A new genetic variant of the Crimean–Congo hemorrhagic fever virus isolated in Crimea


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

The work presents the results of genetic identification of Crimean–Congo hemorrhagic fever (CCHF) virus isolates obtained in the Crimean federal district in the course of the 2015 epidemiological survey for a Crimean-Congo hemorrhagic fever case from Crimea. A PCR test for the presence of the CCHF virus RNA was performed for a single blood serum sample obtained from a patient and for 61 pools (506 individuals) of ixodic ticks collected during an epizootological study carried out in six administrative regions of the Crimean federal district. CCHF virus RNA was detected in the patient’s blood serum and in ten samples of ixodic ticks. Genetic identification of the CCHF virus isolates was performed by sequencing S, M, and L virus genome segments. The results of the molecular and genetic analysis showed that the RNAs of the CCHF viruses detected in the blood serum samples and three tick suspension samples are highly homologous to each other and belong to a new Crimea (Vd) genetic subgroup of the Europe 1 genotype. Whole genome sequences were obtained for two CCHF virus isolates from the Crimea subgroup (Vd). CCHF virus variants belonging to the Crimea subgroup (Vd) of the Europe 1 genotype have been described for the first time and are endemic for the Crimean peninsula.

Об авторах

A. Kulichenko

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

A. Volynkina

Stavropol Research Antiplague Institute

Автор, ответственный за переписку.
Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

E. Kotenev

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

S. Pisarenko

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

L. Shaposhnikova

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

Y. Lisitskaya

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

N. Vasilenko

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

O. Tsygankova

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

Y. Evchenko

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

Y. Tohov

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

V. Savel’ev

Stavropol Research Antiplague Institute

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Sovetskaya 15, Stavropol, Crimean Federal District, 355035

S. Tihonov

Crimea Republic Plague Control Station

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Promyshlennaya 42, Simferopol, Crimean Federal District, 295023

N. Penkovskaya

Federal Service on Customers’ Rights Protection and Human Wellbeing Surveillance Interregional Directorate in the Crimea Republic and Sevastopol Federal City

Email: volyn444@mail.ru
Россия, ul. Naberezhnaya 67, Simferopol, Crimean Federal District, 295034

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Allerton Press, Inc., 2016

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».