Сравнительная молекулярно-генетическая характеристика изолятов вируса бешенства (Rabies lyssavirus, Lyssavirus, Rhabdoviridae), циркулировавших на территории Российской Федерации в период с 1985 по 2016 год
- Авторы: Зайкова О.Н.1,2, Гребенникова Т.В.1,2, Лосич М.А.1, Елаков А.Л.1, Гулюкин А.М.3, Метлин А.Е.4
-
Учреждения:
- Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
- ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов»
- ФГБНУ «Федеральный научный центр – Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной ветеринарии имени К.И. Скрябина и Я.Р. Коваленко Российской академии наук»
- ФГБУ «Всероссийский государственный центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов»
- Выпуск: Том 65, № 1 (2020)
- Страницы: 41-48
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- URL: https://journals.rcsi.science/0507-4088/article/view/118041
- DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-1-41-48
- ID: 118041
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Бешенство – древнейшая инфекция, вызываемая нейротропным вирусом рода Lyssavirus, семейства Rhabdoviridae, который поражает всех теплокровных позвоночных. Гомология последовательностей аминокислот нуклеопротеина среди лиссавирусов 78–93%.
Целью данного исследования было изучение генетического разнообразия и молекулярной эпидемиологии лиссавирусов, циркулировавших на территории РФ с 1985 по 2016 г.
Материал и методы. Исследовано 54 изолята вируса бешенства, выделенных от животных, 2 изолята, выделенных от людей, и 4 вакцинных штамма вируса бешенства: RV-97, ERA, Shchelkovo 51, ERAG333. Филогенетический анализ проводили с использованием данных GenBank о фрагментах геномов 73 изолятов вируса бешенства и 9 изолятов EBLV-1. Для исследования использовали программы DNASTAR V.3.12, Bio Edit 7.0.4.1 и MEGA v. 10.0.5, Primer Premier 5.
Результаты. Сравнительный молекулярно-генетический анализ фрагментов геномов 130 лиссавирусов, выделенных на территории РФ и Украины, а также вакцинных штаммов вируса бешенства показал их распределение по географическому признаку. Сравнение фрагментов нуклеопротеина изолятов вируса бешенства, циркулирующих на территории РФ и Украины, с вакцинными штаммами выявило 4 маркёрных мутации: V56I (для Евразийской группы), L/V95W (для Центральной группы), D101N/S/T, N/G106D. Филогенетический анализ изолята «Juli», выделенного в 1985 г. от человека, укушенного летучей мышью, и описанного М.А. Селимовым и С.В. Грибенча, доказал его принадлежность к европейскому лиссавирусу летучих мышей (подгруппе 1a).
Обсуждение. Изучение молекулярной эпидемиологии бешенства в пределах РФ позволяет проводить генотипирование вируса (распределение по группам, выявление маркёрных мутаций, генотипирование изолята «Juli»). Это помогает изучать скрытые механизмы рабической инфекции в популяции животных и человека, а также характеризовать вакцинные штаммы, в том числе при оральной вакцинации. Заключение. Необходимо дальнейшее изучение молекулярной эпидемиологии бешенства в пределах РФ и граничащих с ней стран.
Ключевые слова
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
О. Н. Зайкова
Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России; ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов»
Автор, ответственный за переписку.
Email: zaykova_o_n@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4708-2069
Зайкова Ольга Николаевна, науч. сотрудник лаборатории молекулярной диагностики.
123098, г. Москва
117198, г. Москва
Т. В. Гребенникова
Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России; ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов»
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6141-9361
123098, г. Москва
117198, г. Москва Россия
М. А. Лосич
Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-5618-1918
123098, г. Москва Россия
А. Л. Елаков
Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0001-5798-6518
123098, г. Москва Россия
А. М. Гулюкин
ФГБНУ «Федеральный научный центр – Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной ветеринарии имени К.И. Скрябина и Я.Р. Коваленко Российской академии наук»
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0003-2160-4770
109428, г. Москва Россия
А. Е. Метлин
ФГБУ «Всероссийский государственный центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов»
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-4283-0171
123022, г. Москва Россия
Список литературы
- В кн.: Львов Д.К., ред. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. М.: МИА; 2013.
