Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 51, № 6 (2025)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ

КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ ПАНАЛЛЕРГЕНЫ В РАЗВИТИИ СЕНСИБИЛИЗАЦИИ И МЕТОДЫ ИХ ДИАГНОСТИКИ

Петрова С.Ю., Хлгатян С.В., Бержец В.М., Нестеренко Л.Н., Алаторцева Г.И., Самойликов П.В.

Аннотация

Среди родственных белков растительного или животного происхождения, широко распространенных в природе, существуют семейства, способные вызывать в организме перекрестные IgE-опосредованные реакции. Такие семейства белков называют паналлергенами. Каждое семейство паналлергенов обладает своими физико-химическими и иммунобиологическими особенностями, что оказывает влияние на их аллергенные свойства. В настоящем обзоре описаны основные семейства паналлергенов, их структура, свойства, функции и возможные последствия сенсибилизации пациентов, а также современные методы молекулярной аллергодиагностики. В обзоре представлена сводная таблица по белковым семействам паналлергенов. Выбор способа лечения пациентов с аллергопатологией, подбор элиминационных мероприятий и аллерген-специфической иммунотерапии во многом зависят от точной и ранней диагностики аллергических заболеваний. Как и при любой патологии, при аллергических болезнях терапия эффективна только в том случае, когда она патогенетически обоснована, применяется комплексный подход и соблюдается последовательность в проведении лечебных мероприятий. Соответственно, знание семейств паналлергенов и их свойств позволяет более грамотно выявлять перекрестные реакции у пациентов с аллергопатологией и прицельно подбирать необходимое лечение.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1011-1026
pages 1011-1026 views

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

ОЦЕНКА АДАПТИВНОГО ИММУННОГО ОТВЕТА ПРОТИВ ГРИППА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ СИНТЕТИЧЕСКИХ ПЕПТИДОВ

Грибовская О.В., Цыганков А.М., Мартинович В.П., Янченко В.В.

Аннотация

В данной работе апробирован метод оценки иммуногенности синтетических пептидов, который может лечь в основу метода клинической диагностики клеточного иммунного ответа против вируса гриппа А. Используемые пептиды идентичны по аминокислотному составу 9-мерным эпитопам поверхностных белков вирусов гриппа, актуальных для вакцинных штаммов Северного полушария сезона 2023–2024 гг., и представляют собой фрагмент (432–440 a.o.) Phe-Leu-Asp-Ile-Trp-Thr-Tyr-Asn-Ala гемагглютинина вируса гриппа А и фрагмент (454–462 a.o.) Leu-Leu-Trp-Asp-Thr-Val-Thr-Gly-Val нейраминидазы вируса гриппа В. Пептиды синтезировали классическими методами пептидной химии с использованием методов активированных эфиров и карбодиимидного метода в качестве основных способов конденсации. В клиническом исследовании участвовало 55 добровольцев в возрасте 20–26 лет. Уровень гамма-интерферона (IFN-γ) оценивали методом иммуноферментного анализа. Внутри групп добровольцев, имеющих различия в статусе вакцинации и инфекционного анамнеза, не было получено статистически значимых различий для всех парных сравнений концентраций IFN-γ в 55 случаях. Для проведения клинической диагностики иммунного ответа против вируса гриппа А необходима оптимизация данного метода.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1027-1037
pages 1027-1037 views

6-МЕТИЛУРАЦИЛ В СИНТЕЗЕ МОНО- И ДИГИДРАЗОНОВ: СИНТЕЗ, ЦИТОТОКСИЧНОСТЬ И АНТИОКСИДАНТНАЯ АКТИВНОСТЬ

Черникова И.Б., Хисамутдинова Р.Ю., Макара Н.С., Саяхова Э.Р., Ишметова Д.В., Вахитов В.А.

