SEROTYPING OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE STRAINS, ISOLATED FROM CHILDREN IN URAL REGION WITH THE USE OF MULTIPLEX PCR


如何引用文章

全文:

详细

This article presents results of the multiplex PCR investigation of the serotypes distribution of S. pneumoniae strains circulating in Ekaterinburg and the Sverdlovsk region. This study was performed in children with invasive, noninvasive pneumococcal infections and carriers. 118 strains of pneumococci typed out of 129 ones (91.5%) referred to the 15 serotypes: 6A, 6B (20,8%); 23F (13,9%); 19F (11,5%); 8, 9V, 9A, 11F, 11A, 11B, 11C, 11D, 12F, 15A, 33F (11,5%); 3 (10%) 2, 15F, 17F, 22F, 23B (3,9%); 18B, 18C (3.9%), 19A (3,2%); 7F, 19B, 19C, 23A (3,2%); 5,10A (1.6%), 20 (1.6%), 14 (1, 6%); 9L, 9N, 15B, 15C (1,6%); 18F (1,6%); 18A (1.6%). Coincidence rate of serotypes S. pneumoniae, isolated from children with chronic infectious and inflammatory diseases of the lung with serotypes included into the content of the conjugate vaccines is: 7-valent - 69.3%, 10-valent - 98.2%, 11 - and 13-valent - 100%.

作者简介

E. Samatova

State Budgetary Educational Institution of higher professional education Ural State Medical Academy of the Ministry of Health care and Social Development of the Russian Federation

Email: lavrinenko@eka-net.ru
врач-бактериолог лаб. клинической микробиологии ОДКБ №1, заочный аспирант каф. клинической лабораторной диагностики и бактериологии фак. повышения квалификации и профессиональной переподготовки УГМА 620028, 3, Ul. Repina, Yekaterinburg, Russian Federation, 620028

A. Druy

State Budgetary Educational Institution of higher professional education Ural State Medical Academy of the Ministry of Health care and Social Development of the Russian Federation

Email: Dr-Drui@yandex.ru
очный аспирант каф. клин. лаб. диагностики и бактериологии УГМА, врач клин. лаб. диагностики лаб. молекулярной биологии Центра детской онкологии и гематологии ОДКБ № 1, мл. науч. сотр. лаб. клеточной терапии онкогематологических заболеваний ИМКТ 620028, 3, Ul. Repina, Yekaterinburg, Russian Federation, 620028

G. Tsaur

State Budgetary Institution of Healthcare of the Sverdlovsk region Regional Children's Hospital N1

Email: tsaur@mail.ru
канд. мед. наук, зав. лаб. молекулярной биологии Центра детской онкологии и гематологии ОДКБ№ , вед. науч. сотр. лаб. клеточной терапии онкогематологических заболеваний ИМКТ 32, Seraphima Deryabina Str., Yekaterinburg, Russian Federation, 620149

L. Boronina

State Budgetary Educational Institution of higher professional education Ural State Medical Academy of the Ministry of Health care and Social Development of the Russian Federation

Email: boroninalg@mail.ru
д-р мед. наук, проф. каф. клин. лаб. диагностики и бактериологии УГМА , зав. лаб. клин. микробиологии ОДКБ №1 620028, 3, Ul. Repina, Yekaterinburg, Russian Federation, 620028

