Ассоциация полиморфных вариантов генов системы гемостаза с течением COVID-19

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. COVID-19 характеризуется разнообразным течением: от бессимптомного до тяжелого с летальным исходом. Комплекс неблагоприятных факторов инфицированного организма во многом определяет течение и исход болезни.

Цель работы – выявить возможные ассоциации полиморфных генов системы гемостаза с течением COVID-19.

Материалы и методы. ДНК выделяли из крови инфицированных пациентов (n=117) и  участников группы сравнения (n=104). Все инфицированные были поделены на 3 группы в зависимости от тяжести состояния, которую оценивали по NEWS2. Еще одну группу составили участники, перенесшие инфекцию бессимптомно. Определение однонуклеотидного полиморфизма (ОНП) генов FGB (-455 G/A), FII (20210 G/A), FV (1691 G/A), FVII (10976 G/A), FXIIIA1 (103 G/T), ITGA2 (807 C/T), ITGB3 (1565 T/C), SERPINE1 (-675 5G/4G) проводили методом ПЦР, используя набор «Генетика гемостаза» («ДНК-Технология», Россия).

Результаты. Достоверных различий в аллельных вариантах анализируемых генов между группой всех инфицированных и здоровыми участниками не выявлено. Но анализ групп пациентов, различающихся по тяжести COVID-19, относительно группы участников, бессимптомно перенесших инфекцию, показал, что в гене SERPINE1 (-675 5G/4G) обнаружена достоверная ассоциация ОНП с течением инфекции (р=0,0381; р=0,0066; р=0,0009). Установлено, что по мере увеличения баллов тяжести COVID-19 доля аллеля 5G гена SERPINE1 (-675 5G/4G) снижалась, а доля аллеля 4G увеличивалась (р=0,005; р=0,009; р=0,0005). Аналогичные процессы наблюдались для генотипов 5G/5G и 4G/4G.

Обсуждение. Анализ вклада ОНП генов системы гемостаза показал, что  фибринолитическое звено ассоциировано с тяжестью COVID-19. Полиморфизм гена этого звена SERPINE1 (-675 5G/4G) имел достоверную связь с течением COVID-19.

Заключение. Впервые обнаружено, что ОНП гена SERPINE1 (-675 5G/4G) ассоциирован с  течением COVID-19. Генотип 5G/5G этого гена может рассматриваться как маркер более легкого течения инфекции, генотип 4G/4G – более тяжелого.

Об авторах

Людмила Ивановна Николаева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: l.i.nikolaeva@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1323-5568

доктор биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории генно-инженерных препаратов

Россия, 123098, Москва

Майя Денисовна Стучинская

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: mayastaya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-8544-7482

младший научный сотрудник лаборатории генно-инженерных препаратов

Россия, 123098, Москва

Анна Владимировна Дедова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: dedova.anna2010@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-2491-9324

аспирант лаборатории генно-инженерных препаратов

Россия, 123098, Москва

Надежда Григорьевна Шевченко

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: dr.nadya@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-2486-4554

младший научный сотрудник лаборатории генно-инженерных препаратов

Россия, 123098, Москва

Ирина Николаевна Хлопова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: khlopova.ira@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7419-590X

кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории хронических вирусных инфекций

Россия, 123098, Москва

Ирина Сергеевна Кружкова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России; ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: irina-kru@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1983-481X

научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций с апробацией лекарственных средств

Россия, 123098, Москва; 125367, Москва

Лилия Николаевна Меркулова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: merkulova0320@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7260-0879

кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций с апробацией лекарственных средств

Россия, 123098, Москва

Лидия Борисовна Кистенева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: lborisovna2007@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7336-409X

доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории хронических вирусных инфекций

Россия, 123098, Москва

Людмила Васильевна Колобухина

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России; ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: lkolobuchina@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-5775-3343

доктор медицинских наук, профессор, главный научный сотрудник лаборатории респираторных вирусных инфекций с апробацией лекарственных средств, врач-инфекционист

Россия, 123098, Москва; 125367, Москва

Евгения Андреевна Мукашева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: mukasheva_evgeniya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5688-5309

научный сотрудник лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа

Россия, 123098, Москва

Кирилл Геннадьевич Краснослободцев

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: kkg_87@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1745-9128

