Геномные перестройки влияют на устойчивость биопленок почвенных бактерий Azospirillum brasilense к абиотическим стрессам
- Авторы: Мокеев Д.И.1, Телешева Е.М.2, Волохина И.В.1, Евстигнеева С.С.3, Пылаев Т.Е.3, Петрова Л.П.3, Филипьечева Ю.А.3, Шелудько А.В.3
-
Учреждения:
- Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра “Саратовский научный центр Российской академии наук”
- Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов – обособленное структурное подразделение Федерального исследовательского центра “Саратовский научный центр Российской академии наук”
- Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН
- Выпуск: Том 23, № 4 (2023)
- Страницы: 426-436
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/1816-9775/article/view/251832
- DOI: https://doi.org/10.18500/1816-9775-2023-23-4-426-436
- EDN: https://elibrary.ru/JPBABO
- ID: 251832
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Ключевые слова
Об авторах
Дмитрий Игоревич Мокеев
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра “Саратовский научный центр Российской академии наук”
ORCID iD: 0000-0002-0558-0775
Саратов, проспект Энтузиастов 13
Елизавета Михайловна Телешева
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов – обособленное структурное подразделение Федерального исследовательского центра “Саратовский научный центр Российской академии наук”просп. Энтузиастов, 13
Ирина Васильевна Волохина
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра “Саратовский научный центр Российской академии наук”
ORCID iD: 0000-0002-9088-481X
Саратов, проспект Энтузиастов 13
Стелла Сергеевна Евстигнеева
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН410049, Россия, Саратов, просп. Энтузиастов, 13
Тимофей Евгеньевич Пылаев
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН410049, Россия, Саратов, просп. Энтузиастов, 13
Лилия Петровна Петрова
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН410049, Россия, Саратов, просп. Энтузиастов, 13
Юлия Анатольевна Филипьечева
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН410049, Россия, Саратов, просп. Энтузиастов, 13
Андрей Вячеславович Шелудько
Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН410049, Россия, Саратов, просп. Энтузиастов, 13
Список литературы
- Fibach-Paldi S., Burdman S., Okon Y. Key physiological properties contributing to rhizosphere adaptation and plant growth promoting abilities of Azospirillum brasilense // FEMS Microbiol. Lett. 2012. Vol. 326. P. 99–108. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2011.02407.x
- Fukami J., Cerezini P., Hungria M. Azospirillum: benefi ts that go far beyond biological nitrogen fi xation // AMB Expr. 2018. Vol. 8. P. 73–85. https://doi.org/10.1186/s13568-018-0608-1
- Lipa P., Janczarek M. Phosphorylation systems in symbiotic nitrogen-fi xing bacteria and their role in bacterial adaptation to various environmental stresses // PeerJ. 2020. Feb11 : 8 : e8466. https://doi.org/10.7717/peerj.8466
- Ansari F. A., Jabeen M., Ahmad I. Pseudomonas azotoformans FAP5, a novel biofi lm-forming PGPR strain, alleviates drought stress in wheat plant // Int. J. Environ. Sci. Technol. 2021. Vol. 18. P. 3855–3870. https://doi.org/10.1007/s13762-020-03045-9
- Vurukonda S. S. K. P., Sandhya V., Shrivastava M., Ali S. K. Z. Enhancement of drought stress tolerance in crops by plant growth promoting rhizobacteria // Microbiol.Res. 2016. Vol. 184. P. 13–24. https://doi.org/10.1016/j.micres.2015.12.003
- Hsiao T. C. Plant responses to water stress // Ann. Rev. Plant Physiol. 1973. Vol. 24. P. 519–570. https://doi.org/10.1146/annurev.pp.24.060173.002511
- Bogino P. C., Oliva M. M., Sorroche F. G., Giordano W. The role of bacterial biofi lms and surface components in plant-bacterial associations // Int. J. Mol. Sci. 2013. Vol. 14. P. 15838–15859. https://doi.org/10.3390/ijms140815838
- Lerner A., Valverde A., Castro-Sowinski S., Lerner H., Okon Y., Burdman S. Phenotypic variation in Azospirillum brasilense exposed to starvation // Environ. Microbiol. Rep. 2010. Vol. 2. P. 577–586. https://doi.org/10.1111/j.1758-2229.2010.00149.x
- Volfson V., Fibach-Paldi Sh., Paulucci N. S., Dardanelli M., Matan O., Burdman S., Okon Y. Phenotypic variation in Azospirillum brasilense Sp7 does not infl uence plant growth promotion effects // Soil Biology and Biochemistry. 2013. Vol. 67. P. 255–262. https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2013.09.008
- Petrova L. P., Borisov I. V., Katsy E. I. Plasmid rearrangements in Azospirillum brasilense // Microbiology (Moscow). 2005. Vol. 74, № 4. P. 495–497. https://doi.org/10.1007/s1102100500948
- Petrova L. P., Shelud’ko A. V., Katsy E. I. Plasmid rearrangements and alterations in Azospirillum brasilense biofilm formation // Microbiology (Moscow). 2010. Vol. 79, № 1. P. 121–124. https://doi.org/10.1134/ S00226261710010169