Аннотация

6-Метилурацил – важное соединение, активно участвующее в процессах клеточной регенерации. Его способность стимулировать рост и размножение клеток – ключевой фактор в процессе заживления тканей. Метилурацил ускоряет процесс восстановления кожи, что делает его применение незаменимым в дерматологии и хирургии для лечения ран, язв и ожогов. Гидразиды карбоновых кислот также представляют интерес благодаря уникальным координационно-химическим свойствам и находят применение в различных отраслях. В медицине гидразиды проявляют широкий спектр активности: они обладают противотуберкулезным, противовирусным и антибактериальным действием. Некоторые гетероциклические гидразоны проявили себя в качестве ингибиторов основной протеазы SARSCoV-2. Это подчеркивает важность изучения структурных и функциональных особенностей данных соединений. Синтез гидразонов с фрагментом 6-метилурацила представляет собой многообещающее направление в области фармацевтической химии и медицины, открывающее новые возможности для разработки инновационных лекарственных средств. В данной работе осуществлен синтез дигидразонов на основе дигидразидов карбоновых кислот (адипиновой, азелаиновой и себащиовой) с фрагментами 6-метилурацила. С помощью онлайн-версии экспертной системы OCHEM произведена оценка спектра биологической активности in silico, включая цитотоксичность, антиоксидантную активность, острую токсичность и гематотоксичность полученных соединений и препаратов сравнения. Исследования биологической активности показали, что полученные моно- и дигидразоны не обладают цитотоксическим действием по отношению к изученным линиям опухолевых клеток (НepG2, A549, MCF-7, HCT-116) и условно-нормальной клеточной линии HEK 293. При этом установлена умеренная избирательная цитотоксичность 6-метил-5-[(2-фенилгидразоно)метил]пиримидин-2,4(1H,3H)-диона в отношении колоректальной карциномы человека (клеточная линия HCT-116, IC50 = 71.75 ± 8.29) и условно-нормальной клеточной линии HEK 293 (IC50 = 19.35 ± 2.12). Антиоксидантную активность моно- и дигидразонов изучили с использованием методов восстановления Fe3+, катион-радикала ABTS и стабильного радикала DPPH в условиях in vitro. Выявлено соединение-лидер (3-(2-((6-метил-2,4-диоксо-1,2,3,4-тетрагидропиримидин-5-ил)метилен)гидразинил)бензойная кислота), сравнимое по антиоксидантной активности с аскорбиновой кислотой, для углубленного изучения.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1038-1050
pages 1038-1050 views

ОСОБЕННОСТИ СИНТЕЗА И ИССЛЕДОВАНИЕ ТОКСИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ТРИПТОФАНСОДЕРЖАЩЕГО АНАЛОГА АРГИНИН-ВАЗОПРЕССИНА

Бородина К.В., Квятковская Е.И., Мартинович В.П., Грибовская О.В., Панибрат О.В., Чукарина Т.В., Огурцова С.Э., Зильберман Р.Д., Саванец О.Н., Ольгомец Л.М., Савин А.О., Жебракова И.В., Кравченко Е.В.

Аннотация

Среди ранее исследованных аналогов C-концевого фрагмента аргинин-вазопрессина (АВП) большой интерес в качестве потенциальной фармацевтической субстанции представляет тетрапептид Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2, продемонстрировавший в опытах с грызунами антидепрессантоподобную и анксиолитическую (противогревожную) активность. В данной работе рассмотрены особенности синтеза триптофансодержащего аналога АВП, предложена новая "блочная" схема получения пептида, позволяющая нарабатывать его с большими выходами, чем было показано ранее. Также проведены токсикологические исследования тетрапептида Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2 in vitro и in vivo. Исследования in vitro продемонстрировали низкую цитотоксичность в отношении культуры клеток фибробластов кожи человека (IC50 > 1000 мкМ). Исследование острой токсичности в эксперименте на мышах ICR не выявило токсического действия тетрапептида Ac-Trp-Pro-Arg-Gly-NH2. Низкая токсичность тетрапептида, продемонстрированная в данном исследовании, делает перспективными дальнейшие исследования биологической активности, токсичности и механизмов действия триптофансодержащего аналога АВП с целью создания на его основе новых более безопасных и эффективных анксиолитиков и антидепрессантов.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1051-1062
pages 1051-1062 views

ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА С-КОНЦЕВОГО ДОМЕНА ГЕМОЛИЗИНА II Bacillus cereus СТАБИЛИЗИРУЕТСЯ В СОСТАВЕ ПОЛНОРАЗМЕРНОГО ТОКСИНА

Руденко Н.В., Мельник Б.С., Каратовская А.П., Нагель А.С., Андреева-Ковалевская Ж.И., Замятина А.В., Ветрова О.С., Сиунов А.В., Бровко Ф.А., Солонин А.С.

Аннотация

Гемолизин II (HlyII) – один из ключевых патогенных факторов Bacillus cereus, породоразующий токсин с пространственной структурой типа β-баррель, обладающий C-концевым удлинением из 94 a.o., обозначаемый как C-концевой домен HlyII (HlyIICTD). В данной работе проведен сайт-направленный мутагенез аминокислотных остатков, лежащих на поверхности белковой глобулы HlyIICTD. Методом иммуноферментного анализа показано, что моноклональные антитела HlyIIC-16 и HlyIIC-23, полученные против HlyIICTD, взаимодействовали с интактным HlyIICTD гораздо эффективнее, чем с полиоразмерным токсином и химерным белком – HlyIICTD, слитым с SlyD. Антитела HlyIIC-16 и HlyIIC-23 эффективно ингибировали взаимодействие друг друга с иммобилизованным HlyIICTD в иммуноферментном анализе, что свидетельствовало о близости их эпитопов на поверхности молекулы HlyIICTD. Для определения эпитопов HlyIIC-16 и HlyIIC-23 использовали фаговый дисплей, сайт-направленный мутагенев и клонирование генов отдельных частей молекулы HlyIICTD. Пространственное моделирование HlyIICTD, слитого с SlyD, с использованием программы AlphaFold позволило предположить расположение эпитопов HlyIIC-16 и HlyIIC-23 на участке Gly341–Gly364 белка HlyII. Продемонстрировано, что C-концевой домен может одновременно находиться в нескольких структурных состояниях (изоформах). В составе водорастворимой формы мономера полиоразмерного токсина наблюдается переход пространственной структуры HlyIICTD в стабильную форму.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1063-1074
pages 1063-1074 views

НОВЫЕ КОНЪЮГАТЫ 3'-АЗИДО-3' ДЕЗОКСИТИМИДИНА И 2',3'-ДИДЕЗОКСИ- 3'-ТИАЦИТИДИНА НА ОСНОВЕ 1,3-(ДИПАЛЬМИТОИЛАМИНО)ПРОПАН-2-ОЛА: СИНТЕЗ И ИССЛЕДОВАНИЕ АНТИ-ВИЧ-АКТИВНОСТИ НА МОДЕЛЬНЫХ КЛЕТОЧНЫХ СИСТЕМАХ

Дарнотук Е.С., Синявин А.Э., Чудина М.Н., Шастина Н.С.

