Bombali virus (Filoviridae: Orthoebolavirus: Orthoebolavirus bombaliense)

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

Introduction. Members of genus Orthoebolavirus of family Filoviridae cause severe hemorrhagic fever in humans with high fatality rates (up to 90%). The first outbreaks of disease caused by the members of genus Orthoebolavirus were registered in 1976 in Zaire and Sudan. The outbreaks of disease caused by the members of genus Orthoebolavirus occur regularly in Africa. The largest outbreak (for all history of monitoring) happened in Guinea, Liberia, Sierra-Leone in 2013–2016. During this outbreak, the cases of disease importation in non-endemic regions were registered. The foci of circulation of the members of genus Orthoebolavirus (with exception for Reston virus) are situated in moist tropical forests of Central and West Africa. The bats are natural reservoirs for filoviruses, the genomic RNA sequences of the members of genus Orthoebolavirus were isolated from various bat species (Hypsignathus monstrosus, Epomops franqueti, Myonycteris tarquata). Recently, the new members of Filoviridae family were isolated from several bat species.

Aims. The purpose of the presented article is analysis of the properties of the new member of genus Orthoebolavirus of family Filoviridae – Bombali virus (Orthoebolavirus bombaliense).

Material and methods. The paper presents analysis of data published in English language scientific publications in citation databases RSCI, PubMed.The research method is analytical. The literature for the period from 2005 to 2023 was analyzed.

Results. Bombali virus was first isolated in Guinea in August 2018 from bats Mops condylurus. When comparing the concentration of the Bombali virus in the organs of infected bats, the highest level of accumulation was detected in the lungs which indirectly indicates the possibility of aerosol infection of Mops condylurus. Later RNA of Bombali virus was identified by reverse transcription-polymerase chain reaction in bats Chaerephon pumilus in Sierra-Leone, but not in other species of fruit-eating and insectivores bats. Nucleotide sequence of genomic RNA of Bombali virus from samples collected in Guinea had 99.3% homology to that from samples collected in Sierra-Leone, and 98.3% homology to that from samples collected in Kenya. Considering that bats Mops condylurus as many other species of insectivores bats cannot travel long distances, this is indirect evidence for the wide distribution of the Bombali virus on the African continent. Despite the fact that cases of human disease caused by Bombali virus have not been identified to date, glycoprotein of this virus (as glycoprotein of filoviruses pathogenic for humans) has affinity to the C1 receptor of Neumann–Pieck protein of human cells.

Conclusion. The study of the molecular biological characteristics of the Bombali virus, as well as other recently discovered new representatives of family Filoviridae can give valuable information for identification of molecular markers of pathogenicity for humans.

About the authors

Tatiana E. Sizikova

48 Central Scientific Research Institute of the Ministry of Defense of the Russian Federation

Author for correspondence.
Email: anyuta6549@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1817-0126

