COMMUNITY-ACQUIRED PNEUMONIA PNEUMOCOCCAL ETIOLOGY AND MICROBIOLOGICAL ASPECTS OF NASOPHARYNGEAL CARRIAGE IN CHILDREN IN THE REPUBLIC OF TATARSTAN

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Prevalence estimate of pneumococcus carrier in preschool age children (medically fragile children with respiratory diseases and practically healthy organized children) have been carried out; microbiological features of clinical isolates S. pneumoniae have been studied. 511 S. pneumoniae strains isolated from medically fragile children with respiratory diseases aged between 6 months to 7 years during the period 2009–2016 and 47 isolates isolated from 200 practically healthy children attending preschool institutions of Kazan (2016) have been included in the research. Among 343 strains, 76 isolates were isolated during the period of 2009–2011; 82 strains — in 2012–2013; 87 strains — in 2014; 98 strains — in 2015; 168 strains — in 2016. Analysis of microbiocenosis of nasopharynx in medically fragile children showed that S. pneumoniae was sowed in 32.9% cases. In 58.4% of children it was as a monoculture (degree of colonization is 104–106  CFU/ml). S. pneumoniae contaminated nasopharynx in bacterial associations with other respiratory pathogens (S. aureus, Moraxella spp., Haemophilus spp.) in 41.6% of children. The analysis of microbiocenosis character of nasopharynx in children aged between 2.5–7 years attending preschool institutions in Kazan (n = 200) have showed that contamination S. pneumoniae (23.5%) was observed in 47 children. Pneumococcus have been isolated in monoculture in 82.9% of children; the contamination degree made 103–106 CFU/ml. According to serotyping data, nasopharynx of often and long-term ill children living in Kazan is colonized by serotypes of pneumococcus which are covered with 13 valence conjugated serum. The obtained data on the dynamics of strain S. pneumoniae antibiotic sensitivity among medically fragile children with respiratory diseases in Kazan during 2009–2015 showed high activity of β-lactams antibiotics (from 96 to 90.8% sensitive isolates) and clyndamicin (94.7–91.8% sensitive straines). Macrolides (azytromicin, clarytromicin) and phtorchinolons (ciprof loxacin) are less active in regard to isolates S. рneumoniae. S. pneumoniae with multiple antibiotic resistance were detected in children nasopharynx: 3.8–9.95 in medically fragile children and 8.5% in organized children-bactericides. Identification of the carrier level S. pneumoniae and monitoring the dynamics on antibiotic resistance and serotyping composition of nasopharyngeal pneumococcus will optimize prevention and treatment of infections S. pneumoniae in preschool children.

 

About the authors

L. T. Bayazitova

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor; Kazan State Medical University

Author for correspondence.
Email: bajalt@mail.ru

Lira T. Bayazitova - PhD (Medicine), Head of Scientific Research Laboratory of Microbiology KSRI EM, FSSCRPHW; Associate Professor, Microbiology Department KSMU.

420015, Republic of Tatarstan, Kazan, Bol’shaya Krasnaya str., 67. Phone: +7 (843) 236-67-91

Russian Federation

O. F. Tyupkina

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor

Email: fake@neicon.ru

Senior Researcher, Scientific Research Laboratory of Microbiology KSRI EM, FSSCRPHW 

Russian Federation

T. A. Chazova

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor

Email: fake@neicon.ru
Junior Researcher, Scientific Research Laboratory of Microbiology KSRI EM, FSSCRPHW Russian Federation

Y. A. Tyurin

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor; Kazan State Medical University

Email: fake@neicon.ru

PhD (Medicine), Head of Scientific Research Laboratory Of Immunology And Allergens Development KSRI EM, FSSCRPHW

Russian Federation

G. S. Isaeva

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor; Kazan State Medical University

Email: fake@neicon.ru

PhD, MD (Medicine), Director of the KSRI EM, FSSCRPHW; Head of Microbiology Department KSMU

Russian Federation

A. Z. Zaripova

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor

Email: fake@neicon.ru

Junior Researcher, Scientific Research Laboratory of Microbiology, KSRI EM, FSSCRPHW 

