Biological Microarray for Detection of Somatic Mutations in the Genes of Isocitrate Dehydrogenase 1 and 2

V. O. Varachev; Варачев В. О.; D. A. Guskov; Гуськов Д. А.; A. P. Shekhtman; Шехтман А. П.; D. V. Rogozhin; Рогожин Д. В.; S. A. Polyakov; Поляков С. А.; A. V. Chudinov; Чудинов А. В.; A. S. Zasedatelev; Заседателев А. С.; T. V. Nasedkina; Наседкина Т. В.

doi:10.31857/S0132342323050093

Биологический микрочип для определения соматических мутаций в генах изоцитратдегидрогеназ 1 и 2

Авторы: Варачев В.О.¹, Гуськов Д.А.¹, Шехтман А.П.², Рогожин Д.В.², Поляков С.А.¹, Чудинов А.В.¹, Заседателев А.С.¹, Наседкина Т.В.¹
Учреждения:
1. ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН
2. Российская детская клиническая больница ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
Выпуск: Том 49, № 5 (2023)
Страницы: 537-542
Раздел: ПИСЬМА РЕДАКТОРУ
URL: https://journals.rcsi.science/0132-3423/article/view/139260
DOI: https://doi.org/10.31857/S0132342323050093
EDN: https://elibrary.ru/ABXFZT
ID: 139260

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

Мутации в генах изоцитратдегидрогеназ 1 и 2 (IDH1 и IDH2) – важные диагностические и прогностические маркеры при целом ряде опухолей (хондроидные опухоли, опухоли головного мозга, лейкозы). Для определения мутаций в генах IDH1/2 разработан метод аллель-специфичной гибридизации на биологическом микрочипе, позволяющий определять наличие мутации в образце опухоли (хондроидные опухоли, глиобластома) и вариант нуклеотидной замены. При сравнении методов определения мутаций IDH1/2 с помощью биологического микрочипа и анализа кривых плавления с TaqMan-зондом получено полное совпадение результатов, при этом метод с использованием биочипа позволяет не только выявлять наличие мутантного генотипа, но и идентифицировать тип нуклеотидной замены без дополнительного этапа секвенирования.

Ключевые слова

изоцитратдегидрогеназа 1 и 2, мутации, глиобластома, хондроидные опухоли, диагностика, биологический микрочип

Список литературы

Dang L., White D.W., Gross S., Bennett B.D., Bittinger M.A., Driggers E.M., Fantin V.R., Jang H.G., Jin S., Keenan M.C., Marks K.M., Prins R.M., Ward P.S., Yen K.E., Liau L.M., Rabinowitz J.D., Cantley L.C., Thompson C.B., Vander Heiden M.G., Su S.M. // Nature. 2009. V. 462. P. 739–744. https://doi.org/10.1038/nature08617
Cairns R.A., Mak T.W. // Cancer Discov. 2013. V. 3. P. 730–741. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-13-0083
Chen S., Fritchie K., Wei S., Ali N., Curless K., Shen T., Brini A.T., Latif F., Sumathi V., Siegal G.P., Cheng L. // Hum. Pathol. 2017. V. 65. P. 239–246. https://doi.org/10.1016/j.humpath.2017.05.015
Hartmann C., Meyer J., Balss J., Capper D., Mueller W., Christians A., Felsberg J., Wolter M., Mawrin C., Wick W., Weller M., Herold-Mende C., Unterberg A., Jeuken J.W., Wesseling P., Reifenberger G., von Deimling A. // Acta Neuropathol. 2009. V. 118. P. 469–474. https://doi.org/10.1007/s00401-009-0561-9
Agarwal S., Sharma M.C., Jha P., Pathak P., Suri V., Sarkar C., Chosdol K., Suri A., Kale S.S., Mahapatra A.K., Jha P. // Neuro Oncol. 2013. V. 15. P. 718–726. https://doi.org/10.1093/neuonc/not015
Arita H., Narita Y., Matsushita Y., Fukushima S., Yoshida A., Takami H., Miyakita Y., Ohno M., Shibui S., Ichimura K. // Brain Tumor Pathol. 2015. V. 32. P. 22–30. https://doi.org/10.1007/s10014-014-0186-0
Perizzolo M., Winkfein B., Hui S., Krulicki W., Chan J.A., Demetrick D.J. // Brain Pathol. 2012. V. 22. P. 619–624. https://doi.org/10.1111/j.1750- 3639.2012.00579.x
Табаков Д.В., Катаргин А.Н., Строганова А.М., Сендерович А.И., Насхлеташвили Д.Р., Киселева Н.П. // Усп. мол. онкол. 2017. Т. 4. С. 53–59. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2017-4-1-53-59
Emelyanova M., Arkhipova K., Mazurenko N., Chudinov A., Demidova I., Zborovskaya I., Lyubchenko L., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 2015. V. 23. P. 255–265. https://doi.org/10.1097/PAI.0000000000000084
Emelyanova M., Ghukasyan L., Abramov I., Ryabaya O., Stepanova E., Kudryavtseva A., Sadritdinova A., Dzhumakova C., Belysheva T., Surzhikov S., Lyubchenko L., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Oncotarget. 2017. V. 8. P. 52304–52320. https://doi.org/10.18632/oncotarget.17014
Lee D., Suh Y.L., Kang S.Y., Park T.I., Jeong J.Y., Kim S.H. // Brain Pathol. 2013. V. 23. P. 285–293. https://doi.org/10.1111/bpa.12000
Emelyanova M.A., Telysheva E.N., Orlova K.V., Ryabaya O.O., Snigiryova G.P., Abramov I.S., Mikhailovich V.M. // Cancer Genet. 2021. V. 250–251. P. 25–35. https://doi.org/10.1016/j.cancergen.2020.11.005
Gryadunov D.A., Shaskolskiy B.L., Nasedkina T.V., Rubina A.Y., Zasedatelev A.S. // Acta Naturae. 2018. V. 10. P. 4–18. https://doi.org/10.32607/20758251-2018-10-4-4-18