- Васильев Д.А., Луговцев В.Ю., ред. Вирусы, вызывающие болезни общие для многих видов сельскохозяйственных животных. Курс лекций по вирусологии. Часть вторая. Ульяновск; 2004.
- Cai L., Tao X., Liu Y., Zhang H., Gao L., Hu S., et al. Molecular characteristics and phylogenetic analysis of N gene of human derived rabies virus. Biomed. Environ. Sci. 2011; 24(4): 431-7. http://doi.org/10.3967/0895-3988.2011.04.015.
- International Committee on Taxonomy of Viruses ICTV. Available at: http://www.ictvonline.org/
- Hayman D.T., Fooks A.R., Marston D.A., Garcia-R J.C. The global phylogeography of lyssaviruses – challenging the ‘out of Africa’ hypothesis. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016; 10(12): e0005266. http://doi.org/10.1371/journal.pntd.0005266
- Грибенча С.В., Козлов А.Ю., Костина Л.В., Елаков А.Л., Лосич М.А., Цибезов В.В. и др. Получение моноклональных антител к нуклеопротеину вируса бешенства. Вопросы вирусологии. 2013; 58(5): 38-43.
- Чупин С.А., Чернышова Е.В., Метлин А.Е. Генетическая характеристика полевых изолятов вируса бешенства, выявленных на территории Российской Федерации в период 2008-2011 гг. Вопросы вирусологии. 2013; 58(4): 44-9.
- Ботвинкин А.Д. Смертельные случаи заболевания людей бешенством в Евразии после контактов с рукокрылыми. (Обзор литературы). Plecotus et al. 2011; (14): 75-86.
- Kuzmin I.V., Orciari L.A., Arai Y.T., Smith J.S., Hanlon C.A., Kameoka Y., et al. Bat lyssaviruses (Aravan and Khujand) from Central Asia: phylogenetic relationships according to N, P and G gene sequences. Virus Res. 2003; 97(2): 65-79. http://doi.org/10.1016/s0168-1702(03)00217-x
- Botvinkin A.D., Poleschuk E.M., Kuzmin I.V., Borisova T.I., Gazaryan S.V., Yager P., et al. Novel lyssaviruses isolated from bats in Russia. Emerg. Infect. Dis. 2003; 9(12): 1623-5. http://doi.org/10.3201/eid0912.030374
- Всемирная организация здравоохранения. Available at: http://www.who.int/ru
- Shulpin M.I., Nazarov N.A., Chupin S.A., Korennoy F.I., Metlin A.Y., Mischenko A.V. Rabies surveillance in the Russian Federation. Rev. Sci. Tech. 2018; 37(2): 483-95. http://doi.org/10.20506/rst.37.2.2817
- Hampson K., Coudeville L., limbo T., Sambo M., Kieffer A., Attlan M., et al. Estimating the global burden of endemic canine rabies. PLos Negi. Trop. Dis. 2015; 9(4): e0003709. http://doi.org/10.1371/journal.pntd.0003709
- Шабейкин А.А., Гулюкин А.М., Зайкова О.Н. Обзор эпизоотической ситуации по бешенству в Российской Федерации за период с 1991 по 2015 годы. Ветеринария Кубани. 2016; (4): 4-6.
- Fehlner-Gardiner C., Nardine-Davis S., Armstrong J., Muldoon F., Bachmann P., Wandeler A. ERA vaccine-derived cases of rabies in wildlife and domestic animals in Ontario, Canada, 1989 – 2004. J. Wildl. Dis. 2008; 44(1): 71-85. http://doi.org/10.7589/0090-3558-44.1.71
- Müller T., Bätza H.J., Beckert A., Bunzenthal C., Cox J.H., Freuling C.M., et al. Analysis of vaccine-virus-associated rabies cases in red foxes (Vulpes vulpes) after oral rabies vaccination campaigns in Germany and Austria. Arch. Virol. 2009; 154(7): 1081-91. http://doi.org/10.1007/s00705-009-0408-7
- Forró B., Marton S., Kecskeméti S., Hornyák Á., Bányai K. Vaccineassociated rabies in red fox, Hungary. Vaccine. 2019; 37(27): 3535-3538. http://doi.org/10.1016/j.vaccine.2019.05.014
- Елаков А.Л., Уласов В.И., Баньковский Д.О., Сафонов Г.А. Изучение биологических свойств штамма ERA G333 вируса бешенства. Ветеринария. 2011; (2): 22-4.
