Биосинтез субериновой кислоты из глюкозы по обращенному β-окислению жирных кислот рекомбинантными штаммами Escherichia coli

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

С использованием направленно сконструированных производных ранее полученных адипат-продуцирующих штаммовEscherichia coliMG1655lacIQ, ∆ackA-pta, ∆poxB, ∆ldhA,∆adhE, PL-SDj10-atoB, Ptrc-ideal-4-SDj10-fadB, ∆fadE, PL-SDj10-tesB, ∆yciA, Ptrc-ideal-4-SDj10-fabI, PL-SDj10-paaJ,∆aceBAK,∆glcBи MG1655lacIQ, ∆ackA-pta, ∆poxB, ∆ldhA,∆adhE, PL-SDj10-atoB, Ptrc-ideal-4-SDj10-fadB, PL-SDj10-tesB, ∆yciA, Ptrc-ideal-4-SDj10-fadE, PL-SDj10-paaJ,∆aceBAK,∆glcBпродемонстрирована принципиальная возможность биосинтеза этой бактерией субериновой кислоты из глюкозы в результате обращения природного пути β-окисления жирных кислот. Конденсация ацетил-КоА с сукцинил-КоА и адипил-КоА обеспечивалась в рекомбинантах 3-оксоадипил-КоА тиолазой PaaJ, тогда как предполагаемая ацетил-КоА С-ацетилтрансфераза YqeF была неспособна к катализу соответствующих реакций. Биосинтез субериновой кислоты на уровне ~60 мкМ был достигнут при значительном усилении в штаммах экспрессии гена бифункциональной (S)-3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы/еноил-КоА-редуктазы,fadB. Последующая инактивация в штаммах сукцинатдегидрогеназы повышала внутриклеточную доступность сукцинил-КоА для инициации первого раунда обращения цикла и способствовала росту накопления рекомбинантами целевого соединения до ~75 мкМ. Полученные результаты создают основу для разработки высокоэффективных штаммов-продуцентов для биотехнологического производства субериновой кислоты из возобновляемого сырья.

Об авторах

А. Ю. Гулевич

Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: andrey.gulevich@gmail.com
Москва, 117312 Россия

А. Ю. Скороходова

Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Email: andrey.gulevich@gmail.com
Москва, 117312 Россия

В. Г. Дебабов

Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: andrey.gulevich@gmail.com
Москва, 117312 Россия

Список литературы

  1. Tarasava K.,Lee S.H.,Chen J.,Köpke M.,Jewett M.C.,Gonzalez R. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2022. V. 49. № 2. kuac003. https://doi.org/10.1093/jimb/kuac003
  2. Fujita Y.,Matsuoka H.,Hirooka K. // Mol. Microbiol. 2007. V. 66. № 4. P. 829–839.
  3. Kim S.,Cheong S.,Chou A.,Gonzalez R. // Curr. Opin. Biotechnol. 2016. V. 42. P.206–215. https://doi.org/10.1016/j.copbio.2016.07.004
  4. Dellomonaco C.,Clomburg J.M.,Miller E.N.,Gonzalez R. // Nature. 2011. V. 476. P. 355–359. https://doi.org/10.1038/nature10333
  5. Gulevich A.Y.,Skorokhodova A.Y.,Sukhozhenko A.V.,Shakulov R.S.,Debabov V.G. // Biotechnol. Lett. 2012. V. 34. P. 463–469. https://doi.org/10.1007/s10529-011-0797-z
  6. Mehrer C.R.,Incha M.R.,Politz M.C.,Pfleger B.F. // Metab. Eng. 2018. V. 48. P. 63–71. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2018.05.011
  7. Chen J.,Gonzalez R. // Metab. Eng. 2023. V. 79. P. 173–181. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2023.07.006
  8. Kim S.,Clomburg J.M.,Gonzalez R. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2015. V. 42. P. 465–75. https://doi.org/10.1007/s10295-015-1589-6
  9. Kim S.,Cheong S.,Gonzalez R. // Metab. Eng. 2016. V. 36. P. 90–98. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2016.03.005
  10. Gulevich A.Y.,Skorokhodova A.Y.,Debabov V.G. // Biomolecules. 2024. V. 14. 449. http://doi.org/10.3390/biom14040449
  11. Cheong S.,Clomburg J.M.,Gonzalez R. // Nat. Biotechnol. V. 34. № 5. P. 556–561. https://doi.org/10.1038/nbt.3505
  12. Lang M.,Li H. // ChemSusChem. 2022. V. 15. № 1. e202101531. https://doi.org/10.1002/cssc.202101531
  13. Liao Z.,Yeoh Y.K.,Parumasivam T.,Koh W.Y.,Alrosan M.,Alu’datt M.H.,Tan T.C. // RSC Adv. 2024.V. 14. № 24. P. 17008–17021. https://doi.org/10.1039/d4ra02598a
  14. Гулевич А.Ю.,Скороходова А.Ю.,Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2023. Т. 59. № 3. С. 235–243.
  15. Гулевич А.Ю.,Скороходова А.Ю.,Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2023. Т. 60. № 3. С. 28–35.
  16. Sambrook J.,Fritsch E.,Maniatis T. // Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2 nd Ed., N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989. 1659 р.
  17. Скороходова А.Ю.,Стасенко А.А.,Гулевич А.Ю.,Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2018. Т. 54. № 3. С. 244–252.
  18. Skorokhodova A.Y.,Gulevich A.Y.,Debabov V.G. // Biotechnol. Rep. 2022. V. 33. e00703. http://doi.org/10.1016/j.btre.2022.e00703
  19. Datsenko K.A.,Wanner B.L. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.2000. V. 97. № 12. Р. 6640–6645.
  20. Каташкина Ж.И.,Скороходова А.Ю.,Зименков Д.В.,Гулевич А.Ю.,Минаева Н.И.,Дорошенко В.Г.,Бирюкова И.В.,Машко С.В. // Молекулярная биология. 2005. Т. 39. № 5. С. 823–831.
  21. Гулевич А.Ю.,Скороходова А.Ю.,Ермишев В.Ю.,Крылов А.А.,Минаева Н.И.,Полонская З.М. и др. // Молекулярная биология. 2009. Т. 43. № 3. С. 547–557.
  22. Clark D.P.,Cronan J.E. // EcoSal Plus.2005. V. 1. 10.1128/ecosalplus.3.4.4. https://doi.org/10.1128/ecosalplus.3.4.4.
  23. Binstock J.F.,Schulz H. // Methods. Enzymol. 1981. V. 71. P. 403–411. https://doi.org/10.1016/0076-6879(81)71051-6
  24. Teufel R.,Mascaraque V.,Ismail W.,Voss M.,Perera J.,Eisenreich W.,Haehnel W.,Fuchs G. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. № 32. P. 14390–14395. https://doi.org/10.1073/pnas.1005399107
  25. Deuschle U.,Kammerer W.,Gentz R.,Bujard H. // EMBO J. 1986. V. 5. P. 2987–2994. https://doi.org/10.1002/j.1460-2075.1986.tb04596.x

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».