научный сотрудник лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа

Россия, 123098, Москва

Светлана Викторовна Трушакова

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: s.trushakova@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-9610-3041

кандидат биол. наук, старший научный сотрудник лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа

Россия, 123098, Москва

Анастасия Сергеевна Крепкая

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: nastya18-96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7272-4011

младший научный сотрудник лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа

Россия, 123098, Москва

Виктор Васильевич Куприянов

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: vkoup@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8602-1974

кандидат биол. наук, старший научный сотрудник лаборатории генно-инженерных препаратов

Россия, 123098, Москва

Наталья Анатольевна Никитенко

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: nan-nikitenko@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-5829-744X

кандидат биол. наук, старший научный сотрудник лаборатории клеточной микробиологии

Россия, 123098, Москва

Елизавета Андреевна Хадорич

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: eli.hadd@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0005-1816-0496

лаборант-исследователь лаборатории клеточной микробиологии

Россия, 123098, Москва

Егор Михайлович Бурмистров

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: burmistrov.gamaleya@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-6592-8331

научный сотрудник лаборатории клеточной микробиологии

Россия, 123098, Москва

Игорь Николаевич Тюрин

ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: tyurin.dti@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-5696-1586

кандидат медицинских наук, главный врач

Россия, 125367, Москва

Наталья Александровна Антипят

ГБУЗ «Инфекционная клиническая больница № 1» Департамента здравоохранения города Москвы

Email: natadoc70@bk.ru
ORCID iD: 0000-0001-8578-2838

заместитель главного врача по медицинской части

Россия, 125367, Москва

Елена Ивановна Бурцева

ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России

Email: elena-burtseva@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2518-6801

доктор медицинских наук, руководитель лаборатории этиологии и эпидемиологии гриппа