Аннотация

Разработка пролекарств противовирусных нуклеозидов с изостерными производными природных липидов позволяет повысить биодоступность данных препаратов, модулировать эффективность их действия. В данной работе с использованием H-фосфонатного метода осуществлен синтез новых липофильных пролекарств 3’-азидо-3’-дезокситимидина (AZT), 2’,3’-дидезокси-3’-тиацитидина (ЗТС) на основе 1,3-(дипальмитоиламино)пропан-2-ола с функциональными фосфорными связями. Проведены исследования анти-ВИЧ-активности синтезированных соединений в отношении различных штаммов ВИЧ (HIV-1 MVP-899, HIV-1 RF) и цитотоксичности в отношении клеток MT-4. H-фосфонатдиэфирные и фосфодиэфирные конъюгаты проявили более низкую анти-ВИЧактивность, чем исходные нуклеозиды (EC50 = 0.59–3.04 мкМ), их преимущества включают низкую цитотоксичность (CC50 >100 мкм). Противовирусная активность амидофосфатных производных с эфирами L-α-аланина снижалась в ряду (tBu) > Me > (iPr) > Et, значения EC50 при этом составили 0.46, 4.60, 8.97 и 12.55 мкМ соответственно, эти соединения проявляли цитотоксичность, сходную с AZT (CC50 >50 мкм). Дополнительным преимуществом таких конъюгатов может служить возможность направленного транспорта в резервуары ВИЧ за счет энтероцит-опосредованного лимфатического транспорта, а также потенциального внутриклеточного высвобождения нуклеозидмонофосфата, что позволяет обойти первичное фосфорилирование нуклеозидов при их метаболизме до активной трифосфатной формы. Следовательно, разработка таких пролекарств может послужить основой для поиска лекарств с высокой эффективностью.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1075-1087
pages 1075-1087 views

ПРОСТРАНСТВЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ОРАНЖЕВО-КРАСНОГО ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО БИОМАРКЕРА DiB3-F53L

Россохин А.В., Артемьев И.В., Архипова С.Ф., Плетнев В.З., Плетнева Н.В.

Аннотация

Расчетным методом молекулярной динамики (МД) изучена пространственная организация флуоресцентного белка DiB3-F53L – оранжево-красного флуоресцентного нековалентного комплекса генно-инженерного варианта бактериального белка липокалина Blc в комплексе с синтетическим GFP-подобным хромофором M739. Показано, что хромофор сильнее взаимодействует с мутированным белком DiB3-F53L по сравнению с нативным белком DiB3. Расчеты позволили установить аминокислотные остатки из окружения хромофора в сайте связывания, вносящие наибольший вклад в энергию взаимодействия хромофор–белок. Комплекс белка DiB3-F53L с хромофором M739 обладает повышенной яркостью флуоресценции по отношению к известному родительскому биомаркеру DiB3, что выдвигает его в число перспективных маркеров для лечения биологических объектов в клеточной биологии, а также в качестве стартового объекта для последующего дизайна новых более ярких биологических маркеров.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1088-1092
pages 1088-1092 views

ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОНЦЕНТРАЦИИ АНТИТЕЛ IgG И IgA МЕТОДОМ ПОЛЯРИЗАЦИИ ФЛУОРЕСЦЕНЦИИ С ПРИМЕНЕНИЕМ ФЛУОРЕСЦЕНТНО-МЕЧЕННЫХ РЕКОМБИНАНТНЫХ НАНОТЕЛ

Мухаметова Л.И., Еремин С.А., Михура И.В., Горяйнова О.С., Иванова Т.И., Тиллиб С.В.

Аннотация

Количественный, быстрый и высокопроизводительный анализ иммуноглобулинов IgG и IgA необходим для определения содержания этих белков и ассоциированных с ними молекул в физиологических жидкостях больных. Анализ этих белков необходим при диагностике дефицита специфических антител в качестве вспомогательного теста для выявления общего вариабельного иммунодефицита, а также для оценки степени риска пациентов с низким уровнем IgA. Определение содержания IgG может помочь при назначении ревакцинации пациентам и поддержки стратегии их лечения, использоваться для мониторинга гуморальной иммунной системы пациента, а также при разработке и последующем производстве большинства терапевтических антител в биофармацевтике. Миниатюрные рекомбинантные однодоменные антитела (нанотела) обладают рядом преимуществ перед классическими антителами, таких как относительная простота их наработки, высокая стабильность в широком диапазоне значений температуры и pH, способность узнавать высокоспецифические конформационные эпитопы целевого белка, а также возможность использования их в качестве зондов для детекции более крупных целевых белков-антигенов в методе поляризации флуоресценции. Получены и охарактеризованы флуоресцентно-меченные нанотела FITC-anti-IgG и FITC-anti-IgA к IgG и IgA человека. Определены Kd комплексов FITC-anti-IgG*IgG и FITC-anti-IgA*IgA, подтверждающие высокую аффинность иммунореагентов. Показана возможность специфичного определения содержания IgG и IgA в сыворотке крови человека в диапазоне 35–120 мкг/мл (для IgA) и 75–260 мкг/мл (для IgG). Протестированы 18 сывороток человека на содержание IgG и IgA, количество антител в образцах подтверждено определением с использованием коммерческих иммуноферментных наборов. Показано, что FITC-anti-IgG и FITC-anti-IgA не взаимодействуют с другими белками человека: альбумином, плазминогеном, фибриногеном, лактоферрином и трансферрином. Тестирование сывороток человека и животных с FITC-anti-IgG и FITC-anti-IgA продемонстрировало специфичное связывание с антисыворотками человека и обезьяны, но не с сыворотками животных: быка, собаки, кошки, кролика и овцы. Таким образом, метод FPIA может быть использован для быстрого и специфичного определения IgG и IgA человека.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1093-1105
pages 1093-1105 views

