Taxonomic and applied value of profiles utilization of protein amino acids of bacteria Acinetobacterbaumannii, Acinetobacterpittii, Acinetobacternosocomialis


Cite item

Full Text

Abstract

The profiles of utilization of 20 protein amino acids 118 strains of A. baumannii, 9 strains of A. pitti, 7 strains of A. nosocomial were studied. Utilization of amino acids was determined on a minimum salt agar with an amino acid as the only source of nitrogen and carbon. Species identification of acinetobacters was carried out by matrix-activated laser desorption/ionization with time-of-flight mass spectrometry with a database of Biotyper (by BrukerDaltonics Inc. Germany.) At A. baumannii was identified 14 profiles utilization of protein amino acids, of which the first 6 profiles included 87,3% of the strains. For the first time, a wide spread of A. baumannii strains that do not utilize L-histidine - 56 (47,4%) strains was established. Signs of utilization of L-histidine (His+) or lack of utilization (His-) persist steadily in repeated strains isolated from patients. It is proposed to subdivide all the strains of A. baumannii for two trophies: the «histidine-negative trophy (His-)», which does not utilize L-histidine as the sole source of nitrogen and carbon, and the «histidine-positive trophy (His+)», which utilize it, which will be useful for epidemiological surveillance. In bacteria, A. pittii and A. nosocomial are installed close phenotypic similarity with A. baumannii at the profiles of utilization of amino acids, which proves the validity of combining these species in a complex of A. calcoaceticus-A. baumannii. Bacteria of the species A. pittii and A. nosocomial has no«histidine-negative trophy (His-)», that distinguishes them from A. baumannii.

Full Text

##article.viewOnOriginalSite##

About the authors

E P Sivolodskii

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова; Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

E V Zueva

Научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

Санкт-Петербург

References

  1. Пат. № 2660567 Российская Федерация, МПК C12 Q1/04. Способ выделения и идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii / Е.П. Сиволодский; опубл. 06.07. 2018, Б и № 19. - С. 24-26.
  2. Сиволодский Е.П. Таксономическое значение профилей ути- лизации белковых аминокислот бактерий рода Klebsiella / E.П. Сиволодский, В.Д. Бадиков, Е.В. Зуева // Вестн. Росс. воен.-мед. акад. - 2016. - № 4 (56). -С.148-151.
  3. Carr, E.L. Seven novel species of Acinetobacter isolated from activated sludge / E.L. Carr [et al.] // Int. J. Sys. Evol. Microbiol. - 2003. - Vol. 53. - P. 953-963.
  4. Cosgaya, C. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries / C. Cosgaya [et al.] // Int. J. Sys. Evol. Microbiol. - 2016. - Vol. 66. - P. 4105-4111.
  5. Gerner-Smidt, P. Reliability of phenotypic test for identification of Acinetobacter species / P. Gerner-Smidt [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 1991. -Vol. 29, № 2. - P. 277-282.
  6. Nemec, A. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13U) / A. Nemec [et al.] // Res. Microbiol. - 2011. - Vol. 162, № 4. - P. 393-404.
  7. Sivolodskii, E.P. Application the profiles of amino acid utilization as the sole carbon and nitrogen sources for Pseudomonas taxonomy / E.P. Sivolodskii // Microbiology (Moscow). - 2009. - Vol. 78, № 6. - P. 711-716.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2018 Sivolodskii E.P., Zueva E.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».