PhD, senior researcher

Russian Federation, 141306, Sergiev Posad

Vitaliy N. Lebedev

48 Central Scientific Research Institute of the Ministry of Defense of the Russian Federation

Email: 48cnii@mil.ru
ORCID iD: 0000-0002-6552-4599

DSc, professor, leading researcher

Russian Federation, 141306, Sergiev Posad

Sergey V. Borisevich

48 Central Scientific Research Institute of the Ministry of Defense of the Russian Federation

Email: 48cnii@mil.ru
ORCID iD: 0000-0002-6742-3919

DSc, professor, academician of RAS, head of the institute

Russian Federation, 141306, Sergiev Posad

References

  1. Sanchez A., Geisbert T.W., Feldmann H. Filoviridae: Marburg and Ebola viruses. In: Knipe D.M., Howley P.M., eds. Fields Virology. Philadelphia: Lippincott William & Wilkins, a Wolters Kluwer Business; 2007: 1409–48.
  2. Radoshitzky S.R., Bavari S., Jahrling P.B., Cuhn J.H. Filoviruses. In: Bozue J., Cote C.K., Glass P.J., eds. Medical Aspects of Biological Warfare. Houston; 2018: 569–614.
  3. Biedenkopf N., Bukreyev A., Chandran K., Di Paola N., Formenty P.B.H., Griffiths A., et al. Renaming of genera Ebolavirus and Marburgvirus to Orthoebolavirus and Orthomarburgvirus, respectively, and introduction of binomial species names within family Filoviridae. Arch. Virol. 2023; 168(8): 220. https://doi.org/10.1007/s00705-023-05834-2
  4. Piot P., Muyembe J.J., Edmunds W.J. Ebola in West Africa: from disease outbreak to humanitarian crisis. Lancet Infect. Dis. 2014; 14(11): 1034–5. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(14)70956-9.
  5. Olival K.J., Hayman D.T.S. Filoviruses in bats: current knowledge and future directions. Viruses. 2014; 6(4): 1759–88. https://doi.org/10.3390/v6041759
  6. Nikegasong J.N., Onyebujoh P. Response to the Ebola virus disease outbreak in Democratic Republic of the Congo. Lancet. 2018; 391(10138): 2395–8. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(18)31326-6
  7. Agua-Agum J., Allegranzi B., Ariyarajah A., Aylward R., Blake I.M., Barboza P., et al. After Ebola in West Africa – unpredictable risks, preventable epidemics. N. Engl. J. Med. 2016; 375(6): 587–96. https://doi.org/10.1056/nejmsr1513109
  8. Towner J.S., Amman B.R., Sealy T.K., Carroll S.A.R., Comer J.A., Kemp A., et al. Isolation of genetically diverse Marburg viruses from Egyptian fruit bats. PLoS Pathog. 2009; 5(7): e1000536. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000536
  9. Leroy E.M., Kumulungui B., Pourrut X., Rouquet P., Hassanin A., Yaba P., et al. Fruit bats as reservoirs of Ebola virus. Nature. 2005; 438(7068): 575–6. https://doi.org/10.1038/438575a
  10. Kunz T.H., Braun de Torrez E., Bauer D., Lobova T., Fleming T.H. Ecosystem services provided by bats. Ann. N.Y. Acad. Sci. 2011; 1223: 1–38. https://doi.org/10.1111/j.1749-6632.2011.06004.x
  11. Schuh A.J., Amman B.R., Towner J.S. Filoviruses and bats. Microbiol. Aust. 2017; 38(1): 12–6. https://doi.org/10.1071/ma17005
  12. Hayman D.T.S., Emmerich P., Yu M., Wang L.F., Suu-Ire R., Fooks A.R., et al. Long-term survival of an urban fruit bat seropositive for Ebola and Lagos bat viruses. PLoS One. 2010; 5(8): e11978. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0011978
  13. Hayman D.T.S., McCrea R., Restif O., Suu-Ire R., Fooks A.R., Wood J.L.N., et al. Demography of straw-colored fruit bats in Ghana. J. Mammal. 2012; 93(5): 1393–404. https://doi.org/10.1644/11-mamm-a-270.1
  14. Hayman D.T.S., Yu M., Crameri G., Wang L.F., Suu-Ire R., Wood J.L.N., et al. Ebola virus antibodies in fruit bats, Ghana, West Africa. Emerg. Infect. Dis. 2012; 18(7): 1207–9. https://doi.org/10.3201/eid1807.111654
  15. Olival K.J., Islam A., Yu M., Anthony S.J., Epstein J.H., Khan S.A., et al. Ebola virus antibodies in fruit bats, Bangladesh. Emerg. Infect. Dis. 2013; 19(2): 270–3. https://doi.org/10.3201/eid1902.120524
  16. Pourrut X., Kumulungui B., Wittmann T., Moussavou G., Delicat A., Yaba P., et al. The natural history of Ebola virus in Africa. Microbes Infect. 2005; 7(7-8): 1005–14. https://doi.org/10.1016/j.micinf.2005.04.006
  17. Pourrut X., Delicat A., Rollin P.E., Ksiazek T.G., Gonzalez J.P., Leroy E.M. Spatial and temporal patterns of Zaire ebolavirus antibody prevalence in the possible reservoir bat species. J. Infect. Dis. 2007; 196(Suppl. 2): S176-83. https://doi.org/10.1086/520541
  18. Pourrut X., Souris M., Towner J.S., Rollin P.E., Nichol S.T., Gonzalez J.P., et al. Large serological survey showing cocirculation of Ebola and Marburg viruses in Gabonese bat populations, and a high seroprevalence of both viruses in Rousettus aegyptiacus. BMC Infect. Dis. 2009; 9: 159. https://doi.org/10.1186/1471-2334-9-159
  19. Towner J.S., Khristova M.L., Sealy T.K., Vincent M.J., Erickson B.R., Bawiec D.A., et al. Marburgvirus genomics and association with a large hemorrhagic fever outbreak in Angola. J. Virol. 2006; 80(13): 6497–516. https://doi.org/10.1128/jvi.00069-06
  20. Negredo A., Palacios G., Vázquez-Morón S., González F., Dopazo H., Molero F., et al. Discovery of an ebolavirus-like filovirus in Europe. PLoS Pathog. 2011; 7(10): e1002304. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1002304