参考

  1. Воронина Л.Г., Саматова Е.В., Блинова С.М. и др. Этиологическая значимость микроскопического исследования мокроты у детей с острой и хронической бронхолегочной патологией // Вестн. Урал. мед. акад. науки. - 2011. - Т. 36, № 3. - С. 84-88.
  2. Гольдштейн А.В. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции. Бюл. «Вакцинация» / Бронхолегоч. забол. - 2004. - № 2. - С. 30-35.
  3. Катосова Л.К., Сидорина Т.М., Батуро А.П. и др. Серотипы Streptococcus pneumoniae у детей, больных хроническими воспалительными заболеваниями органов дыхания // Журн. микробиол. - 1990. - №2. - С. 32-37.
  4. Катосова Л.К., Таточенко В.К., Арова А.А. и др. Серотипы Streptococcus pneumoniae у детей, больных острой пневмонией и плевритом // Журн. микробиол.- 1990. - № 5. - С. 23-28.
  5. Козлов Р.С. Пневмококки: прошлое, настоящее и будущее. -Смоленск, 2005.
  6. Козлов Р.С., Чагарян А.Н., Козлова Л.В. и др. Серологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации // Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. - 2011. - Т. 13, №2. - С. 177-187.
  7. Мартынова А.В. Эпидемиологические аспекты пневмококковых инфекций и молекулярно-генетическая характеристика Streptococcus pneumoniae. Автореф. дис.. д-ра мед. наук. - СПб., 2008.
  8. Маянский А.Н. Патогенетическая микробиология. Руководство. - Н. Новгород, 2006.
  9. Маянский Н.А., Алябьева Н.М., Катосова Л.К. и др. Определение капсульных серотипов пневмококка методом мультиплексной ПЦР // Вопр. диагн. в педиатр. - 2010. - Т. 2, № 6. - С. 6-10.
  10. Миронов О.К., Платонов А.Е., Козлов Р.С. Идентификация и се-ротипирование российских штаммов Streptococcus pneumoniae с применением методик, основанных на ПЦР / Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. - 2011. - Т. 13, № 4. - С. 304-313.
  11. МР 3.3.1.0027-11 «Эпидемиология и вакцинопрофилактика инфекции, вызываемой Streptococcus pneumoniae». - М., 2011.
  12. Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях ЛПУ: приказ МЗ СССР №535 от 22.04.85. - М., 1985.
  13. Покровский В.И., Брико Н.И., Ряпис Л.А. Стрептококки и стрептококкозы. - М., 2006.
  14. Рыжов А.А. Вакцины «Pneumo-23» и «Act-HIB» в профилакти ке и лечении хронических заболеваний легких у детей. Дис.. канд. мед. наук. - М., 2004.
  15. Ряпис Л.А., Брико Н.И. Проблема пневмококковых инфекций в России / Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2010. № 1. - С. 4-8.
  16. Таточенко В.К. Клинические проявления пневмококковой инфекции в разных возрастных группах // Бюл. «Вакцинация»/ Пневмокок. инфекц. - 2009. - № 2. - С. 3-7.
  17. Таточенко В.К., Катосова Л.К., Уланова М.А. и др. Периодические и географические различия серотипового спектра пневмококков у детей с респираторными заболеваниями и здоровых носителей // Журн. микробиол. 1994. - № 3. - С. 3-10.
  18. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории: методические указания 4.2.2039-05. М., 2005.
  19. Brito D.A., Ramirez M., Lencastre H. Serotyping Streptococcus pneumoniae by Multiplex PCR // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 6. - P. 2378-2384.
  20. Centers for Disease Control and Prevention. Epidemiology and Prevention of Vaccine-Preventable Diseases. 7 th ed. - Atlanta, 2002. - P. 205-217.
  21. Centers for disease control and prevention. PCR Deduction of Pneumococcal Serotypes, October 2009. Serotype distribution of invasive pneumococcal disease isolates among children № 5 years of age, Active Bacterial Core surveillance areas, 2008 vs. 1998-1999. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/pcr.htm.
  22. Centers for disease control and prevention. PCR Deduction of Pneumococcal Serotypes, June 2011. Serotype-specific IPD in children № 5yrs during 2005-2009, Active Bacterial Core surveillance data. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/pcr.htm.
  23. Chang C.C., Singleton R.J., Morris P.S. et al. Pneumococcal vaccines for children and adults with bronchiectasis // Cochrane Database Syst. Rev. - 2009. - Vol. 15, N 2. - CD006316.
  24. Mackenzie G.A., Leach A.J., Carapetis J.R. et al. Epidemiology of nasopharyngeal carriage of respiratory bacterial pathogens in children and adults: cross-sectional surveys in population with high rates of pneumococcal disease // BMC Infect. Dis. - 2010. - Vol. 10. - P. 304-314.
  25. Prevention of pneumococcal diseases among infants and young children using a pneumococcal conjugate vaccine. Recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP) // Mor-biol. Mortal. Wkly Rep. - 2000. -Vol. 49, RR09. - P. 1-38.
  26. Robinson K.A., Baughman W., Rothrock G. et al. Epidemiology of invasive Streptococcus pneumoniae infections in the United States, 1995-1998. Opportunities for prevention in the conjugate vaccine era // J. A. M. A. - 2001. - Vol. 285. - P. 1729-1735.
  27. Zangwill K.M., Vadheim C.M., Vannier A.M. et al. Epidemiology of invasive pneumococcal disease in Southern California: implications for design and conduct of a pneumococcal conjugative vaccine trial // J. Infect. Dis. - 1996. - Vol. 174. - P. 752-759.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载

版权所有 © Eco-vector, 2012


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».