Comparative analysis of MLVA25-typing and MLVA7-typing for their ability to identify focal affiliation of Yersinia pestis strains exemplified by isolates from the Central Caucasus highland natural plague focus


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Comparative analysis of MLVA25-typing and MLVA7-typing for their ability to identify focal affiliation of the Yersinia pestis strains have been performed on the basis of the bv. Medievalis isolates obtained from the Central Caucasus highland natural plague focus. For purposes of analysis, MLVA25 genotypes were identified for 82 isolates and further introduced into a database containing data on the 949 strains of the plague-causing agent obtained in other natural foci in Russia and countries within the former Soviet Union and beyond. The dendrograms were reconstructed by the UPGMA method with a categorical coefficient using data on all 25 VNTR loci or on only 7 of them, which were recommended by the experts from the Microbe Russian Research Anti-Plague Institute to be used for Y. pestis strains differentiation by their focal affiliation. The results of the analysis indicate the higher possibility of diagnostic errors when using the MLVA7-typing for distinguishing between the Y. pestis strains and suggest that it should be useful to subdivide the Central Caucasus highland plague focus into two subfoci.

Об авторах

V. Evseeva

State Scientific Center for Applied Microbiology and Biotechnology

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Obolensk, 142279

M. Platonov

State Scientific Center for Applied Microbiology and Biotechnology

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Obolensk, 142279

I. Govorunov

State Scientific Center for Applied Microbiology and Biotechnology

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Obolensk, 142279

D. Efremenko

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Stavropol, 355035

I. Kuznetsova

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Stavropol, 355035

S. Dentovskaya

State Scientific Center for Applied Microbiology and Biotechnology

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Obolensk, 142279

A. Kulichenko

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Stavropol, 355035

A. Anisimov

State Scientific Center for Applied Microbiology and Biotechnology

Автор, ответственный за переписку.
Email: anisimov@obolensk.org
Россия, Obolensk, 142279

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Allerton Press, Inc., 2016

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».