СИНТЕЗ И БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ПРОИЗВОДНЫХ ПИРИДОКСИНА, СОДЕРЖАЩИХ 1,3-ОКСАЗОЛИДИН-2-ОНОВЫЕ ФРАГМЕНТЫ

Акчурин А.С., Штырлин Н.В., Сапожников С.В., Булатова Е.С., Агафонова М.Н., Азметов Т.Р., Вафина Р.М., Каюмов А.Р., Тризна Е.Ю., Байдамшина Д.Р., Мансурова М.Н., Гришаев Д.Ю., Штырлин Ю.Г.

Аннотация

Синтезирована библиотека из 11 производных пиридоксина с 1,3-оксазолидин-2-оновыми фрагментами во втором, пятом и шестом положениях. Исследования антибактериальной активности полученных соединений на 6 эталонных и 6 клинических штаммах грамположительных бактерий и цитотоксичности в отношении условно нормальных клеток человека in vitro позволили выявить высокоактивное и малотоксичное соединение-лидер, содержащее 1,3-оксазолидин-2-оновый фрагмент в пятом положении пиридоксина. Дальнейшие углубленные исследования этого соединения в отношении бактериальных биопленок S. aureus и E. facetum продемонстрировали сопоставимую, а в ряде случаев превосходящую лекарственный препарат линезолид эффективность. При этом, в отличие от линезолида, соединение-лидер не проявляет мутагенного действия в тесте Эймса и обладает высокой безопасностью при внутрижелудочном введении мышам (ЛД50 >2000 мг/кг).
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1106-1132
pages 1106-1132 views

СИНТЕЗ И АНТИБАКТЕРИАЛЬНАЯ АКТИВНОСТЬ ЭТИНИЛЬНЫХ И АЗИДО-ПРОИЗВОДНЫХ N4-ДОДЕЦИЛАМИНО-2'-ДЕЗОКСИЦИТИДИНА

Макаров Д.А., Ясько М.В., Карпенко И.Л., Урбина Э.В., Попенко В.И., Леонова О.Г., Ткачев Я.В., Васильева Б.Ф., Ефременкова О.В., Кочетков С.Н., Александрова Л.А.

Аннотация

Разработаны методы получения новых производных N4-додециламино-2'-дезоксицитидина и цитидина. Новые производные содержат 5-этинильную, 5-(проп-2-ин-1-ил)оксиметильную или 5'-азидо-группы, необходимые для введения красителей in vitro с использованием методов клик-химии. Полученные соединения (III), (VIII), (XIII), (XVI), как и N4-додециламино-2'-дезоксицитидин, показали значительную антибактериальную активность в отношении грамположительных бактерий. Новые нуклеозиды могут быть использованы для визуализации их субклеточной локализации с целью определения возможного механизма действия антибактериальных агентов подобного рода.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1133-1141
pages 1133-1141 views

N4-(ω-АМИНОАЛКИЛ)- И N4-(ω-ДАНСИЛАМИНОАЛКИЛ)5-МЕТИЛ-2'-ДЕЗОКСИЦИТИДИНЫ

Макаров Д.А., Ясько М.В., Карпенко И.Л., Ткачев Я.В., Васильева Б.Ф., Ефременкова О.В., Кочетков С.Н., Александрова Л.А.