- Katsy E. I., Petrova L. P. Genome rearrangements in Azospirillum brasilense Sp7 with the involvement of the plasmid pRhico and the prophage ΦAb-Cd // Russ. J. Genet. 2015. Vol. 51, № 132. P. 1165–117. https://doi. org/10.1134/S1022795415110095
- Shelud’ko A. V., Mokeev D. I., Evstigneeva S. S., Filip’echeva Yu. A., Burov A. M., Petrova L. P., Ponomareva E. G., Katsy E. I. Cell ultrastructure in biofi lms of Azospirillum brasilense // Microbiology. 2020. Vol. 89, № 1. P. 50–63. https://doi.org/10.1134/S0026261720010142
- Flemming H.-C., Wingender J. The biofi lm matrix // Nat. Rev. Microbiol. 2010. Vol. 8, № 9. P. 623–633. https://doi.org/10.1038/nrmicro2415
- Ramírez-Mata A., López-Lara L. I., Xiqui-Vázquez L., Jijón-Moreno S., Romero-Osorio A., Baca B. E. The cyclic-di-GMP diguanylate cyclase CdgA has a role in biofi lm formation and exopolysaccharide production in Azospirillum brasilense // Res. Microbiol. 2016. Vol. 167. P. 190–201. https://doi.org/10.1016/j.resmic.2015.12.004
- Wang D., Xu A., Elmerich C., Ma L. Z. Biofi lm formation enables free-living nitrogen-fi xing rhizobacteria to fi x nitrogen under aerobic conditions // ISME J. 2017. Vol. 11. P. 1602–1613. https://doi.org/10.1038/ismej.2017.30
- Shelud’ko A. V., Filip’echeva Yu. A., Telesheva E. M., Burov A. M., Evstigneeva S. S., Burygin G. L., Petrova L. P. Characterization of carbohydrate-containing components of Azospirillum brasilense Sp245 biofi lms // Microbiology. 2018. Vol. 87, № 5. P. 610–620. https://doi.org/10.1134/S0026261718050156.
- Wisniewski-Dyé F., Vial L. Phase and antigenic variation mediated by genome modifi cations // Antonie van Leeuwenhoek J. Microbiol. 2008. Vol. 94. P. 493–515. https://doi.org/10.1007/s10482-008-9267-6
- Versalovic J., Koeuth T., Lupski R. Distribution of repetitive DNA sequences in eubacteria and application to fi nerpriting of bacterial genomes // Nucleic Acids Res. 1991. Vol. 19, № 24. P. 6823–6831. https://doi.org/10.1093/nar/19.24.6823
- Fancelli S., Castaldini M., Ceccherini M. T., Di Serio C., Fani R., Gallori E., Marangolo M., Miclaus N., Bazzicalupo M. Use of random amplifi ed polymorphic DNA markers for the detection of Azospirillum strains in soil microcosms // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1998. Vol. 49, № 2. P. 221–225. https://doi.org/10.1007/s002530051162
- Tarrand J. J., Krieg N. R., Döbereiner J. A taxonomic study of the Spirillum lipoferum group with description of a new genus, Azospirillum gen. nov. and two species, Azospirillum lipoferum (Beijerinck) comb. nov. and Azospirillum braslense sp. nov. // Can. J. Microbiol. 1978. Vol. 24, № 8. P. 967–980. https://doi.org/10.1139/m78-160
- Eskew D. L, Focht D. D., Ting L. P. Nitrogen fi xation, denitrification and pleomorphic growth in a highly pigmented Spirillum lipoferum // Appl. Environ. Microbiol. 1977. Vol. 34. P. 582–585. https://doi.org/10.1128/aem.34.5.582-585.1977
- Döbereiner J., Day J. M. Associative symbiosis in tropical grass: Characterization of microorganisms and dinitrogen fi xing sites // Symposium on Nitrogen Fixation / eds. W. E. Newton, C. J. Nijmans. Pullman : Washington State University Press, 1976. P. 518–538.
- O’Toole G. A., Kolter R. Initiation of biofi lm formation in Pseudomonas fl uorescens WCS365 proceeds via multiple, convergent signalling pathways: A genetic analysis // Mol. Microbiol. 1998. Vol. 28, № 3. P. 449–461. https://doi.org/10.1046/j.1365-2958.1998.00797.x
- Chutia J., Borah S. P. Water stress effects on leaf growth and chlorophyll content but not the grain yield in traditional rice (Oryza sativa Linn.) genotypes of Assam, India: II. Protein and proline status in seedlings under PEG induced water stress // Am. J. Plant Sci. 2012. Vol. 3. P. 971–980. http://dx.doi.org/10.4236/ajps.2012.37115
- Malinich E. A., Bauer C. E. The plant growth promoting bacterium Azospirillum brasilense is vertically transmitted in Phaseolus vulgaris (common bean) // Symbiosis. 2018. Vol. 76, № 2. P. 97–108. https://doi.org/10.1007/s13199-018-0539-2
- Schloter M., Hartmann A. Endophytic and surface colonization of wheat roots (Triticum aestivum) by different Azospirillum brasilense strains studied with strain-specifi c monoclonal antibodies // Symbiosis. 1998. Vol. 25. P. 159–179.
- Pradedova E. V., Isheeva O. D., Salyaev R. K. Classification of the antioxidant defense system as the ground for reasonable organization of experimental studies of the oxidative stress in plants // Russ. J. Plant. Physiol. 2011. Vol. 58. P. 210–217. https://doi.org/10.1134/S1021443711020166
- Notununu I., Moleleki L., Roopnarain A., Adeleke R. Effects of plant growth-promoting rhizobacteria on the molecular responses of maize under drought and heat stresses: A review // Pedosphere. 2022. Vol. 32. P. 90–106. https://doi.org/10.1016/S10020160(21)60051-6