  21. Yang X.L., Tan C.W., Anderson D.E., Jiang R.D., Li B., Zhang W., et al. Characterization of a filovirus (Měnglà virus) from Rousettus bats in China. Nat. Microbiol. 2019; 4(3): 390–5. https://doi.org/10.1038/s41564-018-0328-y
  22. He B., Feng Y., Zhang H., Xu L., Yang W., Zhang Y., et al. Filovirus RNA in fruit bats, China. Emerg. Infect. Dis. 2015; 21(9): 1675–7. https://doi.org/10.3201/eid2109.150260
  23. Maes P., Amarasinghe G.K., Ayllón M.A., Basler C.F., Bavari S., Blasdell K.R., et al. Taxonomy of the order Mononegavirales: second update 2018. Arch. Virol. 2019; 164(4): 1233–44. https://doi.org/10.1007/s00705-018-04126-4
  24. Towner J.S., Sealy T.K., Khristova M.L., Albarino C.G., Conlan S., Reeder S.A., et al. Newly discovered Ebola virus associated with hemorrhagic fever outbreak in Uganda. PLoS Pathog. 2008; 4(11): e1000212. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000212
  25. Biedenkopf N, Bukreyev A, Chandran K, et al. Renaming of genera Ebolavirus and Marburgvirus to Orthoebolavirus and Orthomarburgvirus, respectively, and introduction of binomial species names within family Filoviridae. Arch Virol. 2023;168(8):220. Published 2023 Aug 3. doi: 10.1007/s00705-023-05834-2
  26. Newsweek. Touchberry R. Scientists warn New Ebola strain found in West Africa has potential to infect humans; 2018. Available at: https://newsweek.com/scientists-warn-new-ebola-strain-found-west-africa-has-potential-infect-1046701
  27. Kuhn J.H., Adkins S., Alioto D., Alkhovsky S.V., Amarasinghe G.K., Anthony S.J., et al. 2020 taxonomic update for phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales. Arch. Virol. 2020; 165(12): 3023–72. https://doi.org/10.1007/s00705-020-04731-2
  28. Goldstein T., Anthony S.J., Gbakima A., Bird B.H., Bangura J., Tremeau-Bravard A., et al. The discovery of Bombali virus adds further support for bats as hosts of ebolaviruses. Nat. Microbiol. 2018; 3(10): 1084–9. https://doi.org/10.1038/s41564-018-0227-2
  29. Forbes K.M., Webala P.W., Jääskeläinen A.J., Abdurahman S., Ogola J., Masika M.M., et al. Bombali virus in Mops condylurus bat, Kenya. Emerg. Infect. Dis. 2019; 25(5): 955–7. https://doi.org/10.3201/eid2505.181666
  30. Karan L.S., Makenov M.T., Korneev M.G., Sacko N., Boumbaly S., Yakovlev S.A., et al. Bombali Virus in Mops condylurus Bats, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2019; 25(9): 1774–5. https://doi.org/10.3201/eid2509.190581
  31. Crameri G., Todd S., Grimley S., McEachern J.A., Marsh G.A., Smith C., et al. Establishment, immortalisation and characterisation of pteropid bat cell lines. PLoS One. 2009; 4(12): e8266. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0008266
  32. Jordan I., Munster V.J., Sandig V. Authentication of the R06E fruit bat cell line. Viruses. 2012; 4(5): 889–900. https://doi.org/10.3390/v4050889
  33. Hofmann-Winkler H., Kaup F., Pohlman S. Host cell factors in filovirus entry; novel players, new insights. Viruses. 2012; 4(12): 3336–62. https://doi.org/10.3390/v4123336
  34. Muller E.H., Obernoster G., Raaben M., Herbert A.S., Deffieu M.S., Krishnan A., et al. Ebola virus entry requires the host-programmed recognition of an intracellular recognition of an intracellular receptor. EMBO J. 2012; 31(8): 1947–60. https://doi.org/10.1038/emboj.2012.53
  35. He F., Melen K., Maljanen S., Lundberg R., Jiang M., Osterlund P., et al. Ebolavirus protein VP24 interferes with innate immune responses by inhibiting interferon-λ1 gene expression. Virology. 2017; 509: 23–34. https://doi.org/10.1016/j.virol.2017.06.002
  36. Guito J.C., Albarino C.G., Chakrabarti A.K., Towner J.S. Novel activities by ebolavirus and marburgvirus interferon antagonists revealed using a standardized in vitro reporter system. Virology. 2017; 501: 147–65. https://doi.org/10.1016/j.virol.2016.11.015
  37. Feagins A.R., Basler C.F. Lloviu virus VP24 and VP35 proteins function as innate immune antagonists in human and bat cells. Virology. 2015; 485: 145–52. https://doi.org/10.1016/j.virol.2015.07.010
  38. Woolsey C., Menicucci A.R., Cross R.W., Luthra P., Agans K.N., Borisevich V., et al. A VP35 mutant Ebola virus lacks virulence but can elicit protective immunity to wild-type virus challenge. Cell Rep. 2019; 28(12): 3032–46.e6. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.08.047
  39. Mustafa M.I., Shantier S.W., Abdelmageed M.I., Makhawi A.M. Epitope-based peptide vaccine against Bombali Ebolavirus viral protein 40: An immunoinformatics combined with molecular docking studies. Inform. Med. Unlocked. 2021; 25: 1–10. https://doi.org/10.1016/j.imu.2021.100694
  40. Сhen S., Dick J., Owen A.B. Consistency of Markov chain quasi-Monte Carlo on continuous state spaces. Ann. Stat. 2011; 39(2): 673–701. https://doi.org/10.1214/10-AOS831

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2025 Sizikova T.E., Lebedev V.N., Borisevich S.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».