Study of the isolated bacteriophage ΦAb-Sр7 adsorption on the cell surface of the Azospirillum brasilense Sp7

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

The bacteriophage ΦAb-Sр7 was isolated from the cells of the azospirillum brasilense sp7. The morphology, size of the gram-negative colonies, and range of lytic activity against other strains and species of the genus Azospirillum was tested. The isolated phage DNA was examined using electrophoretic and restriction analysis, and the size of the genome were established. The electron microscopy results show that the phage (capsid) has a strand-like form. The electron microscopy study of the bacteriophage ΦAb-Sр7 adsorption on the A. brasilense Sp7 bacterial surface was performed.

About the authors

O. I. Guliy

Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences; Saratov State Vavilov Agrarian University; Scientific Research Veterinary Institute

Author for correspondence.
Email: guliy_olga@mail.ru

Ol’ga Guliy, MD, PhD, DSc

410049, Saratov
410012, Saratov
410028, Saratov 

Russian Federation

O. A. Karavaeva

Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences

Email: fake@neicon.ru
410049, Saratov Russian Federation

V. A. Velikov

Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences; Saratov State University

Email: fake@neicon.ru
410049, Saratov
410005, Saratov Russian Federation

O. I. Sokolov

Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences

Email: fake@neicon.ru
410049, Saratov Russian Federation

S. A. Pavliy

Saratov State University

Email: fake@neicon.ru
410005, Saratov Russian Federation

O. S. Larionova

Saratov State Vavilov Agrarian University

Email: fake@neicon.ru
410012, Saratov Russian Federation

A. M. Burov

Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences

Email: fake@neicon.ru
410049, Saratov Russian Federation

O. V. Ignatov

Institute of Biochemistry and Physiology of Plants and Microorganisms, Russian Academy of Sciences

Email: fake@neicon.ru
410049, Saratov Russian Federation

References

  1. Chang J.T., Schmid M.F., Haase-Pettingell C., Weigele P.R., King J.A., Chiu W. Visualizing the structural changes of bacteriophage Epsilon15 and its Salmonella host during infection. J. Mol. Biol. 2010; 402(4): 731–40.
  2. Уткин Д.В., Ерохин П.С., Осина Н.А., Конов Н.П. Оценка фаголизабельности штаммов холерных вибрионов с использованием атомно-силовой микроскопии. Известия Саратовского университета. Новая серия. Серия: Химия. Биология. Экология. 2013; 13 (3): 81–4.
  3. Краевский С.В. Атомно-силовая микроскопия аффинных взаимодействий в микробиологии: Дисс. … канд. биол. наук. Оболенск; 2011.
  4. Kang A.S., Barbas C.F., Janda K.D., Benkovic S.J., Lerner R.A. Linkage of recognition and replication functions by assembling combinatorial antibody Fab libraries along phage surfaces. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 1991; 88(10): 4363–6.
  5. Suttle C.A. Viruses in the sea. Nature. 2005; 437: 356–61.
  6. Ewing B., Hillier L., Wendl M.C., Green P. Base-calling of automated sequencer traces using phred. I. Accuracy assessment. Genome Res.1998; 8(3): 175–85.
  7. Germida J.J., Khachatourians G.G. Transduction of Escherichia coli in soil. Can. J. Microbiol. 1988; 34(2): 190–3.
  8. Boyer M., Haurat J., Samain S., Segurens B., Gavory F., González V. et al. Bacteriophage prevalence in the genus Azospirillum and analyses of the first genome sequence of an Azospirillum brasilense integrative phage. Appl. Environ. Microbiol. 2008; 74(3): 861–74.
  9. Gerhardt P., ed. Manual of Methods for General Bacteriology. American Society for Microbiology, Washington, DC; 1981.
  10. Martha R.J.Clokie, AndrewM.Kropinski, eds. Bacteriophages Methods and Protocols. Vol.1: Isolation, Characterization, and Interaction. Humana Press; 2008: 113–26.
  11. Sambrook J., Fritsch D.F., Maniatis T. Molecular Сloning: A Laboratory Manual. 2nd ed. (v. 1–3). Cold Spring Harbor, New York, Cold Spring Harbor Lab. Press; 1989.
  12. Boyer M., Haurat J., Samain S., Segurens B., Gavory F., González V. et al. Bacteriophage prevalence in the genus Azospirillum and analyses of the first genome sequence of an Azospirillum brasilense integrative phage. Appl. Environ. Microbiol. 2008; 74(3): 861–74.
  13. Stengele I., Bross P., Garces X., Giray J., Rasched I. Dissection of functional domains in phage fd adsorption protein. Discrimination between attachment and penetration sites. J. Mol. Biol. 1990; 212(1): 143–9.
  14. Jakes K.S., Davis N.G., Zinder N.D. A hybrid toxin from bacteriophage f1 attachment protein and colicin E3 has altered cell receptor specificity. J. Bacteriol. 1988; 170(9): 4231–8.
  15. Russel M., Whirlow H., Sun T.P., Webster R.E. Low-frequency infection of F-bacteria by transducing particles of Filamentous bacteriophages. J. Bacteriol. 1988; 170(11): 5312–6.
  16. Krebber C., Spada S., Desplancq D., Krebber A., Ge L., Pluckthun A. Selectively infective phage (SIP): a mechanistic dissection of a novel in vivo selection for protein–ligand interactions. J. Mol. Biol. 1997; 268(3): 607–18.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2016 Guliy O.I., Karavaeva O.A., Velikov V.A., Sokolov O.I., Pavliy S.A., Larionova O.S., Burov A.M., Ignatov O.V.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».