- Metlin A., Paulin L., Suomalainen S., Neuvonen E., Rybakov S., Mikhalishin V., et al. Characterization of Russian rabies virus vaccine strain RV-97. Virus Res. 2008; 132(1-2): 242-7. http://doi.org/10.1016/j.virusres.2007.11.016
- Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Нашатырева Д.Н., Градобоева Е.А., Пакскина Н.Д., Попова И.В. Бешенство в Российской Федерации: информационно-аналитический бюллетень. Омск: КАН; 2019.
- OIE Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals (mammals, birds and bees). Available at: https://www.oie.int/standard-setting/terrestrial-manual/access-online/
- Heaton P.R., Johnstone P., McElhinney L.M., Cowley R., O’Sullivan E., Whitby J.E. Heminested PCR assay for detection of six genotypes of rabies and rabies-related viruses. J. Clin. Microbiol. 1997; 35(11): 2762-6.
- Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucl. Acids. Symp. 1999; (41): 95-8.
- Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 2018; 35(6): 1547-9. http://doi.org/10.1093/molbev/msy096
- Hall B.G. Building Phylogenetic trees from molecular data with MEGA. Mol. Biol. Evol. 2013; 30(5): 1229-35. http://doi.org/10.1093/molbev/mst012
- Елаков А.Л., Зайкова О.Н., Кочергин-Никитский К.С., Гребенникова Т.В., Алипер Т.И. Мониторинг бешенства у диких животных в Брянской области. Ветеринария. 2015; (1): 11-4.
- Зайкова О.Н., Гребенникова Т.В., Елаков А.Л., Кочергин-Никитский К.С., Алипер Т.И., Чучалин С.Ф. и др. Молекулярногенетическая характеристика геномов полевых изолятов вируса бешенства, циркулирующих на территории Кировской области. Вопросы вирусологии. 2016; 61(4): 186-92. http://doi.org/10.18821/0507-4088-2016-61-4-186-192
- Зайкова О.Н., Гребенникова Т.В., Гулюкин А.М., Шабейкин А.А., Полякова И.В., Метлин А.Е. Молекулярно-генетическая характеристика полевых изолятов вируса бешенства, выявленных на территории Владимирской, Московской, Тверской, Нижегородской и Рязанской областей. Вопросы вирусологии. 2017; 62(3): 101-8. http://doi.org/10.18821/0507-4088-2017-62-3-101-108
- Гулюкин А.М. Значимость современных методов лабораторной диагностики и идентификации возбудителя бешенства для иммунологического мониторинга данного зооноза. Вопросы вирусологии. 2014; 59(3): 5-10.
- Полещук Е.М., Сидоров Г.Н., Грибенча С.В. Итоги изучения антигенного и генетического разнообразия вируса бешенства в популяциях наземных млекопитающих России. Вопросы вирусологии. 2013; 58(3): 9-16.
- Ботвинкин А.Д., Кузьмин И.В., Хисматуллина Н.А. Итоги изучения антигенного разнообразия вируса бешенства на территории бывшего СССР. Ветеринарная патология. 2004; (3): 117-27.
- Metlin A.E., Rybakov S., Gruzdev K., Neuvonen E., Huovilainen A. Genetic heterogeneity of Russian, Estonian and Finnish field rabies viruses. Arch. Virol. 2007; 152(9): 1645-54. http://doi.org/10.1007/s00705-007-1001-6
- Deviatkin A.A., Lukashev A.N., Poleshchuk E.M., Dedkov V.G., Tkachev S.E., Sidorov G.N., et al. The phylodinamics of the rabies virus in the Russian Federation. PLos One. 2017; 12(2): e0171855. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0171855
- Picard-Meyer E., Robardet E., Laurent A., Cliquet F., et al. Bat rabies in France: a 24-year retrospective epidemiological study. PLos One. 2014; 9(6): e98622. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0098622
- Troupin C., Picard-Meyer E., Dellicour S., Casademont I., Kergoat L., Lepelletier A., et al. Host Genetic Variation Does Not Determine Spatio-Temporal Patterns of European Bat 1 Lyssavirus. Genome Biol. Evol. 2017; 9(11): 3202-13. http://doi.org/10.1093/gbe/evx236
Дополнительные файлы
