and Infectious Diseases. Current items, 2014, vol. 2, pp. 40–44. (In Russ.)]
  3. Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Зайцева Т.А. Некоторые аспекты развития эпидемического процесса инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (обзор литературы) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2019. № 36. С. 92–97. [Bondarenko A.P., Shmylenko V.A., Trotsenko O.E., Zaytseva T.A. Some aspects of epidemic process of health care-associated infections: a review. Dal’nevostochnyj zhurnal infektsionnoy patologii = Far Eastern Journal of Infectious Pathology, 2019, no. 36, pp. 92–97. (In Russ.)]
  4. Брусина Е.Б., Рычагов И.П. Эпидемиология внутрибольничных гнойно-септических инфекций в хирургии. Новосибирск: Наука, 2006. 171 с. [Brusina E.B., Rychagov I.P. Epidemiology of healthcare associated purulent-septic infections in surgery. Novosibirsk: Nauka, 2006. 171 p. (In Russ.)]
  5. Головерова Ю.А., Марьин Г.Г., Шабалина С.В., Тутельян А.В., Орлова О.А., Акимкин В.Г. Уровень заболеваемости инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, в отделениях высокого эпидемиологического риска инфицирования // Инфекционные болезни. 2019. Т. 17, № 3. С. 69–73. [Goloverova Yu.A., Mariin G.G., Shabalina S.V., Tutelian A.V., Orlova O.A., Akimkin V.G. Incidence of health care-associated infections in high-risk hospital units. Infektsionnye bolezni = Infectious Diseases, 2019, vol. 17, no. 3, pp. 69–73. (In Russ.)]
  6. Гончаров А.Е., Зуева Л.П., Мохов А.С., Колоджиева В.В., Мельцер А.А., Смирнова М.В., Хавлина Т.В., Оришак Е.А. Распространение мультиантибиотикорезистентных возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в стационарах для лечения пациентов с COVID-19 // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021. Т. 20, № 2. С. 68–73. [Goncharov A.E., Zueva L.P., Mokhov A.S., Kolodzhieva V.V., Meltser A.A., Smirnova M.V., Khavlina T.V., Orishak E.A. Spread of multi-antibiotic-resistant health-care pathogens in hospitals to treat COVID-19 patients. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika = Epidemiology and Vaccinal Prevention, 2021, vol. 20, no. 2, pp. 68–73. (In Russ.)]
  7. Коза Н.М. Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи. Эпидемиология и профилактика: обзорная лекция // Пермский медицинский журнал. 2013. Т. 30, № 4. С. 135–143. [Koza N.M. Infections connected with rendering medical care. Epidemiology and prevention (review lecture). Permskiy meditsinskiy zhurnal = Perm Medical Journal, vol. 30, no. 4, pp. 135–143. (In Russ.)] doi: 10.17816/pmj304135-143
  8. Омарова С.М., Муталипова З.М.-К., Нурмагомедова З.М., Меджидова Д.Ш., Юнусова Р.Ю., Горелова В.Г. Видовой состав и биологические свойства возбудителей нозокомиальных пневмоний, выделенных в стационарах хирургического профиля Махачкалы // Клиническая лабораторная диагностика. 2012. Т. 12. С. 38–40. [Omarova S.M., Mutalipova Z.M.-K., Nurmagomedova Z.M., Medzhidova D.Sh., Yunusova R.Yu., Gorelova V.G. The specific compound and biological characteristics of agents of nosocomial pneumonia isolated in hospital surgery departments of Makhachkala. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika = Russian Clinical Laboratory Diagnostics, 2012, no. 12, pp. 38–40. (In Russ.)]
  9. Орлова О.А., Акимкин В.Г. Организация эпидемиологической диагностики вентилятор-ассоциированных инфекций дыхательных путей // Медицинский алфавит. 2017. Т. 3, № 30. С. 15–19. [Orlova O.A., Akimkin V.G. Organization of epidemiological diagnosis of ventilator-associated respiratory infections. Meditsinskiy alfavit = Medical Alphabet, 2017, vol. 3, no. 30, pp. 15–19. (In Russ.)]
  10. Mani S., Nair J. Pantoea infections in the neonatal intensive care unit. Cureus, 2021, vol. 13, no. 2: e13103. doi: 10.7759/cureus.13103

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2022 Trotsenko O.E., Bondarenko A.P., Pshenichnaya N.Y., Zaitseva T.A., Garbuz Y.A., Chishagorova I.V., Shmylenko V.A., Bazykina E.A., Ogienko O.N.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».