Россия, 123098, Москва

Список литературы

  1. Hui D.S., Azhar E.I., Madani T.A., Ntoumi F., Kock R., Dar O., et al. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health – The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. Int. J. Infect. Dis. 2020; 91: 264–66. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.01.009
  2. Chen Y., Lio Q., Guo D. Emerging coronaviruses: Genome structure, replication, and pathogenesis. J. Med. Virol. 2020; 92(4): 418–23. https://doi.org/10.1002/jmv.25681
  3. Connors J.M., Levy J.H. COVID-19 and its implications for thrombosis and anticoagulation. Blood. 2020; 135(23): 2033–40. https://doi.org/10.1182/blood.2020006000
  4. Dolhnikoff M., Duarte-Neto A.N., de Almeida Monteiro R.A., da Silva L.F.F., de Oliveira E.P., Saldiva P.H.N., et al. Pathological evidence of pulmonary thrombotic phenomena in severe COVID-19. J. Thromb. Haemost. 2020; 18(6): 1517–9. https://doi.org/10.1111/jth.14844
  5. Varga Z., Flammer A.J., Steiger P., Haberecker M., Andermatt R., Zinkernagel A.S., et al. Endothelial cell infection and endotheliitis in COVID-19. Lancet. 2020; 395(10234): 1417–8. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30937-5
  6. Arachchillage D.R.J., Laffan M. Abnormal coagulation parameters are associated with poor prognosis in patients with novel coronavirus pneumonia. J. Thromb. Haemost. 2020; 18(5): 1233–4. https://doi.org/10.1111/jth.14820
  7. Gupta A., Madhavan M.V., Sehgal K., Nair N., Mahajan S., Sehrawat T.S., et al. Extrapulmonary manifestations of COVID-19. Nat. Med. 2020; 26(7): 1017–32. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0968-3.
  8. Baranova A., Cao H., Zhang F. Unraveling risk genes of COVID-19 by multi-omics integrative analyses. Front. Med. (Lausanne). 2021; 8: 738687. https://doi.org/10.3389/fmed.2021.738687
  9. Saponi-Cortes J.M.R., Rivas M.D., Calle-Alonso F., Sanchez J.F., Costo A., Martin C., et al. IFNL4 genetic variant can predispose to COVID-19. Sci. Rep. 2021; 11(1): 21185. https://doi.org/10.1038/s41598-021-00747-z
  10. Samadizadeh S., Masoudi M., Rastegar M., Salimi V., Shahbaz M.B., Tahamtan A. COVID-19: why does disease severity vary among individuals? Respir. Med. 2021; 180: 106356. https://doi.org/10.1016/j.rmed.2021.106356
  11. Pairo-Castineira E., Rawlik K., Bretherick A.D., Qi T., Wu Y., Nassiri I., et al. GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19. Nature. 2023; 617(7962): 764–8. https://doi.org/10.1038/s41586-023-06034-3
  12. Chen J.Y., Zhai C.N., Wang Z.Q., Li R., Wu W.J., Hou K., et al. The susceptibility of SERPINE1 rs1799889 SNP in diabetic vascular complications: a meta-analysis of fifty-one case-control studies. BMC Endocr. Disord. 2021; 21(1): 195. https://doi.org/10.1186/s12902-021-00837-z
  13. Gils A., Declerck P.J. Plasminogen activator inhibitor-1. Curr. Med. Chem. 2004; 11(17): 2323–34. https://doi.org/10.2174/0929867043364595
  14. Zhang Q., Jin Y., Li X., Peng X., Peng N., Song J. Plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) 4G/5G promoter polymorphisms and risk of venous thromboembolism – a meta-analysis and systematic review. Vasa. 2020; 49(2): 141–6. https://doi.org/10.1024/0301-1526/a000839
  15. Huang X., Li Y., Huang Z., Wang C.., Xu Z. PAI-1 gene variants and COC use are associated with stroke risk: a case-control study in the Han Chinese women. J. Mol. Neurosci. 2014; 54(4): 803–10. https://doi.org/10.1007/s12031-014-0418-0
  16. Gao W.F., Guo Y.B., Bai Y., Ding X.Y., Yan Y.J., Wu ZQ. Association between PAI-1 4G/5G polymorphism and diabetic nephropathy: a meta-analysis in the Chinese population. Int. Urol. Nephrol. 2016; 48(9): 1483–9. https://doi.org/10.1007/s11255-016-1333-9
  17. Wang S., Cao Q., Wang X., Li B., Tang M., Yuan W., et al. PAI-1 4G/5G polymorphism contributes to cancer susceptibility: evidence from meta-analysis. PLoS One. 2013; 8(2): e56797. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0056797.
  18. Madàch K., Aladzsity I., Szilàgyi A., Fust G., Gàl J., Pénzes I., et al. 4G/5G polymorphism of PAI-1 gene is associated with multiple organ dysfunction and septic shock in pneumonia induced severe sepsis: prospective, observational, genetic study. Crit. Care. 2010; 14(2): R79. https://doi.org/10.1186/cc8992
  19. Wang Z., Kong L., Luo G., Zhang H., Sun F., Liang W., et al. Clinical impact of the PAI-1 4G/5G polymorphism in Chinese patients with venous thromboembolism. Thromb. J. 2022; 20(1): 68. https://doi.org/10.1186/s12959-022-00430-x
  20. Li W., Mao S., Wu L., Shi W., Zhang J., Wang Z. Association between the PAI-1 4G/5G gene polymorphism and the risk of systemic lupus erythematosus/lupus nephritis. Crit. Rev. Eukaryot. Gene Expr. 2019; 29(1): 85–94. https://doi.org/10.1615/critreveukaryotgeneexpr.2019025311
  21. Kong M., Zhang H., Cao X., Lu Z. Higher level of neutrophil-to-lymphocyte is associated with severe COVID-19. Epidemiol. Infect. 2020; 148: e139. https://doi.org/10.1017/S0950268820001557
  22. Городин В.Н., Мойсова Д.П., Зотов С.В., Ванюков А.А., Подсадная А.А., Тихоненко Ю.В. Роль полиморфизма генов системы гемостаза в патогенезе COVID-19. Инфекционные болезни. 2021; 19(2): 16–26. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2021-2-16-26 https://elibrary.ru/cooovc

© Николаева Л.И., Стучинская М.Д., Дедова А.В., Шевченко Н.Г., Хлопова И.Н., Кружкова И.С., Меркулова Л.Н., Кистенева Л.Б., Колобухина Л.В., Мукашева Е.А., Краснослободцев К.Г., Трушакова С.В., Крепкая А.С., Куприянов В.В., Никитенко Н.А., Хадорич Е.А., Бурмистров Е.М., Тюрин И.Н., Антипят Н.А., Бурцева Е.И., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах