Animal delta-like viruses (Kolmioviridae: Deltavirus) and the origin of the human hepatitis D virus (HDV)

封面

如何引用文章

全文:

详细

Hepatitis D (delta, δ) virus (HDV) was discovered more than 40 years ago, but the understanding of its origin and evolution is poor. This is mainly due to the lack, until recently, of data on the existence of any viruses similar to HDV. The discovery in recent years of sequences of new delta-like agents in a wide range of vertebrate (Vertebrata) and invertebrate (Invertebrata) species has facilitated a revision of views on the origin of HDV and contributed to understanding the place of this unique virus among other animals’ viral agents. The purpose of this review is to analyze the latest published data on new delta-like agents and their biological characteristics.

作者简介

O. Isaeva

FSBSI «I.I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera»; FSBEI FPE «Russian Medical Academy of Continuous Professional Education» of the Ministry of Health of Russia

编辑信件的主要联系方式.
Email: isaeva.06@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-2656-3667

Ol’ga V. Isaeva, Ph.D. (Biol.), Lead Researcher of the Viral Hepatitis Laboratory; Lead Researcher of the Molecular and Personalized Medicine Research Institute

105064, Moscow, Russia

125993, Moscow, Russia

俄罗斯联邦

K. Kyuregyan

FSBSI «I.I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera»; FSBEI FPE «Russian Medical Academy of Continuous Professional Education» of the Ministry of Health of Russia

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-3599-117X

105064, Moscow, Russia

125993, Moscow, Russia

俄罗斯联邦

M. Mikhailov

FSBSI «I.I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera»; FSBEI FPE «Russian Medical Academy of Continuous Professional Education» of the Ministry of Health of Russia

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6636-6801

105064, Moscow, Russia

125993, Moscow, Russia

俄罗斯联邦

参考

  1. Rizzetto M., Canese M.G., Aricò S., Crivelli O., Trepo C., Bonino F., et al. Immunofluorescence detection of new antigen-antibody system (delta/anti-delta) associated to hepatitis B virus in liver and in serum of HBsAg carriers. Gut. 1977; 18(12): 997–1003. https://doi.org/10.1136/gut.18.12.997
  2. Lok A.S., Negro F., Asselah T., Farci P., Rizzetto M. Endpoints and new options for treatment of chronic hepatitis D. Hepatology. 2021. https://doi.org/10.1002/hep.32082
  3. Urban S., Neumann-Haefelin C., Lampertico P. Hepatitis D virus in 2021: virology, immunology and new treatment approaches for a difficult-to-treat disease. Gut. 2021; 70(9): 1782–94. https://dx.doi.org/10.1136/gutjnl-2020-323888
  4. Magnius L., Taylor J., Mason W.S., Sureau C., Dény P., Norder H. ICTV Report Consortium. ICTV virus taxonomy profile: Deltavirus. J. Gen. Virol. 2018; 99(12): 1565–6. https://doi.org/10.1099/jgv.0.001150
  5. Taylor J., Pelchat M. Origin of hepatitis delta virus. Future Microbiol. 2010; 5(3): 393–402. https://doi.org/10.2217/fmb.10.15
  6. Lasda E., Parker R. Circular RNAs: Diversity of form and function. RNA. 2014; 20(12): 1829–42. https://doi.org/10.1261/rna.047126.114
  7. Riccitelli N., Lupták A. HDV family of self-cleaving ribozymes. Prog. Mol. Biol. Transl. Sci. 2013; 120: 123–71. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-381286-5.00004-4
  8. Huang C.R., Lo S.J. Evolution and diversity of the human hepatitis D virus genome. Adv. Bioinformatics. 2010; 2010: 323654. https://doi.org/10.1155/2010/323654
  9. Wille M., Netter H.J., Littlejohn M., Yuen L., Shi M., Eden J.S., et al. A divergent hepatitis D-like agent in birds. Viruses. 2018; 10(12): 720. https://doi.org/10.3390/v10120720
  10. Brazas R., Ganem D. A cellular homolog of hepatitis delta antigen: Implications for viral replication and evolution. Science. 1996; 274(5284): 90–4. https://doi.org/10.1126/science.274.5284.90
  11. Salehi-Ashtiani K., Lupták A., Litovchick A., Szostak J.W. A genomewide search for ribozymes reveals an HDV-like sequence in the human CPEB3 gene. Science. 2006; 313(5794): 1788–92. https://doi.org/10.1126/science.1129308
  12. Chang W.S., Pettersson J.H., Le Lay C., Shi M., Lo N., Wille M., et al. Novel hepatitis D-like agents in vertebrates and invertebrates. Virus Evol. 2019; 5(2): vez021. https://doi.org/10.1093/ve/vez021
  13. Hetzel U., Szirovicza L., Smura T., Prähauser B., Vapalahti O., Kipar A., et al. Identification of a novel deltavirus in Boa constrictors. mBio. 2019; 10(2): e00014–19. https://doi.org/10.1128/mbio.00014-19
  14. Shi M., Lin X.D., Tian J.H., Chen L.J., Chen X., Li C.X., et al. Redefining the invertebrate RNA virosphere. Nature. 2016; 540(7634): 539–43. https://doi.org/10.1038/nature20167
  15. Shi M., Lin X.D., Chen X., Tian J.H., Chen L.J., Li K., et al. The evolutionary history of vertebrate RNA viruses. Nature. 2018; 556(7700): 197–202. https://doi.org/10.1038/s41586-018-0012-7
  16. Iwamoto M., Shibata Y., Kawasaki J., Kojima S., Li Y.T., Iwami S., et al. Identification of novel avian and mammalian deltaviruses provides new insights into deltavirus evolution. Virus Evol. 2021; 7(1): veab003. https://doi.org/10.1093/ve/veab003
  17. Paraskevopoulou S., Pirzer F., Goldmann N., Schmid J., Corman V.M., Gottula L.T., et al. Mammalian deltavirus without hepadnavirus coinfection in the neotropical rodent Proechimys semispinosus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2020; 117(30): 17977–83. https://doi.org/10.1073/pnas.2006750117
  18. Walker P.J., Siddell S.G., Lefkowitz E.J., Mushegian A.R., Adriaenssens E.M., Alfenas-Zerbini P., et al. Changes to virus taxonomy and to the International Code of Virus Classification and Nomenclature ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (2021). Arch. Virol. 2021; 166(9): 2633–48. https://doi.org/10.1007/s00705-021-05156-1
  19. Szirovicza L., Hetzel U., Kipar A., Martinez-Sobrido L., Vapalahti O., Hepojoki J. Snake deltavirus utilizes envelope proteins of different viruses to generate infectious particles. mBio. 2020; 11(2): e03250–19. https://doi.org/10.1128/mBio.03250-19
  20. de la Peña M., Ceprián R., Casey J.L., Cervera A. Hepatitis delta virus-like circular RNAs from diverse metazoans encode conserved hammerhead ribozymes. Virus Evol. 2021; 7(1): veab016. https://doi.org/10.1093/ve/veab016
  21. Taylor J.M. Infection by hepatitis delta virus. Viruses. 2020; 12(6): 648. https://doi.org/10.3390/v12060648
  22. Lai M.M. RNA replication without RNA-dependent RNA polymerase: Surprises from hepatitis delta virus. J. Virol. 2005; 79(13): 7951–8. https://doi.org/10.1128/jvi.79.13.7951-7958.2005
  23. Fiedler M., Roggendorf M. Vaccination against Hepatitis Delta Virus Infection: Studies in the Woodchuck (Marmota monax) Model. Intervirology. 2001; 44(2-3): 154–61. https://doi.org/10.1159/000050042
  24. Perez-Vargas J., Amirache F., Boson B., Mialon C., Freitas N., Sureau C., et al. Enveloped viruses distinct from HBV induce dissemination of hepatitis D virus in vivo. Nat. Commun. 2019; 10(1): 2098. https://doi.org/10.1038/s41467-019-10117-z
  25. Netter H.J., Barrios M.H., Littlejohn M., Yuen L.K.W. Hepatitis Delta Virus (HDV) and delta-like agents: Insights into their origin. Front. Microbiol. 2021; 12: 652962. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.652962
  26. Bergner L.M., Orton R.J., Broos A., Tello C., Becker D.J., Carrera J.E., et al. Diversification of mammalian deltaviruses by host shifting. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2021; 118(3): e2019907118. https://doi.org/10.1073/pnas.2019907118

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML

版权所有 © Problems of Virology, 2021

Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名 4.0国际许可协议的许可

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».