Аннотация

Синтезированы новые производные N4-(додецил)-5-метил-2'-дезоксицитидина, содержащие терминальные аминогруппы в алкильном линкере. Показано, что они могут быть удобными синтонами для последующего введения дансильных флюорофорных групп. Одно из N4-ω-дансиламиноалкильных производных показало умеренную противобактериальную активность в отношении штамма Mycobacterium smegmatis и может быть использовано для изучения субклеточной локализации данного рода соединений
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1142-1147
pages 1142-1147 views

КОМПОЗИЦИОННЫЕ АЭРОГЕЛЬНЫЕ МАТЕРИАЛЫ С ГЕМОСТАТИЧЕСКИМ ЭФФЕКТОМ НА ОСНОВЕ АЛЬГИНАТА И ХИТОЗАНА

Горшкова Н.А., Бровко О.С., Кашутин С.Л.

Аннотация

В настоящее время во всем мире наблюдается высокий спрос на новые эффективные гемостатические материалы. Перспективны для этих целей – высокопористые органические аэрогели на основе полисахаридов морского происхождения, таких как альгинат натрия и хитозан, которые благодаря своей развитой структуре и природному происхождению обладают такими важными свойствами, как биосовместимость, биодеградируемость, нетоксичность, химическая инертность, волокнистость, механическая прочность и нерастворимость в воде. В настоящей работе на основе комплекса альгината и хитозана с введением активных добавок (магнетит и ватерит) были получены композиционные аэрогельные материалы, и изучены их потребительские свойства с целью оценки возможности применения в качестве гемостатических материалов. Показано, что разработанные материалы характеризуются развитой микро- и мезопористой структурой, обеспечивающей высокую влагопоглощающую способность по отношению к физиологическому раствору, моделирующему pH крови теплокровных животных. Значение предельной впитывающей способности составило 67 и 43 г/г для материала, содержащего ватерит и магнетит, соответственно, что связано с различными в пористой структуре образцов. Результаты тестирования антимикробной активности материалов подтвердили возможность их использования для биомедицинских целей. Наиболее выражена антибактериальная активность материалов по отношению к грамположительным микроорганизмам Staphylococcus aureus и Bacillus subtilis, диаметры зон подавления роста которых достигали 24 ± 0.2 и 20 ± 0.2 мм. Проведенный сравнительный анализ гемостатической активности разработанных материалов в эксперименте in vivo показал, что материалы характеризуются высокой скоростью остановки кровотечений по сравнению с ватным тампоном: время свертывания крови в экспериментальной группе для материала, содержащего ватерит и магнетит, составило 32.6 и 49.6 с соответственно, что в 1.3–2 раза меньше, чем в контрольной группе. Выполненные исследования показали, что композиционные аэрогельные материалы на основе комплекса альгината натрия и хитозана с введением активных добавок (магнетит и ватерит) могут составить серьезную конкуренцию как на международном, так и на российском рынке гемостатических препаратов и медицинских изделий.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1148-1158
pages 1148-1158 views

ОЦЕНКА ТОКСИЧНОСТИ, ГЕНОТОКСИЧНОСТИ И ЦИТОТОКСИЧНОСТИ ФЕНИЛЦИКЛОАЛКАНПОЛИКАРБОНОВЫХ КИСЛОТ: ИССЛЕДОВАНИЕ С Allium cepa И Chlorella vulgaris

Фирстова А.А., Ковалева М.И., Кофанов Е.Р., Тарасенко М.В.