Russian Federation

M. А. Patyashina

Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor

Email: fake@neicon.ru

PhD, MD (Medicine), Head of the FSSCRPHW Department in Republic of Tatarstan

Russian Federation

L. G. Avdonina

Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare

Email: fake@neicon.ru

Deputy Head, FSSCRPHW Department in Republic of Tatarstan

Russian Federation

L. R. Yuzlibaeva

Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare

Email: fake@neicon.ru

PhD (Medicine), Head of the Department of Epidemiological Surveillance FSSCRPHW Department in Republic of Tatarstan

Russian Federation

References

  1. Козлов Р.С. Динамика антибиотикорезистентности Streptococcus pneumoniae в России (по данным многоцентрового проспективного исследования ПЕГАС 2006–2009 гг.) // К линическая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2010. № 4. С. 329–341. [Kozlov R.S. The dynamics of antibiotic resistance in Streptococcus pneumoniae in Russia (according to a multicenter prospective study PEGASUS 2006–2009). Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2010, no. 4, pp. 329–341. (In Russ.)]
  2. Cидоренко С.В., Лобзин Ю.В., Харит С.М., Королева И.С., Таточенко В.К. Пневмококковая инфекция и современные возможности ее профилактики: эпидемиологический обзор ситуации в мире и в России // Вопросы современной педиатрии. 2010. № 9 (1). С. 62–69. [Sidorenko S.V., Lobzin Yu.V., Kharit S.M., Koroleva I.S., Tatochenko V.K. Pneumococcal infection and modern opportunities of its prophylaxis — epidemiological review of situation in the world and russia. Voprosy sovremennoi pediatrii = Current Pediatrics. 2010, no. 9 (1), pp. 62–69. (In Russ.)]
  3. Antimicrobial resistance surveillance in Europe. Surveillance report. Annual Report of the European Antimicrobial Resistance Surveillance Network. Stockholm, 2012, pp. 51–59.
  4. Cilloniz C., Ardanuy C., Vila J., Torres A. What is the clinical relevance of drug-resistant pneumococcus? Curr. Opin. Pulm. Med., 2016, vol. 22, iss. 3, pp. 227–234. doi: 10.1097/MCP.0000000000000262
  5. Jain S., Self W.H., Wunderink R.G., Fakhran S., Balk R., Bramley A.M., Reed C., Grijalva C.G., Anderson E.J., Courtney D.M., Chappell J.D., Qi C., Hart E.M., Carroll F., Trabue C., Donnelly H.K., Williams D.J., Zhu Y., Arnold S.R., Ampofo K., Waterer G.W., Levine M., Lindstrom S., Winchell J.M., Katz J.M., Erdman D., Schneider E., Hicks L.A., McCullers J.A., Pavia A.T., Edwards K.M., Finelli L. Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among U.S. adults. N. Engl. J. Med., 2015, vol. 373, iss. 5, pp. 415–427.
  6. Musher D.M., Roig I.L., Cazares G., Stager C.E., Logan N., Safar H. Can an etiologic agent be identified in adults who are hospitalized for community-acquired pneumonia: results of a one-year study. J. Infect., 2013, vol. 67, iss. 1, pp. 11–18. doi: 10.1016/j.inf.2013.03.003
  7. Pletz M.W., Von Baum H., Van der Linden M., Schutte H., Welte T., Rohde G., Suttorp N. The burden of pneumococcal pneumonia — experience of the German competence network CAPNETZ. Pneumologie, 2012, vol. 66, iss. 8, pp. 470 –475. doi: 10.1055/s-00321310103
  8. Simell B., Auranen K., Käyhty H., Goldblatt D., Dagan R., O’Brien K.L. The fundamental link between pneumococcal carriage and disease. Expert Rev. Vaccines, 2012, vol. 11, no. 7, pp. 841–855.
  9. Torres A., Blasi F., Peetermans W.E., Viegi G., Welte T. The aetiology and antibiotic management o0f community-acquired pneumonia in adults in Europe: a literature review. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2014, vol. 33, iss. 7, pp. 1065–1079. doi: 10.1007/s10096-014-2067-1
  10. Welte T., Torres A., Nathwani D. Clinical and economic burden of community-acquired pneumonia among adults in Europe. Thorax, 2012, vol. 67, iss. 1, pp. 71–79. doi: 10.1136/thx.2009.129502

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2017 Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., Chazova T.A., Tyurin Y.A., Isaeva G.S., Zaripova A.Z., Patyashina M.А., Avdonina L.G., Yuzlibaeva L.R.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».