Biofilm Forming Ability and Spa Gene Polymorphism in Methicillin Resistant Staphylococcus aureus Clinical Isolates in North of Iran


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Spa typing has been shown to function as a genetic marker for Staphylococcus aureus outbreak investigations and epidemiological studies. This study was aimed to investigate biofilm formation capacity and spa gene polymorphism in methicillin resistant S. aureus (MRSA) strains isolated from clinical samples. A total of 102 S. aureus isolated during 2016, were analyzed for methicillin resistance and biofilm formation using phenotypic assays and PCR-based detection of associated genes. The polymorphic region of the spa gene was amplified by PCR using specific primers and subsequently in MRSA strains the amplified products were sequenced and spa types determined by using the spa database website. Out of 102 S. aureus, 41 isolates (40.2%) recognized as MRSA in phenotypic and genotypic investigations. In phenotypic assay, biofilm forming ability was detected in 71 isolates. The frequency of icaA and fnbA in test isolate were 53.9 and 65.7% respectively. Amplification of polymorphic region of the spa gene in all 102 tested isolates resulted in eight size fragments ranged between 168–336 bp. In MRSA strains thirteen distinct spa types with 5–12 repeats were observed. The most frequent types of spa were t030, t037, t325, t421, t937, t1814 and t084. spa types t2421, t1814, t359 and t2617 identified for the first time in Iran. The present results showed high biofilm formation capacity and great diversity of variable region of spa gene in MRSA strains and confirmed that, spa typing provides valuable information on the epidemiologic features and discrimination of this bacterium.

Ключевые слова

Об авторах

L. Asadpour

Department of Biology, Faculty of Science, Rasht Branch

Автор, ответственный за переписку.
Email: Asadpour@iaurasht.ac.ir
Иран, Rasht

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Allerton Press, Inc., 2018

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».