Аннотация

Для оценки токсичности, цитотоксичности и генотоксичности поликарбоновых кислот, содержащих циклоалифатические фрагменты, был применен комплексный подход, основанный на использовании тестовых организмов (одноклеточная зеленая водоросль Chlorella vulgaris и лук Allium cepa). Соединения поликарбоновых кислот оценивались в концентрациях 1.0, 0.1, 0.001 и 0.001%. Показано, что поликислоты не были мутагенными для биопроб на основе лука Allium cepa, а высокие концентрации препаратов могут взывать увеличение частоты мутаций Chlorella vulgaris. Полученные результаты обосновывают необходимость дальнейших исследований для всесторонней оценки безопасности и потенциальной применимости данных соединений. Описанный подход может быть применен для получения быстрых, экономически эффективных и полезных дополнительных данных о различных типах токсичности in vitro для веществ с потенциальной биологической активностью.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1159-1166
pages 1159-1166 views

АНАЛИЗ БЕЛОК-БЕЛКОВОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ CREBBP, НТТ и КМТ2D МЕТОДОМ ГЛАВНЫХ КОМПОНЕНТ

Хегай И.И., Гун Ж., Ефимов В.М.

Аннотация

Транскрипционный коактиватор CREBBP (cyclic AMP response element binding protein-binding protein), нейроспецифический регулятор транскрипции НТТ (huntingtin) и гистон-лизиновая метилтрансфераза КМТ2D (lysine methyltransferase 2D) кооперативно участвуют в посттрансляционной модификации гистонов и регуляции дифференциальной экспрессии генов. Механизм межбелкового взаимодействия исследован слабо. Компьютерный анализ первичной структуры белков методом главных компонент выявил наличие максимально высокой корреляции между главными компонентами аминокислотных последовательностей в парах CREBBP–НТТ и CREBBP–КМТ2D с глутамином. Траектория первой главной компоненты CREBBP практически совпадает с графиком позиционной частоты глутамина вдоль молекулы белка. Показано, что во вторичной структуре CREBBP существенную долю занимают элементы E-strand (extended strand) с открытой конформацией пептидной цепи. Полилутаминовые тракты, локализованные на C-конце CREBBP, N-конце НТТ, N-, C-концах и в центре КМТ2D также имеют открытую конформацию, облегчающую образование межмолекулярных водородных связей. Предполагается, что полилутаминовые тракты C-конца CREBBP и N-конца НТТ непосредственно вовлечены в белок-белковый контакт CREBBP–НТТ. Аналогичная связь между полилутаминовыми трактами C-конца CREBBP и центрального региона КМТ2D фиксирует физическое взаимодействие в данной паре белков. Выявленные особенности исследованиям белков могут быть использованы для конструирования новых фармакологических препаратов физико-химическими методами.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1167-1174
pages 1167-1174 views

ПИСЬМА РЕДАКТОРУ

АНАЛОГ ХРОМОФОРА БЕЛКА КАЕВЕ КАК ИНСТРУМЕНТ ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО МЕЧЕНИЯ ЯДРА И МИТОХОНДРИЙ ЖИВЫХ КЛЕТОК

Рудик Д.И., Гильванов А.Р., Баранов М.С., Богданова Ю.А.

Аннотация

Синтезирована серия из трех красителей – аналогов хромофора флуоресцентного белка Kaede с различными заместителями. По результатам флуоресцентной микроскопии был выявлен перспективный флуороген – 5-((Z)-2-(дифторборанил)-4-(диметиламино)-5-гидроксибензилиден)3-метил-2-((E)-2-(пиридин-4-ил)винил)-3,5-дигидро-4H-имидазол-4-он. Продемонстрировано использование этого красителя в широкопольной флуоресцентной микроскопии для одновременного селективного окрашивания ядра и митохондрий в живых клетках на примере клеточной линии Hel.a Kyoto. Полученное соединение может найти применение в области визуализации процессов живых систем.
Биоорганическая химия. 2025;51(6):1175-1180
pages 1175-1180 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».